MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P6

Total Repeats: 792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017793	ACG	2	6	277	282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854560
2	NC_017793	GCC	2	6	292	297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386854560
3	NC_017793	CTG	2	6	298	303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854560
4	NC_017793	GGC	2	6	366	371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854560
5	NC_017793	GAT	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854560
6	NC_017793	GCT	2	6	435	440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854560
7	NC_017793	GGTG	2	8	447	454	0 %	25 %	75 %	0 %	386854560
8	NC_017793	AGC	2	6	455	460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854560
9	NC_017793	GTCG	2	8	461	468	0 %	25 %	50 %	25 %	386854560
10	NC_017793	GGCC	2	8	469	476	0 %	0 %	50 %	50 %	386854560
11	NC_017793	GC	3	6	500	505	0 %	0 %	50 %	50 %	386854560
12	NC_017793	GCT	2	6	636	641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854560
13	NC_017793	CCCGA	2	10	688	697	20 %	0 %	20 %	60 %	386854560
14	NC_017793	CGG	2	6	749	754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854560
15	NC_017793	GCA	2	6	813	818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854560
16	NC_017793	AGG	2	6	824	829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386854560
17	NC_017793	CTG	2	6	844	849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854560
18	NC_017793	CCT	2	6	855	860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386854560
19	NC_017793	GC	3	6	899	904	0 %	0 %	50 %	50 %	386854560
20	NC_017793	GGC	2	6	974	979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854561
21	NC_017793	GCG	2	6	1005	1010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854561
22	NC_017793	GCC	2	6	1035	1040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386854561
23	NC_017793	AGG	2	6	1059	1064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386854561
24	NC_017793	GCA	2	6	1081	1086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854561
25	NC_017793	GAT	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854562
26	NC_017793	CTC	2	6	1442	1447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386854562
27	NC_017793	TCC	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386854562
28	NC_017793	CTC	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386854562
29	NC_017793	G	6	6	1630	1635	0 %	0 %	100 %	0 %	386854562
30	NC_017793	TCA	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854562
31	NC_017793	TCC	2	6	1726	1731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386854562
32	NC_017793	TCC	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386854562
33	NC_017793	GAA	2	6	1826	1831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854562
34	NC_017793	CG	4	8	1893	1900	0 %	0 %	50 %	50 %	386854562
35	NC_017793	CGG	2	6	1969	1974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854562
36	NC_017793	ACC	2	6	2015	2020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386854562
37	NC_017793	GCA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854562
38	NC_017793	GA	3	6	2195	2200	50 %	0 %	50 %	0 %	386854563
39	NC_017793	TCCCGT	2	12	2265	2276	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386854563
40	NC_017793	TCT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854563
41	NC_017793	ACC	2	6	2313	2318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386854563
42	NC_017793	GGC	2	6	2342	2347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854563
43	NC_017793	CAA	2	6	2495	2500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854563
44	NC_017793	TGA	2	6	2516	2521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854563
45	NC_017793	TGG	2	6	2552	2557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386854563
46	NC_017793	GAT	2	6	2688	2693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854563
47	NC_017793	A	6	6	2718	2723	100 %	0 %	0 %	0 %	386854563
48	NC_017793	TAC	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854563
49	NC_017793	TTA	2	6	2755	2760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854563
50	NC_017793	ACA	2	6	2776	2781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854563
51	NC_017793	TAG	2	6	2858	2863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854563
52	NC_017793	TGATA	2	10	2867	2876	40 %	40 %	20 %	0 %	386854563
53	NC_017793	AT	3	6	2949	2954	50 %	50 %	0 %	0 %	386854563
54	NC_017793	TTC	2	6	3158	3163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854563
55	NC_017793	TA	4	8	3215	3222	50 %	50 %	0 %	0 %	386854563
56	NC_017793	AT	4	8	3337	3344	50 %	50 %	0 %	0 %	386854563
57	NC_017793	AGA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854563
58	NC_017793	TCT	2	6	3461	3466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854563
59	NC_017793	GCA	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854563
