MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016629	GCCC	2	8	721638	721645	0 %	0 %	25 %	75 %	374299026
13002	NC_016629	GCCC	2	8	721728	721735	0 %	0 %	25 %	75 %	374299026
13003	NC_016629	CAG	2	6	721738	721743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299026
13004	NC_016629	GAT	2	6	721785	721790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299026
13005	NC_016629	GCG	2	6	721800	721805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299026
13006	NC_016629	GCA	2	6	721806	721811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299026
13007	NC_016629	CGTCCA	2	12	721818	721829	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374299026
13008	NC_016629	GCG	2	6	721845	721850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299026
13009	NC_016629	GGC	2	6	721870	721875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299026
13010	NC_016629	GCC	2	6	721885	721890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299026
13011	NC_016629	CG	3	6	721944	721949	0 %	0 %	50 %	50 %	374299026
13012	NC_016629	GCT	2	6	721953	721958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299026
13013	NC_016629	GCC	2	6	721997	722002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299027
13014	NC_016629	GGCCA	2	10	722024	722033	20 %	0 %	40 %	40 %	374299027
13015	NC_016629	CAG	2	6	722048	722053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299027
13016	NC_016629	ATG	2	6	722097	722102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299027
13017	NC_016629	AGA	2	6	722134	722139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374299027
13018	NC_016629	GAT	2	6	722174	722179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299027
13019	NC_016629	GCC	2	6	722186	722191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299027
13020	NC_016629	TGA	2	6	722224	722229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299027
13021	NC_016629	ACC	2	6	722265	722270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299027
13022	NC_016629	CTTGGC	2	12	722288	722299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299027
13023	NC_016629	GCA	2	6	722320	722325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299027
13024	NC_016629	TGGC	2	8	722406	722413	0 %	25 %	50 %	25 %	374299027
13025	NC_016629	CGAG	2	8	722455	722462	25 %	0 %	50 %	25 %	374299027
13026	NC_016629	GCA	2	6	722479	722484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299027
13027	NC_016629	AAC	2	6	722502	722507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374299027
13028	NC_016629	AGC	3	9	722514	722522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299027
13029	NC_016629	GCCA	2	8	722523	722530	25 %	0 %	25 %	50 %	374299027
13030	NC_016629	GCC	2	6	722588	722593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299027
13031	NC_016629	GGT	2	6	722713	722718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299027
13032	NC_016629	GC	3	6	722756	722761	0 %	0 %	50 %	50 %	374299027
13033	NC_016629	GCG	2	6	722822	722827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299027
13034	NC_016629	TGA	2	6	722908	722913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299027
13035	NC_016629	GAA	2	6	722924	722929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374299027
13036	NC_016629	CCAC	2	8	722938	722945	25 %	0 %	0 %	75 %	374299027
13037	NC_016629	ATC	2	6	722979	722984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299027
13038	NC_016629	T	7	7	723331	723337	0 %	100 %	0 %	0 %	374299028
13039	NC_016629	CGGC	2	8	723355	723362	0 %	0 %	50 %	50 %	374299028
13040	NC_016629	TCA	2	6	723481	723486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299028
13041	NC_016629	AGC	2	6	723532	723537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299028
13042	NC_016629	CTA	2	6	723599	723604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299028
13043	NC_016629	CGC	2	6	723612	723617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299028
13044	NC_016629	TCGATC	2	12	723649	723660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374299028
13045	NC_016629	GAT	2	6	723681	723686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299028
13046	NC_016629	CTG	2	6	723774	723779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299028
13047	NC_016629	GAG	2	6	723825	723830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299028
13048	NC_016629	CTG	2	6	723849	723854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299028
13049	NC_016629	GA	3	6	723945	723950	50 %	0 %	50 %	0 %	374299028
13050	NC_016629	GTT	2	6	724020	724025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374299028
13051	NC_016629	GCT	2	6	724049	724054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299028
13052	NC_016629	ACG	2	6	724065	724070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299028
13053	NC_016629	AAC	2	6	724318	724323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374299029
13054	NC_016629	TCC	2	6	724351	724356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374299029
13055	NC_016629	CTT	2	6	724359	724364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374299029
13056	NC_016629	GTT	2	6	724374	724379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374299029
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13058	NC_016629	CCACGC	2	12	724547	724558	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374299029
