MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides mccartyi DCMB5

Total Repeats: 23334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020386	AGC	2	6	293	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202846
2	NC_020386	ACG	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202846
3	NC_020386	A	6	6	454	459	100 %	0 %	0 %	0 %	452202846
4	NC_020386	TAC	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202846
5	NC_020386	GCT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202846
6	NC_020386	ACAA	2	8	543	550	75 %	0 %	0 %	25 %	452202846
7	NC_020386	GCC	2	6	645	650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202846
8	NC_020386	CCG	2	6	752	757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202846
9	NC_020386	TCT	2	6	804	809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202846
10	NC_020386	GAA	2	6	828	833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202846
11	NC_020386	GAT	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202846
12	NC_020386	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202846
13	NC_020386	CCCA	2	8	980	987	25 %	0 %	0 %	75 %	452202846
14	NC_020386	CCG	2	6	1056	1061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202846
15	NC_020386	A	6	6	1066	1071	100 %	0 %	0 %	0 %	452202846
16	NC_020386	GCC	2	6	1368	1373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202846
17	NC_020386	ACA	2	6	1424	1429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202846
18	NC_020386	CT	3	6	1439	1444	0 %	50 %	0 %	50 %	452202846
19	NC_020386	GAA	2	6	1471	1476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202846
20	NC_020386	AGCTGG	2	12	1513	1524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452202846
21	NC_020386	ACC	2	6	1567	1572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202846
22	NC_020386	CGG	2	6	1965	1970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202847
23	NC_020386	CGG	2	6	2013	2018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202847
24	NC_020386	CGG	2	6	2034	2039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202847
25	NC_020386	CGG	2	6	2043	2048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202847
26	NC_020386	GGT	2	6	2134	2139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202847
27	NC_020386	CTA	2	6	2207	2212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202847
28	NC_020386	GGA	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202847
29	NC_020386	AGGG	2	8	2294	2301	25 %	0 %	75 %	0 %	452202847
30	NC_020386	GCG	2	6	2369	2374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202847
31	NC_020386	TAT	2	6	2418	2423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202847
32	NC_020386	CTG	2	6	2461	2466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202847
33	NC_020386	TAC	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202847
34	NC_020386	CTG	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202847
35	NC_020386	GAT	2	6	2686	2691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202847
36	NC_020386	GGT	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202847
37	NC_020386	AGAT	2	8	2768	2775	50 %	25 %	25 %	0 %	452202847
38	NC_020386	GAA	2	6	2800	2805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202847
39	NC_020386	AAG	2	6	2822	2827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202847
40	NC_020386	T	6	6	2842	2847	0 %	100 %	0 %	0 %	452202847
41	NC_020386	CTG	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202847
42	NC_020386	GCG	2	6	2920	2925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202847
43	NC_020386	AT	3	6	2927	2932	50 %	50 %	0 %	0 %	452202847
44	NC_020386	TGGC	2	8	3018	3025	0 %	25 %	50 %	25 %	452202847
45	NC_020386	ATT	2	6	3052	3057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202847
46	NC_020386	AGG	2	6	3088	3093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202847
47	NC_020386	G	6	6	3215	3220	0 %	0 %	100 %	0 %	452202848
48	NC_020386	A	6	6	3269	3274	100 %	0 %	0 %	0 %	452202848
49	NC_020386	TAT	2	6	3321	3326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202848
50	NC_020386	AAG	2	6	3428	3433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202848
51	NC_020386	CTTTA	2	10	3498	3507	20 %	60 %	0 %	20 %	452202848
52	NC_020386	GCTGG	2	10	3509	3518	0 %	20 %	60 %	20 %	452202848
53	NC_020386	ATA	2	6	3561	3566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202848
54	NC_020386	TGA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202848
55	NC_020386	CAG	2	6	3651	3656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202848
56	NC_020386	AT	3	6	3688	3693	50 %	50 %	0 %	0 %	452202848
