MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_016629	CGTGGC	2	12	3110768	3110779	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374301136
55502	NC_016629	CGA	2	6	3110816	3110821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301136
55503	NC_016629	TCA	2	6	3110866	3110871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301136
55504	NC_016629	GCC	2	6	3110883	3110888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301136
55505	NC_016629	GAG	2	6	3110901	3110906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374301136
55506	NC_016629	CGA	2	6	3110969	3110974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301136
55507	NC_016629	AAG	2	6	3111135	3111140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301136
55508	NC_016629	CGG	2	6	3111146	3111151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301136
55509	NC_016629	TTG	2	6	3111229	3111234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374301136
55510	NC_016629	GCG	2	6	3111235	3111240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301136
55511	NC_016629	AAG	2	6	3111283	3111288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374301136
55512	NC_016629	GGT	2	6	3111320	3111325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301136
55513	NC_016629	CTC	2	6	3111371	3111376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301136
55514	NC_016629	GGC	2	6	3111416	3111421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301136
55515	NC_016629	GGCC	2	8	3111431	3111438	0 %	0 %	50 %	50 %	374301136
55516	NC_016629	GCT	2	6	3111443	3111448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301136
55517	NC_016629	CGA	2	6	3111482	3111487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301136
55518	NC_016629	GCTCG	2	10	3111536	3111545	0 %	20 %	40 %	40 %	374301136
55519	NC_016629	TGC	2	6	3111598	3111603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301136
55520	NC_016629	AGGGC	2	10	3111635	3111644	20 %	0 %	60 %	20 %	374301136
55521	NC_016629	GAG	2	6	3111672	3111677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374301136
55522	NC_016629	C	6	6	3111830	3111835	0 %	0 %	0 %	100 %	374301137
55523	NC_016629	TGG	2	6	3111845	3111850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301137
55524	NC_016629	CGC	2	6	3111900	3111905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301137
55525	NC_016629	CCT	2	6	3111906	3111911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374301137
55526	NC_016629	CAT	2	6	3111945	3111950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301137
55527	NC_016629	CGG	2	6	3111951	3111956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301137
55528	NC_016629	GAAC	2	8	3111997	3112004	50 %	0 %	25 %	25 %	374301137
55529	NC_016629	CGGC	2	8	3112043	3112050	0 %	0 %	50 %	50 %	374301137
55530	NC_016629	CGA	2	6	3112089	3112094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301137
55531	NC_016629	GCTAC	2	10	3112148	3112157	20 %	20 %	20 %	40 %	374301137
55532	NC_016629	GAT	2	6	3112173	3112178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301137
55533	NC_016629	GGA	2	6	3112290	3112295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374301137
55534	NC_016629	TTC	2	6	3112637	3112642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301138
55535	NC_016629	CGC	2	6	3112669	3112674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301138
55536	NC_016629	CGC	2	6	3112706	3112711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301138
55537	NC_016629	CGG	2	6	3112764	3112769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301138
55538	NC_016629	CCG	2	6	3112842	3112847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301138
55539	NC_016629	GCG	2	6	3112857	3112862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301138
55540	NC_016629	CTGG	2	8	3112876	3112883	0 %	25 %	50 %	25 %	374301138
55541	NC_016629	GCCG	2	8	3112906	3112913	0 %	0 %	50 %	50 %	374301138
55542	NC_016629	CCG	2	6	3112929	3112934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301138
55543	NC_016629	CGG	2	6	3112940	3112945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301138
55544	NC_016629	TGC	2	6	3112980	3112985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301138
55545	NC_016629	CAT	2	6	3113008	3113013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301138
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55547	NC_016629	CTG	3	9	3113120	3113128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301138
55548	NC_016629	CGG	2	6	3113131	3113136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301138
55549	NC_016629	CAT	2	6	3113530	3113535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301139
55550	NC_016629	GTC	2	6	3113564	3113569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301139
55551	NC_016629	CAA	2	6	3113608	3113613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374301139
55552	NC_016629	CCG	2	6	3113616	3113621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301139
55553	NC_016629	TCAG	2	8	3113625	3113632	25 %	25 %	25 %	25 %	374301139
55554	NC_016629	ACC	2	6	3113730	3113735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374301139
55555	NC_016629	CTT	2	6	3113756	3113761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374301139
55556	NC_016629	TGG	2	6	3113793	3113798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374301139
55557	NC_016629	GA	3	6	3114066	3114071	50 %	0 %	50 %	0 %	374301139
55558	NC_016629	CCGG	2	8	3114097	3114104	0 %	0 %	50 %	50 %	374301139
55559	NC_016629	GCC	2	6	3114127	3114132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301139
55560	NC_016629	GCA	2	6	3114187	3114192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301139
55561	NC_016629	C	6	6	3114259	3114264	0 %	0 %	0 %	100 %	374301140
55562	NC_016629	CATGAT	2	12	3114320	3114331	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374301140
55563	NC_016629	TGCT	2	8	3114403	3114410	0 %	50 %	25 %	25 %	374301140
55564	NC_016629	CAT	3	9	3114431	3114439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301140
55565	NC_016629	GCT	2	6	3114479	3114484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301140
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55567	NC_016629	GT	3	6	3114640	3114645	0 %	50 %	50 %	0 %	374301140
55568	NC_016629	ATC	2	6	3114951	3114956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374301140
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55570	NC_016629	AAC	2	6	3115011	3115016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374301140
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55572	NC_016629	TGC	2	6	3115114	3115119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301140
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55574	NC_016629	TGC	2	6	3115360	3115365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374301140
55575	NC_016629	GCG	2	6	3115447	3115452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301140
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55577	NC_016629	ACA	2	6	3115510	3115515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374301140
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55582	NC_016629	CCCG	2	8	3115778	3115785	0 %	0 %	25 %	75 %	374301140
55583	NC_016629	GCG	2	6	3115826	3115831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301140
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55587	NC_016629	CGC	2	6	3116062	3116067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374301141
55588	NC_016629	GGTC	2	8	3116116	3116123	0 %	25 %	50 %	25 %	374301141
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55601	NC_016629	CG	3	6	3116542	3116547	0 %	0 %	50 %	50 %	374301141
55602	NC_016629	CGG	2	6	3116599	3116604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374301141
55603	NC_016629	A	7	7	3116634	3116640	100 %	0 %	0 %	0 %	374301141
55604	NC_016629	CGTG	2	8	3116643	3116650	0 %	25 %	50 %	25 %	374301141
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55606	NC_016629	GGAA	2	8	3116788	3116795	50 %	0 %	50 %	0 %	374301142
55607	NC_016629	CAG	3	9	3116798	3116806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374301142
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55609	NC_016629	CG	3	6	3116902	3116907	0 %	0 %	50 %	50 %	374301142
55610	NC_016629	ATG	2	6	3116958	3116963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374301142
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55614	NC_016629	CGGCT	2	10	3117094	3117103	0 %	20 %	40 %	40 %	374301143
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