MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P4

Total Repeats: 1145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017792	CGC	2	6	107	112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858169
2	NC_017792	GGC	4	12	122	133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386858169
3	NC_017792	CGG	2	6	155	160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386858169
4	NC_017792	GCC	2	6	190	195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858169
5	NC_017792	GAA	2	6	239	244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858169
6	NC_017792	CCA	2	6	265	270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858169
7	NC_017792	GCC	2	6	351	356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858169
8	NC_017792	AAG	2	6	372	377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858169
9	NC_017792	AGC	2	6	400	405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858169
10	NC_017792	A	6	6	425	430	100 %	0 %	0 %	0 %	386858169
11	NC_017792	CTAC	2	8	488	495	25 %	25 %	0 %	50 %	386858169
12	NC_017792	GCTCA	2	10	588	597	20 %	20 %	20 %	40 %	386858169
13	NC_017792	TCC	2	6	679	684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858169
14	NC_017792	GAC	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858169
15	NC_017792	TTC	2	6	759	764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858169
16	NC_017792	CA	4	8	839	846	50 %	0 %	0 %	50 %	386858169
17	NC_017792	CAC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858169
18	NC_017792	GAC	2	6	980	985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858169
19	NC_017792	ACC	2	6	1109	1114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858170
20	NC_017792	TCA	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858170
21	NC_017792	TCC	2	6	1176	1181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858170
22	NC_017792	CGG	2	6	1192	1197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386858170
23	NC_017792	CGC	2	6	1250	1255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858170
24	NC_017792	GTT	2	6	1267	1272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858170
25	NC_017792	CAG	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858170
26	NC_017792	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858170
27	NC_017792	GGA	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858170
28	NC_017792	GCG	3	9	1389	1397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386858170
29	NC_017792	AC	3	6	1425	1430	50 %	0 %	0 %	50 %	386858170
30	NC_017792	CCA	2	6	1432	1437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858170
31	NC_017792	GAA	2	6	1460	1465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858170
32	NC_017792	CGAC	2	8	2068	2075	25 %	0 %	25 %	50 %	386858172
33	NC_017792	GGA	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858172
34	NC_017792	CTG	2	6	2175	2180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858172
35	NC_017792	CGT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858172
36	NC_017792	ATGG	2	8	2280	2287	25 %	25 %	50 %	0 %	386858172
37	NC_017792	CGG	2	6	2332	2337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386858172
38	NC_017792	GCA	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858172
39	NC_017792	GCA	2	6	2405	2410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858172
40	NC_017792	TCT	2	6	2726	2731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858173
41	NC_017792	TCA	2	6	2864	2869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858173
42	NC_017792	ACTGA	2	10	3340	3349	40 %	20 %	20 %	20 %	386858174
43	NC_017792	ACA	2	6	3356	3361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858174
44	NC_017792	AGT	2	6	3391	3396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858174
45	NC_017792	AAT	2	6	3409	3414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858174
46	NC_017792	GCCC	2	8	3432	3439	0 %	0 %	25 %	75 %	386858174
47	NC_017792	CGC	2	6	3525	3530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858175
48	NC_017792	GGAAAC	2	12	3599	3610	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386858175
49	NC_017792	CCTGAA	2	12	3662	3673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386858175
50	NC_017792	TCT	2	6	3719	3724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858175
51	NC_017792	CAG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858175
52	NC_017792	TAC	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858175
53	NC_017792	AGA	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858175
54	NC_017792	GCAT	2	8	3930	3937	25 %	25 %	25 %	25 %	386858175
55	NC_017792	CGG	2	6	3964	3969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386858175
56	NC_017792	TCT	2	6	3974	3979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858175
