MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 plasmid sequence

Total Repeats: 1934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022436	CAG	2	6	21109	21114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625520
502	NC_022436	GGGCC	2	10	21210	21219	0 %	0 %	60 %	40 %	545625520
503	NC_022436	GGC	2	6	21244	21249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625520
504	NC_022436	GTC	2	6	21256	21261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625520
505	NC_022436	ACA	2	6	21273	21278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545625520
506	NC_022436	GCA	2	6	21315	21320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625520
507	NC_022436	CGGC	2	8	21345	21352	0 %	0 %	50 %	50 %	545625520
508	NC_022436	GCGG	2	8	21355	21362	0 %	0 %	75 %	25 %	545625520
509	NC_022436	CAGC	2	8	21366	21373	25 %	0 %	25 %	50 %	545625520
510	NC_022436	CCA	2	6	21378	21383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545625520
511	NC_022436	AGC	2	6	21407	21412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625520
512	NC_022436	GCA	2	6	21417	21422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625520
513	NC_022436	AGC	2	6	21521	21526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625520
514	NC_022436	AAT	2	6	21564	21569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545625520
515	NC_022436	GGC	2	6	21577	21582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625520
516	NC_022436	ATG	2	6	21605	21610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545625520
517	NC_022436	GAA	2	6	21625	21630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545625520
518	NC_022436	TCG	2	6	21713	21718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625520
519	NC_022436	GGCC	3	12	21721	21732	0 %	0 %	50 %	50 %	545625520
520	NC_022436	CGT	2	6	21867	21872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625520
521	NC_022436	CGG	2	6	21881	21886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625520
522	NC_022436	GGGC	2	8	21933	21940	0 %	0 %	75 %	25 %	545625520
523	NC_022436	GGT	2	6	21946	21951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545625520
524	NC_022436	CAG	2	6	21989	21994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625520
525	NC_022436	GTCAGG	2	12	22001	22012	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545625520
526	NC_022436	GCG	2	6	22019	22024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625520
527	NC_022436	CGC	2	6	22038	22043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545625520
528	NC_022436	GCA	2	6	22044	22049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625520
529	NC_022436	CCA	2	6	22092	22097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545625520
530	NC_022436	TGC	2	6	22124	22129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625520
531	NC_022436	GCA	2	6	22134	22139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625520
532	NC_022436	GCA	2	6	22143	22148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625520
533	NC_022436	AAC	2	6	22199	22204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545625520
534	NC_022436	GGTCC	2	10	22240	22249	0 %	20 %	40 %	40 %	545625520
535	NC_022436	GGC	2	6	22321	22326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625520
536	NC_022436	CAG	2	6	22375	22380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625520
537	NC_022436	GC	3	6	22385	22390	0 %	0 %	50 %	50 %	545625520
538	NC_022436	GAT	2	6	22483	22488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545625520
539	NC_022436	G	6	6	22518	22523	0 %	0 %	100 %	0 %	545625520
540	NC_022436	CA	3	6	22629	22634	50 %	0 %	0 %	50 %	545625520
541	NC_022436	GAT	2	6	22899	22904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545625521
542	NC_022436	GCGG	2	8	22913	22920	0 %	0 %	75 %	25 %	545625521
543	NC_022436	GCA	2	6	22943	22948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625521
544	NC_022436	TCA	2	6	22979	22984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545625521
545	NC_022436	GATG	2	8	22985	22992	25 %	25 %	50 %	0 %	545625521
546	NC_022436	GGCC	2	8	22993	23000	0 %	0 %	50 %	50 %	545625521
547	NC_022436	GGGCA	2	10	23035	23044	20 %	0 %	60 %	20 %	545625521
548	NC_022436	CGG	2	6	23075	23080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625521
549	NC_022436	GGC	2	6	23100	23105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625521
550	NC_022436	CGG	2	6	23206	23211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625521
551	NC_022436	CGG	2	6	23293	23298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625521
552	NC_022436	GCC	2	6	23341	23346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545625521
553	NC_022436	CCTGC	2	10	23445	23454	0 %	20 %	20 %	60 %	545625521
554	NC_022436	GCG	2	6	23458	23463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625521
555	NC_022436	CAG	2	6	23464	23469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625521
556	NC_022436	CGG	2	6	23492	23497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625521
557	NC_022436	G	8	8	23496	23503	0 %	0 %	100 %	0 %	545625521
558	NC_022436	CAG	3	9	23511	23519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625521
559	NC_022436	TTG	2	6	23707	23712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545625522
560	NC_022436	GCC	2	6	23722	23727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545625522
