MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 62685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_020055	TTC	2	6	2629249	2629254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842220
44503	NC_020055	CTT	2	6	2629293	2629298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842220
44504	NC_020055	T	6	6	2629510	2629515	0 %	100 %	0 %	0 %	436842220
44505	NC_020055	CAT	2	6	2629826	2629831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842221
44506	NC_020055	T	6	6	2629848	2629853	0 %	100 %	0 %	0 %	436842221
44507	NC_020055	AGC	2	6	2629887	2629892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842221
44508	NC_020055	TCG	2	6	2629897	2629902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842221
44509	NC_020055	ATC	2	6	2629944	2629949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842221
44510	NC_020055	CAG	2	6	2629970	2629975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842221
44511	NC_020055	AAG	2	6	2630038	2630043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842221
44512	NC_020055	GAA	2	6	2630067	2630072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842221
44513	NC_020055	AGAC	2	8	2630088	2630095	50 %	0 %	25 %	25 %	436842221
44514	NC_020055	CTG	2	6	2630115	2630120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842221
44515	NC_020055	ACC	2	6	2630154	2630159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842221
44516	NC_020055	AGT	2	6	2630162	2630167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842221
44517	NC_020055	TTG	2	6	2630188	2630193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842221
44518	NC_020055	CAG	2	6	2630256	2630261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842221
44519	NC_020055	AAG	2	6	2630408	2630413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842221
44520	NC_020055	CCA	2	6	2630421	2630426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842221
44521	NC_020055	TTG	2	6	2630440	2630445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842221
44522	NC_020055	AGC	2	6	2630565	2630570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842221
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44524	NC_020055	CAA	2	6	2630702	2630707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842221
44525	NC_020055	AGC	2	6	2630751	2630756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842221
44526	NC_020055	CAGG	2	8	2630759	2630766	25 %	0 %	50 %	25 %	436842221
44527	NC_020055	AGA	2	6	2630856	2630861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842221
44528	NC_020055	GGA	2	6	2630865	2630870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436842221
44529	NC_020055	GTCAGA	2	12	2630874	2630885	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436842221
44530	NC_020055	GAAAC	2	10	2630946	2630955	60 %	0 %	20 %	20 %	436842221
44531	NC_020055	GTT	2	6	2631003	2631008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842221
44532	NC_020055	CAGA	2	8	2631014	2631021	50 %	0 %	25 %	25 %	436842221
44533	NC_020055	TGT	2	6	2631029	2631034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842221
44534	NC_020055	CTGGAA	2	12	2631048	2631059	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436842221
44535	NC_020055	T	6	6	2631144	2631149	0 %	100 %	0 %	0 %	436842221
44536	NC_020055	GT	3	6	2631495	2631500	0 %	50 %	50 %	0 %	436842222
44537	NC_020055	TAT	2	6	2631526	2631531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842222
44538	NC_020055	AT	3	6	2631530	2631535	50 %	50 %	0 %	0 %	436842222
44539	NC_020055	AATT	2	8	2631628	2631635	50 %	50 %	0 %	0 %	436842222
44540	NC_020055	AAG	2	6	2631666	2631671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842222
44541	NC_020055	A	6	6	2631698	2631703	100 %	0 %	0 %	0 %	436842222
44542	NC_020055	ACA	2	6	2631717	2631722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842222
44543	NC_020055	GAT	2	6	2631734	2631739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842222
44544	NC_020055	T	6	6	2631851	2631856	0 %	100 %	0 %	0 %	436842222
44545	NC_020055	GC	3	6	2631857	2631862	0 %	0 %	50 %	50 %	436842222
44546	NC_020055	AGC	2	6	2632117	2632122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842222
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44548	NC_020055	TGAA	2	8	2632182	2632189	50 %	25 %	25 %	0 %	436842222
44549	NC_020055	CTT	2	6	2632247	2632252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842222
44550	NC_020055	A	8	8	2632280	2632287	100 %	0 %	0 %	0 %	436842222
44551	NC_020055	GAA	2	6	2632313	2632318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842222
44552	NC_020055	GCT	2	6	2632384	2632389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842222
44553	NC_020055	GAAGA	2	10	2632481	2632490	60 %	0 %	40 %	0 %	436842222
44554	NC_020055	A	6	6	2632510	2632515	100 %	0 %	0 %	0 %	436842222
44555	NC_020055	AGAAA	2	10	2632534	2632543	80 %	0 %	20 %	0 %	436842222
44556	NC_020055	ATA	2	6	2632548	2632553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842222
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44558	NC_020055	GGTA	2	8	2632648	2632655	25 %	25 %	50 %	0 %	436842222
44559	NC_020055	TGA	2	6	2632732	2632737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842222
44560	NC_020055	CGC	2	6	2632741	2632746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842222
44561	NC_020055	GATT	2	8	2632771	2632778	25 %	50 %	25 %	0 %	436842222
44562	NC_020055	CCG	2	6	2632784	2632789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842222
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44565	NC_020055	ATC	2	6	2632965	2632970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842222
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44568	NC_020055	A	6	6	2633069	2633074	100 %	0 %	0 %	0 %	436842222
44569	NC_020055	AAG	2	6	2633166	2633171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842222
