MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfitobacterium dichloroeliminans LMG P-21439 chromosome

Total Repeats: 57296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019903	TTC	2	6	28	33	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431792070
2	NC_019903	ACG	2	6	45	50	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431792070
3	NC_019903	A	6	6	94	99	100 %	0 %	0 %	0 %	431792070
4	NC_019903	CT	3	6	107	112	0 %	50 %	0 %	50 %	431792070
5	NC_019903	CGA	2	6	118	123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431792070
6	NC_019903	T	6	6	124	129	0 %	100 %	0 %	0 %	431792070
7	NC_019903	GAAA	2	8	537	544	75 %	0 %	25 %	0 %	431792071
8	NC_019903	TCT	2	6	609	614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431792071
9	NC_019903	AC	3	6	629	634	50 %	0 %	0 %	50 %	431792071
10	NC_019903	AAG	2	6	764	769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792071
11	NC_019903	GC	3	6	772	777	0 %	0 %	50 %	50 %	431792071
12	NC_019903	TTAT	2	8	949	956	25 %	75 %	0 %	0 %	431792071
13	NC_019903	AT	3	6	955	960	50 %	50 %	0 %	0 %	431792071
14	NC_019903	ATCC	2	8	1083	1090	25 %	25 %	0 %	50 %	431792071
15	NC_019903	AGG	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431792071
16	NC_019903	TTC	2	6	1195	1200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431792071
17	NC_019903	CAA	2	6	1227	1232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431792071
18	NC_019903	TCT	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431792071
19	NC_019903	TCC	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431792071
20	NC_019903	AGA	2	6	1281	1286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792071
21	NC_019903	ACC	2	6	1332	1337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431792071
22	NC_019903	TTC	2	6	1361	1366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431792071
23	NC_019903	A	6	6	1369	1374	100 %	0 %	0 %	0 %	431792071
24	NC_019903	ATT	2	6	1543	1548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792071
25	NC_019903	AC	3	6	1556	1561	50 %	0 %	0 %	50 %	431792071
26	NC_019903	AGCA	2	8	1589	1596	50 %	0 %	25 %	25 %	431792071
27	NC_019903	TTATCA	2	12	1615	1626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431792071
28	NC_019903	TATC	2	8	1684	1691	25 %	50 %	0 %	25 %	431792071
29	NC_019903	TGA	2	6	1728	1733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792071
30	NC_019903	GGA	2	6	1738	1743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431792071
31	NC_019903	CAC	2	6	1752	1757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431792071
32	NC_019903	TAT	2	6	2218	2223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792072
33	NC_019903	GTTGT	2	10	2283	2292	0 %	60 %	40 %	0 %	431792072
34	NC_019903	T	6	6	2340	2345	0 %	100 %	0 %	0 %	431792072
35	NC_019903	CAT	2	6	2377	2382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431792072
36	NC_019903	GAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792072
37	NC_019903	TTA	2	6	2468	2473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792072
38	NC_019903	GAA	2	6	2561	2566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792072
39	NC_019903	ATA	2	6	2607	2612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431792072
40	NC_019903	GCTTA	2	10	2643	2652	20 %	40 %	20 %	20 %	431792072
41	NC_019903	TAT	2	6	2698	2703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792072
42	NC_019903	AGA	3	9	2743	2751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792072
43	NC_019903	CT	3	6	2816	2821	0 %	50 %	0 %	50 %	431792072
44	NC_019903	ACGGG	2	10	2941	2950	20 %	0 %	60 %	20 %	431792072
45	NC_019903	AAG	2	6	3051	3056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792072
46	NC_019903	TTG	2	6	3092	3097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431792072
47	NC_019903	ATT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792072
48	NC_019903	AGA	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792072
49	NC_019903	ATC	2	6	3128	3133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431792072
50	NC_019903	TAT	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792072
51	NC_019903	TTATCT	2	12	3190	3201	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	431792072
52	NC_019903	GTAC	2	8	3212	3219	25 %	25 %	25 %	25 %	431792072
53	NC_019903	T	6	6	3269	3274	0 %	100 %	0 %	0 %	431792073
54	NC_019903	AAG	2	6	3291	3296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792073
55	NC_019903	CTA	2	6	3370	3375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431792073
56	NC_019903	TGA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792073
57	NC_019903	G	6	6	3429	3434	0 %	0 %	100 %	0 %	431792073
58	NC_019903	AGA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792073
59	NC_019903	AGAAA	2	10	3507	3516	80 %	0 %	20 %	0 %	431792073
60	NC_019903	ATCA	2	8	3527	3534	50 %	25 %	0 %	25 %	431792073
61	NC_019903	TGT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431792073
62	NC_019903	T	9	9	3582	3590	0 %	100 %	0 %	0 %	431792073
63	NC_019903	TGA	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792073
64	NC_019903	G	6	6	3617	3622	0 %	0 %	100 %	0 %	431792073
65	NC_019903	CTT	2	6	3640	3645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431792073
