MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017310	CAT	2	6	204832	204837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152026
4002	NC_017310	GTG	3	9	204890	204898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152026
4003	NC_017310	ATC	2	6	204899	204904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152026
4004	NC_017310	GTG	2	6	204993	204998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152026
4005	NC_017310	CG	3	6	205002	205007	0 %	0 %	50 %	50 %	387152026
4006	NC_017310	TCG	2	6	205053	205058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152026
4007	NC_017310	ATG	2	6	205073	205078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152026
4008	NC_017310	G	6	6	205095	205100	0 %	0 %	100 %	0 %	387152026
4009	NC_017310	GGT	2	6	205102	205107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152026
4010	NC_017310	GC	3	6	205138	205143	0 %	0 %	50 %	50 %	387152026
4011	NC_017310	GGT	2	6	205174	205179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152026
4012	NC_017310	GTG	2	6	205232	205237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152026
4013	NC_017310	TGC	2	6	205257	205262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152026
4014	NC_017310	TTC	2	6	205340	205345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152026
4015	NC_017310	TGG	2	6	205374	205379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152026
4016	NC_017310	GCT	2	6	205384	205389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152026
4017	NC_017310	TGG	2	6	205446	205451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152026
4018	NC_017310	GGGGCT	2	12	205594	205605	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387152026
4019	NC_017310	TCT	2	6	205611	205616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152026
4020	NC_017310	CGTGGG	2	12	205621	205632	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387152026
4021	NC_017310	TCG	2	6	205643	205648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152026
4022	NC_017310	GGC	2	6	205651	205656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152026
4023	NC_017310	GCA	2	6	205663	205668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152026
4024	NC_017310	CCG	2	6	205701	205706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152026
4025	NC_017310	GGT	2	6	205768	205773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152026
4026	NC_017310	TCA	2	6	205797	205802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152026
4027	NC_017310	CGG	2	6	205833	205838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152026
4028	NC_017310	GCC	2	6	205865	205870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152026
4029	NC_017310	CTA	2	6	205921	205926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152026
4030	NC_017310	AGC	2	6	206231	206236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152027
4031	NC_017310	GAT	2	6	206284	206289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152027
4032	NC_017310	TGT	2	6	206352	206357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152027
4033	NC_017310	GAT	2	6	206371	206376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152027
4034	NC_017310	GCC	2	6	206402	206407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152027
4035	NC_017310	CAC	2	6	206467	206472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152027
4036	NC_017310	CCA	2	6	206484	206489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152027
4037	NC_017310	CGCC	2	8	206526	206533	0 %	0 %	25 %	75 %	387152027
4038	NC_017310	GGC	2	6	206569	206574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152027
4039	NC_017310	CGCC	2	8	206586	206593	0 %	0 %	25 %	75 %	387152027
4040	NC_017310	CACC	2	8	206598	206605	25 %	0 %	0 %	75 %	387152027
4041	NC_017310	C	6	6	206610	206615	0 %	0 %	0 %	100 %	387152027
4042	NC_017310	CG	3	6	206644	206649	0 %	0 %	50 %	50 %	387152027
4043	NC_017310	GCA	2	6	206658	206663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152027
4044	NC_017310	CCGC	2	8	206759	206766	0 %	0 %	25 %	75 %	387152027
4045	NC_017310	CCGCG	2	10	206794	206803	0 %	0 %	40 %	60 %	387152027
4046	NC_017310	CGC	2	6	206818	206823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152027
4047	NC_017310	C	6	6	206846	206851	0 %	0 %	0 %	100 %	387152027
4048	NC_017310	GTT	2	6	206898	206903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152027
4049	NC_017310	TGCGG	2	10	206972	206981	0 %	20 %	60 %	20 %	387152027
4050	NC_017310	CAC	2	6	206992	206997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152027
4051	NC_017310	TGCC	2	8	207021	207028	0 %	25 %	25 %	50 %	387152027
4052	NC_017310	GTG	2	6	207035	207040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152027
4053	NC_017310	CGG	2	6	207045	207050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152027
4054	NC_017310	CCA	2	6	207051	207056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152027
4055	NC_017310	AGGCA	2	10	207105	207114	40 %	0 %	40 %	20 %	387152027
4056	NC_017310	GGC	2	6	207115	207120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152027
4057	NC_017310	ACG	2	6	207141	207146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152027
4058	NC_017310	CGG	2	6	207162	207167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152027
4059	NC_017310	GGC	2	6	207172	207177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152027
4060	NC_017310	CAG	2	6	207178	207183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152027