60	NC_017793	TGC	2	6	3490	3495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854563
61	NC_017793	CCAGT	2	10	3531	3540	20 %	20 %	20 %	40 %	386854563
62	NC_017793	AAC	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854563
63	NC_017793	GAA	2	6	3694	3699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854563
64	NC_017793	CAT	2	6	3708	3713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854563
65	NC_017793	AAC	2	6	3734	3739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854563
66	NC_017793	CAA	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854563
67	NC_017793	AAT	2	6	3873	3878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854563
68	NC_017793	GAAC	2	8	3932	3939	50 %	0 %	25 %	25 %	386854563
69	NC_017793	TTA	2	6	3969	3974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854563
70	NC_017793	GAATC	2	10	3981	3990	40 %	20 %	20 %	20 %	386854563
71	NC_017793	TAC	2	6	4044	4049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854563
72	NC_017793	ACAAA	2	10	4082	4091	80 %	0 %	0 %	20 %	386854563
73	NC_017793	TTC	2	6	4187	4192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854563
74	NC_017793	TA	4	8	4218	4225	50 %	50 %	0 %	0 %	386854563
75	NC_017793	TA	3	6	4279	4284	50 %	50 %	0 %	0 %	386854563
76	NC_017793	TAC	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854563
77	NC_017793	GAG	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386854563
78	NC_017793	ACT	2	6	4440	4445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854563
79	NC_017793	CTG	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854563
80	NC_017793	ATT	2	6	4473	4478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854563
81	NC_017793	TA	3	6	4618	4623	50 %	50 %	0 %	0 %	386854563
82	NC_017793	TCT	2	6	4634	4639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854563
83	NC_017793	GCA	2	6	4676	4681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854563
84	NC_017793	ATG	2	6	4717	4722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854563
85	NC_017793	TCA	2	6	4757	4762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854563
86	NC_017793	GTT	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386854563
87	NC_017793	AGT	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854563
88	NC_017793	AAC	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854563
89	NC_017793	ATATCA	2	12	4919	4930	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386854563
90	NC_017793	GTC	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854563
91	NC_017793	CAA	2	6	5102	5107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854563
92	NC_017793	GA	3	6	5156	5161	50 %	0 %	50 %	0 %	386854563
93	NC_017793	ATG	2	6	5197	5202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854563
94	NC_017793	TAT	2	6	5230	5235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854563
95	NC_017793	CA	3	6	5236	5241	50 %	0 %	0 %	50 %	386854563
96	NC_017793	TACTT	2	10	5286	5295	20 %	60 %	0 %	20 %	386854563
97	NC_017793	GAAG	2	8	5319	5326	50 %	0 %	50 %	0 %	386854563
98	NC_017793	ATA	3	9	5353	5361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854563
99	NC_017793	AGA	2	6	5470	5475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854563
100	NC_017793	ATT	2	6	5494	5499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854563
101	NC_017793	AAG	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854563
102	NC_017793	A	6	6	5593	5598	100 %	0 %	0 %	0 %	386854563
103	NC_017793	CGG	2	6	5678	5683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854563
104	NC_017793	GAT	2	6	5736	5741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854563
105	NC_017793	CTCAA	2	10	5761	5770	40 %	20 %	0 %	40 %	386854563
106	NC_017793	ATG	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854563
107	NC_017793	GGA	2	6	5899	5904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386854563
108	NC_017793	ACA	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854563
109	NC_017793	AG	3	6	5990	5995	50 %	0 %	50 %	0 %	386854563
110	NC_017793	ACA	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854563
111	NC_017793	GAA	3	9	6117	6125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854563
112	NC_017793	AATT	2	8	6202	6209	50 %	50 %	0 %	0 %	386854563
113	NC_017793	TTAC	2	8	6301	6308	25 %	50 %	0 %	25 %	386854563
114	NC_017793	TGG	2	6	6374	6379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386854563
115	NC_017793	TCTTA	2	10	6384	6393	20 %	60 %	0 %	20 %	386854563
116	NC_017793	AATTC	2	10	6421	6430	40 %	40 %	0 %	20 %	386854563
117	NC_017793	AAT	2	6	6438	6443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854563
118	NC_017793	CAA	2	6	6451	6456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854563
119	NC_017793	AAT	2	6	6675	6680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854563
120	NC_017793	ATG	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854563
