MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfurococcus fermentans DSM 16532 chromosome

Total Repeats: 24393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018001	ATC	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937753
2	NC_018001	AG	3	6	343	348	50 %	0 %	50 %	0 %	390937753
3	NC_018001	TCC	2	6	350	355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937753
4	NC_018001	AGG	2	6	403	408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937753
5	NC_018001	TCT	2	6	420	425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937753
6	NC_018001	CAT	3	9	533	541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937753
7	NC_018001	TA	3	6	668	673	50 %	50 %	0 %	0 %	390937753
8	NC_018001	AT	3	6	678	683	50 %	50 %	0 %	0 %	390937753
9	NC_018001	GAT	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937753
10	NC_018001	ATG	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937753
11	NC_018001	ATT	2	6	927	932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937753
12	NC_018001	AGG	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937753
13	NC_018001	AG	3	6	1084	1089	50 %	0 %	50 %	0 %	390937753
14	NC_018001	GAA	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937753
15	NC_018001	GAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937753
16	NC_018001	TGT	2	6	1164	1169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390937753
17	NC_018001	GAA	2	6	1200	1205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937753
18	NC_018001	TA	3	6	1253	1258	50 %	50 %	0 %	0 %	390937753
19	NC_018001	CT	4	8	1300	1307	0 %	50 %	0 %	50 %	390937753
20	NC_018001	ATT	2	6	1324	1329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937753
21	NC_018001	ATG	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937753
22	NC_018001	GGT	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937753
23	NC_018001	AAT	2	6	1398	1403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937753
24	NC_018001	CAT	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937754
25	NC_018001	TCCC	2	8	1528	1535	0 %	25 %	0 %	75 %	390937754
26	NC_018001	TAG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937754
27	NC_018001	GA	3	6	1800	1805	50 %	0 %	50 %	0 %	390937754
28	NC_018001	GGA	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937754
29	NC_018001	GTG	2	6	1857	1862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937754
30	NC_018001	ATT	2	6	1867	1872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937754
31	NC_018001	AAT	2	6	1907	1912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937754
32	NC_018001	TAGG	2	8	1939	1946	25 %	25 %	50 %	0 %	390937754
33	NC_018001	GTA	2	6	1947	1952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937754
34	NC_018001	ATGT	2	8	1966	1973	25 %	50 %	25 %	0 %	390937754
35	NC_018001	AT	3	6	1974	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	390937754
36	NC_018001	CT	4	8	2024	2031	0 %	50 %	0 %	50 %	390937754
37	NC_018001	AT	3	6	2113	2118	50 %	50 %	0 %	0 %	390937755
38	NC_018001	TC	3	6	2149	2154	0 %	50 %	0 %	50 %	390937755
39	NC_018001	GA	3	6	2180	2185	50 %	0 %	50 %	0 %	390937755
40	NC_018001	ATAA	2	8	2195	2202	75 %	25 %	0 %	0 %	390937755
41	NC_018001	CTC	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937755
42	NC_018001	AGG	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937755
43	NC_018001	AGGAG	2	10	2320	2329	40 %	0 %	60 %	0 %	390937755
44	NC_018001	ATCT	2	8	2431	2438	25 %	50 %	0 %	25 %	390937755
45	NC_018001	GAT	2	6	2440	2445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937755
46	NC_018001	AG	3	6	2459	2464	50 %	0 %	50 %	0 %	390937755
47	NC_018001	AT	3	6	2489	2494	50 %	50 %	0 %	0 %	390937755
48	NC_018001	TA	3	6	2522	2527	50 %	50 %	0 %	0 %	390937755
49	NC_018001	TTG	2	6	2646	2651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390937755
50	NC_018001	TCC	2	6	2682	2687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937755
51	NC_018001	ATGG	2	8	2712	2719	25 %	25 %	50 %	0 %	390937755
52	NC_018001	AACAT	2	10	2765	2774	60 %	20 %	0 %	20 %	390937755
53	NC_018001	AAG	2	6	2816	2821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937755
54	NC_018001	AGGG	2	8	2855	2862	25 %	0 %	75 %	0 %	390937755
55	NC_018001	GAT	2	6	2993	2998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937755
56	NC_018001	AAT	2	6	3004	3009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937755
57	NC_018001	AAT	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937755
58	NC_018001	AT	3	6	3101	3106	50 %	50 %	0 %	0 %	390937755
59	NC_018001	AGA	2	6	3160	3165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937755
60	NC_018001	TGG	2	6	3176	3181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937755
61	NC_018001	TGG	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937755
62	NC_018001	ACC	2	6	3268	3273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390937755
63	NC_018001	GA	3	6	3382	3387	50 %	0 %	50 %	0 %	390937755
64	NC_018001	GGA	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937755
65	NC_018001	GA	3	6	3467	3472	50 %	0 %	50 %	0 %	390937755
66	NC_018001	AG	3	6	3503	3508	50 %	0 %	50 %	0 %	390937755
67	NC_018001	AG	3	6	3596	3601	50 %	0 %	50 %	0 %	390937755
68	NC_018001	AT	3	6	3608	3613	50 %	50 %	0 %	0 %	390937755
