MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017310	GCG	2	6	518096	518101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152284
10002	NC_017310	TC	3	6	518103	518108	0 %	50 %	0 %	50 %	387152284
10003	NC_017310	GCG	2	6	518117	518122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152284
10004	NC_017310	GAA	2	6	518131	518136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152284
10005	NC_017310	ATCTCC	2	12	518207	518218	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387152284
10006	NC_017310	GGC	2	6	518225	518230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152284
10007	NC_017310	ACG	2	6	518276	518281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152284
10008	NC_017310	CAG	2	6	518305	518310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152284
10009	NC_017310	GGT	3	9	518371	518379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152284
10010	NC_017310	C	6	6	518417	518422	0 %	0 %	0 %	100 %	387152284
10011	NC_017310	CGA	2	6	518439	518444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152284
10012	NC_017310	CAT	2	6	518463	518468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152284
10013	NC_017310	GTG	2	6	518471	518476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152284
10014	NC_017310	GTG	2	6	518479	518484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152284
10015	NC_017310	CG	4	8	519389	519396	0 %	0 %	50 %	50 %	387152285
10016	NC_017310	GGT	3	9	519530	519538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152285
10017	NC_017310	CGC	3	9	519583	519591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152285
10018	NC_017310	TCA	2	6	519592	519597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152285
10019	NC_017310	AAG	2	6	519609	519614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152285
10020	NC_017310	TGC	2	6	519655	519660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152285
10021	NC_017310	CGC	2	6	519677	519682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152285
10022	NC_017310	GGA	2	6	519692	519697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152285
10023	NC_017310	TCG	2	6	519715	519720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152285
10024	NC_017310	AAC	2	6	519835	519840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152285
10025	NC_017310	ACG	2	6	519859	519864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152285
10026	NC_017310	GGT	2	6	519866	519871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152285
10027	NC_017310	CTG	2	6	519930	519935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152285
10028	NC_017310	GTG	2	6	519948	519953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152285
10029	NC_017310	GCT	2	6	519992	519997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152285
10030	NC_017310	G	6	6	520093	520098	0 %	0 %	100 %	0 %	387152285
10031	NC_017310	CGA	2	6	520130	520135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152285
10032	NC_017310	GAA	2	6	520248	520253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152285
10033	NC_017310	ACG	2	6	520273	520278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152285
10034	NC_017310	CG	3	6	520365	520370	0 %	0 %	50 %	50 %	387152286
10035	NC_017310	GTG	2	6	520426	520431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152286
10036	NC_017310	CTT	2	6	520452	520457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152286
10037	NC_017310	GCG	2	6	520552	520557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152286
10038	NC_017310	GGC	2	6	520558	520563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152286
10039	NC_017310	GGCT	2	8	520618	520625	0 %	25 %	50 %	25 %	387152286
10040	NC_017310	GACG	2	8	520662	520669	25 %	0 %	50 %	25 %	387152286
10041	NC_017310	TCA	2	6	520733	520738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152286
10042	NC_017310	CGG	2	6	520770	520775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152286
10043	NC_017310	TCGT	2	8	520825	520832	0 %	50 %	25 %	25 %	387152286
10044	NC_017310	CCA	2	6	520853	520858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152286
10045	NC_017310	GGC	2	6	520894	520899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152286
10046	NC_017310	CGG	2	6	520926	520931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152286
10047	NC_017310	TGC	2	6	520985	520990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152286
10048	NC_017310	TCCTC	2	10	520997	521006	0 %	40 %	0 %	60 %	387152286
10049	NC_017310	GGT	2	6	521007	521012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152286
10050	NC_017310	TTCAGC	2	12	521071	521082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387152286
10051	NC_017310	CAT	2	6	521208	521213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152286
10052	NC_017310	GAC	2	6	521217	521222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152286
10053	NC_017310	CTG	2	6	521236	521241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152286