4061	NC_017310	CGGC	2	8	207511	207518	0 %	0 %	50 %	50 %	387152028
4062	NC_017310	GGC	2	6	207541	207546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152028
4063	NC_017310	CCTG	2	8	207600	207607	0 %	25 %	25 %	50 %	387152028
4064	NC_017310	GAA	2	6	207680	207685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152028
4065	NC_017310	TCA	2	6	207771	207776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152028
4066	NC_017310	GCG	2	6	207790	207795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152028
4067	NC_017310	CGA	2	6	207844	207849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152028
4068	NC_017310	TCG	2	6	207855	207860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152028
4069	NC_017310	GGT	2	6	207934	207939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152028
4070	NC_017310	TGC	2	6	207954	207959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152028
4071	NC_017310	GAT	2	6	208103	208108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152028
4072	NC_017310	ACCG	2	8	208151	208158	25 %	0 %	25 %	50 %	387152028
4073	NC_017310	AGG	2	6	208170	208175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152028
4074	NC_017310	GTG	2	6	208203	208208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152028
4075	NC_017310	GGCA	2	8	208213	208220	25 %	0 %	50 %	25 %	387152028
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4080	NC_017310	GAC	2	6	208426	208431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152028
4081	NC_017310	TGC	2	6	208479	208484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152028
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4083	NC_017310	GGT	2	6	208516	208521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152028
4084	NC_017310	CG	3	6	208560	208565	0 %	0 %	50 %	50 %	387152028
4085	NC_017310	GTG	2	6	208572	208577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152028
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4089	NC_017310	GCA	2	6	208730	208735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152028
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4091	NC_017310	CGG	2	6	209048	209053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152029
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4093	NC_017310	CGC	2	6	209109	209114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152029
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4099	NC_017310	CCATC	2	10	209495	209504	20 %	20 %	0 %	60 %	387152029
4100	NC_017310	CCGC	2	8	209548	209555	0 %	0 %	25 %	75 %	387152029
4101	NC_017310	GCG	2	6	209563	209568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152029
4102	NC_017310	CAT	2	6	210148	210153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152030
4103	NC_017310	CCGCAA	2	12	210154	210165	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387152030
4104	NC_017310	GCA	2	6	210240	210245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152030
4105	NC_017310	ACG	2	6	210272	210277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152030
4106	NC_017310	TCT	2	6	210282	210287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152030
4107	NC_017310	GCG	2	6	210311	210316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152030
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4110	NC_017310	TCA	3	9	210354	210362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152030
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4117	NC_017310	ACA	2	6	210558	210563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152030
4118	NC_017310	GCT	2	6	210571	210576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152030
4119	NC_017310	TCA	2	6	210588	210593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152030
4120	NC_017310	TCA	2	6	210648	210653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152030
4121	NC_017310	GGC	3	9	210668	210676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152030
4122	NC_017310	CGG	3	9	210688	210696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152030
4123	NC_017310	CAC	2	6	210703	210708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152030
4124	NC_017310	C	6	6	210743	210748	0 %	0 %	0 %	100 %	387152030
4125	NC_017310	CGA	2	6	210760	210765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152030
4126	NC_017310	CGG	2	6	210778	210783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152030
4127	NC_017310	GGC	2	6	210815	210820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152030
4128	NC_017310	GTG	2	6	210824	210829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152030
4129	NC_017310	CAT	2	6	210844	210849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152030
4130	NC_017310	CGG	3	9	210856	210864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152030
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4132	NC_017310	ACC	2	6	210914	210919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152030
4133	NC_017310	ATC	2	6	210941	210946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152030
4134	NC_017310	CCG	2	6	210951	210956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152030
4135	NC_017310	TGC	2	6	211020	211025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152030
4136	NC_017310	GCT	2	6	211033	211038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152030
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4140	NC_017310	TCA	2	6	211125	211130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152030
