MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE01

Total Repeats: 9401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019789	GCA	2	6	15	20	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221373
2	NC_019789	GCA	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221373
3	NC_019789	TTGCC	2	10	219	228	0 %	40 %	20 %	40 %	429221373
4	NC_019789	CGG	2	6	234	239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221373
5	NC_019789	GC	3	6	276	281	0 %	0 %	50 %	50 %	429221373
6	NC_019789	CTGG	2	8	298	305	0 %	25 %	50 %	25 %	429221373
7	NC_019789	GACA	2	8	360	367	50 %	0 %	25 %	25 %	429221373
8	NC_019789	GTG	2	6	410	415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221373
9	NC_019789	TCC	2	6	420	425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221373
10	NC_019789	CTG	2	6	434	439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221373
11	NC_019789	CGT	3	9	445	453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221373
12	NC_019789	GC	3	6	476	481	0 %	0 %	50 %	50 %	429221373
13	NC_019789	GATCC	2	10	805	814	20 %	20 %	20 %	40 %	429221374
14	NC_019789	TGC	2	6	867	872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221374
15	NC_019789	GCT	2	6	880	885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221374
16	NC_019789	GC	3	6	893	898	0 %	0 %	50 %	50 %	429221374
17	NC_019789	TCT	2	6	901	906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221374
18	NC_019789	GCC	2	6	924	929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221374
19	NC_019789	CGG	2	6	937	942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221374
20	NC_019789	TG	3	6	943	948	0 %	50 %	50 %	0 %	429221374
21	NC_019789	GCA	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221374
22	NC_019789	CTG	2	6	1232	1237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221374
23	NC_019789	CCG	2	6	1285	1290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221374
24	NC_019789	CAC	2	6	1301	1306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221374
25	NC_019789	GCA	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221374
26	NC_019789	GC	3	6	1330	1335	0 %	0 %	50 %	50 %	429221374
27	NC_019789	GCA	2	6	1467	1472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221374
28	NC_019789	CCG	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221374
29	NC_019789	GAGG	2	8	1489	1496	25 %	0 %	75 %	0 %	429221374
30	NC_019789	GTT	2	6	1504	1509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221374
31	NC_019789	TCA	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221374
32	NC_019789	TGA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429221374
33	NC_019789	GT	3	6	1588	1593	0 %	50 %	50 %	0 %	429221374
34	NC_019789	GCCG	2	8	1607	1614	0 %	0 %	50 %	50 %	429221374
35	NC_019789	CG	3	6	1627	1632	0 %	0 %	50 %	50 %	429221374
36	NC_019789	TCG	2	6	1683	1688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221374
37	NC_019789	TTC	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221375
38	NC_019789	TCG	2	6	2380	2385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221375
39	NC_019789	CG	3	6	2387	2392	0 %	0 %	50 %	50 %	429221375
40	NC_019789	ATC	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221375
41	NC_019789	GT	3	6	2429	2434	0 %	50 %	50 %	0 %	429221375
42	NC_019789	CTG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221375
43	NC_019789	TGGC	2	8	2590	2597	0 %	25 %	50 %	25 %	429221375
44	NC_019789	CCG	2	6	2600	2605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221375
45	NC_019789	CAG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221375
46	NC_019789	CCG	2	6	2658	2663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221375
47	NC_019789	TCGC	2	8	2722	2729	0 %	25 %	25 %	50 %	429221375
48	NC_019789	GGC	2	6	2730	2735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221375
49	NC_019789	GGC	2	6	2739	2744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221375
50	NC_019789	CGA	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221375
51	NC_019789	CGG	2	6	2787	2792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221375
52	NC_019789	CGTGG	2	10	2850	2859	0 %	20 %	60 %	20 %	429221375
53	NC_019789	GCA	2	6	2871	2876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221375
54	NC_019789	CAC	2	6	2893	2898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221375
55	NC_019789	CG	3	6	3046	3051	0 %	0 %	50 %	50 %	429221375
56	NC_019789	CTG	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221375
57	NC_019789	GGGA	2	8	3106	3113	25 %	0 %	75 %	0 %	429221376
58	NC_019789	CCG	2	6	3128	3133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221376
59	NC_019789	CCG	2	6	3178	3183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221376
60	NC_019789	GCC	2	6	3206	3211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221376
61	NC_019789	GTG	2	6	3221	3226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221376
62	NC_019789	CCCG	2	8	3254	3261	0 %	0 %	25 %	75 %	429221376
63	NC_019789	CGA	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221376
64	NC_019789	CGG	2	6	3317	3322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221376