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44571	NC_020055	ATG	2	6	2633232	2633237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842222
44572	NC_020055	ATG	2	6	2633251	2633256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842222
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44577	NC_020055	TCA	2	6	2633695	2633700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842223
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44588	NC_020055	GGA	2	6	2634170	2634175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436842224
44589	NC_020055	ATC	2	6	2634179	2634184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842224
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44597	NC_020055	T	7	7	2634655	2634661	0 %	100 %	0 %	0 %	436842224
44598	NC_020055	GAT	2	6	2634992	2634997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842225
44599	NC_020055	CTT	2	6	2634999	2635004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842225
44600	NC_020055	GGC	3	9	2635005	2635013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842225
44601	NC_020055	TTG	2	6	2635066	2635071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842225
44602	NC_020055	AGGA	2	8	2635237	2635244	50 %	0 %	50 %	0 %	436842225
44603	NC_020055	ACC	2	6	2635269	2635274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842225
44604	NC_020055	AGA	2	6	2635364	2635369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842225
44605	NC_020055	TGC	2	6	2635376	2635381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842225
44606	NC_020055	TGA	2	6	2635420	2635425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842225
44607	NC_020055	TCC	2	6	2635428	2635433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436842225
44608	NC_020055	ATT	2	6	2635474	2635479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842225
44609	NC_020055	CGG	2	6	2635499	2635504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842225
44610	NC_020055	TTG	2	6	2635540	2635545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842225
44611	NC_020055	CAGG	2	8	2635619	2635626	25 %	0 %	50 %	25 %	436842225
44612	NC_020055	GCAGCC	2	12	2635652	2635663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	436842225
44613	NC_020055	TGAC	2	8	2635666	2635673	25 %	25 %	25 %	25 %	436842225
44614	NC_020055	GGCG	2	8	2635725	2635732	0 %	0 %	75 %	25 %	436842225
44615	NC_020055	TGA	2	6	2635766	2635771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842225
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44852	NC_020055	T	6	6	2650015	2650020	0 %	100 %	0 %	0 %	436842242
44853	NC_020055	TTC	2	6	2650033	2650038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842242
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44952	NC_020055	TCT	2	6	2656487	2656492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842247
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44960	NC_020055	CAA	3	9	2657050	2657058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842248
44961	NC_020055	TGA	2	6	2657065	2657070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842248
44962	NC_020055	CTG	2	6	2657131	2657136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842248
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44964	NC_020055	CAG	2	6	2657300	2657305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842248
44965	NC_020055	GCACT	2	10	2657341	2657350	20 %	20 %	20 %	40 %	436842248
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44967	NC_020055	CGA	2	6	2657389	2657394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842248
44968	NC_020055	GAT	2	6	2657516	2657521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842248
44969	NC_020055	CCG	2	6	2657599	2657604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842248
44970	NC_020055	CCG	2	6	2657721	2657726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842248
44971	NC_020055	CAGG	2	8	2657777	2657784	25 %	0 %	50 %	25 %	436842248
44972	NC_020055	GAA	2	6	2657819	2657824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842248
44973	NC_020055	TGA	2	6	2657884	2657889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842248
44974	NC_020055	GC	3	6	2657920	2657925	0 %	0 %	50 %	50 %	436842248
44975	NC_020055	TCT	2	6	2658006	2658011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842248
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44980	NC_020055	TAATTT	2	12	2658363	2658374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842249
44981	NC_020055	ATC	2	6	2658386	2658391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842249
44982	NC_020055	GATGTT	2	12	2658394	2658405	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	436842249
44983	NC_020055	TCA	2	6	2658407	2658412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842249
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44985	NC_020055	TCA	2	6	2658689	2658694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842249
44986	NC_020055	AGT	2	6	2658752	2658757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842249
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44990	NC_020055	CGG	2	6	2659032	2659037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842249
44991	NC_020055	TCC	2	6	2659048	2659053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436842249
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44994	NC_020055	AGC	2	6	2659250	2659255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842249
44995	NC_020055	GAGT	2	8	2659297	2659304	25 %	25 %	50 %	0 %	436842249
44996	NC_020055	CATT	2	8	2659334	2659341	25 %	50 %	0 %	25 %	436842249
44997	NC_020055	AGAA	2	8	2659381	2659388	75 %	0 %	25 %	0 %	436842249
44998	NC_020055	GAGG	2	8	2659581	2659588	25 %	0 %	75 %	0 %	436842250
44999	NC_020055	TCAAT	2	10	2659607	2659616	40 %	40 %	0 %	20 %	436842250
45000	NC_020055	TGT	2	6	2659721	2659726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842250

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