57	NC_020386	CTT	2	6	3694	3699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202848
58	NC_020386	CGG	2	6	3751	3756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202848
59	NC_020386	TAAA	2	8	3797	3804	75 %	25 %	0 %	0 %	452202848
60	NC_020386	CAG	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202849
61	NC_020386	GGC	2	6	3988	3993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202849
62	NC_020386	TCC	2	6	4044	4049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202849
63	NC_020386	CAT	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202849
64	NC_020386	AG	3	6	4188	4193	50 %	0 %	50 %	0 %	452202849
65	NC_020386	TAA	2	6	4224	4229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202849
66	NC_020386	GAA	2	6	4246	4251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202849
67	NC_020386	TGA	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202849
68	NC_020386	TTC	2	6	4390	4395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202849
69	NC_020386	GCG	2	6	4471	4476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202849
70	NC_020386	ACC	2	6	4498	4503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202849
71	NC_020386	CAGG	2	8	4575	4582	25 %	0 %	50 %	25 %	452202849
72	NC_020386	GCGG	2	8	4630	4637	0 %	0 %	75 %	25 %	452202849
73	NC_020386	GGC	2	6	4651	4656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202849
74	NC_020386	ATC	2	6	4687	4692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202849
75	NC_020386	TTC	2	6	4699	4704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202849
76	NC_020386	ACGT	2	8	4840	4847	25 %	25 %	25 %	25 %	452202849
77	NC_020386	CCG	2	6	4952	4957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202849
78	NC_020386	T	6	6	5050	5055	0 %	100 %	0 %	0 %	452202849
79	NC_020386	TA	3	6	5059	5064	50 %	50 %	0 %	0 %	452202849
80	NC_020386	ACC	2	6	5125	5130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202849
81	NC_020386	TAA	2	6	5138	5143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202849
82	NC_020386	TCG	2	6	5165	5170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202849
83	NC_020386	AT	3	6	5174	5179	50 %	50 %	0 %	0 %	452202849
84	NC_020386	TTG	2	6	5192	5197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202849
85	NC_020386	GTCA	2	8	5221	5228	25 %	25 %	25 %	25 %	452202849
86	NC_020386	GTG	2	6	5249	5254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202849
87	NC_020386	GTG	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202849
88	NC_020386	CTT	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202849
89	NC_020386	CCG	2	6	5444	5449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202849
90	NC_020386	GCC	2	6	5467	5472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202849
91	NC_020386	GTA	2	6	5528	5533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202849
92	NC_020386	TTA	2	6	6060	6065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202850
93	NC_020386	GTG	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202850
94	NC_020386	T	6	6	6192	6197	0 %	100 %	0 %	0 %	452202850
95	NC_020386	ACCC	2	8	6232	6239	25 %	0 %	0 %	75 %	452202850
96	NC_020386	TTC	2	6	6277	6282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202850
97	NC_020386	TC	3	6	6313	6318	0 %	50 %	0 %	50 %	452202850
98	NC_020386	TTC	2	6	6322	6327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202850
99	NC_020386	TAT	2	6	6394	6399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202850
100	NC_020386	GCA	2	6	6421	6426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202850
101	NC_020386	AGGT	2	8	6483	6490	25 %	25 %	50 %	0 %	452202850
102	NC_020386	TGG	2	6	6492	6497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202850
103	NC_020386	G	6	6	6505	6510	0 %	0 %	100 %	0 %	452202850
104	NC_020386	ACC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202850
105	NC_020386	CTG	2	6	6532	6537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202850
106	NC_020386	GAG	2	6	6541	6546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202850
107	NC_020386	TGA	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202850
108	NC_020386	GTTC	2	8	6716	6723	0 %	50 %	25 %	25 %	452202850
109	NC_020386	CTT	2	6	6727	6732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202850
110	NC_020386	TCTT	2	8	6818	6825	0 %	75 %	0 %	25 %	452202850
111	NC_020386	GGT	2	6	6826	6831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202850
112	NC_020386	ACC	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202850
113	NC_020386	T	6	6	6854	6859	0 %	100 %	0 %	0 %	452202850
114	NC_020386	AAAGAC	2	12	6997	7008	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	452202850
