MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 62685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020055	TGA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839710
2	NC_020055	A	7	7	381	387	100 %	0 %	0 %	0 %	436839710
3	NC_020055	GAA	3	9	470	478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
4	NC_020055	A	6	6	492	497	100 %	0 %	0 %	0 %	436839711
5	NC_020055	GAA	2	6	527	532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
6	NC_020055	AAAG	2	8	539	546	75 %	0 %	25 %	0 %	436839711
7	NC_020055	CTCAT	2	10	567	576	20 %	40 %	0 %	40 %	436839711
8	NC_020055	GCAG	2	8	581	588	25 %	0 %	50 %	25 %	436839711
9	NC_020055	T	6	6	610	615	0 %	100 %	0 %	0 %	436839711
10	NC_020055	AAT	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839711
11	NC_020055	GAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839711
12	NC_020055	T	6	6	692	697	0 %	100 %	0 %	0 %	436839711
13	NC_020055	TA	3	6	774	779	50 %	50 %	0 %	0 %	436839712
14	NC_020055	GAC	2	6	788	793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
15	NC_020055	AGC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
16	NC_020055	CAG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839712
17	NC_020055	A	8	8	1182	1189	100 %	0 %	0 %	0 %	436839712
18	NC_020055	A	6	6	1238	1243	100 %	0 %	0 %	0 %	436839712
19	NC_020055	CCA	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839713
20	NC_020055	GAA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839713
21	NC_020055	GAA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839713
22	NC_020055	TGC	2	6	1701	1706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839713
23	NC_020055	GT	3	6	1733	1738	0 %	50 %	50 %	0 %	436839713
24	NC_020055	T	7	7	1738	1744	0 %	100 %	0 %	0 %	436839713
25	NC_020055	A	6	6	1768	1773	100 %	0 %	0 %	0 %	436839713
26	NC_020055	TAA	2	6	1935	1940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839713
27	NC_020055	ATC	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839713
28	NC_020055	TTAA	2	8	2621	2628	50 %	50 %	0 %	0 %	436839714
29	NC_020055	A	6	6	2635	2640	100 %	0 %	0 %	0 %	436839714
30	NC_020055	TAGG	2	8	2652	2659	25 %	25 %	50 %	0 %	436839714
31	NC_020055	GATTG	2	10	2845	2854	20 %	40 %	40 %	0 %	436839715
32	NC_020055	GAG	2	6	2893	2898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839715
33	NC_020055	TCCA	2	8	2916	2923	25 %	25 %	0 %	50 %	436839715
34	NC_020055	GTTA	2	8	2929	2936	25 %	50 %	25 %	0 %	436839715
35	NC_020055	TTCA	2	8	2958	2965	25 %	50 %	0 %	25 %	436839715
36	NC_020055	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
37	NC_020055	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
38	NC_020055	A	8	8	3105	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	436839716
39	NC_020055	TGT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839716
40	NC_020055	A	7	7	3181	3187	100 %	0 %	0 %	0 %	436839716
41	NC_020055	ATT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839716
42	NC_020055	TGA	3	9	3306	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
43	NC_020055	TGA	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
44	NC_020055	GAAA	2	8	3468	3475	75 %	0 %	25 %	0 %	436839716
45	NC_020055	GAA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
46	NC_020055	AAG	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
47	NC_020055	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839716
48	NC_020055	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
49	NC_020055	AGA	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
50	NC_020055	A	7	7	3863	3869	100 %	0 %	0 %	0 %	436839716
51	NC_020055	AGC	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
52	NC_020055	ATG	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
53	NC_020055	CAT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839716
54	NC_020055	TTCAG	2	10	4147	4156	20 %	40 %	20 %	20 %	436839716
55	NC_020055	AAC	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
56	NC_020055	CTC	2	6	4262	4267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839716
57	NC_020055	TGA	2	6	4275	4280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
58	NC_020055	GAAT	2	8	4338	4345	50 %	25 %	25 %	0 %	436839716
59	NC_020055	TGA	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
60	NC_020055	A	6	6	4473	4478	100 %	0 %	0 %	0 %	436839716
61	NC_020055	AAT	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
62	NC_020055	GAT	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
63	NC_020055	A	6	6	4711	4716	100 %	0 %	0 %	0 %	436839716
64	NC_020055	GAT	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
65	NC_020055	CCAA	2	8	4803	4810	50 %	0 %	0 %	50 %	436839716
66	NC_020055	GAT	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839716
67	NC_020055	T	6	6	4858	4863	0 %	100 %	0 %	0 %	436839716
68	NC_020055	AAC	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
69	NC_020055	T	6	6	5014	5019	0 %	100 %	0 %	0 %	436839716
70	NC_020055	TGTC	2	8	5047	5054	0 %	50 %	25 %	25 %	436839716
71	NC_020055	CAA	2	6	5126	5131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839716
72	NC_020055	AAT	2	6	5179	5184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839716
73	NC_020055	ATTT	2	8	5203	5210	25 %	75 %	0 %	0 %	436839716
74	NC_020055	GAC	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
75	NC_020055	TTC	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839716
76	NC_020055	AGA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839716
77	NC_020055	AG	3	6	5407	5412	50 %	0 %	50 %	0 %	436839716
78	NC_020055	CAG	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839716
79	NC_020055	GGA	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839717
80	NC_020055	CTG	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839717
81	NC_020055	GAA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839717
82	NC_020055	CCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839717
83	NC_020055	GAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839717