561	NC_022436	GAACG	2	10	23765	23774	40 %	0 %	40 %	20 %	545625522
562	NC_022436	TGT	2	6	23788	23793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545625522
563	NC_022436	CAG	2	6	23795	23800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625522
564	NC_022436	GAA	2	6	23839	23844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545625522
565	NC_022436	AGG	2	6	23858	23863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545625522
566	NC_022436	GCC	2	6	23864	23869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545625522
567	NC_022436	CAG	2	6	23896	23901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625522
568	NC_022436	GCG	2	6	23939	23944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625522
569	NC_022436	GGCC	2	8	23947	23954	0 %	0 %	50 %	50 %	545625522
570	NC_022436	CCA	2	6	23967	23972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545625522
571	NC_022436	CGG	3	9	24006	24014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625522
572	NC_022436	CGG	2	6	24057	24062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625522
573	NC_022436	GGC	2	6	24076	24081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625522
574	NC_022436	CCG	2	6	24333	24338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545625522
575	NC_022436	GCG	2	6	24351	24356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625522
576	NC_022436	GGC	2	6	24370	24375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625522
577	NC_022436	GGC	2	6	24423	24428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625522
578	NC_022436	ATC	2	6	24589	24594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545625523
579	NC_022436	TGAT	2	8	24620	24627	25 %	50 %	25 %	0 %	545625523
580	NC_022436	TTG	2	6	24797	24802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545625523
581	NC_022436	ATG	2	6	24815	24820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545625523
582	NC_022436	CATG	2	8	24864	24871	25 %	25 %	25 %	25 %	545625523
583	NC_022436	TCG	2	6	24920	24925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625523
584	NC_022436	C	6	6	24965	24970	0 %	0 %	0 %	100 %	545625523
585	NC_022436	GGC	2	6	25048	25053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625523
586	NC_022436	GCG	2	6	25081	25086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625523
587	NC_022436	TCC	2	6	25094	25099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545625523
588	NC_022436	CAG	2	6	25186	25191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625523
589	NC_022436	CCT	2	6	25203	25208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545625523
590	NC_022436	T	6	6	25237	25242	0 %	100 %	0 %	0 %	545625523
591	NC_022436	CCA	2	6	25278	25283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545625523
592	NC_022436	CACGGC	2	12	25306	25317	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	545625523
593	NC_022436	CAG	2	6	25441	25446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625523
594	NC_022436	TGA	2	6	25455	25460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545625523
595	NC_022436	CCCG	2	8	25470	25477	0 %	0 %	25 %	75 %	545625523
596	NC_022436	ATG	2	6	25616	25621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545625523
597	NC_022436	GACG	2	8	25719	25726	25 %	0 %	50 %	25 %	545625523
598	NC_022436	CTT	2	6	25774	25779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545625523
599	NC_022436	CCA	2	6	25829	25834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545625524
600	NC_022436	CAC	2	6	25866	25871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545625524
601	NC_022436	CAGG	2	8	25872	25879	25 %	0 %	50 %	25 %	545625524
602	NC_022436	CAG	2	6	25899	25904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625524
603	NC_022436	C	7	7	25908	25914	0 %	0 %	0 %	100 %	545625524
604	NC_022436	CCA	2	6	25958	25963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545625524
605	NC_022436	TCCAC	2	10	25979	25988	20 %	20 %	0 %	60 %	545625524
606	NC_022436	GGA	2	6	26016	26021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545625524
607	NC_022436	ACC	2	6	26032	26037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545625524
608	NC_022436	ATG	3	9	26050	26058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545625524
609	NC_022436	CAG	2	6	26061	26066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625524
610	NC_022436	CGC	2	6	26127	26132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545625524
611	NC_022436	CAG	3	9	26139	26147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625524
612	NC_022436	GCA	2	6	26153	26158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625524
613	NC_022436	CAG	2	6	26160	26165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625524
614	NC_022436	ATGCC	2	10	26197	26206	20 %	20 %	20 %	40 %	545625524
615	NC_022436	TGA	2	6	26237	26242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545625524
616	NC_022436	GC	3	6	26267	26272	0 %	0 %	50 %	50 %	545625524
617	NC_022436	CG	3	6	26297	26302	0 %	0 %	50 %	50 %	545625524
618	NC_022436	GATCA	2	10	26310	26319	40 %	20 %	20 %	20 %	545625524
619	NC_022436	GCCTGC	2	12	26320	26331	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545625524
620	NC_022436	GCAG	2	8	26363	26370	25 %	0 %	50 %	25 %	545625524
621	NC_022436	TGC	2	6	26381	26386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625524