65	NC_019789	GGC	2	6	3352	3357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221376
66	NC_019789	CTG	2	6	3389	3394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221376
67	NC_019789	TCG	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221376
68	NC_019789	CTGG	2	8	3458	3465	0 %	25 %	50 %	25 %	429221376
69	NC_019789	CGA	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221376
70	NC_019789	GGC	2	6	3520	3525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221376
71	NC_019789	TC	3	6	3553	3558	0 %	50 %	0 %	50 %	429221376
72	NC_019789	CGA	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221376
73	NC_019789	CAT	2	6	3589	3594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221376
74	NC_019789	GAG	2	6	3692	3697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221376
75	NC_019789	TGG	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221376
76	NC_019789	CGC	3	9	3826	3834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221376
77	NC_019789	CG	3	6	3848	3853	0 %	0 %	50 %	50 %	429221376
78	NC_019789	CTG	2	6	3857	3862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221376
79	NC_019789	GCCA	2	8	3881	3888	25 %	0 %	25 %	50 %	429221376
80	NC_019789	CCG	3	9	3988	3996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221376
81	NC_019789	CGA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221376
82	NC_019789	ACC	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221376
83	NC_019789	CAGG	2	8	4545	4552	25 %	0 %	50 %	25 %	429221377
84	NC_019789	AGGTGT	2	12	4580	4591	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	429221377
85	NC_019789	GCT	3	9	4620	4628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221377
86	NC_019789	GC	3	6	4987	4992	0 %	0 %	50 %	50 %	429221378
87	NC_019789	TGC	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221378
88	NC_019789	GTAC	2	8	5090	5097	25 %	25 %	25 %	25 %	429221378
89	NC_019789	CAC	2	6	5124	5129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221378
90	NC_019789	CG	3	6	5178	5183	0 %	0 %	50 %	50 %	429221378
91	NC_019789	AGCGA	2	10	5211	5220	40 %	0 %	40 %	20 %	429221378
92	NC_019789	GC	3	6	5302	5307	0 %	0 %	50 %	50 %	429221378
93	NC_019789	CGG	3	9	5434	5442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221378
94	NC_019789	CACC	2	8	5521	5528	25 %	0 %	0 %	75 %	429221378
95	NC_019789	GTG	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221378
96	NC_019789	TGG	2	6	5568	5573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221378
97	NC_019789	AGTG	2	8	5588	5595	25 %	25 %	50 %	0 %	429221378
98	NC_019789	ACG	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221378
99	NC_019789	TCA	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221378
100	NC_019789	GCT	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221378
101	NC_019789	CGG	2	6	5690	5695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221378
102	NC_019789	ATG	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429221378
103	NC_019789	GCC	2	6	5798	5803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221378
104	NC_019789	ATGG	2	8	5831	5838	25 %	25 %	50 %	0 %	429221378
105	NC_019789	GGA	2	6	5843	5848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221378
106	NC_019789	AGGA	2	8	5916	5923	50 %	0 %	50 %	0 %	429221378
107	NC_019789	CTC	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221379
108	NC_019789	AGGA	2	8	6317	6324	50 %	0 %	50 %	0 %	429221379
109	NC_019789	GAA	2	6	6346	6351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221379
110	NC_019789	ATC	2	6	6569	6574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221379
111	NC_019789	CGG	2	6	6627	6632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221379
112	NC_019789	TGA	2	6	6633	6638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429221379
113	NC_019789	GCA	2	6	6657	6662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221379
114	NC_019789	CCA	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221379
115	NC_019789	GCA	2	6	6720	6725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221379
116	NC_019789	CCAG	2	8	6738	6745	25 %	0 %	25 %	50 %	429221379
117	NC_019789	TAC	2	6	6790	6795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221379
118	NC_019789	TTC	2	6	6820	6825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221379
119	NC_019789	CGGT	2	8	6846	6853	0 %	25 %	50 %	25 %	429221379
120	NC_019789	GAA	2	6	7355	7360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221380
121	NC_019789	CG	5	10	7393	7402	0 %	0 %	50 %	50 %	429221380
122	NC_019789	AAC	2	6	7406	7411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221380
123	NC_019789	ACG	2	6	7416	7421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221380
124	NC_019789	GCA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221380
125	NC_019789	GCC	2	6	7471	7476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221380
126	NC_019789	CAA	2	6	7484	7489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221380
127	NC_019789	GAC	2	6	7592	7597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221380
128	NC_019789	GAC	3	9	7601	7609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221380