66	NC_019903	CAT	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431792073
67	NC_019903	A	7	7	3717	3723	100 %	0 %	0 %	0 %	431792073
68	NC_019903	CCT	2	6	3727	3732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431792073
69	NC_019903	AAT	2	6	3805	3810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431792073
70	NC_019903	A	6	6	3846	3851	100 %	0 %	0 %	0 %	431792073
71	NC_019903	AAG	2	6	3855	3860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792073
72	NC_019903	GA	3	6	3883	3888	50 %	0 %	50 %	0 %	431792073
73	NC_019903	GAA	2	6	3965	3970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792073
74	NC_019903	A	6	6	3969	3974	100 %	0 %	0 %	0 %	431792073
75	NC_019903	TGGAAA	2	12	3981	3992	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	431792073
76	NC_019903	TGA	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792073
77	NC_019903	TAAAT	2	10	4036	4045	60 %	40 %	0 %	0 %	431792073
78	NC_019903	TGC	2	6	4155	4160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431792073
79	NC_019903	GAT	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792073
80	NC_019903	GA	3	6	4198	4203	50 %	0 %	50 %	0 %	431792073
81	NC_019903	TATT	2	8	4205	4212	25 %	75 %	0 %	0 %	431792073
82	NC_019903	CAG	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431792073
83	NC_019903	CAT	2	6	4281	4286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431792073
84	NC_019903	AGG	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431792073
85	NC_019903	TGAT	2	8	4324	4331	25 %	50 %	25 %	0 %	431792073
86	NC_019903	ATTA	2	8	4356	4363	50 %	50 %	0 %	0 %	431792074
87	NC_019903	ATT	2	6	4375	4380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792074
88	NC_019903	GAAAA	2	10	4481	4490	80 %	0 %	20 %	0 %	431792074
89	NC_019903	TTTCT	2	10	4518	4527	0 %	80 %	0 %	20 %	431792074
90	NC_019903	ATC	2	6	4533	4538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431792074
91	NC_019903	ATG	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792074
92	NC_019903	ATG	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792075
93	NC_019903	TTG	2	6	4978	4983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431792075
94	NC_019903	ACA	2	6	4984	4989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431792075
95	NC_019903	ATTC	2	8	5037	5044	25 %	50 %	0 %	25 %	431792075
96	NC_019903	GTT	2	6	5214	5219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431792075
97	NC_019903	CTTT	2	8	5433	5440	0 %	75 %	0 %	25 %	431792075
98	NC_019903	T	6	6	5438	5443	0 %	100 %	0 %	0 %	431792075
99	NC_019903	TGA	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792075
100	NC_019903	AG	3	6	5478	5483	50 %	0 %	50 %	0 %	431792075
101	NC_019903	AAGA	2	8	5487	5494	75 %	0 %	25 %	0 %	431792075
102	NC_019903	TAC	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431792075
103	NC_019903	TGG	2	6	5510	5515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431792075
104	NC_019903	AT	3	6	5534	5539	50 %	50 %	0 %	0 %	431792075
105	NC_019903	TTC	2	6	5557	5562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431792075
106	NC_019903	TATT	2	8	5573	5580	25 %	75 %	0 %	0 %	431792075
107	NC_019903	ATG	2	6	5629	5634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792075
108	NC_019903	TA	3	6	5637	5642	50 %	50 %	0 %	0 %	431792075
109	NC_019903	T	6	6	5650	5655	0 %	100 %	0 %	0 %	431792075
110	NC_019903	AAT	2	6	5664	5669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431792075
111	NC_019903	AAG	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792075
112	NC_019903	GGT	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431792075
113	NC_019903	ATT	2	6	5737	5742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792075
114	NC_019903	ATG	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792075
115	NC_019903	ACCAAG	2	12	5859	5870	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	431792075
116	NC_019903	AG	3	6	6018	6023	50 %	0 %	50 %	0 %	431792075
117	NC_019903	GGAA	2	8	6088	6095	50 %	0 %	50 %	0 %	431792075
118	NC_019903	TCG	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431792075
119	NC_019903	CTTT	2	8	6385	6392	0 %	75 %	0 %	25 %	431792075
120	NC_019903	TATATC	2	12	6426	6437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431792075
121	NC_019903	CCT	2	6	6444	6449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431792075
122	NC_019903	CT	3	6	6448	6453	0 %	50 %	0 %	50 %	431792075
123	NC_019903	AAG	2	6	6462	6467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792075
124	NC_019903	GAA	2	6	6498	6503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792075
125	NC_019903	ACC	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431792075
126	NC_019903	GAT	2	6	6642	6647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792075
127	NC_019903	TGG	2	6	6691	6696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431792075
128	NC_019903	GAA	2	6	6778	6783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792076
129	NC_019903	AGGG	2	8	6788	6795	25 %	0 %	75 %	0 %	431792076
130	NC_019903	GA	3	6	6807	6812	50 %	0 %	50 %	0 %	431792076
131	NC_019903	GGA	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431792076
132	NC_019903	ATT	2	6	6845	6850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792076
133	NC_019903	TTG	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431792076