10054	NC_017310	CAT	2	6	521256	521261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152286
10055	NC_017310	CAC	2	6	521328	521333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152286
10056	NC_017310	CAT	2	6	521343	521348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152286
10057	NC_017310	GCG	2	6	521396	521401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152286
10058	NC_017310	CGCC	2	8	521411	521418	0 %	0 %	25 %	75 %	387152286
10059	NC_017310	GGC	2	6	521428	521433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152286
10060	NC_017310	CGT	2	6	521445	521450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152286
10061	NC_017310	GCG	2	6	521458	521463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152286
10062	NC_017310	CGTG	2	8	521484	521491	0 %	25 %	50 %	25 %	387152286
10063	NC_017310	CGGG	2	8	521495	521502	0 %	0 %	75 %	25 %	387152286
10064	NC_017310	GGC	2	6	521520	521525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152286
10065	NC_017310	TTC	2	6	521527	521532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152286
10066	NC_017310	TCA	2	6	521564	521569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152286
10067	NC_017310	CGCC	2	8	521693	521700	0 %	0 %	25 %	75 %	387152286
10068	NC_017310	CAC	2	6	521790	521795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152286
10069	NC_017310	GC	3	6	521898	521903	0 %	0 %	50 %	50 %	387152286
10070	NC_017310	CTG	2	6	521905	521910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152286
10071	NC_017310	GAG	2	6	521914	521919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152286
10072	NC_017310	GTG	3	9	521935	521943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152286
10073	NC_017310	GCT	2	6	521961	521966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152286
10074	NC_017310	GAC	2	6	521983	521988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152286
10075	NC_017310	GCT	2	6	522000	522005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152286
10076	NC_017310	ATC	2	6	522034	522039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152286
10077	NC_017310	GTC	2	6	522040	522045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152286
10078	NC_017310	GAT	2	6	522046	522051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152286
10079	NC_017310	GAC	2	6	522052	522057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152286
10080	NC_017310	GCT	2	6	522075	522080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152286
10081	NC_017310	GCC	2	6	522141	522146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152286
10082	NC_017310	CCTC	2	8	522275	522282	0 %	25 %	0 %	75 %	387152287
10083	NC_017310	GCCA	2	8	522306	522313	25 %	0 %	25 %	50 %	387152287
10084	NC_017310	CCG	2	6	522334	522339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152287
10085	NC_017310	GTC	2	6	522348	522353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152287
10086	NC_017310	TCGCCT	2	12	522354	522365	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387152287
10087	NC_017310	CCA	2	6	522424	522429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152287
10088	NC_017310	ACGCA	2	10	522465	522474	40 %	0 %	20 %	40 %	387152287
10089	NC_017310	CAA	2	6	522512	522517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152287
10090	NC_017310	AGA	2	6	522570	522575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152287
10091	NC_017310	GCG	2	6	522627	522632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152287
10092	NC_017310	GC	3	6	522635	522640	0 %	0 %	50 %	50 %	387152287
10093	NC_017310	GGC	2	6	522647	522652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152287
10094	NC_017310	GGCG	2	8	522718	522725	0 %	0 %	75 %	25 %	387152287
10095	NC_017310	CCG	2	6	522763	522768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152287
10096	NC_017310	GTGG	2	8	522845	522852	0 %	25 %	75 %	0 %	387152287
10097	NC_017310	G	7	7	522914	522920	0 %	0 %	100 %	0 %	387152287
10098	NC_017310	GCGG	2	8	522995	523002	0 %	0 %	75 %	25 %	387152287
10099	NC_017310	AGC	2	6	523062	523067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152287
10100	NC_017310	CAC	2	6	523076	523081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152287
10101	NC_017310	GCGG	2	8	523112	523119	0 %	0 %	75 %	25 %	387152287
10102	NC_017310	GCAA	2	8	523140	523147	50 %	0 %	25 %	25 %	387152287
10103	NC_017310	G	7	7	523263	523269	0 %	0 %	100 %	0 %	387152287
10104	NC_017310	CTG	2	6	523339	523344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152287
10105	NC_017310	TCC	2	6	523347	523352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152287
10106	NC_017310	AGGGG	2	10	523388	523397	20 %	0 %	80 %	0 %	387152287
10107	NC_017310	ACG	2	6	523398	523403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152287
10108	NC_017310	CAT	2	6	523426	523431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152287
10109	NC_017310	CGG	2	6	523435	523440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152287
