MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_016629	CCCA	2	8	3236417	3236424	25 %	0 %	0 %	75 %	374301259
57502	NC_016629	TCA	2	6	3236630	3236635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301259
57503	NC_016629	GCC	2	6	3236659	3236664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301259
57504	NC_016629	GAG	2	6	3236671	3236676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374301259
57505	NC_016629	TGC	2	6	3236771	3236776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301259
57506	NC_016629	TGG	2	6	3236926	3236931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301259
57507	NC_016629	AGC	2	6	3236969	3236974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301259
57508	NC_016629	GAA	2	6	3237036	3237041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301259
57509	NC_016629	AGC	2	6	3237105	3237110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301260
57510	NC_016629	ATC	2	6	3237121	3237126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301260
57511	NC_016629	GCC	2	6	3237134	3237139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301260
57512	NC_016629	GC	3	6	3237148	3237153	0 %	0 %	50 %	50 %	374301260
57513	NC_016629	GCT	2	6	3237168	3237173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301260
57514	NC_016629	CTG	2	6	3237250	3237255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301260
57515	NC_016629	CTG	3	9	3237259	3237267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301260
57516	NC_016629	GCAG	2	8	3237309	3237316	25 %	0 %	50 %	25 %	374301260
57517	NC_016629	TCA	2	6	3237362	3237367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301260
57518	NC_016629	GCG	2	6	3237512	3237517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301260
57519	NC_016629	GGC	2	6	3237531	3237536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301260
57520	NC_016629	GCT	2	6	3237582	3237587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301260
57521	NC_016629	TTC	2	6	3237607	3237612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301260
57522	NC_016629	GCA	2	6	3238365	3238370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301261
57523	NC_016629	TGCC	2	8	3238390	3238397	0 %	25 %	25 %	50 %	374301261
57524	NC_016629	ATG	2	6	3238463	3238468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301261
57525	NC_016629	CTG	2	6	3238489	3238494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301261
57526	NC_016629	AGA	2	6	3238545	3238550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301261
57527	NC_016629	CCG	2	6	3238586	3238591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301261
57528	NC_016629	GC	3	6	3238611	3238616	0 %	0 %	50 %	50 %	374301261
57529	NC_016629	AGC	2	6	3238670	3238675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301261
57530	NC_016629	GC	3	6	3238684	3238689	0 %	0 %	50 %	50 %	374301261
57531	NC_016629	TTGC	2	8	3238762	3238769	0 %	50 %	25 %	25 %	374301261
57532	NC_016629	TCTCCG	2	12	3238775	3238786	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374301261
57533	NC_016629	GCA	2	6	3238929	3238934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301261
57534	NC_016629	GCG	2	6	3239066	3239071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301261
57535	NC_016629	CGG	2	6	3239082	3239087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301261
57536	NC_016629	GCT	2	6	3239197	3239202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301261
57537	NC_016629	TGAA	2	8	3239300	3239307	50 %	25 %	25 %	0 %	374301261
57538	NC_016629	CGT	2	6	3239308	3239313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301261
57539	NC_016629	GGT	2	6	3239654	3239659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301262
57540	NC_016629	GCT	2	6	3239730	3239735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301262
57541	NC_016629	GAA	2	6	3239834	3239839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301262
57542	NC_016629	GAT	2	6	3239925	3239930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301262
57543	NC_016629	CG	3	6	3239933	3239938	0 %	0 %	50 %	50 %	374301262
57544	NC_016629	GTT	2	6	3239979	3239984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374301262
57545	NC_016629	CG	3	6	3239995	3240000	0 %	0 %	50 %	50 %	374301262
57546	NC_016629	AGGC	2	8	3240034	3240041	25 %	0 %	50 %	25 %	374301262
57547	NC_016629	CAT	2	6	3240048	3240053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301262
57548	NC_016629	TGGT	2	8	3240151	3240158	0 %	50 %	50 %	0 %	374301262
57549	NC_016629	CAT	2	6	3240338	3240343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301262
57550	NC_016629	CTC	2	6	3240363	3240368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301262
57551	NC_016629	ATC	2	6	3240381	3240386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301262
