MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides mccartyi DCMB5

Total Repeats: 23334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_020386	CAG	2	6	1215315	1215320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204086
20003	NC_020386	CGG	2	6	1215382	1215387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204087
20004	NC_020386	CCAG	2	8	1215431	1215438	25 %	0 %	25 %	50 %	452204087
20005	NC_020386	TATCCA	2	12	1215602	1215613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204087
20006	NC_020386	TAC	2	6	1215678	1215683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204087
20007	NC_020386	CCCAG	2	10	1215767	1215776	20 %	0 %	20 %	60 %	452204087
20008	NC_020386	AAT	2	6	1215779	1215784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204087
20009	NC_020386	CCG	2	6	1215828	1215833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204087
20010	NC_020386	CAG	2	6	1215903	1215908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204087
20011	NC_020386	TTC	2	6	1215909	1215914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204087
20012	NC_020386	CAT	2	6	1215915	1215920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204087
20013	NC_020386	T	6	6	1215971	1215976	0 %	100 %	0 %	0 %	452204087
20014	NC_020386	CAG	2	6	1216041	1216046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204087
20015	NC_020386	GCA	2	6	1216206	1216211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204087
20016	NC_020386	GTC	2	6	1216368	1216373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204087
20017	NC_020386	CTG	3	9	1216394	1216402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204087
20018	NC_020386	CTT	2	6	1216457	1216462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204087
20019	NC_020386	GGT	2	6	1216472	1216477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204087
20020	NC_020386	CTG	2	6	1216509	1216514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204087
20021	NC_020386	GGC	2	6	1216557	1216562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204087
20022	NC_020386	TTC	2	6	1216575	1216580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204087
20023	NC_020386	CCG	2	6	1216678	1216683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204087
20024	NC_020386	TCG	2	6	1216702	1216707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204087
20025	NC_020386	T	7	7	1216728	1216734	0 %	100 %	0 %	0 %	452204087
20026	NC_020386	AT	3	6	1216735	1216740	50 %	50 %	0 %	0 %	452204087
20027	NC_020386	TTAC	2	8	1216741	1216748	25 %	50 %	0 %	25 %	452204087
20028	NC_020386	T	6	6	1216937	1216942	0 %	100 %	0 %	0 %	452204088
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20031	NC_020386	CGC	2	6	1217084	1217089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204088
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20034	NC_020386	CGG	2	6	1217252	1217257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204088
20035	NC_020386	AT	3	6	1217286	1217291	50 %	50 %	0 %	0 %	452204088
20036	NC_020386	G	6	6	1217360	1217365	0 %	0 %	100 %	0 %	452204088
20037	NC_020386	TTA	2	6	1217395	1217400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452204088
20038	NC_020386	GAT	2	6	1217515	1217520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204089
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20040	NC_020386	CTGC	2	8	1217641	1217648	0 %	25 %	25 %	50 %	452204089
20041	NC_020386	C	6	6	1217715	1217720	0 %	0 %	0 %	100 %	452204089
20042	NC_020386	CCGG	2	8	1217733	1217740	0 %	0 %	50 %	50 %	452204089
20043	NC_020386	C	8	8	1217791	1217798	0 %	0 %	0 %	100 %	452204089
20044	NC_020386	A	6	6	1217836	1217841	100 %	0 %	0 %	0 %	452204089
20045	NC_020386	TGC	2	6	1217859	1217864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204089
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20053	NC_020386	A	6	6	1218258	1218263	100 %	0 %	0 %	0 %	452204089
20054	NC_020386	GCA	2	6	1218270	1218275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204089
20055	NC_020386	A	6	6	1218281	1218286	100 %	0 %	0 %	0 %	452204089
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20117	NC_020386	ATG	2	6	1221328	1221333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204092
20118	NC_020386	CCG	2	6	1221334	1221339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204092
20119	NC_020386	AAT	2	6	1221444	1221449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204092
20120	NC_020386	TCC	2	6	1221477	1221482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452204092
20121	NC_020386	CCG	2	6	1221498	1221503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204092
20122	NC_020386	GCC	2	6	1221525	1221530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204092
20123	NC_020386	CCT	2	6	1221538	1221543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452204092
20124	NC_020386	GCAA	2	8	1221568	1221575	50 %	0 %	25 %	25 %	452204092
20125	NC_020386	AAT	2	6	1222112	1222117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204093
20126	NC_020386	ATC	2	6	1222194	1222199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204093
20127	NC_020386	CGC	2	6	1222208	1222213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204093
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20129	NC_020386	GGT	2	6	1222332	1222337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204093
20130	NC_020386	GGC	2	6	1222353	1222358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204093
20131	NC_020386	AT	3	6	1222364	1222369	50 %	50 %	0 %	0 %	452204093
20132	NC_020386	CAT	2	6	1222370	1222375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204093
20133	NC_020386	GCC	2	6	1222686	1222691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204094
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20137	NC_020386	CAG	2	6	1222860	1222865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204094