115	NC_020386	TTC	2	6	7048	7053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202850
116	NC_020386	TCT	2	6	7124	7129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202850
117	NC_020386	CGG	2	6	7134	7139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202850
118	NC_020386	GGC	2	6	7156	7161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202850
119	NC_020386	CGG	2	6	7239	7244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202850
120	NC_020386	GTTTG	2	10	7264	7273	0 %	60 %	40 %	0 %	452202850
121	NC_020386	ATC	2	6	7288	7293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202850
122	NC_020386	GGC	2	6	7467	7472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202850
123	NC_020386	T	8	8	7496	7503	0 %	100 %	0 %	0 %	452202850
124	NC_020386	AT	3	6	7678	7683	50 %	50 %	0 %	0 %	452202850
125	NC_020386	GCG	2	6	7708	7713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202850
126	NC_020386	CCA	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202850
127	NC_020386	GCC	2	6	7849	7854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202850
128	NC_020386	TCT	2	6	7868	7873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202850
129	NC_020386	T	6	6	7945	7950	0 %	100 %	0 %	0 %	452202850
130	NC_020386	GGC	2	6	8017	8022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202850
131	NC_020386	GCG	2	6	8114	8119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202850
132	NC_020386	CCT	2	6	8133	8138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202850
133	NC_020386	G	6	6	8159	8164	0 %	0 %	100 %	0 %	452202850
134	NC_020386	AGA	2	6	8356	8361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202851
135	NC_020386	CAA	2	6	8402	8407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202851
136	NC_020386	GCC	2	6	8408	8413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202851
137	NC_020386	GCC	2	6	8420	8425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202851
138	NC_020386	GCATG	2	10	8605	8614	20 %	20 %	40 %	20 %	452202851
139	NC_020386	TTA	2	6	8641	8646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202851
140	NC_020386	ATA	2	6	8756	8761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202851
141	NC_020386	CTG	2	6	8786	8791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202851
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143	NC_020386	TAC	2	6	8873	8878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202851
144	NC_020386	CTG	2	6	8942	8947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202851
145	NC_020386	GCC	2	6	9036	9041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202851
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147	NC_020386	GGC	3	9	9170	9178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202851
148	NC_020386	ATT	2	6	9257	9262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202851
149	NC_020386	GA	3	6	9333	9338	50 %	0 %	50 %	0 %	452202851
150	NC_020386	GCTCA	2	10	9428	9437	20 %	20 %	20 %	40 %	452202851
151	NC_020386	GGT	2	6	9466	9471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202851
152	NC_020386	GAA	3	9	9482	9490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202851
153	NC_020386	TTC	2	6	9510	9515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202851
154	NC_020386	GAAG	2	8	9523	9530	50 %	0 %	50 %	0 %	452202851
155	NC_020386	GGCA	2	8	9534	9541	25 %	0 %	50 %	25 %	452202851
156	NC_020386	AAG	2	6	9575	9580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202851
157	NC_020386	A	6	6	9591	9596	100 %	0 %	0 %	0 %	452202852
158	NC_020386	CGG	2	6	9609	9614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202852
159	NC_020386	TGC	2	6	9644	9649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202852
160	NC_020386	GGC	2	6	9682	9687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202852
161	NC_020386	AGA	2	6	9774	9779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202852
162	NC_020386	AAG	2	6	9794	9799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202852
163	NC_020386	TAG	2	6	9818	9823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202852
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165	NC_020386	TGC	2	6	9867	9872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202852
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167	NC_020386	TCA	2	6	10029	10034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202852
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172	NC_020386	CTT	2	6	10525	10530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202852
173	NC_020386	TAG	2	6	10568	10573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202852
174	NC_020386	CGC	2	6	10606	10611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202852
