MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 62685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_020055	CCG	2	6	3249009	3249014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842820
55003	NC_020055	TCC	2	6	3249023	3249028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436842820
55004	NC_020055	ACC	2	6	3249032	3249037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842820
55005	NC_020055	CAG	2	6	3249038	3249043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842820
55006	NC_020055	CCA	2	6	3249069	3249074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842820
55007	NC_020055	CCG	3	9	3249117	3249125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842820
55008	NC_020055	CCT	2	6	3249132	3249137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436842820
55009	NC_020055	AGG	2	6	3249190	3249195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436842820
55010	NC_020055	TCCC	2	8	3249197	3249204	0 %	25 %	0 %	75 %	436842820
55011	NC_020055	CCA	2	6	3249244	3249249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842820
55012	NC_020055	GCT	2	6	3249276	3249281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842820
55013	NC_020055	AAT	2	6	3249320	3249325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842821
55014	NC_020055	CGG	2	6	3249333	3249338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842821
55015	NC_020055	TAA	2	6	3249348	3249353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842821
55016	NC_020055	A	6	6	3249412	3249417	100 %	0 %	0 %	0 %	436842821
55017	NC_020055	T	7	7	3249421	3249427	0 %	100 %	0 %	0 %	436842821
55018	NC_020055	CAAA	2	8	3249505	3249512	75 %	0 %	0 %	25 %	436842821
55019	NC_020055	CAA	2	6	3249541	3249546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842821
55020	NC_020055	CGG	2	6	3249574	3249579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436842821
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55022	NC_020055	TCCA	2	8	3249608	3249615	25 %	25 %	0 %	50 %	436842821
55023	NC_020055	AAC	2	6	3249629	3249634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842821
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55026	NC_020055	TGCTC	2	10	3249791	3249800	0 %	40 %	20 %	40 %	436842821
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55028	NC_020055	CTG	2	6	3249954	3249959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842822
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55032	NC_020055	TGC	2	6	3250173	3250178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842822
55033	NC_020055	AGCA	2	8	3250216	3250223	50 %	0 %	25 %	25 %	436842822
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55035	NC_020055	AGTC	2	8	3250291	3250298	25 %	25 %	25 %	25 %	436842822
55036	NC_020055	A	7	7	3250309	3250315	100 %	0 %	0 %	0 %	436842822
55037	NC_020055	CTCG	2	8	3250330	3250337	0 %	25 %	25 %	50 %	436842822
55038	NC_020055	AT	3	6	3250361	3250366	50 %	50 %	0 %	0 %	436842822
55039	NC_020055	CCA	3	9	3250395	3250403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842822
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55041	NC_020055	TG	3	6	3250418	3250423	0 %	50 %	50 %	0 %	436842822
55042	NC_020055	CAT	2	6	3250527	3250532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842822
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55050	NC_020055	AGGA	2	8	3251040	3251047	50 %	0 %	50 %	0 %	436842822
55051	NC_020055	AGG	2	6	3251074	3251079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436842822
55052	NC_020055	GTCCA	2	10	3251105	3251114	20 %	20 %	20 %	40 %	436842822
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55055	NC_020055	CCA	2	6	3251267	3251272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842822
55056	NC_020055	TA	3	6	3251277	3251282	50 %	50 %	0 %	0 %	436842822
55057	NC_020055	CAC	2	6	3251394	3251399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842822
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55063	NC_020055	TGGG	2	8	3251770	3251777	0 %	25 %	75 %	0 %	436842822
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55072	NC_020055	CCT	2	6	3252401	3252406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436842823
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55118	NC_020055	CATA	2	8	3255906	3255913	50 %	25 %	0 %	25 %	436842829
55119	NC_020055	TCC	2	6	3256039	3256044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436842829
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55121	NC_020055	CAGC	2	8	3256144	3256151	25 %	0 %	25 %	50 %	436842829
55122	NC_020055	AAT	2	6	3256217	3256222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842829
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55155	NC_020055	TTG	2	6	3258589	3258594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842831
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55216	NC_020055	T	7	7	3261791	3261797	0 %	100 %	0 %	0 %	436842833