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4145	NC_017310	CAT	2	6	211222	211227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152030
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4149	NC_017310	CAA	3	9	211319	211327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152031
4150	NC_017310	TGC	2	6	211348	211353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152031
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4152	NC_017310	TCA	2	6	211384	211389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152031
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4154	NC_017310	AAG	2	6	211419	211424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152031
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4159	NC_017310	GCC	2	6	211569	211574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152031
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4224	NC_017310	GACG	2	8	215138	215145	25 %	0 %	50 %	25 %	387152036
4225	NC_017310	GGT	2	6	215188	215193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152036
4226	NC_017310	CTG	2	6	215234	215239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152036
4227	NC_017310	CAG	2	6	215240	215245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152036
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4230	NC_017310	CAG	2	6	215738	215743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152037
4231	NC_017310	CGC	2	6	215758	215763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152037
4232	NC_017310	CGC	2	6	215787	215792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152037
4233	NC_017310	CAT	2	6	215823	215828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152037
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4235	NC_017310	GCCA	2	8	216007	216014	25 %	0 %	25 %	50 %	387152037
4236	NC_017310	TGG	2	6	216065	216070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152037
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4238	NC_017310	TCA	2	6	216173	216178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152037
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4240	NC_017310	CAC	2	6	216222	216227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152037
4241	NC_017310	CAT	2	6	216336	216341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152037
4242	NC_017310	CGG	2	6	216365	216370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152037
4243	NC_017310	GGC	2	6	216405	216410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152037
4244	NC_017310	CGG	2	6	216474	216479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152037
4245	NC_017310	TGG	2	6	216524	216529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152037
4246	NC_017310	GAG	2	6	216544	216549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152037
4247	NC_017310	GCC	2	6	216556	216561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152037
4248	NC_017310	GTGCTG	2	12	216592	216603	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387152037
4249	NC_017310	TGC	2	6	216632	216637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152037
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4251	NC_017310	CAT	2	6	216648	216653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152037
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4255	NC_017310	CAT	2	6	216780	216785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152037
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4257	NC_017310	GCC	2	6	217012	217017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152037
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4264	NC_017310	GGC	2	6	217173	217178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152037
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4266	NC_017310	CTT	2	6	217257	217262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152037
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4269	NC_017310	G	6	6	217332	217337	0 %	0 %	100 %	0 %	387152037
4270	NC_017310	CGT	2	6	217373	217378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152037
4271	NC_017310	CTG	2	6	217572	217577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152038
4272	NC_017310	ACG	2	6	217639	217644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152038
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4346	NC_017310	TCG	2	6	221484	221489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152042
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4348	NC_017310	TTC	2	6	222000	222005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152043
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4350	NC_017310	GAT	2	6	222135	222140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152043
4351	NC_017310	GCA	2	6	222145	222150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152043
4352	NC_017310	TCG	2	6	222151	222156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152043
4353	NC_017310	GC	3	6	222172	222177	0 %	0 %	50 %	50 %	387152043
4354	NC_017310	CGTC	2	8	222187	222194	0 %	25 %	25 %	50 %	387152043
4355	NC_017310	GAC	2	6	222222	222227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152043
4356	NC_017310	GA	3	6	222244	222249	50 %	0 %	50 %	0 %	387152043
4357	NC_017310	CGC	2	6	222263	222268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152043
4358	NC_017310	TCG	3	9	222340	222348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152043
4359	NC_017310	GAC	2	6	222557	222562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152044