84	NC_020055	CTTT	2	8	6000	6007	0 %	75 %	0 %	25 %	436839717
85	NC_020055	CTTT	2	8	6017	6024	0 %	75 %	0 %	25 %	436839717
86	NC_020055	GCA	2	6	6029	6034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839717
87	NC_020055	TCA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839717
88	NC_020055	A	6	6	6076	6081	100 %	0 %	0 %	0 %	436839717
89	NC_020055	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839718
90	NC_020055	T	7	7	6314	6320	0 %	100 %	0 %	0 %	436839718
91	NC_020055	CAA	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839718
92	NC_020055	TCC	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839718
93	NC_020055	ATCTA	2	10	6482	6491	40 %	40 %	0 %	20 %	436839718
94	NC_020055	AAAAT	2	10	6624	6633	80 %	20 %	0 %	0 %	436839718
95	NC_020055	GCC	2	6	6693	6698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839718
96	NC_020055	TCTG	2	8	6730	6737	0 %	50 %	25 %	25 %	436839718
97	NC_020055	GGAT	2	8	6837	6844	25 %	25 %	50 %	0 %	436839718
98	NC_020055	TTG	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839718
99	NC_020055	TCT	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839718
100	NC_020055	CCT	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839718
101	NC_020055	CCAGC	2	10	7092	7101	20 %	0 %	20 %	60 %	436839718
102	NC_020055	CCG	2	6	7169	7174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839718
103	NC_020055	GAAC	2	8	7223	7230	50 %	0 %	25 %	25 %	436839719
104	NC_020055	GCG	2	6	7255	7260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839719
105	NC_020055	TCC	2	6	7265	7270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436839719
106	NC_020055	TCA	3	9	7301	7309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839719
107	NC_020055	GAC	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839719
108	NC_020055	AAG	2	6	7363	7368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839719
109	NC_020055	CTG	2	6	7381	7386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839719
110	NC_020055	CTGAT	2	10	7472	7481	20 %	40 %	20 %	20 %	436839719
111	NC_020055	CTT	2	6	7519	7524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839719
112	NC_020055	GCAA	2	8	7647	7654	50 %	0 %	25 %	25 %	436839720
113	NC_020055	GTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839720
114	NC_020055	CAC	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839720
115	NC_020055	AGG	2	6	7754	7759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839720
116	NC_020055	GCA	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839720
117	NC_020055	GCTTT	2	10	7939	7948	0 %	60 %	20 %	20 %	436839720
118	NC_020055	GGT	2	6	7977	7982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839720
119	NC_020055	AATTT	2	10	8025	8034	40 %	60 %	0 %	0 %	436839720
120	NC_020055	CTT	2	6	8048	8053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839720
121	NC_020055	T	6	6	8231	8236	0 %	100 %	0 %	0 %	436839720
122	NC_020055	T	6	6	8330	8335	0 %	100 %	0 %	0 %	436839720
123	NC_020055	TCA	2	6	8338	8343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839720
124	NC_020055	TGATG	2	10	8942	8951	20 %	40 %	40 %	0 %	436839721
125	NC_020055	ACTC	2	8	8956	8963	25 %	25 %	0 %	50 %	436839721
126	NC_020055	GCA	2	6	9001	9006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839721
127	NC_020055	GAGC	2	8	9007	9014	25 %	0 %	50 %	25 %	436839721
128	NC_020055	ATT	2	6	9022	9027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839721
129	NC_020055	TGATA	2	10	9258	9267	40 %	40 %	20 %	0 %	436839722
130	NC_020055	GC	3	6	9333	9338	0 %	0 %	50 %	50 %	436839722
131	NC_020055	GTG	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839722
132	NC_020055	AGT	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
133	NC_020055	AAC	2	6	9447	9452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839722
134	NC_020055	ATG	2	6	9455	9460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
135	NC_020055	AGC	2	6	9498	9503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839722
136	NC_020055	ATT	2	6	9518	9523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839722
137	NC_020055	AGC	3	9	9560	9568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839722
138	NC_020055	ATA	2	6	9614	9619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839722
139	NC_020055	A	6	6	9654	9659	100 %	0 %	0 %	0 %	436839722
140	NC_020055	GTT	2	6	9673	9678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839722
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142	NC_020055	TCA	3	9	9792	9800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839722
143	NC_020055	ATG	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
144	NC_020055	TTTA	2	8	9902	9909	25 %	75 %	0 %	0 %	436839722
145	NC_020055	AT	3	6	9915	9920	50 %	50 %	0 %	0 %	436839722
146	NC_020055	TTG	2	6	9949	9954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839722
147	NC_020055	TGA	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839722
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149	NC_020055	TA	3	6	9997	10002	50 %	50 %	0 %	0 %	436839722
150	NC_020055	TTG	2	6	10039	10044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839722
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156	NC_020055	CTGG	2	8	10645	10652	0 %	25 %	50 %	25 %	436839723
157	NC_020055	TTG	2	6	10667	10672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839723
158	NC_020055	A	6	6	10721	10726	100 %	0 %	0 %	0 %	436839724
159	NC_020055	TAA	2	6	10727	10732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839724
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178	NC_020055	GACA	2	8	12051	12058	50 %	0 %	25 %	25 %	436839726
179	NC_020055	A	6	6	12342	12347	100 %	0 %	0 %	0 %	436839726
180	NC_020055	A	6	6	12362	12367	100 %	0 %	0 %	0 %	436839726
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253	NC_020055	ATA	2	6	15930	15935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839731
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