MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017310	GGA	2	6	834593	834598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152549
16003	NC_017310	ACCCG	2	10	834629	834638	20 %	0 %	20 %	60 %	387152549
16004	NC_017310	TGC	2	6	834652	834657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152549
16005	NC_017310	GGA	2	6	834719	834724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152549
16006	NC_017310	TGG	2	6	834805	834810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152549
16007	NC_017310	CG	3	6	834829	834834	0 %	0 %	50 %	50 %	387152549
16008	NC_017310	GCA	2	6	834867	834872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152549
16009	NC_017310	CGA	2	6	834890	834895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152549
16010	NC_017310	ATG	2	6	835028	835033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152549
16011	NC_017310	ATG	2	6	835036	835041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152550
16012	NC_017310	TCT	2	6	835101	835106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152550
16013	NC_017310	GTG	2	6	835228	835233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152550
16014	NC_017310	GCC	2	6	835252	835257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152550
16015	NC_017310	TGC	2	6	835298	835303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152550
16016	NC_017310	GGCA	2	8	835349	835356	25 %	0 %	50 %	25 %	387152550
16017	NC_017310	GTG	2	6	835370	835375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152550
16018	NC_017310	GCC	2	6	835386	835391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152550
16019	NC_017310	GT	3	6	835404	835409	0 %	50 %	50 %	0 %	387152550
16020	NC_017310	GCAG	2	8	835432	835439	25 %	0 %	50 %	25 %	387152550
16021	NC_017310	GCT	2	6	835479	835484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152550
16022	NC_017310	CAC	2	6	835533	835538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152550
16023	NC_017310	TGC	2	6	835565	835570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152550
16024	NC_017310	C	6	6	835606	835611	0 %	0 %	0 %	100 %	387152550
16025	NC_017310	GAG	2	6	835675	835680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152550
16026	NC_017310	TCC	2	6	835682	835687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152550
16027	NC_017310	GTG	2	6	835792	835797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152550
16028	NC_017310	CGG	2	6	835837	835842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152550
16029	NC_017310	GC	3	6	835857	835862	0 %	0 %	50 %	50 %	387152550
16030	NC_017310	TGG	2	6	836021	836026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152550
16031	NC_017310	GGAC	2	8	836051	836058	25 %	0 %	50 %	25 %	387152550
16032	NC_017310	GCC	3	9	836089	836097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152550
16033	NC_017310	ACGGC	2	10	836183	836192	20 %	0 %	40 %	40 %	387152550
16034	NC_017310	GC	3	6	836191	836196	0 %	0 %	50 %	50 %	387152550
16035	NC_017310	TGC	2	6	836219	836224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152550
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16038	NC_017310	GACG	2	8	836262	836269	25 %	0 %	50 %	25 %	387152550
16039	NC_017310	AGGCCG	2	12	836291	836302	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387152550
16040	NC_017310	CG	3	6	836301	836306	0 %	0 %	50 %	50 %	387152550
16041	NC_017310	CCA	2	6	836321	836326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152550
16042	NC_017310	CAT	2	6	836379	836384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152550
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16044	NC_017310	GGC	2	6	836475	836480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152550
16045	NC_017310	CTG	2	6	836494	836499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152550
16046	NC_017310	GTC	2	6	836554	836559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152550
16047	NC_017310	CGG	2	6	836582	836587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152550
16048	NC_017310	GCGG	2	8	836595	836602	0 %	0 %	75 %	25 %	387152550
16049	NC_017310	TCC	2	6	836609	836614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152550
16050	NC_017310	GCG	2	6	836633	836638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152550
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16052	NC_017310	TGC	2	6	836733	836738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152550
16053	NC_017310	CGT	2	6	836796	836801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152550
16054	NC_017310	TTTC	2	8	836807	836814	0 %	75 %	0 %	25 %	387152550
16055	NC_017310	GCG	2	6	836825	836830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152550
16056	NC_017310	CAC	2	6	836874	836879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152550
16057	NC_017310	CAT	2	6	836928	836933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152550
16058	NC_017310	CGG	2	6	836943	836948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152550
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16060	NC_017310	TTC	2	6	837043	837048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152551
16061	NC_017310	CGGG	2	8	837099	837106	0 %	0 %	75 %	25 %	387152551
16062	NC_017310	GCC	2	6	837164	837169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152551
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16066	NC_017310	CTG	2	6	837261	837266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152551