129	NC_019789	CAG	2	6	7652	7657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221380
130	NC_019789	CAGGG	2	10	7668	7677	20 %	0 %	60 %	20 %	429221380
131	NC_019789	CGG	2	6	7702	7707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221380
132	NC_019789	ATG	2	6	7709	7714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429221380
133	NC_019789	CAA	2	6	7730	7735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221380
134	NC_019789	CAG	2	6	7748	7753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221380
135	NC_019789	GCCA	2	8	7776	7783	25 %	0 %	25 %	50 %	429221380
136	NC_019789	CAA	2	6	7784	7789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221380
137	NC_019789	CGGG	2	8	7797	7804	0 %	0 %	75 %	25 %	429221380
138	NC_019789	GC	4	8	7832	7839	0 %	0 %	50 %	50 %	429221380
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248	NC_019789	A	6	6	17248	17253	100 %	0 %	0 %	0 %	429221389
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250	NC_019789	GC	3	6	17349	17354	0 %	0 %	50 %	50 %	429221389
251	NC_019789	CTT	2	6	17505	17510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221389
252	NC_019789	GGT	2	6	17530	17535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221389
253	NC_019789	GTG	2	6	17564	17569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221389
254	NC_019789	CAC	2	6	17586	17591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221389
255	NC_019789	CGCCCA	2	12	18203	18214	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	429221390
256	NC_019789	CAC	2	6	18251	18256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221390
257	NC_019789	CGA	2	6	18293	18298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221390
258	NC_019789	CTCGCC	2	12	18312	18323	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	429221390
259	NC_019789	CAT	2	6	18335	18340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221390
260	NC_019789	CGCC	2	8	18422	18429	0 %	0 %	25 %	75 %	429221390
261	NC_019789	TCC	2	6	18511	18516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221390
262	NC_019789	GCA	2	6	18517	18522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221390
263	NC_019789	CAG	2	6	18642	18647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221390
264	NC_019789	ATC	2	6	18663	18668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221390
265	NC_019789	CAG	2	6	18711	18716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221390
266	NC_019789	GTG	2	6	18747	18752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221390
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274	NC_019789	GC	3	6	19133	19138	0 %	0 %	50 %	50 %	429221391
275	NC_019789	GCGTC	2	10	19191	19200	0 %	20 %	40 %	40 %	429221391
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284	NC_019789	CTG	2	6	19550	19555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221391
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290	NC_019789	CCG	2	6	19751	19756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221391
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292	NC_019789	CGC	2	6	19905	19910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221392
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294	NC_019789	CTC	2	6	20022	20027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221392
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378	NC_019789	CAA	2	6	23179	23184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221394
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380	NC_019789	ACC	2	6	23307	23312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221395
381	NC_019789	GCC	2	6	23362	23367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221395
382	NC_019789	CGT	2	6	23417	23422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221395
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384	NC_019789	CCCAA	2	10	23560	23569	40 %	0 %	0 %	60 %	429221395
385	NC_019789	A	6	6	23575	23580	100 %	0 %	0 %	0 %	429221395
386	NC_019789	CGT	2	6	23687	23692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221395
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473	NC_019789	TCAG	2	8	27344	27351	25 %	25 %	25 %	25 %	429221399
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485	NC_019789	CGG	2	6	27719	27724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221399
486	NC_019789	CAT	2	6	27751	27756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221399
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488	NC_019789	ACC	2	6	27845	27850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221399
489	NC_019789	CTT	2	6	27891	27896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221399
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496	NC_019789	GCTTC	2	10	28715	28724	0 %	40 %	20 %	40 %	429221399
497	NC_019789	GATC	2	8	28896	28903	25 %	25 %	25 %	25 %	429221399
498	NC_019789	GTTC	2	8	28904	28911	0 %	50 %	25 %	25 %	429221399
499	NC_019789	GCT	3	9	29031	29039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221399
500	NC_019789	ACC	2	6	29088	29093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221399

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