MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 plasmid DESAM_p

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019953	CAG	2	6	36	41	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637023
2	NC_019953	TAA	2	6	197	202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433637023
3	NC_019953	TTA	2	6	242	247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433637024
4	NC_019953	GAT	2	6	253	258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637024
5	NC_019953	GAA	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637024
6	NC_019953	GCC	2	6	313	318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637024
7	NC_019953	TAG	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637024
8	NC_019953	TGAC	2	8	494	501	25 %	25 %	25 %	25 %	433637024
9	NC_019953	CCGGC	2	10	566	575	0 %	0 %	40 %	60 %	433637024
10	NC_019953	CAG	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637024
11	NC_019953	TCAA	2	8	766	773	50 %	25 %	0 %	25 %	433637024
12	NC_019953	G	6	6	781	786	0 %	0 %	100 %	0 %	433637024
13	NC_019953	TGG	2	6	954	959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637025
14	NC_019953	GAT	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637025
15	NC_019953	TGA	2	6	1073	1078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637025
16	NC_019953	TTC	2	6	1097	1102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433637025
17	NC_019953	CAAG	2	8	1121	1128	50 %	0 %	25 %	25 %	433637025
18	NC_019953	TCTT	2	8	1339	1346	0 %	75 %	0 %	25 %	433637025
19	NC_019953	GACCG	2	10	1352	1361	20 %	0 %	40 %	40 %	433637025
20	NC_019953	GTG	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637025
21	NC_019953	GCG	2	6	1616	1621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637025
22	NC_019953	AAT	2	6	1649	1654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433637025
23	NC_019953	CGG	2	6	1700	1705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637025
24	NC_019953	TTG	2	6	1732	1737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433637025
25	NC_019953	GCT	2	6	1740	1745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637025
26	NC_019953	CAA	2	6	1867	1872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637026
27	NC_019953	TGCT	2	8	1888	1895	0 %	50 %	25 %	25 %	433637026
28	NC_019953	GCT	2	6	1901	1906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637026
29	NC_019953	AAG	2	6	1921	1926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637026
30	NC_019953	ATA	2	6	1963	1968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433637026
31	NC_019953	ACA	2	6	2097	2102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637026
32	NC_019953	GCT	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637026
33	NC_019953	AGG	2	6	2228	2233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637026
34	NC_019953	CGG	2	6	2305	2310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637027
35	NC_019953	AGCTT	2	10	2415	2424	20 %	40 %	20 %	20 %	433637027
36	NC_019953	GGCT	2	8	2500	2507	0 %	25 %	50 %	25 %	433637027
37	NC_019953	TGA	2	6	2519	2524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637027
38	NC_019953	TGA	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637027
39	NC_019953	CTA	2	6	2629	2634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637027
40	NC_019953	GACT	2	8	2777	2784	25 %	25 %	25 %	25 %	433637027
41	NC_019953	TGG	2	6	2819	2824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
42	NC_019953	CTA	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637027
43	NC_019953	TAC	2	6	2859	2864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637027
44	NC_019953	CGC	2	6	2886	2891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637027
45	NC_019953	ACA	2	6	2893	2898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637027
46	NC_019953	GAA	3	9	2973	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637027
47	NC_019953	GAAT	2	8	2993	3000	50 %	25 %	25 %	0 %	433637027
48	NC_019953	TGG	2	6	3040	3045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
49	NC_019953	CA	3	6	3142	3147	50 %	0 %	0 %	50 %	433637027
50	NC_019953	GTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433637027
51	NC_019953	ATT	2	6	3264	3269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433637027
52	NC_019953	ACT	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637027
53	NC_019953	CCG	2	6	3478	3483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637027
54	NC_019953	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637027
55	NC_019953	AC	3	6	3541	3546	50 %	0 %	0 %	50 %	433637027
56	NC_019953	TTGG	2	8	3709	3716	0 %	50 %	50 %	0 %	433637027
57	NC_019953	CTTT	2	8	3757	3764	0 %	75 %	0 %	25 %	433637027
58	NC_019953	ATT	2	6	3769	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433637027
59	NC_019953	G	6	6	3775	3780	0 %	0 %	100 %	0 %	433637027
60	NC_019953	CTTC	2	8	3822	3829	0 %	50 %	0 %	50 %	433637027
61	NC_019953	TGG	2	6	3847	3852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
62	NC_019953	AGGC	2	8	3880	3887	25 %	0 %	50 %	25 %	433637027
63	NC_019953	CTT	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433637027
64	NC_019953	TGC	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637027
65	NC_019953	GGT	2	6	4224	4229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
66	NC_019953	GGT	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
67	NC_019953	TGG	2	6	4253	4258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
68	NC_019953	GGC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637027
69	NC_019953	TTC	2	6	4301	4306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433637027
70	NC_019953	CAGGTG	2	12	4333	4344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433637027
71	NC_019953	CTC	2	6	4381	4386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637027
72	NC_019953	TGG	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
73	NC_019953	GCG	2	6	4411	4416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637027
74	NC_019953	ATC	3	9	4431	4439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637027
75	NC_019953	AT	3	6	4479	4484	50 %	50 %	0 %	0 %	433637027
76	NC_019953	CGG	2	6	4511	4516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637027
77	NC_019953	CGG	2	6	4526	4531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637027
78	NC_019953	G	6	6	4535	4540	0 %	0 %	100 %	0 %	433637027
79	NC_019953	CGG	2	6	4559	4564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637027
80	NC_019953	GGC	2	6	4584	4589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637027
81	NC_019953	TGGCGG	2	12	4616	4627	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	433637027
82	NC_019953	TGG	2	6	4628	4633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
83	NC_019953	GTT	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433637027
84	NC_019953	GGT	2	6	4653	4658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
85	NC_019953	GGT	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
86	NC_019953	CGG	2	6	4703	4708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637027
87	NC_019953	CGG	2	6	4721	4726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637027
88	NC_019953	TGG	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
89	NC_019953	GGT	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027
90	NC_019953	GGT	2	6	4815	4820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637027

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.