MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017310	GAC	2	6	309852	309857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152106
6002	NC_017310	CTGA	2	8	309858	309865	25 %	25 %	25 %	25 %	387152106
6003	NC_017310	GC	3	6	309906	309911	0 %	0 %	50 %	50 %	387152106
6004	NC_017310	TTG	2	6	309913	309918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152106
6005	NC_017310	GGC	2	6	309945	309950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152106
6006	NC_017310	TCT	2	6	309989	309994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152106
6007	NC_017310	ACC	2	6	310032	310037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152107
6008	NC_017310	GAT	2	6	310068	310073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152107
6009	NC_017310	AGCC	2	8	310220	310227	25 %	0 %	25 %	50 %	387152107
6010	NC_017310	GCG	2	6	310270	310275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152107
6011	NC_017310	TCC	2	6	310357	310362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152107
6012	NC_017310	GATG	2	8	310408	310415	25 %	25 %	50 %	0 %	387152107
6013	NC_017310	TCG	2	6	310456	310461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152107
6014	NC_017310	GC	3	6	310473	310478	0 %	0 %	50 %	50 %	387152107
6015	NC_017310	CGT	2	6	310532	310537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152107
6016	NC_017310	GTC	2	6	310551	310556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152107
6017	NC_017310	CCA	2	6	310600	310605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152108
6018	NC_017310	TGG	2	6	310610	310615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152108
6019	NC_017310	GCC	2	6	310690	310695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152108
6020	NC_017310	CGT	2	6	310763	310768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152108
6021	NC_017310	TG	3	6	310808	310813	0 %	50 %	50 %	0 %	387152108
6022	NC_017310	CGT	2	6	310814	310819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152108
6023	NC_017310	CGG	3	9	310829	310837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152108
6024	NC_017310	GCG	2	6	310874	310879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152108
6025	NC_017310	CAG	3	9	310905	310913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152108
6026	NC_017310	GAT	2	6	311020	311025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152109
6027	NC_017310	TGG	2	6	311063	311068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152109
6028	NC_017310	ATG	2	6	311069	311074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152109
6029	NC_017310	TCC	2	6	311075	311080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152109
6030	NC_017310	GCC	2	6	311083	311088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152109
6031	NC_017310	TGA	2	6	311199	311204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152109
6032	NC_017310	CGC	2	6	311205	311210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152109
6033	NC_017310	CAG	3	9	311219	311227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152109
6034	NC_017310	CCA	2	6	311256	311261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152109
6035	NC_017310	GAC	2	6	311281	311286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152109
6036	NC_017310	GCCCGC	2	12	311307	311318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152109
6037	NC_017310	TTC	2	6	311353	311358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152109
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6039	NC_017310	AGA	2	6	311403	311408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152109
6040	NC_017310	CAC	2	6	311422	311427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152109
6041	NC_017310	AGCCA	2	10	311448	311457	40 %	0 %	20 %	40 %	387152109
6042	NC_017310	CGT	2	6	311469	311474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152109
6043	NC_017310	GC	3	6	311552	311557	0 %	0 %	50 %	50 %	387152109
6044	NC_017310	CGC	2	6	311583	311588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152109
6045	NC_017310	GCCT	2	8	311647	311654	0 %	25 %	25 %	50 %	387152109
6046	NC_017310	ATG	2	6	311660	311665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152109
6047	NC_017310	CGG	2	6	311667	311672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152109
6048	NC_017310	CTTC	2	8	311823	311830	0 %	50 %	0 %	50 %	387152109
6049	NC_017310	G	6	6	311886	311891	0 %	0 %	100 %	0 %	387152109
6050	NC_017310	TGA	2	6	311928	311933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152109
6051	NC_017310	AGT	2	6	311961	311966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152109
6052	NC_017310	CCCG	2	8	312039	312046	0 %	0 %	25 %	75 %	387152109
6053	NC_017310	GCA	2	6	312054	312059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152109
6054	NC_017310	GCC	2	6	312060	312065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152109
6055	NC_017310	AGT	2	6	312096	312101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152109
6056	NC_017310	CGT	2	6	312111	312116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152109
6057	NC_017310	AGT	2	6	312126	312131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152109
6058	NC_017310	GTA	2	6	312172	312177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152109
6059	NC_017310	GAGT	2	8	312243	312250	25 %	25 %	50 %	0 %	387152109
6060	NC_017310	CG	3	6	312374	312379	0 %	0 %	50 %	50 %	387152110
6061	NC_017310	CCA	2	6	312427	312432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152110
6062	NC_017310	GA	3	6	312447	312452	50 %	0 %	50 %	0 %	387152110
6063	NC_017310	TCA	2	6	312484	312489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152110
