MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_016629	CCT	2	6	3634076	3634081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301610
64003	NC_016629	GCGCG	2	10	3634162	3634171	0 %	0 %	60 %	40 %	374301610
64004	NC_016629	GCC	2	6	3634174	3634179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301610
64005	NC_016629	GGC	2	6	3634213	3634218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301610
64006	NC_016629	CGG	2	6	3634319	3634324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301610
64007	NC_016629	GCT	2	6	3634356	3634361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301610
64008	NC_016629	GAT	2	6	3634378	3634383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301610
64009	NC_016629	TGC	2	6	3634448	3634453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301610
64010	NC_016629	GC	3	6	3634492	3634497	0 %	0 %	50 %	50 %	374301610
64011	NC_016629	CAA	2	6	3634503	3634508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374301610
64012	NC_016629	GCC	2	6	3634588	3634593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301610
64013	NC_016629	CTTGT	2	10	3635290	3635299	0 %	60 %	20 %	20 %	374301611
64014	NC_016629	CTA	2	6	3635308	3635313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301611
64015	NC_016629	CGATGT	2	12	3635388	3635399	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374301611
64016	NC_016629	GGGCGG	2	12	3635412	3635423	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	374301611
64017	NC_016629	CTCG	2	8	3635424	3635431	0 %	25 %	25 %	50 %	374301611
64018	NC_016629	TCT	2	6	3635501	3635506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301611
64019	NC_016629	CTGGG	2	10	3635509	3635518	0 %	20 %	60 %	20 %	374301611
64020	NC_016629	CATGG	2	10	3635536	3635545	20 %	20 %	40 %	20 %	374301611
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64022	NC_016629	TAC	2	6	3635575	3635580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301611
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64024	NC_016629	CG	3	6	3635803	3635808	0 %	0 %	50 %	50 %	374301611
64025	NC_016629	CGC	2	6	3635829	3635834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301611
64026	NC_016629	TGG	2	6	3635853	3635858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301611
64027	NC_016629	GAG	2	6	3635875	3635880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374301611
64028	NC_016629	CT	3	6	3636249	3636254	0 %	50 %	0 %	50 %	374301612
64029	NC_016629	GATC	2	8	3636262	3636269	25 %	25 %	25 %	25 %	374301612
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64031	NC_016629	GTC	2	6	3636320	3636325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301612
64032	NC_016629	CCT	2	6	3636514	3636519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301612
64033	NC_016629	GGCAA	2	10	3636630	3636639	40 %	0 %	40 %	20 %	374301612
64034	NC_016629	TGG	2	6	3636913	3636918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301612
64035	NC_016629	CGA	2	6	3637105	3637110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301612
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64038	NC_016629	TCC	2	6	3637281	3637286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301612
64039	NC_016629	TGC	2	6	3637416	3637421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301612
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64041	NC_016629	TGA	2	6	3637507	3637512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301612
64042	NC_016629	GCG	2	6	3637545	3637550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301612
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64045	NC_016629	TAT	2	6	3637634	3637639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374301612
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64048	NC_016629	GCC	2	6	3637812	3637817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301612
64049	NC_016629	GAG	2	6	3637832	3637837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374301612
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64051	NC_016629	GCGT	2	8	3638059	3638066	0 %	25 %	50 %	25 %	374301612
64052	NC_016629	GGTGCG	2	12	3638069	3638080	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374301612
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64054	NC_016629	GAT	2	6	3638144	3638149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301612
64055	NC_016629	TCAG	2	8	3638157	3638164	25 %	25 %	25 %	25 %	374301612
64056	NC_016629	GCC	2	6	3638181	3638186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301612
64057	NC_016629	CAGT	2	8	3638194	3638201	25 %	25 %	25 %	25 %	374301612
64058	NC_016629	GAA	2	6	3638249	3638254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301612
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64099	NC_016629	CAAGGG	2	12	3641830	3641841	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374301613
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64116	NC_016629	CAA	2	6	3643372	3643377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374301613
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64225	NC_016629	CGA	2	6	3651360	3651365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301621
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64230	NC_016629	CAC	2	6	3651513	3651518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301621
64231	NC_016629	GCTC	2	8	3651580	3651587	0 %	25 %	25 %	50 %	374301621
64232	NC_016629	GCC	2	6	3651595	3651600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301621
64233	NC_016629	TACGGC	2	12	3651634	3651645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374301621
64234	NC_016629	GCA	2	6	3651719	3651724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301621
64235	NC_016629	CTG	2	6	3651771	3651776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301621
64236	NC_016629	AGG	2	6	3651815	3651820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374301621
64237	NC_016629	AAG	2	6	3652010	3652015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301621
64238	NC_016629	ATC	2	6	3652033	3652038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301621
64239	NC_016629	AGC	2	6	3652055	3652060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301621
64240	NC_016629	C	6	6	3652063	3652068	0 %	0 %	0 %	100 %	374301621
64241	NC_016629	AGG	2	6	3652106	3652111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374301621
