MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016629	GGC	2	6	196656	196661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298562
3502	NC_016629	GC	3	6	196726	196731	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
3503	NC_016629	TCA	2	6	196739	196744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298562
3504	NC_016629	GCAT	2	8	196823	196830	25 %	25 %	25 %	25 %	374298562
3505	NC_016629	GACAG	2	10	196848	196857	40 %	0 %	40 %	20 %	374298562
3506	NC_016629	TCC	2	6	196894	196899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298562
3507	NC_016629	CCGG	2	8	196912	196919	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
3508	NC_016629	CAA	2	6	196971	196976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298562
3509	NC_016629	GC	4	8	197121	197128	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
3510	NC_016629	AGG	2	6	197147	197152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298562
3511	NC_016629	TGG	2	6	197165	197170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298562
3512	NC_016629	CG	3	6	197210	197215	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
3513	NC_016629	GACG	2	8	197244	197251	25 %	0 %	50 %	25 %	374298562
3514	NC_016629	GGA	2	6	197270	197275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298562
3515	NC_016629	ACG	2	6	197345	197350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298562
3516	NC_016629	CGC	2	6	197399	197404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298562
3517	NC_016629	CGGG	2	8	197440	197447	0 %	0 %	75 %	25 %	374298562
3518	NC_016629	GTC	2	6	197455	197460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
3519	NC_016629	AAGC	2	8	197577	197584	50 %	0 %	25 %	25 %	374298562
3520	NC_016629	TCT	2	6	197609	197614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298562
3521	NC_016629	CG	3	6	197615	197620	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
3522	NC_016629	AGA	2	6	197660	197665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298562
3523	NC_016629	GTG	2	6	197674	197679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298562
3524	NC_016629	ACG	2	6	197702	197707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298562
3525	NC_016629	AAG	2	6	197719	197724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298562
3526	NC_016629	TCG	2	6	197816	197821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
3527	NC_016629	TATC	2	8	197871	197878	25 %	50 %	0 %	25 %	374298562
3528	NC_016629	CGG	2	6	197895	197900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298562
3529	NC_016629	CAT	3	9	197901	197909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298562
3530	NC_016629	TCA	2	6	197969	197974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298562
3531	NC_016629	TGGGCG	2	12	198008	198019	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374298562
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3533	NC_016629	TGG	2	6	198071	198076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298562
3534	NC_016629	GGCA	2	8	198079	198086	25 %	0 %	50 %	25 %	374298562
3535	NC_016629	CTGACC	2	12	198202	198213	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374298562
3536	NC_016629	CG	3	6	198216	198221	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
3537	NC_016629	TGC	2	6	198224	198229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
3538	NC_016629	CGT	2	6	198261	198266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
3539	NC_016629	GCG	2	6	198334	198339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298562
3540	NC_016629	ACT	2	6	198796	198801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298563
3541	NC_016629	GCCA	2	8	198830	198837	25 %	0 %	25 %	50 %	374298563
3542	NC_016629	CAT	2	6	198872	198877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298563
3543	NC_016629	AG	3	6	199005	199010	50 %	0 %	50 %	0 %	374298563
3544	NC_016629	GAA	2	6	199013	199018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298563
3545	NC_016629	GCAG	2	8	199078	199085	25 %	0 %	50 %	25 %	374298563
3546	NC_016629	GAT	2	6	199142	199147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298563
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3549	NC_016629	CGT	2	6	199240	199245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298563
3550	NC_016629	GC	3	6	199299	199304	0 %	0 %	50 %	50 %	374298563
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3552	NC_016629	GCA	2	6	199329	199334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298563
3553	NC_016629	AAG	2	6	199364	199369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298563
3554	NC_016629	TTGA	2	8	199376	199383	25 %	50 %	25 %	0 %	374298563
3555	NC_016629	GA	3	6	199382	199387	50 %	0 %	50 %	0 %	374298563
3556	NC_016629	CAC	2	6	199406	199411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298563
3557	NC_016629	ACT	2	6	199449	199454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298563
3558	NC_016629	AGGC	2	8	199523	199530	25 %	0 %	50 %	25 %	374298564
3559	NC_016629	TCG	2	6	199538	199543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298564
