MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 chromosome

Total Repeats: 78165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017790	CTGG	2	8	48	55	0 %	25 %	50 %	25 %	386855209
2	NC_017790	AGG	2	6	80	85	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386855209
3	NC_017790	GC	3	6	179	184	0 %	0 %	50 %	50 %	386855209
4	NC_017790	TGC	2	6	209	214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855209
5	NC_017790	CTG	3	9	232	240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855209
6	NC_017790	CCG	2	6	253	258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855209
7	NC_017790	CCGG	2	8	271	278	0 %	0 %	50 %	50 %	386855209
8	NC_017790	CGC	3	9	296	304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855209
9	NC_017790	GTG	2	6	361	366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855209
10	NC_017790	AAC	3	9	373	381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386855209
11	NC_017790	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855209
12	NC_017790	GCCGG	2	10	417	426	0 %	0 %	60 %	40 %	386855209
13	NC_017790	TCA	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386855209
14	NC_017790	ACC	2	6	592	597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386855209
15	NC_017790	ACCGCT	2	12	608	619	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386855209
16	NC_017790	CTG	2	6	628	633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855209
17	NC_017790	GAC	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855209
18	NC_017790	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386855209
19	NC_017790	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386855209
20	NC_017790	ATC	2	6	727	732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386855209
21	NC_017790	AGC	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855209
22	NC_017790	GCC	2	6	747	752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855209
23	NC_017790	GCC	2	6	776	781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855209
24	NC_017790	GGC	2	6	874	879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855209
25	NC_017790	TCG	2	6	908	913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855209
26	NC_017790	GTG	2	6	964	969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855209
27	NC_017790	AAC	2	6	985	990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386855209
28	NC_017790	TGG	2	6	1007	1012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855209
29	NC_017790	CGC	2	6	1040	1045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855209
30	NC_017790	GAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386855209
31	NC_017790	TGC	2	6	1073	1078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855209
32	NC_017790	GTG	2	6	1114	1119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855209
33	NC_017790	GGGC	2	8	1129	1136	0 %	0 %	75 %	25 %	386855209
34	NC_017790	TGC	2	6	1148	1153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855209
35	NC_017790	TTC	2	6	1219	1224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386855209
36	NC_017790	CAA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386855209
37	NC_017790	GCA	3	9	1852	1860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855210
38	NC_017790	CCT	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386855210
39	NC_017790	CGG	2	6	1954	1959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855210
40	NC_017790	GCG	2	6	2026	2031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855210
41	NC_017790	GAACTC	2	12	2040	2051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386855210
42	NC_017790	CGTG	2	8	2069	2076	0 %	25 %	50 %	25 %	386855210
43	NC_017790	G	6	6	2078	2083	0 %	0 %	100 %	0 %	386855210
44	NC_017790	CGC	2	6	2114	2119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855210
45	NC_017790	CCG	2	6	2124	2129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855210
46	NC_017790	CCCA	2	8	2139	2146	25 %	0 %	0 %	75 %	386855210
47	NC_017790	GC	4	8	2178	2185	0 %	0 %	50 %	50 %	386855210
48	NC_017790	CGC	2	6	2204	2209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855210
49	NC_017790	GTG	2	6	2277	2282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855210
50	NC_017790	GCG	2	6	2326	2331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855210
51	NC_017790	TGCC	2	8	2350	2357	0 %	25 %	25 %	50 %	386855210
52	NC_017790	CGA	2	6	2366	2371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855210
53	NC_017790	TGC	2	6	2383	2388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855210
54	NC_017790	ACC	2	6	2436	2441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386855210
55	NC_017790	GAAG	2	8	2549	2556	50 %	0 %	50 %	0 %	386855210
56	NC_017790	AAC	2	6	2595	2600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386855210
57	NC_017790	GTG	2	6	2682	2687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855210
58	NC_017790	GGC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855210
59	NC_017790	GCT	2	6	2774	2779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855210
60	NC_017790	CG	3	6	2811	2816	0 %	0 %	50 %	50 %	386855210
61	NC_017790	GCG	3	9	2818	2826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855210
62	NC_017790	G	6	6	2826	2831	0 %	0 %	100 %	0 %	386855210
63	NC_017790	GCG	2	6	3597	3602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855211
64	NC_017790	GC	3	6	3612	3617	0 %	0 %	50 %	50 %	386855211
65	NC_017790	GCCG	2	8	3709	3716	0 %	0 %	50 %	50 %	386855211
66	NC_017790	TGG	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855211
67	NC_017790	GCT	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855211
68	NC_017790	CAA	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386855211
69	NC_017790	GGC	2	6	3800	3805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855211