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176	NC_020386	TGG	2	6	10655	10660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202852
177	NC_020386	A	6	6	10670	10675	100 %	0 %	0 %	0 %	452202852
178	NC_020386	TGG	2	6	10706	10711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202852
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188	NC_020386	C	6	6	11271	11276	0 %	0 %	0 %	100 %	452202853
189	NC_020386	CCCG	2	8	11294	11301	0 %	0 %	25 %	75 %	452202853
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202	NC_020386	AT	5	10	12033	12042	50 %	50 %	0 %	0 %	452202854
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214	NC_020386	GGT	2	6	12758	12763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202855
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216	NC_020386	GA	3	6	12843	12848	50 %	0 %	50 %	0 %	452202855
217	NC_020386	CTTAG	2	10	12852	12861	20 %	40 %	20 %	20 %	452202855
218	NC_020386	GTCT	2	8	12887	12894	0 %	50 %	25 %	25 %	452202855
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223	NC_020386	TATC	2	8	13048	13055	25 %	50 %	0 %	25 %	452202855
224	NC_020386	T	7	7	13081	13087	0 %	100 %	0 %	0 %	452202855
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230	NC_020386	AAGG	2	8	13352	13359	50 %	0 %	50 %	0 %	452202855
231	NC_020386	AATA	2	8	13427	13434	75 %	25 %	0 %	0 %	452202855
232	NC_020386	GGC	3	9	13511	13519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202855
233	NC_020386	TAC	2	6	13520	13525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202855
234	NC_020386	CCG	2	6	13529	13534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202855
235	NC_020386	CTA	2	6	13549	13554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202855
236	NC_020386	A	6	6	13604	13609	100 %	0 %	0 %	0 %	452202855
237	NC_020386	TAG	2	6	13702	13707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202856
238	NC_020386	GGT	2	6	13710	13715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202856
239	NC_020386	GCAG	2	8	13725	13732	25 %	0 %	50 %	25 %	452202856
240	NC_020386	CCG	2	6	13778	13783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202856
241	NC_020386	GGGGT	2	10	13786	13795	0 %	20 %	80 %	0 %	452202856
242	NC_020386	CGG	2	6	13951	13956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202857
243	NC_020386	ATA	2	6	14022	14027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202857
244	NC_020386	T	6	6	14138	14143	0 %	100 %	0 %	0 %	452202857
245	NC_020386	CTG	2	6	14153	14158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202857
246	NC_020386	CACC	2	8	14164	14171	25 %	0 %	0 %	75 %	452202857
247	NC_020386	CCA	2	6	14218	14223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202857
248	NC_020386	AG	3	6	14349	14354	50 %	0 %	50 %	0 %	452202857
249	NC_020386	ATTT	2	8	14552	14559	25 %	75 %	0 %	0 %	452202857
250	NC_020386	TCGGG	2	10	14641	14650	0 %	20 %	60 %	20 %	452202857
251	NC_020386	TG	3	6	14719	14724	0 %	50 %	50 %	0 %	452202857
252	NC_020386	GAA	2	6	14868	14873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202858
253	NC_020386	CTG	2	6	15061	15066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202858
254	NC_020386	GTGAA	2	10	15212	15221	40 %	20 %	40 %	0 %	452202858
255	NC_020386	AAG	2	6	15283	15288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202858
256	NC_020386	ACTGGA	2	12	15294	15305	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452202858
257	NC_020386	GCA	2	6	15311	15316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202858
258	NC_020386	GAA	2	6	15451	15456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202858
259	NC_020386	CTGAA	2	10	15485	15494	40 %	20 %	20 %	20 %	452202858
260	NC_020386	TTC	2	6	15537	15542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202858
261	NC_020386	TCTA	2	8	15623	15630	25 %	50 %	0 %	25 %	452202859
262	NC_020386	TTA	2	6	15691	15696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202859
263	NC_020386	AG	3	6	15713	15718	50 %	0 %	50 %	0 %	452202859
264	NC_020386	TTA	2	6	15766	15771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202859
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270	NC_020386	TA	3	6	16296	16301	50 %	50 %	0 %	0 %	452202859
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389	NC_020386	GCCA	2	8	23249	23256	25 %	0 %	25 %	50 %	452202868
390	NC_020386	GA	3	6	23267	23272	50 %	0 %	50 %	0 %	452202868
391	NC_020386	A	6	6	23276	23281	100 %	0 %	0 %	0 %	452202868
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393	NC_020386	T	8	8	23310	23317	0 %	100 %	0 %	0 %	452202868
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