3560	NC_016629	ATC	2	6	199544	199549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298564
3561	NC_016629	TCC	2	6	199604	199609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298564
3562	NC_016629	GCAG	2	8	199638	199645	25 %	0 %	50 %	25 %	374298564
3563	NC_016629	CCA	2	6	199662	199667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298564
3564	NC_016629	GGC	2	6	199677	199682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298564
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3569	NC_016629	GGT	2	6	199861	199866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298564
3570	NC_016629	GTC	2	6	199924	199929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298564
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3572	NC_016629	CCG	2	6	199944	199949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298564
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3581	NC_016629	GAT	2	6	200233	200238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298564
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3587	NC_016629	CGCA	2	8	200624	200631	25 %	0 %	25 %	50 %	374298565
3588	NC_016629	AT	3	6	200639	200644	50 %	50 %	0 %	0 %	374298565
3589	NC_016629	CTGCA	2	10	200718	200727	20 %	20 %	20 %	40 %	374298565
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3592	NC_016629	CGG	2	6	200837	200842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298565
3593	NC_016629	GCC	2	6	200889	200894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298565
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3595	NC_016629	GCAA	2	8	201028	201035	50 %	0 %	25 %	25 %	374298565
3596	NC_016629	GGC	2	6	201056	201061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298565
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3599	NC_016629	GCC	2	6	201135	201140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298565
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3602	NC_016629	GGCC	2	8	201338	201345	0 %	0 %	50 %	50 %	374298565
3603	NC_016629	CTG	2	6	201417	201422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298565
3604	NC_016629	GAC	2	6	201423	201428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298565
3605	NC_016629	CAGC	2	8	201436	201443	25 %	0 %	25 %	50 %	374298565
3606	NC_016629	GGA	2	6	201458	201463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298565
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3609	NC_016629	GCGG	2	8	201608	201615	0 %	0 %	75 %	25 %	374298565
3610	NC_016629	TAT	2	6	201915	201920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298566
3611	NC_016629	TGC	2	6	201976	201981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298566
3612	NC_016629	GCAG	2	8	201995	202002	25 %	0 %	50 %	25 %	374298566
3613	NC_016629	GCT	2	6	202024	202029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298566
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3622	NC_016629	GCC	2	6	202517	202522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298567
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3745	NC_016629	AAG	2	6	208839	208844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298572
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3747	NC_016629	GCC	2	6	208938	208943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298572
3748	NC_016629	GCG	2	6	208949	208954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298572
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3761	NC_016629	GCT	2	6	209585	209590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298572
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3769	NC_016629	CGGCT	2	10	210032	210041	0 %	20 %	40 %	40 %	374298572
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3774	NC_016629	CG	3	6	210399	210404	0 %	0 %	50 %	50 %	374298572
3775	NC_016629	GCT	2	6	210479	210484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298572
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3987	NC_016629	GC	3	6	221355	221360	0 %	0 %	50 %	50 %	374298585
3988	NC_016629	CGG	2	6	221392	221397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298585
3989	NC_016629	ACCT	2	8	221406	221413	25 %	25 %	0 %	50 %	374298585
3990	NC_016629	CTG	2	6	221475	221480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298585
3991	NC_016629	GC	3	6	221481	221486	0 %	0 %	50 %	50 %	374298585
3992	NC_016629	A	6	6	221512	221517	100 %	0 %	0 %	0 %	374298585
3993	NC_016629	TGG	2	6	221529	221534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298585
3994	NC_016629	GGA	2	6	221564	221569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298585
3995	NC_016629	TGG	2	6	221590	221595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298585
3996	NC_016629	GGC	2	6	221654	221659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298585
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3999	NC_016629	CGG	2	6	221744	221749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298585
4000	NC_016629	ACT	2	6	221761	221766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298585

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