MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 62685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020055	TTC	2	6	93140	93145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839804
1502	NC_020055	GAT	2	6	93149	93154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839804
1503	NC_020055	TGG	2	6	93193	93198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839804
1504	NC_020055	TTC	2	6	93365	93370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839804
1505	NC_020055	AAG	2	6	93380	93385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839804
1506	NC_020055	GGA	2	6	93459	93464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839804
1507	NC_020055	GACCG	2	10	93488	93497	20 %	0 %	40 %	40 %	436839804
1508	NC_020055	GTT	2	6	93519	93524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839804
1509	NC_020055	GCGT	2	8	93632	93639	0 %	25 %	50 %	25 %	436839804
1510	NC_020055	TCA	2	6	93684	93689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839804
1511	NC_020055	CCG	2	6	93708	93713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839804
1512	NC_020055	CAG	2	6	93748	93753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839804
1513	NC_020055	TGG	2	6	93778	93783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839804
1514	NC_020055	CAG	2	6	93805	93810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839804
1515	NC_020055	CCG	3	9	93813	93821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839804
1516	NC_020055	TTCG	2	8	94234	94241	0 %	50 %	25 %	25 %	436839805
1517	NC_020055	AGCA	2	8	94312	94319	50 %	0 %	25 %	25 %	436839805
1518	NC_020055	GATG	2	8	94327	94334	25 %	25 %	50 %	0 %	436839805
1519	NC_020055	GTTTT	2	10	94352	94361	0 %	80 %	20 %	0 %	436839805
1520	NC_020055	CAG	2	6	94389	94394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839805
1521	NC_020055	AGCA	2	8	94402	94409	50 %	0 %	25 %	25 %	436839805
1522	NC_020055	TGC	2	6	94480	94485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839805
1523	NC_020055	TCCA	2	8	94511	94518	25 %	25 %	0 %	50 %	436839805
1524	NC_020055	TTTCA	2	10	94549	94558	20 %	60 %	0 %	20 %	436839805
1525	NC_020055	T	6	6	94569	94574	0 %	100 %	0 %	0 %	436839805
1526	NC_020055	CAGC	2	8	94581	94588	25 %	0 %	25 %	50 %	436839805
1527	NC_020055	AAT	2	6	94705	94710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839805
1528	NC_020055	GCA	2	6	94712	94717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839805
1529	NC_020055	ATC	2	6	94730	94735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839805
1530	NC_020055	GAG	2	6	94747	94752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839805
1531	NC_020055	TG	3	6	94814	94819	0 %	50 %	50 %	0 %	436839805
1532	NC_020055	TTC	2	6	94831	94836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839805
1533	NC_020055	ATT	2	6	95252	95257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839806
1534	NC_020055	ATTT	2	8	95290	95297	25 %	75 %	0 %	0 %	436839806
1535	NC_020055	GCA	2	6	95324	95329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839806
1536	NC_020055	CAG	2	6	95379	95384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839806
1537	NC_020055	AT	3	6	95392	95397	50 %	50 %	0 %	0 %	436839806
1538	NC_020055	GTGG	2	8	95438	95445	0 %	25 %	75 %	0 %	436839806
1539	NC_020055	ATG	2	6	95477	95482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839806
1540	NC_020055	ATG	2	6	95516	95521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839806
1541	NC_020055	TGC	2	6	95554	95559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839806
1542	NC_020055	TGC	2	6	95592	95597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839806
1543	NC_020055	ATTC	2	8	95615	95622	25 %	50 %	0 %	25 %	436839806
1544	NC_020055	TCTTGC	2	12	95626	95637	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	436839806
1545	NC_020055	TGAC	2	8	95703	95710	25 %	25 %	25 %	25 %	436839806
1546	NC_020055	AT	3	6	95746	95751	50 %	50 %	0 %	0 %	436839806
1547	NC_020055	GTC	2	6	95756	95761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839806
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1549	NC_020055	TTG	2	6	95853	95858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839806
1550	NC_020055	CTGC	2	8	95978	95985	0 %	25 %	25 %	50 %	436839806
1551	NC_020055	CG	3	6	96035	96040	0 %	0 %	50 %	50 %	436839806
1552	NC_020055	GGC	2	6	96067	96072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839806
1553	NC_020055	TGA	2	6	96079	96084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839806
1554	NC_020055	CTT	2	6	96243	96248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839806
1555	NC_020055	GCTGGG	2	12	96292	96303	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	436839806
1556	NC_020055	ACTGA	2	10	96359	96368	40 %	20 %	20 %	20 %	436839806
1557	NC_020055	TGC	2	6	96384	96389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839806
1558	NC_020055	TGA	2	6	96621	96626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839807
1559	NC_020055	CTG	2	6	96660	96665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839807
1560	NC_020055	GAA	2	6	96746	96751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839807
1561	NC_020055	TGATAT	2	12	96766	96777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	436839807
1562	NC_020055	GGC	2	6	96820	96825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839807
1563	NC_020055	CGT	2	6	96827	96832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839807
1564	NC_020055	T	8	8	96849	96856	0 %	100 %	0 %	0 %	436839807
1565	NC_020055	ATG	2	6	96857	96862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839807
1566	NC_020055	TTG	2	6	96930	96935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839807
1567	NC_020055	TGATTT	2	12	97063	97074	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	436839807
