MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 62685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020055	TGC	2	6	240598	240603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839960
4002	NC_020055	GAA	2	6	240647	240652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839960
4003	NC_020055	CTAA	2	8	240662	240669	50 %	25 %	0 %	25 %	436839960
4004	NC_020055	TTC	2	6	240786	240791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839960
4005	NC_020055	GTTGG	2	10	240820	240829	0 %	40 %	60 %	0 %	436839960
4006	NC_020055	G	6	6	240922	240927	0 %	0 %	100 %	0 %	436839960
4007	NC_020055	GCC	2	6	240962	240967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839960
4008	NC_020055	TTG	2	6	240993	240998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839960
4009	NC_020055	GAA	2	6	241069	241074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839960
4010	NC_020055	T	6	6	241117	241122	0 %	100 %	0 %	0 %	436839960
4011	NC_020055	GAT	2	6	241133	241138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839960
4012	NC_020055	GAGGAA	2	12	241139	241150	50 %	0 %	50 %	0 %	436839960
4013	NC_020055	A	7	7	241170	241176	100 %	0 %	0 %	0 %	436839960
4014	NC_020055	A	6	6	241184	241189	100 %	0 %	0 %	0 %	436839960
4015	NC_020055	GTT	2	6	241196	241201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839960
4016	NC_020055	TGA	2	6	241213	241218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839960
4017	NC_020055	TGC	2	6	241285	241290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839960
4018	NC_020055	GAC	2	6	241331	241336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839960
4019	NC_020055	ATA	2	6	241359	241364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839960
4020	NC_020055	T	7	7	241411	241417	0 %	100 %	0 %	0 %	436839960
4021	NC_020055	GAA	2	6	241421	241426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839960
4022	NC_020055	CAA	2	6	241471	241476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839960
4023	NC_020055	CAG	2	6	241499	241504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839960
4024	NC_020055	GCT	2	6	241541	241546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839960
4025	NC_020055	TCC	2	6	241548	241553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839960
4026	NC_020055	AAC	2	6	241562	241567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839960
4027	NC_020055	ATG	2	6	241599	241604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839961
4028	NC_020055	GTT	2	6	241758	241763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839961
4029	NC_020055	AAC	2	6	241933	241938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839961
4030	NC_020055	CTG	2	6	241995	242000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839962
4031	NC_020055	CCT	2	6	242446	242451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839963
4032	NC_020055	TGC	2	6	242475	242480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839963
4033	NC_020055	A	6	6	242528	242533	100 %	0 %	0 %	0 %	436839963
4034	NC_020055	GAA	2	6	242635	242640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839963
4035	NC_020055	T	6	6	242652	242657	0 %	100 %	0 %	0 %	436839963
4036	NC_020055	ATG	2	6	242678	242683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839963
4037	NC_020055	GTAG	2	8	242887	242894	25 %	25 %	50 %	0 %	436839963
4038	NC_020055	ACTCC	2	10	242927	242936	20 %	20 %	0 %	60 %	436839963
4039	NC_020055	GCA	2	6	242953	242958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839963
4040	NC_020055	TAC	2	6	243006	243011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839963
4041	NC_020055	GGT	2	6	243084	243089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839963
4042	NC_020055	GTT	2	6	243097	243102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839963
4043	NC_020055	A	6	6	243204	243209	100 %	0 %	0 %	0 %	436839964
4044	NC_020055	A	7	7	243239	243245	100 %	0 %	0 %	0 %	436839964
4045	NC_020055	A	6	6	243280	243285	100 %	0 %	0 %	0 %	436839964
4046	NC_020055	CTT	2	6	243820	243825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839965
4047	NC_020055	AT	3	6	243986	243991	50 %	50 %	0 %	0 %	436839965
4048	NC_020055	T	7	7	244389	244395	0 %	100 %	0 %	0 %	436839966
4049	NC_020055	GAA	2	6	244472	244477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839966
4050	NC_020055	A	6	6	244491	244496	100 %	0 %	0 %	0 %	436839966
4051	NC_020055	GTT	2	6	244518	244523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839966
4052	NC_020055	T	6	6	244522	244527	0 %	100 %	0 %	0 %	436839966
4053	NC_020055	T	7	7	244647	244653	0 %	100 %	0 %	0 %	436839966
4054	NC_020055	TAT	2	6	244675	244680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839967
4055	NC_020055	AT	3	6	244742	244747	50 %	50 %	0 %	0 %	436839967
4056	NC_020055	AGA	2	6	244767	244772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839967
4057	NC_020055	CTG	2	6	244801	244806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839967
4058	NC_020055	GAT	2	6	244827	244832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839967
4059	NC_020055	TTG	2	6	244834	244839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839967
4060	NC_020055	ACTG	2	8	244847	244854	25 %	25 %	25 %	25 %	436839967
4061	NC_020055	TCTTTA	2	12	245114	245125	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	436839968
4062	NC_020055	CAT	2	6	245169	245174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839968
4063	NC_020055	TAA	2	6	245277	245282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839968