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16078	NC_017310	CGGTG	2	10	837752	837761	0 %	20 %	60 %	20 %	387152551
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16119	NC_017310	CGC	2	6	840513	840518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152553
16120	NC_017310	GCT	2	6	840653	840658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152553
16121	NC_017310	ATG	2	6	840777	840782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152553
16122	NC_017310	GGC	2	6	840786	840791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152553
16123	NC_017310	CAC	2	6	840818	840823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152553
16124	NC_017310	GCG	2	6	840929	840934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152553
16125	NC_017310	GC	4	8	840939	840946	0 %	0 %	50 %	50 %	387152553
16126	NC_017310	CGG	2	6	841029	841034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152554
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16128	NC_017310	CTG	2	6	841091	841096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152554
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16130	NC_017310	CTG	2	6	841205	841210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152554
16131	NC_017310	CGA	2	6	841264	841269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152554
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16139	NC_017310	CGAA	2	8	841728	841735	50 %	0 %	25 %	25 %	387152555
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16143	NC_017310	CGT	2	6	842033	842038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152555
16144	NC_017310	CGT	2	6	842066	842071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152555
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16148	NC_017310	G	7	7	842214	842220	0 %	0 %	100 %	0 %	387152555
16149	NC_017310	ATCCAC	2	12	842247	842258	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387152555
16150	NC_017310	GGGC	2	8	842269	842276	0 %	0 %	75 %	25 %	387152555
16151	NC_017310	CCA	2	6	842343	842348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152555
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16154	NC_017310	GGT	3	9	842604	842612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152555
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16183	NC_017310	GTC	2	6	844135	844140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152556
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16187	NC_017310	GTCGCA	2	12	844236	844247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387152556
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16219	NC_017310	TCATC	2	10	845885	845894	20 %	40 %	0 %	40 %	387152557
16220	NC_017310	CG	3	6	845897	845902	0 %	0 %	50 %	50 %	387152557
16221	NC_017310	AGC	2	6	845929	845934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152557
16222	NC_017310	GCAA	2	8	845935	845942	50 %	0 %	25 %	25 %	387152557
16223	NC_017310	TGA	2	6	845946	845951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152557
16224	NC_017310	GTG	2	6	845992	845997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152557
16225	NC_017310	CCA	2	6	846030	846035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152557
16226	NC_017310	CTTC	2	8	846043	846050	0 %	50 %	0 %	50 %	387152557
16227	NC_017310	CG	3	6	846097	846102	0 %	0 %	50 %	50 %	387152557
16228	NC_017310	GCA	2	6	846182	846187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152557
16229	NC_017310	CGCC	2	8	846203	846210	0 %	0 %	25 %	75 %	387152557
16230	NC_017310	CTG	2	6	846217	846222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152557
16231	NC_017310	TGA	2	6	846266	846271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152557
16232	NC_017310	TGC	2	6	846302	846307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152557
16233	NC_017310	GCCA	2	8	846310	846317	25 %	0 %	25 %	50 %	387152557
16234	NC_017310	CGA	2	6	846395	846400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152557
16235	NC_017310	GCG	2	6	846414	846419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152557
16236	NC_017310	CCT	2	6	846443	846448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152557
16237	NC_017310	GCT	2	6	846568	846573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152557
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16344	NC_017310	CTG	2	6	853150	853155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152562
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16350	NC_017310	ATGA	2	8	853355	853362	50 %	25 %	25 %	0 %	387152562
16351	NC_017310	CGG	2	6	853466	853471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152563
16352	NC_017310	TCC	2	6	853487	853492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152563
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16474	NC_017310	GTCC	2	8	860749	860756	0 %	25 %	25 %	50 %	387152572
16475	NC_017310	GGC	3	9	860761	860769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152572
16476	NC_017310	GTC	2	6	860879	860884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152572
16477	NC_017310	ACG	2	6	860889	860894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152572
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16480	NC_017310	GTGC	2	8	860916	860923	0 %	25 %	50 %	25 %	387152572
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