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6065	NC_017310	CCAG	2	8	312541	312548	25 %	0 %	25 %	50 %	387152110
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6069	NC_017310	TGG	2	6	312697	312702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152110
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6109	NC_017310	ACGTG	2	10	315762	315771	20 %	20 %	40 %	20 %	387152113
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6120	NC_017310	CGA	2	6	316281	316286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152113
6121	NC_017310	CG	3	6	316322	316327	0 %	0 %	50 %	50 %	387152113
6122	NC_017310	TCG	2	6	316331	316336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152113
6123	NC_017310	AGG	2	6	316343	316348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152113
6124	NC_017310	CGA	2	6	316365	316370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152113
6125	NC_017310	GCT	2	6	316431	316436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152113
6126	NC_017310	GC	3	6	316540	316545	0 %	0 %	50 %	50 %	387152113
6127	NC_017310	CG	4	8	316604	316611	0 %	0 %	50 %	50 %	387152113
6128	NC_017310	CTGG	2	8	316614	316621	0 %	25 %	50 %	25 %	387152113
6129	NC_017310	ACG	2	6	316627	316632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152113
6130	NC_017310	CGT	2	6	316656	316661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152113
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6132	NC_017310	CAT	2	6	316800	316805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152113
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6134	NC_017310	CGA	2	6	316890	316895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152113
6135	NC_017310	CTT	2	6	316974	316979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152113
6136	NC_017310	CAT	2	6	316986	316991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152113
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6141	NC_017310	TCA	2	6	317156	317161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152113
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6143	NC_017310	TGC	2	6	317180	317185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152113
6144	NC_017310	CGG	2	6	317237	317242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152113
6145	NC_017310	CAT	2	6	317274	317279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152113
6146	NC_017310	TGC	2	6	317345	317350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152113
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6149	NC_017310	GGT	2	6	317463	317468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152113
6150	NC_017310	TCT	2	6	317475	317480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152113
6151	NC_017310	GAG	2	6	317503	317508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152113
6152	NC_017310	CGC	2	6	317511	317516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152113
6153	NC_017310	ATG	2	6	317522	317527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152113
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6156	NC_017310	GGT	2	6	317571	317576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152113
6157	NC_017310	GCA	2	6	317619	317624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152113
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6179	NC_017310	CG	3	6	318699	318704	0 %	0 %	50 %	50 %	387152114
6180	NC_017310	CGT	2	6	318737	318742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152114
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6184	NC_017310	TGC	2	6	318893	318898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152114
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6187	NC_017310	CGG	2	6	318940	318945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152114
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6192	NC_017310	GAC	2	6	319083	319088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152114
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6197	NC_017310	GGCG	2	8	319852	319859	0 %	0 %	75 %	25 %	387152115
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6199	NC_017310	GAC	2	6	319970	319975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152115
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6205	NC_017310	CGA	2	6	320353	320358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152115
6206	NC_017310	CCATG	2	10	320416	320425	20 %	20 %	20 %	40 %	387152115
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6209	NC_017310	GCT	2	6	320599	320604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152115
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6216	NC_017310	GTG	2	6	320945	320950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152115
6217	NC_017310	ACG	2	6	320976	320981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152115
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6219	NC_017310	GCG	2	6	320992	320997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152115
6220	NC_017310	ACC	2	6	321002	321007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152115
6221	NC_017310	CGGTGC	2	12	321028	321039	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387152115
6222	NC_017310	TCG	2	6	321120	321125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152115
6223	NC_017310	CGA	2	6	321169	321174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152115
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6225	NC_017310	GTCT	2	8	321382	321389	0 %	50 %	25 %	25 %	387152116
6226	NC_017310	CGA	2	6	321591	321596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152117
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6228	NC_017310	G	7	7	321718	321724	0 %	0 %	100 %	0 %	387152117