1568	NC_020055	TA	3	6	97157	97162	50 %	50 %	0 %	0 %	436839807
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1570	NC_020055	ACTGG	2	10	97191	97200	20 %	20 %	40 %	20 %	436839807
1571	NC_020055	T	6	6	97208	97213	0 %	100 %	0 %	0 %	436839808
1572	NC_020055	T	7	7	97226	97232	0 %	100 %	0 %	0 %	436839808
1573	NC_020055	CTT	2	6	97238	97243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839808
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1582	NC_020055	CAG	2	6	97590	97595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839808
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1589	NC_020055	T	6	6	97878	97883	0 %	100 %	0 %	0 %	436839808
1590	NC_020055	GCA	2	6	97912	97917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839808
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1593	NC_020055	T	6	6	98022	98027	0 %	100 %	0 %	0 %	436839808
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1598	NC_020055	TGTT	2	8	98194	98201	0 %	75 %	25 %	0 %	436839808
1599	NC_020055	ATCA	2	8	98205	98212	50 %	25 %	0 %	25 %	436839808
1600	NC_020055	GC	3	6	98215	98220	0 %	0 %	50 %	50 %	436839808
1601	NC_020055	TCGAA	2	10	98727	98736	40 %	20 %	20 %	20 %	436839809
1602	NC_020055	CCG	2	6	98843	98848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839809
1603	NC_020055	ATTCTG	2	12	98932	98943	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	436839809
1604	NC_020055	TTC	2	6	99035	99040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839809
1605	NC_020055	CTTT	2	8	99060	99067	0 %	75 %	0 %	25 %	436839809
1606	NC_020055	GAT	2	6	99112	99117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839809
1607	NC_020055	GAC	2	6	99202	99207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839809
1608	NC_020055	C	6	6	99230	99235	0 %	0 %	0 %	100 %	436839809
1609	NC_020055	TCT	2	6	99245	99250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839809
1610	NC_020055	CT	3	6	99249	99254	0 %	50 %	0 %	50 %	436839809
1611	NC_020055	TGA	2	6	99333	99338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839809
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1618	NC_020055	TGT	2	6	99510	99515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839809
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1621	NC_020055	GGT	2	6	99609	99614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839809
1622	NC_020055	GTC	2	6	99655	99660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839809
1623	NC_020055	TA	3	6	99736	99741	50 %	50 %	0 %	0 %	436839810
1624	NC_020055	GAA	2	6	99846	99851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839810
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1869	NC_020055	GAA	2	6	113453	113458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839824
1870	NC_020055	TCCCGG	2	12	113566	113577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	436839824
1871	NC_020055	GAA	2	6	113609	113614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839824
1872	NC_020055	ATGC	2	8	113660	113667	25 %	25 %	25 %	25 %	436839824
1873	NC_020055	CTG	2	6	113708	113713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839824
1874	NC_020055	GTT	2	6	113885	113890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839824
1875	NC_020055	TCC	2	6	113900	113905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839824
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1881	NC_020055	CTG	3	9	114278	114286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839825
1882	NC_020055	GAAA	2	8	114292	114299	75 %	0 %	25 %	0 %	436839825
1883	NC_020055	A	6	6	114334	114339	100 %	0 %	0 %	0 %	436839825
1884	NC_020055	GCAGAA	2	12	114340	114351	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	436839825
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1894	NC_020055	GTT	2	6	114921	114926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839826
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1899	NC_020055	TGA	2	6	115100	115105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839826
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1971	NC_020055	A	7	7	120314	120320	100 %	0 %	0 %	0 %	436839836
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1980	NC_020055	G	6	6	121114	121119	0 %	0 %	100 %	0 %	436839838
1981	NC_020055	TTA	2	6	121174	121179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839838
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1983	NC_020055	GTTCA	2	10	121218	121227	20 %	40 %	20 %	20 %	436839839
1984	NC_020055	T	7	7	121260	121266	0 %	100 %	0 %	0 %	436839839
1985	NC_020055	CAGTG	2	10	121320	121329	20 %	20 %	40 %	20 %	436839839
1986	NC_020055	TTCCT	2	10	121340	121349	0 %	60 %	0 %	40 %	436839839
1987	NC_020055	TTC	3	9	121389	121397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839839
1988	NC_020055	GCGG	2	8	121500	121507	0 %	0 %	75 %	25 %	436839839
1989	NC_020055	TTTTTC	2	12	121581	121592	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	436839839
1990	NC_020055	T	6	6	121604	121609	0 %	100 %	0 %	0 %	436839839
1991	NC_020055	T	6	6	121615	121620	0 %	100 %	0 %	0 %	436839839
1992	NC_020055	T	7	7	121729	121735	0 %	100 %	0 %	0 %	436839839
1993	NC_020055	AAG	2	6	121755	121760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839839
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1995	NC_020055	AG	3	6	121861	121866	50 %	0 %	50 %	0 %	436839839
1996	NC_020055	CATC	2	8	121894	121901	25 %	25 %	0 %	50 %	436839839
1997	NC_020055	T	6	6	121935	121940	0 %	100 %	0 %	0 %	436839839
1998	NC_020055	A	6	6	122060	122065	100 %	0 %	0 %	0 %	436839840
1999	NC_020055	TTAG	2	8	122103	122110	25 %	50 %	25 %	0 %	436839840
2000	NC_020055	ACC	2	6	122156	122161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839840

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