MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017310	TTC	2	6	180169	180174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152005
3502	NC_017310	CGG	2	6	180195	180200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152005
3503	NC_017310	TCC	2	6	180205	180210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152005
3504	NC_017310	TCG	2	6	180370	180375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152005
3505	NC_017310	CAG	2	6	180378	180383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152005
3506	NC_017310	GCT	2	6	180425	180430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152005
3507	NC_017310	CAG	2	6	180492	180497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152005
3508	NC_017310	CCT	2	6	180518	180523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152005
3509	NC_017310	GCG	2	6	180534	180539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152005
3510	NC_017310	CTG	2	6	180600	180605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152005
3511	NC_017310	GAT	2	6	180678	180683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152005
3512	NC_017310	TTC	2	6	180699	180704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152005
3513	NC_017310	GAC	3	9	180759	180767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152005
3514	NC_017310	GCA	2	6	180803	180808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152005
3515	NC_017310	GC	3	6	180949	180954	0 %	0 %	50 %	50 %	387152006
3516	NC_017310	GAT	2	6	181063	181068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152006
3517	NC_017310	CGCCGA	2	12	181092	181103	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387152006
3518	NC_017310	GAC	2	6	181105	181110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152006
3519	NC_017310	AGC	2	6	181112	181117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152006
3520	NC_017310	GAT	2	6	181135	181140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152006
3521	NC_017310	GCG	2	6	181155	181160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152006
3522	NC_017310	GAT	2	6	181189	181194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152006
3523	NC_017310	GCCT	2	8	181234	181241	0 %	25 %	25 %	50 %	387152006
3524	NC_017310	CCG	2	6	181329	181334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152006
3525	NC_017310	GGGA	2	8	181339	181346	25 %	0 %	75 %	0 %	387152006
3526	NC_017310	GCG	2	6	181404	181409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152006
3527	NC_017310	TGG	2	6	181434	181439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152006
3528	NC_017310	GCC	2	6	181454	181459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152006
3529	NC_017310	CCG	2	6	181517	181522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152006
3530	NC_017310	TGA	2	6	181527	181532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152006
3531	NC_017310	AGC	3	9	181556	181564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152006
3532	NC_017310	CTT	2	6	181726	181731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152007
3533	NC_017310	GCT	2	6	181791	181796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152007
3534	NC_017310	CGT	2	6	181803	181808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152007
3535	NC_017310	GACCTT	2	12	181882	181893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387152007
3536	NC_017310	CGG	2	6	181902	181907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152007
3537	NC_017310	ACG	2	6	181925	181930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152007
3538	NC_017310	GCCA	2	8	181960	181967	25 %	0 %	25 %	50 %	387152007
3539	NC_017310	GTT	2	6	181990	181995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152007
3540	NC_017310	GACG	2	8	182044	182051	25 %	0 %	50 %	25 %	387152007
3541	NC_017310	CGA	2	6	182070	182075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152007
3542	NC_017310	ATC	2	6	182132	182137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152007
3543	NC_017310	GTA	2	6	182149	182154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152007
3544	NC_017310	CGG	2	6	182175	182180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152007
3545	NC_017310	GAT	2	6	182245	182250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152007
3546	NC_017310	GCT	2	6	182397	182402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152007
3547	NC_017310	C	7	7	183551	183557	0 %	0 %	0 %	100 %	387152008
3548	NC_017310	CTG	2	6	183606	183611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152008
3549	NC_017310	GTG	2	6	183612	183617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152008
3550	NC_017310	GGC	2	6	183626	183631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152008
3551	NC_017310	AGC	2	6	183632	183637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152008
3552	NC_017310	TGG	2	6	183652	183657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152008
3553	NC_017310	G	7	7	183656	183662	0 %	0 %	100 %	0 %	387152008
3554	NC_017310	CGC	2	6	183695	183700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152008
3555	NC_017310	CGG	2	6	183706	183711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152008
3556	NC_017310	CTG	2	6	183726	183731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152008
3557	NC_017310	CGG	2	6	183824	183829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152008
3558	NC_017310	CGAGGT	2	12	183845	183856	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387152008
3559	NC_017310	CTG	2	6	183879	183884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152008
3560	NC_017310	CGCA	2	8	183897	183904	25 %	0 %	25 %	50 %	387152008