13059	NC_016629	TGA	2	6	724562	724567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299029
13060	NC_016629	ATG	2	6	724573	724578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299029
13061	NC_016629	GGCGAA	2	12	724617	724628	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374299029
13062	NC_016629	TGCCGA	2	12	724658	724669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374299029
13063	NC_016629	TGT	2	6	724670	724675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374299029
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13067	NC_016629	GCA	2	6	724733	724738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299029
13068	NC_016629	TGA	2	6	724838	724843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299029
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13071	NC_016629	AGCC	2	8	724948	724955	25 %	0 %	25 %	50 %	374299029
13072	NC_016629	CGC	2	6	724991	724996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299029
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13089	NC_016629	GAG	2	6	726284	726289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374299031
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13109	NC_016629	CCCG	2	8	727642	727649	0 %	0 %	25 %	75 %	374299033
13110	NC_016629	ATC	2	6	727656	727661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299033
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13120	NC_016629	CGC	2	6	728725	728730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299034
13121	NC_016629	AGT	2	6	728911	728916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374299034
13122	NC_016629	CGGCC	2	10	728917	728926	0 %	0 %	40 %	60 %	374299034
13123	NC_016629	AGA	2	6	728934	728939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374299034
13124	NC_016629	CAGG	2	8	728998	729005	25 %	0 %	50 %	25 %	374299034
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13128	NC_016629	CGA	2	6	729099	729104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299035
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13130	NC_016629	GAA	2	6	729180	729185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374299035
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13132	NC_016629	ACG	2	6	729263	729268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299035
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13135	NC_016629	GC	3	6	729652	729657	0 %	0 %	50 %	50 %	374299036
13136	NC_016629	AGGCC	2	10	729687	729696	20 %	0 %	40 %	40 %	374299036
13137	NC_016629	CGGC	2	8	729740	729747	0 %	0 %	50 %	50 %	374299036
13138	NC_016629	CGCT	2	8	729789	729796	0 %	25 %	25 %	50 %	374299036
13139	NC_016629	CCG	2	6	729818	729823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299036
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13142	NC_016629	CCAAG	2	10	729953	729962	40 %	0 %	20 %	40 %	374299036
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13148	NC_016629	GAA	2	6	730104	730109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374299036
13149	NC_016629	CGA	2	6	730137	730142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299036
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13211	NC_016629	TCAG	2	8	732941	732948	25 %	25 %	25 %	25 %	374299039
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13227	NC_016629	ATC	2	6	733697	733702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374299041
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13230	NC_016629	TCG	2	6	733843	733848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299041
13231	NC_016629	CGT	2	6	733854	733859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299041
13232	NC_016629	GCA	2	6	733914	733919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299041
13233	NC_016629	GCG	2	6	733953	733958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374299042
13234	NC_016629	AGC	2	6	734049	734054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374299042
13235	NC_016629	GTG	2	6	734120	734125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374299042
13236	NC_016629	AG	3	6	734148	734153	50 %	0 %	50 %	0 %	374299042
13237	NC_016629	GCCA	2	8	734233	734240	25 %	0 %	25 %	50 %	374299043
13238	NC_016629	CTGG	2	8	734343	734350	0 %	25 %	50 %	25 %	374299043
13239	NC_016629	GCT	2	6	734363	734368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374299043
13240	NC_016629	CGAGGC	2	12	734602	734613	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374299044
13241	NC_016629	TCTGC	2	10	734657	734666	0 %	40 %	20 %	40 %	374299045
13242	NC_016629	GCC	2	6	734722	734727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374299045
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13479	NC_016629	CT	3	6	747515	747520	0 %	50 %	0 %	50 %	374299063
13480	NC_016629	CAA	2	6	747543	747548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374299063
13481	NC_016629	CCA	2	6	747551	747556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374299063
13482	NC_016629	CAA	2	6	747591	747596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374299063
13483	NC_016629	AGA	2	6	747626	747631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374299063
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13487	NC_016629	GAA	2	6	747894	747899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374299063
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