4064	NC_020055	ACA	2	6	245350	245355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839968
4065	NC_020055	CATT	2	8	245357	245364	25 %	50 %	0 %	25 %	436839968
4066	NC_020055	A	8	8	245398	245405	100 %	0 %	0 %	0 %	436839968
4067	NC_020055	TTGC	2	8	245440	245447	0 %	50 %	25 %	25 %	436839968
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4069	NC_020055	A	7	7	245538	245544	100 %	0 %	0 %	0 %	436839968
4070	NC_020055	CAA	2	6	245616	245621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839968
4071	NC_020055	CAT	2	6	245640	245645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839968
4072	NC_020055	AGT	2	6	245754	245759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839968
4073	NC_020055	CAAC	2	8	245822	245829	50 %	0 %	0 %	50 %	436839968
4074	NC_020055	ATAAA	2	10	245861	245870	80 %	20 %	0 %	0 %	436839968
4075	NC_020055	GC	3	6	245894	245899	0 %	0 %	50 %	50 %	436839968
4076	NC_020055	GA	3	6	245902	245907	50 %	0 %	50 %	0 %	436839968
4077	NC_020055	TAA	2	6	245952	245957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839968
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4079	NC_020055	TAT	2	6	246155	246160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839969
4080	NC_020055	AAT	2	6	246205	246210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839969
4081	NC_020055	T	7	7	246212	246218	0 %	100 %	0 %	0 %	436839969
4082	NC_020055	AGC	2	6	246261	246266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839969
4083	NC_020055	TACA	2	8	246339	246346	50 %	25 %	0 %	25 %	436839969
4084	NC_020055	AAG	2	6	246429	246434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839969
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4086	NC_020055	AGT	2	6	246471	246476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839969
4087	NC_020055	TTAT	2	8	246484	246491	25 %	75 %	0 %	0 %	436839969
4088	NC_020055	AGT	2	6	246547	246552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839970
4089	NC_020055	A	7	7	246703	246709	100 %	0 %	0 %	0 %	436839970
4090	NC_020055	A	8	8	246766	246773	100 %	0 %	0 %	0 %	436839970
4091	NC_020055	TCA	2	6	246873	246878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839970
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4093	NC_020055	TTA	2	6	246953	246958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839970
4094	NC_020055	AG	3	6	247002	247007	50 %	0 %	50 %	0 %	436839970
4095	NC_020055	TTA	2	6	247017	247022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839970
4096	NC_020055	AGG	2	6	247072	247077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839970
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4100	NC_020055	TTA	2	6	247169	247174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839970
4101	NC_020055	ACT	2	6	247323	247328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839971
4102	NC_020055	A	6	6	247331	247336	100 %	0 %	0 %	0 %	436839971
4103	NC_020055	AAC	2	6	247366	247371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839971
4104	NC_020055	CAA	2	6	247410	247415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839971
4105	NC_020055	TTAA	2	8	247451	247458	50 %	50 %	0 %	0 %	436839971
4106	NC_020055	ACAGT	2	10	247472	247481	40 %	20 %	20 %	20 %	436839971
4107	NC_020055	GCG	2	6	247630	247635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839972
4108	NC_020055	ATC	2	6	247638	247643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839972
4109	NC_020055	CCGGG	2	10	247680	247689	0 %	0 %	60 %	40 %	436839972
4110	NC_020055	GGT	2	6	247742	247747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839972
4111	NC_020055	GGT	2	6	247854	247859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839972
4112	NC_020055	GAAAAA	2	12	247934	247945	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	436839972
4113	NC_020055	TGAT	2	8	247963	247970	25 %	50 %	25 %	0 %	436839972
4114	NC_020055	GGAT	2	8	248012	248019	25 %	25 %	50 %	0 %	436839972
4115	NC_020055	GAA	2	6	248028	248033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839972
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4117	NC_020055	AAT	2	6	248087	248092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839972
4118	NC_020055	TCT	2	6	248126	248131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839972
4119	NC_020055	CACT	2	8	248197	248204	25 %	25 %	0 %	50 %	436839972
4120	NC_020055	GAG	2	6	248283	248288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839972
4121	NC_020055	AAT	2	6	248336	248341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839972
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4123	NC_020055	GAA	2	6	248411	248416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839972
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4493	NC_020055	AAT	2	6	271839	271844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839998
4494	NC_020055	AGC	2	6	271908	271913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839998
4495	NC_020055	AAC	2	6	271937	271942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839998
4496	NC_020055	TAA	2	6	271988	271993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839998
4497	NC_020055	AT	3	6	272036	272041	50 %	50 %	0 %	0 %	436839998
4498	NC_020055	AAT	2	6	272081	272086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839998
4499	NC_020055	TGC	2	6	272189	272194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839998
4500	NC_020055	AAGAT	2	10	272213	272222	60 %	20 %	20 %	0 %	436839998

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