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55218	NC_020055	AT	3	6	3261835	3261840	50 %	50 %	0 %	0 %	436842833
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55220	NC_020055	AT	3	6	3261928	3261933	50 %	50 %	0 %	0 %	436842833
55221	NC_020055	TGA	2	6	3262397	3262402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842834
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55223	NC_020055	TGA	2	6	3262623	3262628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842834
55224	NC_020055	GAAA	2	8	3262629	3262636	75 %	0 %	25 %	0 %	436842834
55225	NC_020055	CTC	2	6	3262736	3262741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436842834
55226	NC_020055	ACA	2	6	3262793	3262798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842834
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55229	NC_020055	A	6	6	3263002	3263007	100 %	0 %	0 %	0 %	436842834
55230	NC_020055	ATT	2	6	3263119	3263124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842834
55231	NC_020055	AAGA	2	8	3263128	3263135	75 %	0 %	25 %	0 %	436842834
55232	NC_020055	ATA	2	6	3263139	3263144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842834
55233	NC_020055	TGA	2	6	3263324	3263329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842835
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55235	NC_020055	T	7	7	3263361	3263367	0 %	100 %	0 %	0 %	436842835
55236	NC_020055	CAGA	2	8	3263381	3263388	50 %	0 %	25 %	25 %	436842835
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55352	NC_020055	ATC	2	6	3269335	3269340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436842839
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55355	NC_020055	TATG	2	8	3269472	3269479	25 %	50 %	25 %	0 %	436842839
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55468	NC_020055	TCAG	2	8	3276164	3276171	25 %	25 %	25 %	25 %	436842843
55469	NC_020055	ACA	2	6	3276186	3276191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436842843
55470	NC_020055	CCA	2	6	3276233	3276238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842843
55471	NC_020055	AAG	2	6	3276352	3276357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842843
55472	NC_020055	CACG	2	8	3276363	3276370	25 %	0 %	25 %	50 %	436842843
55473	NC_020055	CGC	2	6	3276378	3276383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436842843
55474	NC_020055	AAGG	3	12	3276410	3276421	50 %	0 %	50 %	0 %	436842843
55475	NC_020055	G	6	6	3276420	3276425	0 %	0 %	100 %	0 %	436842843
55476	NC_020055	ACC	2	6	3276452	3276457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842843
55477	NC_020055	TGTC	2	8	3276462	3276469	0 %	50 %	25 %	25 %	436842843
55478	NC_020055	AAAT	2	8	3276503	3276510	75 %	25 %	0 %	0 %	436842843
55479	NC_020055	GGCT	2	8	3276555	3276562	0 %	25 %	50 %	25 %	436842843
55480	NC_020055	ACC	2	6	3276596	3276601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842843
55481	NC_020055	TTATT	2	10	3276602	3276611	20 %	80 %	0 %	0 %	436842844
55482	NC_020055	AGCA	2	8	3276641	3276648	50 %	0 %	25 %	25 %	436842844
55483	NC_020055	TGT	2	6	3276649	3276654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842844
55484	NC_020055	GCA	3	9	3276678	3276686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842844
55485	NC_020055	GTCA	2	8	3276707	3276714	25 %	25 %	25 %	25 %	436842844
55486	NC_020055	AGT	2	6	3276797	3276802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436842844
55487	NC_020055	ATT	2	6	3276869	3276874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436842844
55488	NC_020055	ATA	2	6	3276933	3276938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842844
55489	NC_020055	CAG	3	9	3276976	3276984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842844
55490	NC_020055	CAG	2	6	3277078	3277083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436842844
55491	NC_020055	AAT	2	6	3277145	3277150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842844
55492	NC_020055	CAC	2	6	3277240	3277245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842844
55493	NC_020055	GCT	2	6	3277295	3277300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436842844
55494	NC_020055	TGT	2	6	3277319	3277324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436842844
55495	NC_020055	AAG	2	6	3277358	3277363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436842844
55496	NC_020055	TCT	2	6	3277364	3277369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436842844
55497	NC_020055	ACC	2	6	3277476	3277481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436842844
55498	NC_020055	CCAG	2	8	3277497	3277504	25 %	0 %	25 %	50 %	436842844
55499	NC_020055	TAA	2	6	3277544	3277549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436842844
55500	NC_020055	T	6	6	3277550	3277555	0 %	100 %	0 %	0 %	436842844

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