MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016629	TCG	2	6	309388	309393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298665
5502	NC_016629	GCCT	2	8	309420	309427	0 %	25 %	25 %	50 %	374298665
5503	NC_016629	AGC	2	6	309430	309435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298665
5504	NC_016629	GC	3	6	309438	309443	0 %	0 %	50 %	50 %	374298665
5505	NC_016629	GCC	2	6	309462	309467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298665
5506	NC_016629	CATG	2	8	309482	309489	25 %	25 %	25 %	25 %	374298665
5507	NC_016629	GTGCA	2	10	309671	309680	20 %	20 %	40 %	20 %	374298666
5508	NC_016629	CCAGTT	2	12	309765	309776	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374298666
5509	NC_016629	AAG	2	6	309785	309790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298666
5510	NC_016629	ATGC	2	8	309824	309831	25 %	25 %	25 %	25 %	374298666
5511	NC_016629	CCG	2	6	309854	309859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298666
5512	NC_016629	CCG	2	6	309886	309891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298666
5513	NC_016629	GCA	2	6	309984	309989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298666
5514	NC_016629	CCA	2	6	310025	310030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298666
5515	NC_016629	TGA	2	6	310154	310159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298666
5516	NC_016629	CG	3	6	310213	310218	0 %	0 %	50 %	50 %	374298667
5517	NC_016629	CGA	2	6	310238	310243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298667
5518	NC_016629	GGC	2	6	310283	310288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298667
5519	NC_016629	CATC	2	8	310321	310328	25 %	25 %	0 %	50 %	374298667
5520	NC_016629	TGC	2	6	310345	310350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298667
5521	NC_016629	GC	3	6	310413	310418	0 %	0 %	50 %	50 %	374298667
5522	NC_016629	GAC	2	6	310434	310439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298667
5523	NC_016629	CCG	2	6	310468	310473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298667
5524	NC_016629	GA	3	6	310492	310497	50 %	0 %	50 %	0 %	374298667
5525	NC_016629	CTG	2	6	310532	310537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298667
5526	NC_016629	TGA	2	6	310541	310546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298667
5527	NC_016629	CAT	2	6	310574	310579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298667
5528	NC_016629	GGA	2	6	310689	310694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298667
5529	NC_016629	CTGGCC	2	12	310842	310853	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374298667
5530	NC_016629	ATT	2	6	310978	310983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298668
5531	NC_016629	AGC	2	6	311019	311024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298668
5532	NC_016629	GCC	2	6	311052	311057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298668
5533	NC_016629	GCG	2	6	311102	311107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298668
5534	NC_016629	CTC	2	6	311114	311119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298668
5535	NC_016629	GC	3	6	311124	311129	0 %	0 %	50 %	50 %	374298668
5536	NC_016629	GAG	2	6	311186	311191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298668
5537	NC_016629	CAG	2	6	311384	311389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298668
5538	NC_016629	GCG	2	6	311416	311421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298668
5539	NC_016629	TAG	2	6	311451	311456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298668
5540	NC_016629	TCC	2	6	311460	311465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298668
5541	NC_016629	GCC	2	6	311549	311554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298668
5542	NC_016629	GCA	2	6	311578	311583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298668
5543	NC_016629	GCTC	2	8	311722	311729	0 %	25 %	25 %	50 %	374298668
5544	NC_016629	CCA	2	6	311815	311820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298668
5545	NC_016629	TGA	2	6	311848	311853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298668
5546	NC_016629	CGG	2	6	311869	311874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298668
5547	NC_016629	GC	3	6	311901	311906	0 %	0 %	50 %	50 %	374298668
5548	NC_016629	TGA	2	6	311923	311928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298668
5549	NC_016629	GCG	2	6	311970	311975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298668
5550	NC_016629	GTC	2	6	312005	312010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298668
5551	NC_016629	ATG	2	6	312021	312026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298668
5552	NC_016629	CCG	2	6	312066	312071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298668
5553	NC_016629	GAC	2	6	312113	312118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298668
5554	NC_016629	CGC	2	6	312153	312158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298668
5555	NC_016629	TGA	2	6	312270	312275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298668
5556	NC_016629	TCC	2	6	312288	312293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298668
5557	NC_016629	CCA	2	6	312334	312339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298668
5558	NC_016629	CGG	2	6	312354	312359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298668
5559	NC_016629	CAG	2	6	312757	312762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298669
5560	NC_016629	GGC	2	6	312803	312808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298669
5561	NC_016629	GCT	2	6	312844	312849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298669
5562	NC_016629	GCT	2	6	312869	312874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298669
5563	NC_016629	CTGG	2	8	312890	312897	0 %	25 %	50 %	25 %	374298669
5564	NC_016629	CG	3	6	312946	312951	0 %	0 %	50 %	50 %	374298669
5565	NC_016629	GGCC	2	8	312986	312993	0 %	0 %	50 %	50 %	374298669
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5569	NC_016629	CGG	2	6	313126	313131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298669
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5572	NC_016629	GCA	2	6	313280	313285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298669
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5580	NC_016629	CGA	2	6	313619	313624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298669
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5589	NC_016629	GGC	2	6	314030	314035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298670
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5591	NC_016629	GGC	2	6	314091	314096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298670
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5594	NC_016629	GGCC	2	8	314198	314205	0 %	0 %	50 %	50 %	374298670
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5604	NC_016629	CTG	2	6	315031	315036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298671
5605	NC_016629	CGA	2	6	315051	315056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298671
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5607	NC_016629	GAG	2	6	315130	315135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298671
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5609	NC_016629	CTG	2	6	315163	315168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298671
5610	NC_016629	GGT	2	6	315201	315206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298671
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5612	NC_016629	GACG	2	8	315265	315272	25 %	0 %	50 %	25 %	374298671
5613	NC_016629	GCCG	2	8	315297	315304	0 %	0 %	50 %	50 %	374298671
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5617	NC_016629	A	6	6	315458	315463	100 %	0 %	0 %	0 %	374298671
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5621	NC_016629	TGC	2	6	315656	315661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298671
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5985	NC_016629	GC	3	6	332234	332239	0 %	0 %	50 %	50 %	374298685
5986	NC_016629	AGC	2	6	332283	332288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298685
5987	NC_016629	GCACGC	2	12	332338	332349	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374298685
5988	NC_016629	CCGC	2	8	332370	332377	0 %	0 %	25 %	75 %	374298685
5989	NC_016629	GAAA	2	8	332389	332396	75 %	0 %	25 %	0 %	374298685
5990	NC_016629	CCG	2	6	332412	332417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298685
5991	NC_016629	GCCG	2	8	332440	332447	0 %	0 %	50 %	50 %	374298685
5992	NC_016629	GTA	2	6	332483	332488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298685
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