134	NC_019903	AT	3	6	7030	7035	50 %	50 %	0 %	0 %	431792076
135	NC_019903	ATG	2	6	7223	7228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792076
136	NC_019903	AGA	2	6	7236	7241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792076
137	NC_019903	CCA	2	6	7313	7318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431792076
138	NC_019903	TGA	2	6	7400	7405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792076
139	NC_019903	TA	3	6	7408	7413	50 %	50 %	0 %	0 %	431792076
140	NC_019903	ATT	2	6	7552	7557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792076
141	NC_019903	A	6	6	7601	7606	100 %	0 %	0 %	0 %	431792076
142	NC_019903	AG	3	6	7621	7626	50 %	0 %	50 %	0 %	431792076
143	NC_019903	TA	3	6	7736	7741	50 %	50 %	0 %	0 %	431792076
144	NC_019903	TCAT	2	8	7826	7833	25 %	50 %	0 %	25 %	431792076
145	NC_019903	TTA	2	6	7859	7864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792076
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152	NC_019903	T	6	6	8133	8138	0 %	100 %	0 %	0 %	431792076
153	NC_019903	A	6	6	8159	8164	100 %	0 %	0 %	0 %	431792076
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160	NC_019903	TCT	2	6	8447	8452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431792076
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167	NC_019903	GAA	2	6	8896	8901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792076
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169	NC_019903	ATC	2	6	8992	8997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431792076
170	NC_019903	GAT	2	6	9055	9060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792076
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248	NC_019903	TAT	2	6	14776	14781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431792082
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252	NC_019903	TCTAC	2	10	14959	14968	20 %	40 %	0 %	40 %	431792082
253	NC_019903	CTG	2	6	14993	14998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431792082
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256	NC_019903	TTAT	2	8	16232	16239	25 %	75 %	0 %	0 %	431792084
257	NC_019903	ACC	2	6	16266	16271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431792084
258	NC_019903	TGC	2	6	16394	16399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431792084
259	NC_019903	TGA	2	6	16415	16420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792084
260	NC_019903	CAT	2	6	16481	16486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431792084
261	NC_019903	TGA	2	6	16487	16492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792084
262	NC_019903	CTT	2	6	16527	16532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431792084
263	NC_019903	CCT	2	6	16548	16553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431792084
264	NC_019903	ACT	2	6	16578	16583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431792084
265	NC_019903	TC	3	6	16610	16615	0 %	50 %	0 %	50 %	431792084
266	NC_019903	TCGG	2	8	16693	16700	0 %	25 %	50 %	25 %	431792084
267	NC_019903	TGG	2	6	16864	16869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431792084
268	NC_019903	GCG	2	6	16893	16898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431792084
269	NC_019903	GCTCT	2	10	16983	16992	0 %	40 %	20 %	40 %	431792084
270	NC_019903	TGC	2	6	16994	16999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431792084
271	NC_019903	TGC	2	6	17129	17134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431792084
272	NC_019903	AGC	2	6	17147	17152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431792084
273	NC_019903	TGC	2	6	17218	17223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431792084
274	NC_019903	AGG	2	6	17242	17247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431792084
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279	NC_019903	ATG	2	6	17452	17457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792084
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281	NC_019903	T	6	6	17498	17503	0 %	100 %	0 %	0 %	431792084
282	NC_019903	GGAA	2	8	17507	17514	50 %	0 %	50 %	0 %	431792084
283	NC_019903	TGGTT	2	10	17537	17546	0 %	60 %	40 %	0 %	431792084
284	NC_019903	TG	3	6	17661	17666	0 %	50 %	50 %	0 %	431792084
285	NC_019903	GAT	2	6	17718	17723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792084
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295	NC_019903	A	6	6	18091	18096	100 %	0 %	0 %	0 %	431792085
296	NC_019903	GCT	2	6	18100	18105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431792085
297	NC_019903	TGA	2	6	18139	18144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431792085
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325	NC_019903	TGC	2	6	19880	19885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431792088
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388	NC_019903	A	6	6	22846	22851	100 %	0 %	0 %	0 %	431792088
389	NC_019903	GAA	2	6	22911	22916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792088
390	NC_019903	CTTC	2	8	22949	22956	0 %	50 %	0 %	50 %	431792088
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392	NC_019903	GAA	2	6	23020	23025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431792088
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