MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 genome

Total Repeats: 80559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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72003	NC_022444	ACT	2	6	3287820	3287825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643258
72004	NC_022444	CTG	2	6	3287840	3287845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643258
72005	NC_022444	CCA	2	6	3287919	3287924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643258
72006	NC_022444	CGA	2	6	3287931	3287936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643258
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72008	NC_022444	ATGGC	2	10	3287971	3287980	20 %	20 %	40 %	20 %	545643258
72009	NC_022444	AGC	2	6	3288116	3288121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643259
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72013	NC_022444	GCC	2	6	3288223	3288228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643259
72014	NC_022444	CAT	2	6	3288243	3288248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643259
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72016	NC_022444	GCG	2	6	3288299	3288304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643259
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72018	NC_022444	GGCCT	2	10	3288355	3288364	0 %	20 %	40 %	40 %	545643259
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72032	NC_022444	TACC	2	8	3289031	3289038	25 %	25 %	0 %	50 %	545643260
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72082	NC_022444	CAG	2	6	3291674	3291679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643262
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72088	NC_022444	CTG	2	6	3291989	3291994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643262
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72335	NC_022444	GCT	2	6	3300845	3300850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643270
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72343	NC_022444	TAT	2	6	3301053	3301058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545643270
72344	NC_022444	CTG	2	6	3301062	3301067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643270
72345	NC_022444	TGC	3	9	3301087	3301095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643270
72346	NC_022444	GCC	2	6	3301230	3301235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643270
72347	NC_022444	CAGCTT	2	12	3301283	3301294	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545643270
72348	NC_022444	TCA	2	6	3301312	3301317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643270
72349	NC_022444	TGG	2	6	3301321	3301326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643270
72350	NC_022444	GGGC	2	8	3301331	3301338	0 %	0 %	75 %	25 %	545643270
72351	NC_022444	GCG	2	6	3301351	3301356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643270
72352	NC_022444	CTT	2	6	3301370	3301375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643270
72353	NC_022444	TGC	2	6	3301396	3301401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643270
72354	NC_022444	TGC	2	6	3301423	3301428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643270
72355	NC_022444	CGG	2	6	3301433	3301438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643270
72356	NC_022444	ATG	2	6	3301455	3301460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643270
72357	NC_022444	CGG	2	6	3301469	3301474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643270
72358	NC_022444	TGA	2	6	3301477	3301482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643270
72359	NC_022444	GCC	2	6	3301501	3301506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643270
72360	NC_022444	GGC	2	6	3301600	3301605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643271
72361	NC_022444	GTG	2	6	3301606	3301611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643271
72362	NC_022444	GCA	2	6	3301646	3301651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643271
72363	NC_022444	TGG	2	6	3301715	3301720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643271
72364	NC_022444	CCG	2	6	3301724	3301729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643271
72365	NC_022444	GCG	2	6	3301730	3301735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643271
72366	NC_022444	CTG	2	6	3301741	3301746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643271
72367	NC_022444	CTGC	2	8	3301768	3301775	0 %	25 %	25 %	50 %	545643271
72368	NC_022444	GTG	2	6	3301798	3301803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643271
72369	NC_022444	TGG	2	6	3301859	3301864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643271
72370	NC_022444	CCG	2	6	3301872	3301877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643271
72371	NC_022444	T	6	6	3301890	3301895	0 %	100 %	0 %	0 %	545643271
72372	NC_022444	CTG	2	6	3301903	3301908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643271
72373	NC_022444	CGC	2	6	3301913	3301918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643271
72374	NC_022444	TTC	2	6	3301921	3301926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643271
72375	NC_022444	GC	3	6	3302031	3302036	0 %	0 %	50 %	50 %	545643271
72376	NC_022444	GCC	2	6	3302059	3302064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643271
72377	NC_022444	GCT	4	12	3302073	3302084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643271
72378	NC_022444	CGC	2	6	3302094	3302099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643271
72379	NC_022444	GC	3	6	3302132	3302137	0 %	0 %	50 %	50 %	545643271
72380	NC_022444	TCA	2	6	3302138	3302143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643271
72381	NC_022444	TGG	2	6	3302180	3302185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643271
72382	NC_022444	TCA	2	6	3302222	3302227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643271
72383	NC_022444	CGC	2	6	3302264	3302269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643271
72384	NC_022444	CAG	2	6	3302278	3302283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643271
72385	NC_022444	GCC	2	6	3302299	3302304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643271
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72391	NC_022444	ACC	2	6	3302502	3302507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643272
72392	NC_022444	CTG	2	6	3302508	3302513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643272
72393	NC_022444	GCT	2	6	3302528	3302533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643272
72394	NC_022444	GCG	2	6	3302603	3302608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643272
72395	NC_022444	GCG	2	6	3302633	3302638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643272
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72400	NC_022444	CTG	2	6	3302853	3302858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643272