70	NC_017790	CCGC	2	8	3834	3841	0 %	0 %	25 %	75 %	386855211
71	NC_017790	GCC	3	9	3842	3850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855211
72	NC_017790	GCA	2	6	3888	3893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855211
73	NC_017790	GAT	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386855211
74	NC_017790	TCA	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386855211
75	NC_017790	GGC	2	6	3935	3940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855211
76	NC_017790	GC	3	6	3939	3944	0 %	0 %	50 %	50 %	386855211
77	NC_017790	GC	3	6	3993	3998	0 %	0 %	50 %	50 %	386855211
78	NC_017790	GCGCT	2	10	4013	4022	0 %	20 %	40 %	40 %	386855211
79	NC_017790	GAA	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386855211
80	NC_017790	ACA	2	6	4074	4079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386855211
81	NC_017790	CGA	2	6	4090	4095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855211
82	NC_017790	GGC	2	6	4097	4102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855211
83	NC_017790	TGC	2	6	4143	4148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855211
84	NC_017790	CAT	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386855211
85	NC_017790	CCG	2	6	4209	4214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855211
86	NC_017790	ACC	2	6	4242	4247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386855211
87	NC_017790	TGG	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855211
88	NC_017790	GAC	2	6	4415	4420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855211
89	NC_017790	CCA	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386855211
90	NC_017790	TCA	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386855211
91	NC_017790	CGA	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855211
92	NC_017790	GCT	2	6	4690	4695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855211
93	NC_017790	CG	3	6	4838	4843	0 %	0 %	50 %	50 %	386855212
94	NC_017790	TCG	2	6	4851	4856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855212
95	NC_017790	CCA	2	6	4857	4862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386855212
96	NC_017790	ATG	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386855212
97	NC_017790	ACC	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386855212
98	NC_017790	CGC	2	6	4993	4998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855212
99	NC_017790	AAG	2	6	5000	5005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386855212
100	NC_017790	GAC	2	6	5117	5122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855212
101	NC_017790	CG	3	6	5139	5144	0 %	0 %	50 %	50 %	386855212
102	NC_017790	GCA	2	6	5148	5153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855212
103	NC_017790	GCT	3	9	5194	5202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855212
104	NC_017790	CGA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855212
105	NC_017790	ACG	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855212
106	NC_017790	ACC	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386855212
107	NC_017790	CGG	2	6	5272	5277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855212
108	NC_017790	GAA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386855212
109	NC_017790	CAA	2	6	5290	5295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386855212
110	NC_017790	TGCC	2	8	5328	5335	0 %	25 %	25 %	50 %	386855212
111	NC_017790	TCGT	2	8	5402	5409	0 %	50 %	25 %	25 %	386855212
112	NC_017790	CG	3	6	5415	5420	0 %	0 %	50 %	50 %	386855212
113	NC_017790	CTG	3	9	5426	5434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855212
114	NC_017790	CG	3	6	5449	5454	0 %	0 %	50 %	50 %	386855212
115	NC_017790	CAT	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386855212
116	NC_017790	GC	3	6	5552	5557	0 %	0 %	50 %	50 %	386855212
117	NC_017790	CAT	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386855212
118	NC_017790	TCA	2	6	5646	5651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386855212
119	NC_017790	ACG	2	6	5733	5738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855212
120	NC_017790	GCC	2	6	5771	5776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855212
121	NC_017790	GTCG	2	8	5794	5801	0 %	25 %	50 %	25 %	386855212
122	NC_017790	ATG	2	6	5804	5809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386855212
123	NC_017790	CAG	4	12	5858	5869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855212
124	NC_017790	CGG	2	6	5968	5973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855212
125	NC_017790	CGG	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855212
126	NC_017790	CCGC	2	8	5998	6005	0 %	0 %	25 %	75 %	386855212
127	NC_017790	GTG	2	6	6071	6076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855212
128	NC_017790	CGA	2	6	6106	6111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855212
129	NC_017790	ACG	2	6	6129	6134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855212
130	NC_017790	GAA	2	6	6139	6144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386855212
131	NC_017790	CGG	2	6	6183	6188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855212
132	NC_017790	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855212
133	NC_017790	GAC	2	6	6248	6253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855212
134	NC_017790	GC	3	6	6258	6263	0 %	0 %	50 %	50 %	386855212
135	NC_017790	TAC	2	6	6782	6787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386855213
136	NC_017790	GCA	2	6	6789	6794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855213
137	NC_017790	CGG	2	6	6796	6801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855213
138	NC_017790	GCC	3	9	6848	6856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855213
139	NC_017790	CGA	2	6	6934	6939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855213