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20139	NC_020386	CCA	2	6	1223086	1223091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204094
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20141	NC_020386	A	6	6	1223146	1223151	100 %	0 %	0 %	0 %	452204094
20142	NC_020386	TGAAGC	2	12	1223195	1223206	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452204094
20143	NC_020386	CAA	2	6	1223225	1223230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452204094
20144	NC_020386	GGT	2	6	1223322	1223327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204094
20145	NC_020386	GCCG	2	8	1223346	1223353	0 %	0 %	50 %	50 %	452204094
20146	NC_020386	ACC	2	6	1223421	1223426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204094
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20149	NC_020386	CGG	2	6	1223552	1223557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204094
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20152	NC_020386	GCC	2	6	1223646	1223651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204094
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20154	NC_020386	CGG	3	9	1223672	1223680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204094
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20174	NC_020386	CATGCT	2	12	1225005	1225016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452204095
20175	NC_020386	TTCT	2	8	1225041	1225048	0 %	75 %	0 %	25 %	452204095
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20177	NC_020386	CGGT	2	8	1225156	1225163	0 %	25 %	50 %	25 %	452204095
20178	NC_020386	ACC	2	6	1225179	1225184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204095
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20180	NC_020386	ACCC	2	8	1225302	1225309	25 %	0 %	0 %	75 %	452204095
20181	NC_020386	TA	4	8	1225311	1225318	50 %	50 %	0 %	0 %	452204095
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20183	NC_020386	TGG	2	6	1225351	1225356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204095
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20191	NC_020386	GAT	2	6	1225849	1225854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204096
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20193	NC_020386	ATGTC	2	10	1225950	1225959	20 %	40 %	20 %	20 %	452204097
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20198	NC_020386	CCGG	2	8	1226222	1226229	0 %	0 %	50 %	50 %	452204097
20199	NC_020386	TGA	2	6	1226281	1226286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204097
20200	NC_020386	ACCA	2	8	1226290	1226297	50 %	0 %	0 %	50 %	452204097
20201	NC_020386	AAT	2	6	1226422	1226427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204097
20202	NC_020386	AAAC	2	8	1226519	1226526	75 %	0 %	0 %	25 %	452204098
20203	NC_020386	GGGT	2	8	1226565	1226572	0 %	25 %	75 %	0 %	452204098
20204	NC_020386	GTTT	2	8	1226581	1226588	0 %	75 %	25 %	0 %	452204098
20205	NC_020386	GCC	2	6	1226597	1226602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204098
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20207	NC_020386	GCAGG	2	10	1226666	1226675	20 %	0 %	60 %	20 %	452204098
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20209	NC_020386	TCAG	2	8	1226719	1226726	25 %	25 %	25 %	25 %	452204098
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20213	NC_020386	CCG	2	6	1226881	1226886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204098
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20218	NC_020386	TGCC	2	8	1227055	1227062	0 %	25 %	25 %	50 %	452204098
20219	NC_020386	CTGG	2	8	1227082	1227089	0 %	25 %	50 %	25 %	452204098
20220	NC_020386	CTG	2	6	1227194	1227199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204098
20221	NC_020386	GCC	2	6	1227200	1227205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204098
20222	NC_020386	GCC	2	6	1227252	1227257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204098
20223	NC_020386	GAA	2	6	1227293	1227298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204098
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20226	NC_020386	CGC	2	6	1227352	1227357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204098
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20228	NC_020386	CT	3	6	1227440	1227445	0 %	50 %	0 %	50 %	452204098
20229	NC_020386	CCA	2	6	1227457	1227462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204098
20230	NC_020386	CTT	2	6	1227467	1227472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204098
20231	NC_020386	AAAC	2	8	1227481	1227488	75 %	0 %	0 %	25 %	452204098
20232	NC_020386	ATT	2	6	1227576	1227581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452204098
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20234	NC_020386	CTGC	2	8	1227754	1227761	0 %	25 %	25 %	50 %	452204098
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20350	NC_020386	CAC	2	6	1236478	1236483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204111
20351	NC_020386	TGT	2	6	1236516	1236521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452204111
20352	NC_020386	GGT	2	6	1236523	1236528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204111
20353	NC_020386	TCA	2	6	1236536	1236541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204111
20354	NC_020386	CCG	2	6	1236582	1236587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204111
20355	NC_020386	T	7	7	1236635	1236641	0 %	100 %	0 %	0 %	452204111
20356	NC_020386	AT	3	6	1236789	1236794	50 %	50 %	0 %	0 %	452204111
20357	NC_020386	CTG	2	6	1236823	1236828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204111
20358	NC_020386	GGT	2	6	1236865	1236870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204111
20359	NC_020386	CAG	2	6	1236928	1236933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204111
20360	NC_020386	CTA	2	6	1237125	1237130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204111
20361	NC_020386	TTC	2	6	1237132	1237137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204111