64242	NC_016629	GCT	2	6	3652119	3652124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301621
64243	NC_016629	CG	3	6	3652136	3652141	0 %	0 %	50 %	50 %	374301621
64244	NC_016629	CCTC	2	8	3652148	3652155	0 %	25 %	0 %	75 %	374301621
64245	NC_016629	CG	3	6	3652188	3652193	0 %	0 %	50 %	50 %	374301621
64246	NC_016629	CGA	2	6	3652218	3652223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301621
64247	NC_016629	TCA	2	6	3652229	3652234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301621
64248	NC_016629	CTG	2	6	3652276	3652281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301621
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64250	NC_016629	A	7	7	3652424	3652430	100 %	0 %	0 %	0 %	374301621
64251	NC_016629	ATCC	2	8	3652482	3652489	25 %	25 %	0 %	50 %	374301621
64252	NC_016629	AAGGC	2	10	3652499	3652508	40 %	0 %	40 %	20 %	374301621
64253	NC_016629	CAT	2	6	3652515	3652520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301621
64254	NC_016629	GCCG	2	8	3652609	3652616	0 %	0 %	50 %	50 %	374301622
64255	NC_016629	CGTGGC	2	12	3652782	3652793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374301622
64256	NC_016629	GCT	2	6	3652824	3652829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301622
64257	NC_016629	GCA	2	6	3652881	3652886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301622
64258	NC_016629	GCG	2	6	3652889	3652894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301622
64259	NC_016629	TAT	2	6	3652905	3652910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374301622
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64261	NC_016629	CAT	2	6	3652968	3652973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301622
64262	NC_016629	CCAG	2	8	3652976	3652983	25 %	0 %	25 %	50 %	374301622
64263	NC_016629	TGC	2	6	3653234	3653239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301623
64264	NC_016629	GAA	2	6	3653248	3653253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301623
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64266	NC_016629	CGG	2	6	3653352	3653357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301623
64267	NC_016629	GGT	2	6	3653401	3653406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301623
64268	NC_016629	CTG	2	6	3653467	3653472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301623
64269	NC_016629	GCA	2	6	3653528	3653533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301623
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64271	NC_016629	GACG	2	8	3653562	3653569	25 %	0 %	50 %	25 %	374301623
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64292	NC_016629	TACG	2	8	3655261	3655268	25 %	25 %	25 %	25 %	374301624
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64295	NC_016629	ACA	2	6	3655435	3655440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374301624
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64324	NC_016629	CGC	2	6	3657442	3657447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301625
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64330	NC_016629	CG	3	6	3657837	3657842	0 %	0 %	50 %	50 %	374301626
64331	NC_016629	AGA	2	6	3658441	3658446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301627
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64333	NC_016629	GAA	2	6	3658577	3658582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301627
64334	NC_016629	CCG	2	6	3658592	3658597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301627
64335	NC_016629	CGGC	2	8	3658613	3658620	0 %	0 %	50 %	50 %	374301627
64336	NC_016629	CGC	2	6	3658661	3658666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301627
64337	NC_016629	GCT	2	6	3658730	3658735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301627
64338	NC_016629	CGA	2	6	3658742	3658747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301627
64339	NC_016629	CGA	2	6	3658757	3658762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301627
64340	NC_016629	CG	3	6	3658859	3658864	0 %	0 %	50 %	50 %	374301627
64341	NC_016629	GAT	2	6	3659196	3659201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301628
64342	NC_016629	ACT	2	6	3659215	3659220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301628
64343	NC_016629	CCCG	2	8	3659264	3659271	0 %	0 %	25 %	75 %	374301629
64344	NC_016629	TGA	2	6	3659322	3659327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301629
64345	NC_016629	CTG	2	6	3659351	3659356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301629
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64347	NC_016629	CTG	2	6	3659925	3659930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301630
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64461	NC_016629	CGG	2	6	3665080	3665085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301634
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64463	NC_016629	TGC	2	6	3665189	3665194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301634
64464	NC_016629	CCGT	2	8	3665415	3665422	0 %	25 %	25 %	50 %	374301635
64465	NC_016629	CAG	2	6	3665433	3665438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301635
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64468	NC_016629	GC	3	6	3665502	3665507	0 %	0 %	50 %	50 %	374301635
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64483	NC_016629	CGGC	2	8	3666232	3666239	0 %	0 %	50 %	50 %	374301636
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64491	NC_016629	GAT	2	6	3666541	3666546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301636
64492	NC_016629	GTC	2	6	3666589	3666594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301636
64493	NC_016629	CAG	3	9	3666613	3666621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301636
64494	NC_016629	CATGC	2	10	3666655	3666664	20 %	20 %	20 %	40 %	374301636
64495	NC_016629	CGG	2	6	3666696	3666701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301636
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64497	NC_016629	GGCC	2	8	3666814	3666821	0 %	0 %	50 %	50 %	374301636
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64499	NC_016629	CAG	2	6	3666835	3666840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301636
64500	NC_016629	CGG	2	6	3666843	3666848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301636

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