121	NC_017793	ACAAT	2	10	6707	6716	60 %	20 %	0 %	20 %	386854563
122	NC_017793	TAC	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854563
123	NC_017793	AAC	2	6	6771	6776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854563
124	NC_017793	AAT	3	9	6777	6785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854563
125	NC_017793	TAA	2	6	6787	6792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854563
126	NC_017793	A	6	6	6791	6796	100 %	0 %	0 %	0 %	386854563
127	NC_017793	GTG	2	6	7050	7055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386854564
128	NC_017793	ATTT	2	8	7056	7063	25 %	75 %	0 %	0 %	386854564
129	NC_017793	ACTT	2	8	7075	7082	25 %	50 %	0 %	25 %	386854564
130	NC_017793	AT	3	6	7235	7240	50 %	50 %	0 %	0 %	386854564
131	NC_017793	TCT	2	6	7307	7312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854564
132	NC_017793	GAA	2	6	7361	7366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854564
133	NC_017793	ATA	2	6	7410	7415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854564
134	NC_017793	TGG	2	6	7459	7464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386854564
135	NC_017793	TCA	2	6	7597	7602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854564
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258	NC_017793	CGA	2	6	16667	16672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854572
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262	NC_017793	TGG	2	6	17856	17861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386854574
263	NC_017793	GGC	2	6	17881	17886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854574
264	NC_017793	CCT	2	6	17888	17893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386854574
265	NC_017793	TGA	2	6	17918	17923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854574
266	NC_017793	CCA	2	6	17930	17935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386854574
267	NC_017793	TCC	2	6	17942	17947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386854574
268	NC_017793	CA	3	6	17983	17988	50 %	0 %	0 %	50 %	386854574
269	NC_017793	G	6	6	17990	17995	0 %	0 %	100 %	0 %	386854574
270	NC_017793	CA	3	6	18003	18008	50 %	0 %	0 %	50 %	386854574
271	NC_017793	TCT	2	6	18010	18015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854574
272	NC_017793	CT	3	6	18030	18035	0 %	50 %	0 %	50 %	386854574
273	NC_017793	ACG	2	6	18046	18051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854574
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276	NC_017793	G	6	6	18269	18274	0 %	0 %	100 %	0 %	386854574
277	NC_017793	TCC	2	6	18301	18306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386854574
278	NC_017793	CTG	3	9	18324	18332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854574
279	NC_017793	GCT	2	6	18368	18373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854574
280	NC_017793	GC	3	6	18377	18382	0 %	0 %	50 %	50 %	386854574
281	NC_017793	TC	3	6	18400	18405	0 %	50 %	0 %	50 %	386854574
282	NC_017793	ACC	2	6	18417	18422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386854574
283	NC_017793	GTCTG	2	10	18442	18451	0 %	40 %	40 %	20 %	386854574
284	NC_017793	TCG	2	6	18469	18474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854574
285	NC_017793	CTG	2	6	18508	18513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854574
286	NC_017793	CT	3	6	18698	18703	0 %	50 %	0 %	50 %	386854574
287	NC_017793	GC	3	6	18776	18781	0 %	0 %	50 %	50 %	386854574
288	NC_017793	TG	3	6	19204	19209	0 %	50 %	50 %	0 %	386854575
289	NC_017793	CGGG	2	8	19224	19231	0 %	0 %	75 %	25 %	386854575
290	NC_017793	GCC	2	6	19294	19299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386854575
291	NC_017793	GGC	2	6	19449	19454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854575
292	NC_017793	GCG	2	6	19500	19505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854575
293	NC_017793	CGA	2	6	19533	19538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854575
294	NC_017793	CGA	3	9	19575	19583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854575
295	NC_017793	GAA	2	6	19611	19616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854575
296	NC_017793	GAA	2	6	19780	19785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854575
297	NC_017793	TAG	2	6	19796	19801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854575
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341	NC_017793	TTC	2	6	22233	22238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854577
342	NC_017793	AGC	2	6	22330	22335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854577
343	NC_017793	GCT	2	6	22347	22352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854577
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390	NC_017793	T	6	6	24735	24740	0 %	100 %	0 %	0 %	386854579
391	NC_017793	AG	3	6	24826	24831	50 %	0 %	50 %	0 %	386854579
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