10110	NC_017310	TGCCGG	2	12	523444	523455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387152287
10111	NC_017310	CGG	2	6	523474	523479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152287
10112	NC_017310	CGAG	2	8	523583	523590	25 %	0 %	50 %	25 %	387152287
10113	NC_017310	GCC	2	6	523661	523666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152287
10114	NC_017310	CAT	2	6	523691	523696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152287
10115	NC_017310	GCA	2	6	523936	523941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152288
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10117	NC_017310	GGC	2	6	524014	524019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152288
10118	NC_017310	GCC	2	6	524024	524029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152288
10119	NC_017310	CACC	2	8	524065	524072	25 %	0 %	0 %	75 %	387152288
10120	NC_017310	CGA	2	6	524110	524115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152288
10121	NC_017310	CG	3	6	524145	524150	0 %	0 %	50 %	50 %	387152288
10122	NC_017310	CGA	2	6	524158	524163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152288
10123	NC_017310	GCG	2	6	524244	524249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152288
10124	NC_017310	GGC	2	6	524352	524357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152288
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10127	NC_017310	GCCC	2	8	524428	524435	0 %	0 %	25 %	75 %	387152288
10128	NC_017310	CGA	2	6	524491	524496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152288
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10227	NC_017310	CCA	2	6	530319	530324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152292
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10230	NC_017310	TGCG	2	8	530418	530425	0 %	25 %	50 %	25 %	387152292
10231	NC_017310	CGT	2	6	530448	530453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152292
10232	NC_017310	CAG	2	6	530461	530466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152292
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10236	NC_017310	CGC	2	6	530746	530751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152292
10237	NC_017310	TGC	2	6	530775	530780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152292
10238	NC_017310	CGG	2	6	530788	530793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152292
10239	NC_017310	CGTA	2	8	530845	530852	25 %	25 %	25 %	25 %	387152292
10240	NC_017310	TGCG	2	8	530904	530911	0 %	25 %	50 %	25 %	387152292
10241	NC_017310	T	6	6	531977	531982	0 %	100 %	0 %	0 %	387152293
10242	NC_017310	TGG	2	6	532005	532010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152293
10243	NC_017310	CAT	2	6	532232	532237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152294
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10247	NC_017310	GGC	2	6	532383	532388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152294
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10249	NC_017310	TC	3	6	532469	532474	0 %	50 %	0 %	50 %	387152294
10250	NC_017310	CCA	2	6	532627	532632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152294
10251	NC_017310	ATG	2	6	532665	532670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152294
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10253	NC_017310	GGT	2	6	532712	532717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152294
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10257	NC_017310	GCCC	2	8	532944	532951	0 %	0 %	25 %	75 %	387152294
10258	NC_017310	GCCATC	2	12	533010	533021	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387152294
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10269	NC_017310	GTG	3	9	533402	533410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152295
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10272	NC_017310	GCT	2	6	533551	533556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152295
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10347	NC_017310	CGTTC	2	10	537177	537186	0 %	40 %	20 %	40 %	387152298
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10477	NC_017310	AAC	2	6	542541	542546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152304
10478	NC_017310	GCA	2	6	542615	542620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152304
10479	NC_017310	GCG	3	9	542637	542645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152304
10480	NC_017310	GCT	2	6	542726	542731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152304
10481	NC_017310	ACT	2	6	542830	542835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152304
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10483	NC_017310	CGG	2	6	542913	542918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152304
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10492	NC_017310	CTG	2	6	543366	543371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152304
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