3561	NC_017310	AG	3	6	183917	183922	50 %	0 %	50 %	0 %	387152008
3562	NC_017310	CAGA	2	8	183939	183946	50 %	0 %	25 %	25 %	387152008
3563	NC_017310	TCT	2	6	184027	184032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152008
3564	NC_017310	CAG	2	6	184062	184067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152008
3565	NC_017310	CGA	2	6	184091	184096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152008
3566	NC_017310	TGG	2	6	184186	184191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152008
3567	NC_017310	ACA	2	6	184192	184197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152008
3568	NC_017310	AGG	2	6	184300	184305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152008
3569	NC_017310	TGCG	2	8	184328	184335	0 %	25 %	50 %	25 %	387152008
3570	NC_017310	ACG	2	6	184348	184353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152008
3571	NC_017310	GAC	2	6	184354	184359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152008
3572	NC_017310	CAT	2	6	184382	184387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152008
3573	NC_017310	CGT	2	6	184406	184411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152008
3574	NC_017310	CCG	2	6	184451	184456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152008
3575	NC_017310	CGA	2	6	184457	184462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152008
3576	NC_017310	TTC	2	6	184476	184481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152008
3577	NC_017310	AGG	3	9	184489	184497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152008
3578	NC_017310	GGC	2	6	184545	184550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152008
3579	NC_017310	TGC	2	6	184600	184605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152008
3580	NC_017310	GAC	2	6	184617	184622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152008
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3582	NC_017310	ACG	2	6	184647	184652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152009
3583	NC_017310	CAT	2	6	184716	184721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152009
3584	NC_017310	TCA	3	9	184851	184859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152009
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3586	NC_017310	CCA	2	6	184896	184901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152009
3587	NC_017310	GCC	2	6	184983	184988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152009
3588	NC_017310	CGG	2	6	185029	185034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152009
3589	NC_017310	TGG	2	6	185049	185054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152009
3590	NC_017310	GCTGGT	2	12	185116	185127	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387152009
3591	NC_017310	CGGGCA	2	12	185139	185150	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387152009
3592	NC_017310	TGG	2	6	185157	185162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152009
3593	NC_017310	GCG	2	6	185325	185330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152009
3594	NC_017310	CGA	2	6	185344	185349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152009
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3598	NC_017310	CGC	2	6	185461	185466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152009
3599	NC_017310	GCC	2	6	185486	185491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152009
3600	NC_017310	CTA	2	6	185521	185526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152009
3601	NC_017310	GTC	2	6	185537	185542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152009
3602	NC_017310	C	6	6	185584	185589	0 %	0 %	0 %	100 %	387152009
3603	NC_017310	CTT	2	6	185599	185604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152009
3604	NC_017310	CCAT	2	8	185680	185687	25 %	25 %	0 %	50 %	387152009
3605	NC_017310	TGC	2	6	185757	185762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152009
3606	NC_017310	GCA	2	6	185799	185804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152009
3607	NC_017310	CGA	2	6	185821	185826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152009
3608	NC_017310	CGA	2	6	185836	185841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152009
3609	NC_017310	CTG	2	6	185843	185848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152009
3610	NC_017310	GAC	2	6	185879	185884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152009
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3613	NC_017310	CGG	2	6	185950	185955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152009
3614	NC_017310	GCG	2	6	185969	185974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152009
3615	NC_017310	AGC	2	6	186039	186044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152009
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3617	NC_017310	ATC	2	6	186252	186257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152010
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3619	NC_017310	CTGC	2	8	186413	186420	0 %	25 %	25 %	50 %	387152010
3620	NC_017310	CGC	2	6	186474	186479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152010
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3737	NC_017310	GAGT	2	8	193567	193574	25 %	25 %	50 %	0 %	387152016
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3982	NC_017310	GCC	2	6	204163	204168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152025
3983	NC_017310	GC	3	6	204182	204187	0 %	0 %	50 %	50 %	387152025
3984	NC_017310	TGG	2	6	204237	204242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152025
3985	NC_017310	TGA	2	6	204249	204254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152025
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