72401	NC_022444	TGG	2	6	3302914	3302919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643272
72402	NC_022444	TGC	2	6	3302947	3302952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643272
72403	NC_022444	AAG	2	6	3302970	3302975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545643272
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72406	NC_022444	CTG	2	6	3303048	3303053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643272
72407	NC_022444	GC	3	6	3303071	3303076	0 %	0 %	50 %	50 %	545643272
72408	NC_022444	ACG	2	6	3303088	3303093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643272
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72412	NC_022444	CCAACT	2	12	3303196	3303207	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545643273
72413	NC_022444	GC	3	6	3303239	3303244	0 %	0 %	50 %	50 %	545643273
72414	NC_022444	A	7	7	3303260	3303266	100 %	0 %	0 %	0 %	545643273
72415	NC_022444	CGA	2	6	3303271	3303276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643273
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72421	NC_022444	CAC	2	6	3303424	3303429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643273
72422	NC_022444	GTG	3	9	3303440	3303448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643273
72423	NC_022444	TGG	2	6	3303486	3303491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643273
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72427	NC_022444	TGC	2	6	3303531	3303536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643273
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72429	NC_022444	ACG	2	6	3303582	3303587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643273
72430	NC_022444	GC	3	6	3303588	3303593	0 %	0 %	50 %	50 %	545643273
72431	NC_022444	CCGG	2	8	3303636	3303643	0 %	0 %	50 %	50 %	545643273
72432	NC_022444	CAGATC	2	12	3303644	3303655	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545643273
72433	NC_022444	CAC	2	6	3303670	3303675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643273
72434	NC_022444	GCC	2	6	3303728	3303733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643273
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72436	NC_022444	GC	3	6	3303802	3303807	0 %	0 %	50 %	50 %	545643273
72437	NC_022444	GCA	2	6	3303895	3303900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643273
72438	NC_022444	GCAT	2	8	3303906	3303913	25 %	25 %	25 %	25 %	545643273
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72441	NC_022444	TGC	2	6	3304029	3304034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643273
72442	NC_022444	GCCCCT	2	12	3304071	3304082	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	545643273
72443	NC_022444	GCG	2	6	3304096	3304101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643273
72444	NC_022444	CGA	2	6	3304126	3304131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643273
72445	NC_022444	TGG	2	6	3304185	3304190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643273
72446	NC_022444	GCC	2	6	3304207	3304212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643273
72447	NC_022444	CCGC	2	8	3304332	3304339	0 %	0 %	25 %	75 %	545643273
72448	NC_022444	GCC	2	6	3304427	3304432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643273
72449	NC_022444	GGC	2	6	3304433	3304438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643273
72450	NC_022444	CGC	2	6	3304445	3304450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643273
72451	NC_022444	GAT	2	6	3304465	3304470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643273
72452	NC_022444	GC	3	6	3304668	3304673	0 %	0 %	50 %	50 %	545643274
72453	NC_022444	TGC	2	6	3304674	3304679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643274
72454	NC_022444	TGG	2	6	3304725	3304730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643274
72455	NC_022444	GGCC	2	8	3304771	3304778	0 %	0 %	50 %	50 %	545643274
72456	NC_022444	GGT	2	6	3304795	3304800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643274
72457	NC_022444	CCGGG	2	10	3304806	3304815	0 %	0 %	60 %	40 %	545643274
72458	NC_022444	GC	3	6	3304840	3304845	0 %	0 %	50 %	50 %	545643274
72459	NC_022444	CAT	2	6	3304849	3304854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643274
72460	NC_022444	GGC	2	6	3304918	3304923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643274
72461	NC_022444	GCA	2	6	3304972	3304977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643274
72462	NC_022444	CTG	3	9	3305018	3305026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643274
72463	NC_022444	GGC	2	6	3305621	3305626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643275
72464	NC_022444	CTC	2	6	3305665	3305670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545643275
72465	NC_022444	GGCT	2	8	3305686	3305693	0 %	25 %	50 %	25 %	545643275
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72467	NC_022444	GTG	2	6	3305863	3305868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643275
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72471	NC_022444	CTGC	2	8	3305998	3306005	0 %	25 %	25 %	50 %	545643275
72472	NC_022444	GC	3	6	3306004	3306009	0 %	0 %	50 %	50 %	545643275
72473	NC_022444	GCC	2	6	3306079	3306084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643275
72474	NC_022444	CTG	3	9	3306094	3306102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643275
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72476	NC_022444	GCC	2	6	3306146	3306151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643275
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72483	NC_022444	CGC	3	9	3306491	3306499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643276
72484	NC_022444	CGC	2	6	3306514	3306519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643276
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72486	NC_022444	CTG	2	6	3306600	3306605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643276
72487	NC_022444	TGC	2	6	3306610	3306615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643276
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72490	NC_022444	GCCT	2	8	3306708	3306715	0 %	25 %	25 %	50 %	545643276
72491	NC_022444	GCA	2	6	3306794	3306799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643276
72492	NC_022444	GAA	2	6	3306810	3306815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545643276
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72494	NC_022444	CTG	2	6	3306870	3306875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643276
72495	NC_022444	GCA	2	6	3306878	3306883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643276
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72498	NC_022444	AAG	3	9	3306987	3306995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545643276
72499	NC_022444	GCGCC	2	10	3307100	3307109	0 %	0 %	40 %	60 %	545643277
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