4360	NC_017310	CACC	2	8	222565	222572	25 %	0 %	0 %	75 %	387152044
4361	NC_017310	GTC	2	6	222608	222613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152044
4362	NC_017310	ATG	2	6	222666	222671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152044
4363	NC_017310	AC	3	6	222691	222696	50 %	0 %	0 %	50 %	387152044
4364	NC_017310	GC	3	6	222702	222707	0 %	0 %	50 %	50 %	387152044
4365	NC_017310	CGC	2	6	222763	222768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152044
4366	NC_017310	CAG	2	6	222806	222811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152044
4367	NC_017310	ATG	2	6	222904	222909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152044
4368	NC_017310	GC	3	6	222912	222917	0 %	0 %	50 %	50 %	387152044
4369	NC_017310	TGA	2	6	222997	223002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152044
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4371	NC_017310	CGC	2	6	223057	223062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152044
4372	NC_017310	GCA	2	6	223096	223101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152044
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4374	NC_017310	CCG	2	6	223122	223127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152044
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4381	NC_017310	GA	3	6	223257	223262	50 %	0 %	50 %	0 %	387152044
4382	NC_017310	CAG	2	6	223274	223279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152044
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4385	NC_017310	AGCC	2	8	223421	223428	25 %	0 %	25 %	50 %	387152045
4386	NC_017310	GAA	2	6	223456	223461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152045
4387	NC_017310	TCG	2	6	223487	223492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152045
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4391	NC_017310	TCG	2	6	223793	223798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152046
4392	NC_017310	TCT	2	6	223821	223826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152046
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4401	NC_017310	GGC	2	6	224096	224101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152046
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4424	NC_017310	GCC	2	6	225263	225268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152047
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4460	NC_017310	TTG	2	6	227283	227288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152049
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4462	NC_017310	CGT	3	9	227338	227346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152049
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4465	NC_017310	GC	3	6	227370	227375	0 %	0 %	50 %	50 %	387152049
4466	NC_017310	CCCGAC	2	12	227430	227441	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387152049
4467	NC_017310	CATC	2	8	227515	227522	25 %	25 %	0 %	50 %	387152049
4468	NC_017310	GCC	2	6	227523	227528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152049
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4471	NC_017310	CAG	3	9	227594	227602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152049
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4478	NC_017310	CTG	2	6	227892	227897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152049
4479	NC_017310	CTA	2	6	227933	227938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152049
4480	NC_017310	TCA	2	6	227950	227955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152049
4481	NC_017310	CGC	2	6	227982	227987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152049
4482	NC_017310	TCA	2	6	228016	228021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152049
4483	NC_017310	GTG	2	6	228067	228072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152049
4484	NC_017310	TGC	2	6	228085	228090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152049
4485	NC_017310	TCA	2	6	228130	228135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152049
4486	NC_017310	CAT	2	6	228164	228169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152049
4487	NC_017310	GGCCGA	2	12	228221	228232	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387152049
4488	NC_017310	G	7	7	228305	228311	0 %	0 %	100 %	0 %	387152049
4489	NC_017310	GGGC	2	8	228325	228332	0 %	0 %	75 %	25 %	387152049
4490	NC_017310	G	6	6	228347	228352	0 %	0 %	100 %	0 %	387152049
4491	NC_017310	GGC	2	6	228426	228431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152049
4492	NC_017310	GGC	2	6	228474	228479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152049
4493	NC_017310	GAT	2	6	228486	228491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152049
4494	NC_017310	TCG	2	6	228503	228508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152049
4495	NC_017310	CCA	2	6	228517	228522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152049
4496	NC_017310	ATG	2	6	228535	228540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152049
4497	NC_017310	GAT	2	6	228555	228560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152049
4498	NC_017310	GTG	2	6	228565	228570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152049
4499	NC_017310	CCT	2	6	228573	228578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152049
4500	NC_017310	GTG	2	6	228588	228593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152049

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