69	NC_018001	GAT	2	6	3635	3640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937755
70	NC_018001	CTGA	2	8	3653	3660	25 %	25 %	25 %	25 %	390937755
71	NC_018001	ATGG	2	8	3688	3695	25 %	25 %	50 %	0 %	390937755
72	NC_018001	ATG	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937755
73	NC_018001	ATG	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937755
74	NC_018001	ATT	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937755
75	NC_018001	AGG	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937755
76	NC_018001	GGGT	2	8	3837	3844	0 %	25 %	75 %	0 %	390937755
77	NC_018001	GA	3	6	3863	3868	50 %	0 %	50 %	0 %	390937755
78	NC_018001	AT	3	6	3869	3874	50 %	50 %	0 %	0 %	390937755
79	NC_018001	AT	3	6	3878	3883	50 %	50 %	0 %	0 %	390937755
80	NC_018001	TTC	2	6	3911	3916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937755
81	NC_018001	TTA	2	6	3923	3928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937755
82	NC_018001	CCG	2	6	3980	3985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390937755
83	NC_018001	TATT	2	8	4385	4392	25 %	75 %	0 %	0 %	390937756
84	NC_018001	CAT	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
85	NC_018001	CT	3	6	4467	4472	0 %	50 %	0 %	50 %	390937756
86	NC_018001	GAGGG	2	10	4482	4491	20 %	0 %	80 %	0 %	390937756
87	NC_018001	TCA	2	6	4526	4531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
88	NC_018001	TTA	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937756
89	NC_018001	ATT	2	6	4561	4566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937756
90	NC_018001	TCT	2	6	4592	4597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937756
91	NC_018001	ATT	2	6	4657	4662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937756
92	NC_018001	CTA	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
93	NC_018001	TGG	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937756
94	NC_018001	GGC	2	6	4819	4824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390937756
95	NC_018001	ACT	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
96	NC_018001	GCCA	2	8	4933	4940	25 %	0 %	25 %	50 %	390937756
97	NC_018001	TCA	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
98	NC_018001	ATT	2	6	4984	4989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937756
99	NC_018001	ATT	2	6	5077	5082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937756
100	NC_018001	GGT	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937756
101	NC_018001	CGC	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390937756
102	NC_018001	TCT	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937756
103	NC_018001	TCC	2	6	5242	5247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937756
104	NC_018001	AGTA	2	8	5297	5304	50 %	25 %	25 %	0 %	390937756
105	NC_018001	T	6	6	5394	5399	0 %	100 %	0 %	0 %	390937756
106	NC_018001	CCT	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937756
107	NC_018001	TATAT	2	10	5538	5547	40 %	60 %	0 %	0 %	390937756
108	NC_018001	ACT	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
109	NC_018001	TA	3	6	5571	5576	50 %	50 %	0 %	0 %	390937756
110	NC_018001	TC	3	6	5578	5583	0 %	50 %	0 %	50 %	390937756
111	NC_018001	CTA	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
112	NC_018001	ACC	2	6	5623	5628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390937756
113	NC_018001	ACT	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
114	NC_018001	GGCT	2	8	5774	5781	0 %	25 %	50 %	25 %	390937757
115	NC_018001	ACT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937757
116	NC_018001	ATA	3	9	6178	6186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937758
117	NC_018001	TA	3	6	6269	6274	50 %	50 %	0 %	0 %	390937758
118	NC_018001	GGT	2	6	6283	6288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937758
119	NC_018001	GGTG	2	8	6339	6346	0 %	25 %	75 %	0 %	390937758
120	NC_018001	GGT	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937758
121	NC_018001	TA	3	6	6520	6525	50 %	50 %	0 %	0 %	390937758
122	NC_018001	AAT	2	6	6619	6624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937758
123	NC_018001	AT	3	6	6642	6647	50 %	50 %	0 %	0 %	390937758
124	NC_018001	CAAG	2	8	6676	6683	50 %	0 %	25 %	25 %	390937758
125	NC_018001	TAG	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937758
126	NC_018001	GCA	2	6	6802	6807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937758
127	NC_018001	CAG	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937758
128	NC_018001	GCAG	2	8	6882	6889	25 %	0 %	50 %	25 %	390937758
129	NC_018001	CAG	3	9	6887	6895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937758
130	NC_018001	TC	3	6	6900	6905	0 %	50 %	0 %	50 %	390937758
131	NC_018001	GTT	2	6	6951	6956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390937758
132	NC_018001	ACC	2	6	7013	7018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390937758
133	NC_018001	TA	3	6	7112	7117	50 %	50 %	0 %	0 %	390937758
134	NC_018001	GA	3	6	7120	7125	50 %	0 %	50 %	0 %	390937758
135	NC_018001	ATCT	2	8	7130	7137	25 %	50 %	0 %	25 %	390937758
136	NC_018001	TAGCAT	2	12	7205	7216	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390937758
137	NC_018001	ATA	2	6	7348	7353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937758
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