20362	NC_020386	TTC	2	6	1237147	1237152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204111
20363	NC_020386	AC	3	6	1237214	1237219	50 %	0 %	0 %	50 %	452204111
20364	NC_020386	ATTC	2	8	1237266	1237273	25 %	50 %	0 %	25 %	452204111
20365	NC_020386	TTC	2	6	1237303	1237308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204111
20366	NC_020386	GCC	2	6	1237310	1237315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204111
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20372	NC_020386	TCA	2	6	1238143	1238148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204113
20373	NC_020386	AC	3	6	1238215	1238220	50 %	0 %	0 %	50 %	452204113
20374	NC_020386	A	7	7	1238289	1238295	100 %	0 %	0 %	0 %	452204113
20375	NC_020386	GAAA	2	8	1238378	1238385	75 %	0 %	25 %	0 %	452204113
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20379	NC_020386	CGG	2	6	1238582	1238587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204113
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20382	NC_020386	ATA	2	6	1238758	1238763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204114
20383	NC_020386	TCCC	2	8	1238783	1238790	0 %	25 %	0 %	75 %	452204114
20384	NC_020386	GCT	2	6	1238841	1238846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204114
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20386	NC_020386	CTG	2	6	1238983	1238988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204114
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20392	NC_020386	GCC	2	6	1239391	1239396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204114
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20399	NC_020386	CTGG	2	8	1239883	1239890	0 %	25 %	50 %	25 %	452204115
20400	NC_020386	GCCA	2	8	1240097	1240104	25 %	0 %	25 %	50 %	452204115
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20405	NC_020386	CATC	2	8	1240334	1240341	25 %	25 %	0 %	50 %	452204116
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20434	NC_020386	GCC	2	6	1241955	1241960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204119
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20437	NC_020386	CGG	2	6	1242325	1242330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204119
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20450	NC_020386	TCA	2	6	1242945	1242950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204121
20451	NC_020386	GCA	2	6	1242956	1242961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204121
20452	NC_020386	GGT	2	6	1243020	1243025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204121
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20454	NC_020386	GCTG	2	8	1243146	1243153	0 %	25 %	50 %	25 %	452204121
20455	NC_020386	T	6	6	1243180	1243185	0 %	100 %	0 %	0 %	452204121
20456	NC_020386	CTG	2	6	1243222	1243227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204121
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20458	NC_020386	CTT	2	6	1243284	1243289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204121
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20460	NC_020386	TTC	2	6	1243345	1243350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204121
20461	NC_020386	GGC	2	6	1243405	1243410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204121
20462	NC_020386	CGG	2	6	1243424	1243429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204121
20463	NC_020386	CCA	2	6	1243455	1243460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204121
20464	NC_020386	A	6	6	1243496	1243501	100 %	0 %	0 %	0 %	452204121
20465	NC_020386	GGA	2	6	1243552	1243557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452204121
20466	NC_020386	TTC	2	6	1243595	1243600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204122
20467	NC_020386	TGGA	2	8	1243723	1243730	25 %	25 %	50 %	0 %	452204122
20468	NC_020386	TCCCC	2	10	1243732	1243741	0 %	20 %	0 %	80 %	452204122
20469	NC_020386	CTA	2	6	1243768	1243773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204122
20470	NC_020386	CCAGTT	2	12	1243795	1243806	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452204122
20471	NC_020386	ATT	2	6	1243821	1243826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452204122
20472	NC_020386	GCA	2	6	1243858	1243863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204123
20473	NC_020386	T	6	6	1243870	1243875	0 %	100 %	0 %	0 %	452204123
20474	NC_020386	ATAC	2	8	1244041	1244048	50 %	25 %	0 %	25 %	452204123
20475	NC_020386	G	6	6	1244102	1244107	0 %	0 %	100 %	0 %	452204123
20476	NC_020386	T	6	6	1244130	1244135	0 %	100 %	0 %	0 %	452204123
20477	NC_020386	CTC	2	6	1244232	1244237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452204123
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20480	NC_020386	ATCT	2	8	1244406	1244413	25 %	50 %	0 %	25 %	452204123
20481	NC_020386	TACC	2	8	1244486	1244493	25 %	25 %	0 %	50 %	452204123
20482	NC_020386	GGT	2	6	1244523	1244528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204123
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20484	NC_020386	GCTG	2	8	1244576	1244583	0 %	25 %	50 %	25 %	452204123
20485	NC_020386	TAG	2	6	1244597	1244602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204123
20486	NC_020386	TCT	2	6	1244621	1244626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204123
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20493	NC_020386	GCC	2	6	1244851	1244856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204123
20494	NC_020386	T	7	7	1244870	1244876	0 %	100 %	0 %	0 %	452204123
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20497	NC_020386	ACC	2	6	1244980	1244985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204123
20498	NC_020386	TCACA	2	10	1244993	1245002	40 %	20 %	0 %	40 %	452204123
20499	NC_020386	TA	3	6	1245024	1245029	50 %	50 %	0 %	0 %	452204123
20500	NC_020386	CGG	2	6	1245218	1245223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204123

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