57	NC_017792	GCTG	2	8	4081	4088	0 %	25 %	50 %	25 %	386858175
58	NC_017792	CGG	2	6	4124	4129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386858175
59	NC_017792	GAA	2	6	4139	4144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858175
60	NC_017792	TCA	2	6	4159	4164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858175
61	NC_017792	TGG	2	6	4273	4278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858176
62	NC_017792	TCT	2	6	4346	4351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858176
63	NC_017792	CAC	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858176
64	NC_017792	GGCT	2	8	4466	4473	0 %	25 %	50 %	25 %	386858176
65	NC_017792	CAT	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858177
66	NC_017792	GCT	2	6	4580	4585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858177
67	NC_017792	CCT	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858177
68	NC_017792	CCT	2	6	4775	4780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858177
69	NC_017792	CGA	2	6	4826	4831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858177
70	NC_017792	GAA	2	6	4890	4895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858177
71	NC_017792	CGA	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858177
72	NC_017792	ATC	2	6	5068	5073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858178
73	NC_017792	CGGA	2	8	5079	5086	25 %	0 %	50 %	25 %	386858178
74	NC_017792	CCG	2	6	5194	5199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858178
75	NC_017792	GAA	2	6	5261	5266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858178
76	NC_017792	CCA	2	6	5303	5308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858178
77	NC_017792	GGT	2	6	5336	5341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858178
78	NC_017792	CAGG	2	8	5364	5371	25 %	0 %	50 %	25 %	386858178
79	NC_017792	GAA	2	6	5451	5456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858178
80	NC_017792	TCG	2	6	5494	5499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858178
81	NC_017792	CCA	2	6	5504	5509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858178
82	NC_017792	AGC	2	6	5521	5526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858178
83	NC_017792	GCC	2	6	5613	5618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858178
84	NC_017792	GGT	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858178
85	NC_017792	CGA	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858178
86	NC_017792	TTCG	2	8	5965	5972	0 %	50 %	25 %	25 %	386858179
87	NC_017792	CCA	2	6	5981	5986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858179
88	NC_017792	GTC	2	6	6013	6018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858179
89	NC_017792	GGT	2	6	6223	6228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858179
90	NC_017792	GAC	2	6	6277	6282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858179
91	NC_017792	GTC	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858179
92	NC_017792	ACG	2	6	6344	6349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858179
93	NC_017792	AC	3	6	6354	6359	50 %	0 %	0 %	50 %	386858179
94	NC_017792	CAGC	2	8	6486	6493	25 %	0 %	25 %	50 %	386858180
95	NC_017792	CGT	2	6	6733	6738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858180
96	NC_017792	CAC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858181
97	NC_017792	CGC	2	6	7118	7123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858181
98	NC_017792	GCT	2	6	7261	7266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858182
99	NC_017792	AG	3	6	7284	7289	50 %	0 %	50 %	0 %	386858182
100	NC_017792	GCA	2	6	7327	7332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858182
101	NC_017792	ACT	2	6	7365	7370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858182
102	NC_017792	GCCT	2	8	7424	7431	0 %	25 %	25 %	50 %	386858182
103	NC_017792	CAGA	2	8	8104	8111	50 %	0 %	25 %	25 %	386858183
104	NC_017792	GCG	2	6	8131	8136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386858183
105	NC_017792	GCCG	2	8	8176	8183	0 %	0 %	50 %	50 %	386858183
106	NC_017792	CG	3	6	8508	8513	0 %	0 %	50 %	50 %	386858183
107	NC_017792	GCATC	2	10	8659	8668	20 %	20 %	20 %	40 %	386858184
108	NC_017792	CCG	2	6	8766	8771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858184
109	NC_017792	GGA	2	6	8888	8893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858184
110	NC_017792	ACC	2	6	8913	8918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858184
111	NC_017792	CCT	2	6	8925	8930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858184
112	NC_017792	CCCA	2	8	9094	9101	25 %	0 %	0 %	75 %	386858184
113	NC_017792	CGC	2	6	9141	9146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858184
114	NC_017792	CCCA	2	8	9182	9189	25 %	0 %	0 %	75 %	386858184