57552	NC_016629	GCG	2	6	3240498	3240503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301262
57553	NC_016629	CCG	2	6	3240520	3240525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301262
57554	NC_016629	ATC	2	6	3240595	3240600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301262
57555	NC_016629	CCA	2	6	3240623	3240628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301262
57556	NC_016629	TGGA	2	8	3240661	3240668	25 %	25 %	50 %	0 %	374301262
57557	NC_016629	GTC	2	6	3241034	3241039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301263
57558	NC_016629	GCG	2	6	3241090	3241095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301263
57559	NC_016629	CGC	2	6	3241109	3241114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301263
57560	NC_016629	GCC	2	6	3241170	3241175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301263
57561	NC_016629	GGCC	2	8	3241229	3241236	0 %	0 %	50 %	50 %	374301263
57562	NC_016629	CAC	2	6	3241263	3241268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301263
57563	NC_016629	CGA	2	6	3241382	3241387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301263
57564	NC_016629	ATC	2	6	3241420	3241425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301263
57565	NC_016629	AGC	2	6	3241486	3241491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301263
57566	NC_016629	GGC	2	6	3241510	3241515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301263
57567	NC_016629	C	6	6	3241552	3241557	0 %	0 %	0 %	100 %	374301263
57568	NC_016629	CTA	2	6	3241573	3241578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301263
57569	NC_016629	GTA	2	6	3241581	3241586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301263
57570	NC_016629	ACT	2	6	3241594	3241599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301263
57571	NC_016629	GCG	2	6	3241780	3241785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301264
57572	NC_016629	GCC	2	6	3241863	3241868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301264
57573	NC_016629	TGA	2	6	3241904	3241909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301264
57574	NC_016629	TGA	2	6	3241970	3241975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301264
57575	NC_016629	TTC	2	6	3242008	3242013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301264
57576	NC_016629	TTC	2	6	3242086	3242091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301264
57577	NC_016629	GAC	2	6	3242167	3242172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301264
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57581	NC_016629	CTT	2	6	3242334	3242339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301264
57582	NC_016629	TCCTGC	2	12	3242343	3242354	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374301264
57583	NC_016629	ACAA	2	8	3242413	3242420	75 %	0 %	0 %	25 %	374301264
57584	NC_016629	CGC	2	6	3242469	3242474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301265
57585	NC_016629	CG	3	6	3242516	3242521	0 %	0 %	50 %	50 %	374301265
57586	NC_016629	TTC	2	6	3242529	3242534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301265
57587	NC_016629	AAG	2	6	3242538	3242543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301265
57588	NC_016629	GCT	2	6	3242555	3242560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301265
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57590	NC_016629	TCCAGA	2	12	3242710	3242721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374301265
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57598	NC_016629	GCCT	2	8	3243285	3243292	0 %	25 %	25 %	50 %	374301266
57599	NC_016629	CAG	2	6	3243309	3243314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301266
57600	NC_016629	TTGG	2	8	3243323	3243330	0 %	50 %	50 %	0 %	374301266
57601	NC_016629	AT	3	6	3243482	3243487	50 %	50 %	0 %	0 %	374301266
57602	NC_016629	GAAT	2	8	3243550	3243557	50 %	25 %	25 %	0 %	374301266
57603	NC_016629	ACC	2	6	3243573	3243578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301266
57604	NC_016629	ATGC	2	8	3243595	3243602	25 %	25 %	25 %	25 %	374301266
57605	NC_016629	AGCC	2	8	3243632	3243639	25 %	0 %	25 %	50 %	374301266
57606	NC_016629	GGCC	2	8	3243675	3243682	0 %	0 %	50 %	50 %	374301266
57607	NC_016629	CG	3	6	3243814	3243819	0 %	0 %	50 %	50 %	374301266
57608	NC_016629	GCCG	2	8	3243841	3243848	0 %	0 %	50 %	50 %	374301266
57609	NC_016629	ATCG	2	8	3243853	3243860	25 %	25 %	25 %	25 %	374301266
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57615	NC_016629	GGC	2	6	3244977	3244982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301268
57616	NC_016629	GC	4	8	3245003	3245010	0 %	0 %	50 %	50 %	374301268
57617	NC_016629	TTTG	2	8	3245038	3245045	0 %	75 %	25 %	0 %	374301268
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