622	NC_022436	GCA	2	6	26432	26437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625524
623	NC_022436	TCA	2	6	26474	26479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545625524
624	NC_022436	CAG	2	6	26487	26492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625524
625	NC_022436	AGA	2	6	26546	26551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545625524
626	NC_022436	ATG	2	6	26560	26565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545625524
627	NC_022436	CA	3	6	26608	26613	50 %	0 %	0 %	50 %	545625524
628	NC_022436	GCC	2	6	26616	26621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545625524
629	NC_022436	CGTT	2	8	26626	26633	0 %	50 %	25 %	25 %	545625524
630	NC_022436	TCG	2	6	26665	26670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625524
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642	NC_022436	GGGC	2	8	27947	27954	0 %	0 %	75 %	25 %	545625526
643	NC_022436	CAG	2	6	27959	27964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625526
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742	NC_022436	TGGC	2	8	35198	35205	0 %	25 %	50 %	25 %	545625531
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747	NC_022436	GGCAG	2	10	35600	35609	20 %	0 %	60 %	20 %	545625531
748	NC_022436	GCG	2	6	36726	36731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625532
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750	NC_022436	AGCC	2	8	36871	36878	25 %	0 %	25 %	50 %	545625532
751	NC_022436	GCC	2	6	36883	36888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545625532
752	NC_022436	CCG	2	6	36889	36894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545625532
753	NC_022436	CGG	2	6	36905	36910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625532
754	NC_022436	CAAGGC	2	12	36912	36923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625532
755	NC_022436	GCT	2	6	36990	36995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625532
756	NC_022436	TGC	2	6	37010	37015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625532
757	NC_022436	AAAT	2	8	37041	37048	75 %	25 %	0 %	0 %	545625532
758	NC_022436	CAA	2	6	37061	37066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545625532
759	NC_022436	AAGG	2	8	37168	37175	50 %	0 %	50 %	0 %	545625532
760	NC_022436	A	6	6	37204	37209	100 %	0 %	0 %	0 %	545625532
761	NC_022436	TGC	2	6	37397	37402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625532
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763	NC_022436	TGTT	2	8	37448	37455	0 %	75 %	25 %	0 %	545625532
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766	NC_022436	CTG	2	6	37687	37692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625532
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770	NC_022436	C	6	6	37960	37965	0 %	0 %	0 %	100 %	545625532
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774	NC_022436	GGC	2	6	38232	38237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625532
775	NC_022436	GTT	2	6	38244	38249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545625532
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782	NC_022436	TGC	2	6	38547	38552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545625532
783	NC_022436	TCA	2	6	38558	38563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545625532
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785	NC_022436	CCGG	2	8	38613	38620	0 %	0 %	50 %	50 %	545625532
786	NC_022436	TCC	2	6	38641	38646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545625532
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841	NC_022436	TGG	2	6	41798	41803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545625534
842	NC_022436	TAC	2	6	41807	41812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545625534
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844	NC_022436	ATC	2	6	41866	41871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545625534
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858	NC_022436	CG	3	6	42744	42749	0 %	0 %	50 %	50 %	545625535
859	NC_022436	TCT	2	6	42952	42957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545625535
860	NC_022436	TGG	2	6	42968	42973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545625535
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864	NC_022436	ATT	2	6	44941	44946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545625536
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868	NC_022436	GT	3	6	45174	45179	0 %	50 %	50 %	0 %	545625536
869	NC_022436	T	6	6	45209	45214	0 %	100 %	0 %	0 %	545625536
870	NC_022436	TAC	2	6	45222	45227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545625536
871	NC_022436	T	6	6	45351	45356	0 %	100 %	0 %	0 %	545625536
872	NC_022436	ACA	2	6	45361	45366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545625536
873	NC_022436	G	6	6	45368	45373	0 %	0 %	100 %	0 %	545625536
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876	NC_022436	TTC	2	6	45590	45595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545625536
877	NC_022436	CG	3	6	45601	45606	0 %	0 %	50 %	50 %	545625536
878	NC_022436	T	6	6	45612	45617	0 %	100 %	0 %	0 %	545625536
879	NC_022436	GCA	2	6	45650	45655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625536
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1000	NC_022436	GC	3	6	53566	53571	0 %	0 %	50 %	50 %	545625541

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