MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016629	CTA	2	6	141927	141932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298510
2502	NC_016629	ATC	2	6	141961	141966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298510
2503	NC_016629	CCA	2	6	141974	141979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298510
2504	NC_016629	ATC	2	6	142042	142047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298510
2505	NC_016629	CAT	2	6	142266	142271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298510
2506	NC_016629	A	6	6	142289	142294	100 %	0 %	0 %	0 %	374298510
2507	NC_016629	GCATGC	2	12	142316	142327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374298510
2508	NC_016629	CTG	2	6	142420	142425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298510
2509	NC_016629	CCG	2	6	142451	142456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298510
2510	NC_016629	CCTG	2	8	142524	142531	0 %	25 %	25 %	50 %	374298510
2511	NC_016629	AGG	2	6	142604	142609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298510
2512	NC_016629	GTG	2	6	142633	142638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298510
2513	NC_016629	GAC	2	6	142696	142701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298510
2514	NC_016629	TCG	2	6	142754	142759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298510
2515	NC_016629	CAG	2	6	142858	142863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298511
2516	NC_016629	GCC	2	6	142908	142913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298511
2517	NC_016629	GAC	2	6	142929	142934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298511
2518	NC_016629	GC	3	6	142968	142973	0 %	0 %	50 %	50 %	374298511
2519	NC_016629	GC	3	6	142996	143001	0 %	0 %	50 %	50 %	374298511
2520	NC_016629	CG	4	8	143154	143161	0 %	0 %	50 %	50 %	374298511
2521	NC_016629	CGT	2	6	143184	143189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298511
2522	NC_016629	CG	3	6	143201	143206	0 %	0 %	50 %	50 %	374298511
2523	NC_016629	GCA	2	6	143216	143221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298511
2524	NC_016629	TGC	2	6	143351	143356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298511
2525	NC_016629	ATCGC	2	10	143368	143377	20 %	20 %	20 %	40 %	374298511
2526	NC_016629	CG	3	6	143465	143470	0 %	0 %	50 %	50 %	374298511
2527	NC_016629	GC	3	6	143585	143590	0 %	0 %	50 %	50 %	374298511
2528	NC_016629	CGT	2	6	143627	143632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298511
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2530	NC_016629	CGC	2	6	143666	143671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298511
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2534	NC_016629	AAG	2	6	143841	143846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298511
2535	NC_016629	CGT	2	6	143855	143860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298511
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2538	NC_016629	CGT	2	6	144355	144360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298512
2539	NC_016629	GCCAC	2	10	144413	144422	20 %	0 %	20 %	60 %	374298512
2540	NC_016629	CGGC	2	8	144430	144437	0 %	0 %	50 %	50 %	374298512
2541	NC_016629	CGG	2	6	144495	144500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298512
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2543	NC_016629	AAC	2	6	144549	144554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298512
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2545	NC_016629	CAG	2	6	144704	144709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298512
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2549	NC_016629	ACC	2	6	144840	144845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298512
2550	NC_016629	GCC	2	6	145023	145028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298512
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2552	NC_016629	GCA	2	6	145093	145098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298512
2553	NC_016629	AGAT	2	8	145120	145127	50 %	25 %	25 %	0 %	374298512
2554	NC_016629	ACGC	2	8	145157	145164	25 %	0 %	25 %	50 %	374298512
2555	NC_016629	CAG	2	6	145190	145195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298512
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2558	NC_016629	GCT	2	6	145346	145351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298513
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2561	NC_016629	CAGATC	2	12	145686	145697	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374298514
2562	NC_016629	GTC	2	6	145699	145704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298514
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2577	NC_016629	GCCGA	2	10	146297	146306	20 %	0 %	40 %	40 %	374298515
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2600	NC_016629	GCACG	2	10	147670	147679	20 %	0 %	40 %	40 %	374298517
2601	NC_016629	CTTC	2	8	147753	147760	0 %	50 %	0 %	50 %	374298517
2602	NC_016629	CGC	2	6	147816	147821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298517
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2606	NC_016629	GAG	2	6	147978	147983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298517
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2609	NC_016629	GC	4	8	148189	148196	0 %	0 %	50 %	50 %	374298517
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2620	NC_016629	GC	3	6	148993	148998	0 %	0 %	50 %	50 %	374298518
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2622	NC_016629	GC	3	6	149161	149166	0 %	0 %	50 %	50 %	374298518
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2987	NC_016629	GCC	2	6	169449	169454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298537
2988	NC_016629	GCCG	2	8	169482	169489	0 %	0 %	50 %	50 %	374298537
2989	NC_016629	TGG	2	6	169502	169507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298537
2990	NC_016629	CCG	2	6	169686	169691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298537
2991	NC_016629	GGC	2	6	169704	169709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298537
2992	NC_016629	CGGC	2	8	169747	169754	0 %	0 %	50 %	50 %	374298537
2993	NC_016629	CAG	2	6	169767	169772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298537
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2999	NC_016629	GC	3	6	170132	170137	0 %	0 %	50 %	50 %	374298538
3000	NC_016629	GGA	2	6	170149	170154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298538

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