140	NC_017790	CTC	2	6	6971	6976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386855213
141	NC_017790	ATC	2	6	6977	6982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386855213
142	NC_017790	GCGA	2	8	7010	7017	25 %	0 %	50 %	25 %	386855213
143	NC_017790	ATGC	2	8	7078	7085	25 %	25 %	25 %	25 %	386855213
144	NC_017790	GTC	2	6	7100	7105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855213
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146	NC_017790	GCA	2	6	7261	7266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855213
147	NC_017790	CTG	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855213
148	NC_017790	ATG	2	6	7346	7351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386855213
149	NC_017790	CGA	2	6	7408	7413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855213
150	NC_017790	CAA	2	6	7507	7512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386855213
151	NC_017790	GAC	2	6	7543	7548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855213
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153	NC_017790	CTGG	2	8	7636	7643	0 %	25 %	50 %	25 %	386855213
154	NC_017790	TGA	2	6	7644	7649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386855213
155	NC_017790	CGC	3	9	7666	7674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855213
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157	NC_017790	GC	4	8	7874	7881	0 %	0 %	50 %	50 %	386855214
158	NC_017790	GGC	2	6	7888	7893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855214
159	NC_017790	GC	3	6	7896	7901	0 %	0 %	50 %	50 %	386855214
160	NC_017790	GGT	2	6	7903	7908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855214
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162	NC_017790	TGC	2	6	7989	7994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855214
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165	NC_017790	CTG	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855214
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172	NC_017790	GTG	2	6	8216	8221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855214
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178	NC_017790	TGGA	2	8	8462	8469	25 %	25 %	50 %	0 %	386855214
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249	NC_017790	CGCC	2	8	11197	11204	0 %	0 %	25 %	75 %	386855218
250	NC_017790	CGG	2	6	11211	11216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855218
251	NC_017790	GGC	2	6	11221	11226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855218
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253	NC_017790	GTG	2	6	11301	11306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855218
254	NC_017790	GC	3	6	11344	11349	0 %	0 %	50 %	50 %	386855218
255	NC_017790	TGCG	2	8	11358	11365	0 %	25 %	50 %	25 %	386855218
256	NC_017790	GGCG	2	8	11390	11397	0 %	0 %	75 %	25 %	386855218
257	NC_017790	CCA	2	6	11410	11415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386855218
258	NC_017790	CGG	2	6	11431	11436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855218
259	NC_017790	AGG	2	6	11455	11460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386855218
260	NC_017790	CCTGC	2	10	11489	11498	0 %	20 %	20 %	60 %	386855218
261	NC_017790	GGC	2	6	11582	11587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855219
262	NC_017790	GCA	2	6	11602	11607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855219
263	NC_017790	CTG	2	6	11613	11618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855219
264	NC_017790	TGG	2	6	11641	11646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386855219
265	NC_017790	GCG	2	6	11665	11670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855219
266	NC_017790	GCT	2	6	11774	11779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855219
267	NC_017790	CGC	2	6	11815	11820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855219
268	NC_017790	CCG	2	6	11824	11829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855219
269	NC_017790	TGC	2	6	11845	11850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855219
270	NC_017790	GC	3	6	11897	11902	0 %	0 %	50 %	50 %	386855219
271	NC_017790	CCG	2	6	11903	11908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855219
272	NC_017790	CGC	2	6	11935	11940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855219
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287	NC_017790	CGA	2	6	12455	12460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855219
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371	NC_017790	CCGG	2	8	15393	15400	0 %	0 %	50 %	50 %	386855223
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377	NC_017790	G	6	6	15627	15632	0 %	0 %	100 %	0 %	386855223
378	NC_017790	GTC	2	6	15670	15675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855223
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382	NC_017790	CGTG	2	8	15789	15796	0 %	25 %	50 %	25 %	386855223
383	NC_017790	CGC	2	6	15829	15834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855223
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385	NC_017790	AGC	2	6	15848	15853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855223
386	NC_017790	GC	3	6	15852	15857	0 %	0 %	50 %	50 %	386855223
387	NC_017790	GC	3	6	15894	15899	0 %	0 %	50 %	50 %	386855223
388	NC_017790	GGC	2	6	15907	15912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386855223
389	NC_017790	CTC	2	6	15916	15921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386855223
390	NC_017790	C	6	6	15943	15948	0 %	0 %	0 %	100 %	386855223
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392	NC_017790	CGC	2	6	16228	16233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386855224
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497	NC_017790	G	7	7	20528	20534	0 %	0 %	100 %	0 %	386855228
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