6229	NC_017310	AGGT	2	8	321737	321744	25 %	25 %	50 %	0 %	387152117
6230	NC_017310	TGGT	2	8	321755	321762	0 %	50 %	50 %	0 %	387152117
6231	NC_017310	CGTC	2	8	321819	321826	0 %	25 %	25 %	50 %	387152117
6232	NC_017310	GTC	2	6	321898	321903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152117
6233	NC_017310	TGG	2	6	321915	321920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152117
6234	NC_017310	GCAG	2	8	322215	322222	25 %	0 %	50 %	25 %	387152118
6235	NC_017310	CGT	2	6	322230	322235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152118
6236	NC_017310	GTC	2	6	322285	322290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152118
6237	NC_017310	GGT	2	6	322323	322328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152118
6238	NC_017310	CTG	2	6	322367	322372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152118
6239	NC_017310	GGC	2	6	322459	322464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152118
6240	NC_017310	G	6	6	322499	322504	0 %	0 %	100 %	0 %	387152118
6241	NC_017310	AGG	2	6	322535	322540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152118
6242	NC_017310	CGG	2	6	322638	322643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152118
6243	NC_017310	GC	3	6	322649	322654	0 %	0 %	50 %	50 %	387152118
6244	NC_017310	GAA	2	6	322693	322698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152118
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6246	NC_017310	TG	3	6	322789	322794	0 %	50 %	50 %	0 %	387152118
6247	NC_017310	TTC	2	6	322831	322836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152118
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6343	NC_017310	ACC	3	9	329378	329386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152124
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6351	NC_017310	AGGCG	2	10	329710	329719	20 %	0 %	60 %	20 %	387152124
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6358	NC_017310	CGC	3	9	330054	330062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152124
6359	NC_017310	CCAG	2	8	330072	330079	25 %	0 %	25 %	50 %	387152124
6360	NC_017310	CG	3	6	330247	330252	0 %	0 %	50 %	50 %	387152125
6361	NC_017310	GTT	2	6	330330	330335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152125
6362	NC_017310	CGT	2	6	330401	330406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152125
6363	NC_017310	CGA	2	6	330425	330430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152125
6364	NC_017310	CGC	2	6	330458	330463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152125
6365	NC_017310	GCA	2	6	330464	330469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152125
6366	NC_017310	TCG	2	6	330490	330495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152125
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6368	NC_017310	CGT	2	6	330623	330628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152125
6369	NC_017310	CGT	2	6	330682	330687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152125
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6387	NC_017310	AGC	2	6	331450	331455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152125
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6470	NC_017310	TCA	2	6	335815	335820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152129
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6472	NC_017310	CCG	2	6	336075	336080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152130
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6476	NC_017310	GGCAG	2	10	336174	336183	20 %	0 %	60 %	20 %	387152130
6477	NC_017310	GAAC	2	8	336189	336196	50 %	0 %	25 %	25 %	387152130
6478	NC_017310	CAC	2	6	336201	336206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152130
6479	NC_017310	CGA	2	6	336213	336218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152130
6480	NC_017310	TGC	2	6	336221	336226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152130
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6482	NC_017310	CAT	2	6	336324	336329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152130
6483	NC_017310	GGAC	2	8	336362	336369	25 %	0 %	50 %	25 %	387152130
6484	NC_017310	GC	3	6	336377	336382	0 %	0 %	50 %	50 %	387152130
6485	NC_017310	CTG	2	6	336439	336444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152130
6486	NC_017310	CTA	2	6	336486	336491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152130
6487	NC_017310	CCAT	2	8	336551	336558	25 %	25 %	0 %	50 %	387152130
6488	NC_017310	CGGGC	2	10	336561	336570	0 %	0 %	60 %	40 %	387152130
6489	NC_017310	GCT	2	6	336621	336626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152130
6490	NC_017310	GCC	2	6	336655	336660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152130
6491	NC_017310	ATC	2	6	336677	336682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152131
6492	NC_017310	GC	3	6	336697	336702	0 %	0 %	50 %	50 %	387152131
6493	NC_017310	GCG	2	6	336769	336774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152131
6494	NC_017310	CTA	2	6	336775	336780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152131
6495	NC_017310	TCT	2	6	336804	336809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152131
6496	NC_017310	GGTG	2	8	336895	336902	0 %	25 %	75 %	0 %	387152131
6497	NC_017310	CAT	2	6	336994	336999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152131
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6499	NC_017310	CCATC	2	10	337077	337086	20 %	20 %	0 %	60 %	387152131
6500	NC_017310	CGG	2	6	337108	337113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152131

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