115	NC_017792	CTG	2	6	9191	9196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858184
116	NC_017792	CGC	2	6	9226	9231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858184
117	NC_017792	TGT	2	6	9279	9284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858184
118	NC_017792	G	6	6	9289	9294	0 %	0 %	100 %	0 %	386858184
119	NC_017792	ATGG	2	8	9330	9337	25 %	25 %	50 %	0 %	386858184
120	NC_017792	CTC	2	6	9449	9454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858184
121	NC_017792	GCG	2	6	9475	9480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386858184
122	NC_017792	CAGGC	2	10	9785	9794	20 %	0 %	40 %	40 %	386858184
123	NC_017792	CAG	2	6	9911	9916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858184
124	NC_017792	TAG	2	6	10086	10091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858185
125	NC_017792	GGA	2	6	10122	10127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858185
126	NC_017792	ATC	2	6	10146	10151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858185
127	NC_017792	AAG	2	6	10165	10170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858185
128	NC_017792	TC	3	6	10177	10182	0 %	50 %	0 %	50 %	386858185
129	NC_017792	GA	3	6	10200	10205	50 %	0 %	50 %	0 %	386858185
130	NC_017792	A	6	6	10256	10261	100 %	0 %	0 %	0 %	386858185
131	NC_017792	AGG	2	6	10323	10328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858185
132	NC_017792	ATC	2	6	10352	10357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858185
133	NC_017792	ATG	2	6	10535	10540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858185
134	NC_017792	CAA	2	6	10607	10612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858185
135	NC_017792	CAG	2	6	10672	10677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858185
136	NC_017792	ATAC	2	8	10781	10788	50 %	25 %	0 %	25 %	386858185
137	NC_017792	ATTTTT	2	12	10791	10802	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386858185
138	NC_017792	GGA	2	6	10824	10829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858185
139	NC_017792	GTA	2	6	10921	10926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858185
140	NC_017792	GC	3	6	10932	10937	0 %	0 %	50 %	50 %	386858185
141	NC_017792	TCA	2	6	10971	10976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858185
142	NC_017792	A	7	7	10976	10982	100 %	0 %	0 %	0 %	386858185
143	NC_017792	A	6	6	11017	11022	100 %	0 %	0 %	0 %	386858185
144	NC_017792	T	6	6	11032	11037	0 %	100 %	0 %	0 %	386858185
145	NC_017792	T	6	6	11054	11059	0 %	100 %	0 %	0 %	386858185
146	NC_017792	TC	3	6	11126	11131	0 %	50 %	0 %	50 %	386858185
147	NC_017792	CAG	2	6	11365	11370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858185
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149	NC_017792	GCA	2	6	11385	11390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858185
150	NC_017792	CAG	2	6	11396	11401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858185
151	NC_017792	CTG	2	6	11416	11421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858185
152	NC_017792	CTC	2	6	11633	11638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858185
153	NC_017792	GA	3	6	11669	11674	50 %	0 %	50 %	0 %	386858185
154	NC_017792	GGA	2	6	11751	11756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858185
155	NC_017792	T	7	7	11760	11766	0 %	100 %	0 %	0 %	386858185
156	NC_017792	GAG	2	6	11777	11782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858185
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159	NC_017792	GTCG	2	8	12228	12235	0 %	25 %	50 %	25 %	386858185
160	NC_017792	GCA	2	6	12261	12266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858185
161	NC_017792	TCAA	2	8	12338	12345	50 %	25 %	0 %	25 %	386858185
162	NC_017792	TGTC	2	8	12372	12379	0 %	50 %	25 %	25 %	386858185
163	NC_017792	CCAG	2	8	12410	12417	25 %	0 %	25 %	50 %	386858185
164	NC_017792	ACCGG	2	10	12423	12432	20 %	0 %	40 %	40 %	386858185
165	NC_017792	CTG	2	6	12454	12459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858185
166	NC_017792	GAT	2	6	12505	12510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858185
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168	NC_017792	GCA	2	6	12576	12581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858185
169	NC_017792	GAC	2	6	12667	12672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858185
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256	NC_017792	CTC	2	6	17665	17670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858193
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259	NC_017792	AG	3	6	17803	17808	50 %	0 %	50 %	0 %	386858193
260	NC_017792	GAGG	2	8	17825	17832	25 %	0 %	75 %	0 %	386858193
261	NC_017792	GGA	2	6	17948	17953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858193
262	NC_017792	CAT	2	6	18006	18011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858193
263	NC_017792	GCC	2	6	18036	18041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858193
264	NC_017792	GCA	2	6	18081	18086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858193
265	NC_017792	TCA	2	6	18126	18131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858193
266	NC_017792	GCT	2	6	18204	18209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858193
267	NC_017792	GCC	2	6	18302	18307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858193
268	NC_017792	GT	3	6	18318	18323	0 %	50 %	50 %	0 %	386858193
269	NC_017792	TC	3	6	18370	18375	0 %	50 %	0 %	50 %	386858193
270	NC_017792	GGT	2	6	18385	18390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858193
271	NC_017792	TGT	2	6	18414	18419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858193
272	NC_017792	CTCG	2	8	19448	19455	0 %	25 %	25 %	50 %	386858194
273	NC_017792	CGAT	2	8	19501	19508	25 %	25 %	25 %	25 %	386858194
274	NC_017792	AGA	2	6	19659	19664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858194
275	NC_017792	CGTTC	2	10	19686	19695	0 %	40 %	20 %	40 %	386858194
276	NC_017792	ACC	2	6	19714	19719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858194
277	NC_017792	TCCT	2	8	19736	19743	0 %	50 %	0 %	50 %	386858194
278	NC_017792	CTG	2	6	19799	19804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858194
279	NC_017792	CACC	2	8	19805	19812	25 %	0 %	0 %	75 %	386858194
280	NC_017792	AGT	2	6	19868	19873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858194
281	NC_017792	CTGT	2	8	19893	19900	0 %	50 %	25 %	25 %	386858194
282	NC_017792	CTG	2	6	19935	19940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858194
283	NC_017792	GCC	2	6	19995	20000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858194
284	NC_017792	AGAGA	2	10	20047	20056	60 %	0 %	40 %	0 %	386858194
285	NC_017792	CGCC	2	8	20093	20100	0 %	0 %	25 %	75 %	386858194
286	NC_017792	CAG	2	6	20118	20123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858194
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288	NC_017792	CG	3	6	20161	20166	0 %	0 %	50 %	50 %	386858194
289	NC_017792	GCA	2	6	20215	20220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858194
290	NC_017792	CTG	2	6	20292	20297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858194
291	NC_017792	GCC	2	6	20314	20319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858194
292	NC_017792	TGGCC	2	10	20345	20354	0 %	20 %	40 %	40 %	386858194
293	NC_017792	CTTC	2	8	20366	20373	0 %	50 %	0 %	50 %	386858194
294	NC_017792	CGC	2	6	20439	20444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858194
295	NC_017792	CAC	2	6	20460	20465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858194
296	NC_017792	TCT	2	6	20558	20563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858194
297	NC_017792	TGA	2	6	20606	20611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858194
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300	NC_017792	TCT	2	6	20771	20776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858194
301	NC_017792	GGAG	2	8	20794	20801	25 %	0 %	75 %	0 %	386858194
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349	NC_017792	GAC	2	6	25166	25171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858201
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352	NC_017792	T	7	7	25418	25424	0 %	100 %	0 %	0 %	386858202
353	NC_017792	ATG	2	6	25448	25453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858202
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355	NC_017792	CCGAA	2	10	25511	25520	40 %	0 %	20 %	40 %	386858202
356	NC_017792	AAT	2	6	25544	25549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858202
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359	NC_017792	TTGA	2	8	25720	25727	25 %	50 %	25 %	0 %	386858202
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370	NC_017792	CT	3	6	26443	26448	0 %	50 %	0 %	50 %	386858202
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373	NC_017792	GA	3	6	26628	26633	50 %	0 %	50 %	0 %	386858202
374	NC_017792	CTGC	2	8	26852	26859	0 %	25 %	25 %	50 %	386858202
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377	NC_017792	A	6	6	26981	26986	100 %	0 %	0 %	0 %	386858202
378	NC_017792	CT	4	8	26989	26996	0 %	50 %	0 %	50 %	386858202
379	NC_017792	ATTC	2	8	27119	27126	25 %	50 %	0 %	25 %	386858203
380	NC_017792	ATC	2	6	27258	27263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858203
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392	NC_017792	GTA	2	6	27681	27686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858203
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499	NC_017792	AGATTG	2	12	35304	35315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858209
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