MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfotomaculum ruminis DSM 2154 chromosome

Total Repeats: 68420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015589	GCTG	2	8	263	270	0 %	25 %	50 %	25 %	334338614
2	NC_015589	TAT	2	6	288	293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338614
3	NC_015589	CAT	2	6	312	317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334338614
4	NC_015589	GAA	2	6	322	327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338614
5	NC_015589	TAT	2	6	342	347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338614
6	NC_015589	AAG	2	6	356	361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338614
7	NC_015589	TTAT	2	8	526	533	25 %	75 %	0 %	0 %	334338614
8	NC_015589	ATGC	2	8	568	575	25 %	25 %	25 %	25 %	334338614
9	NC_015589	TA	3	6	586	591	50 %	50 %	0 %	0 %	334338614
10	NC_015589	AAT	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334338614
11	NC_015589	TAAT	2	8	653	660	50 %	50 %	0 %	0 %	334338614
12	NC_015589	GAC	2	6	670	675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338614
13	NC_015589	AATA	2	8	694	701	75 %	25 %	0 %	0 %	334338614
14	NC_015589	GCA	2	6	704	709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338614
15	NC_015589	TGA	2	6	726	731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334338614
16	NC_015589	AAAG	2	8	747	754	75 %	0 %	25 %	0 %	334338614
17	NC_015589	GAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338614
18	NC_015589	ATC	2	6	814	819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334338614
19	NC_015589	TCC	2	6	834	839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334338614
20	NC_015589	AGA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338614
21	NC_015589	ATTA	2	8	891	898	50 %	50 %	0 %	0 %	334338614
22	NC_015589	A	6	6	946	951	100 %	0 %	0 %	0 %	334338614
23	NC_015589	ATTC	2	8	1012	1019	25 %	50 %	0 %	25 %	334338614
24	NC_015589	TCC	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334338614
25	NC_015589	A	6	6	1076	1081	100 %	0 %	0 %	0 %	334338614
26	NC_015589	GCA	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338614
27	NC_015589	TTA	2	6	1163	1168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338614
28	NC_015589	GAT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334338614
29	NC_015589	A	7	7	1219	1225	100 %	0 %	0 %	0 %	334338614
30	NC_015589	CAGG	2	8	1248	1255	25 %	0 %	50 %	25 %	334338614
31	NC_015589	GAA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338614
32	NC_015589	TGG	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334338614
33	NC_015589	AAT	2	6	1430	1435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334338614
34	NC_015589	AAT	2	6	1671	1676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334338615
35	NC_015589	ACC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334338615
36	NC_015589	G	6	6	1721	1726	0 %	0 %	100 %	0 %	334338615
37	NC_015589	GAA	2	6	1852	1857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338615
38	NC_015589	TGG	2	6	1886	1891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334338615
39	NC_015589	AAG	2	6	1899	1904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338615
40	NC_015589	AACAG	2	10	1932	1941	60 %	0 %	20 %	20 %	334338615
41	NC_015589	GAA	2	6	2002	2007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338615
42	NC_015589	GGA	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334338615
43	NC_015589	TTC	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334338615
44	NC_015589	ACG	2	6	2105	2110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338615
45	NC_015589	AC	3	6	2182	2187	50 %	0 %	0 %	50 %	334338615
46	NC_015589	GA	3	6	2228	2233	50 %	0 %	50 %	0 %	334338615
47	NC_015589	GC	3	6	2285	2290	0 %	0 %	50 %	50 %	334338615
48	NC_015589	TC	3	6	2309	2314	0 %	50 %	0 %	50 %	334338615
49	NC_015589	ATT	2	6	2329	2334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338615
50	NC_015589	GGGT	2	8	2486	2493	0 %	25 %	75 %	0 %	334338615
51	NC_015589	TGAT	2	8	2630	2637	25 %	50 %	25 %	0 %	334338615
52	NC_015589	ATTT	2	8	2665	2672	25 %	75 %	0 %	0 %	334338615
53	NC_015589	A	6	6	2785	2790	100 %	0 %	0 %	0 %	334338616
54	NC_015589	AGA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338616
55	NC_015589	GGTAAA	2	12	2891	2902	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	334338616
56	NC_015589	ATT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338616
57	NC_015589	T	6	6	2975	2980	0 %	100 %	0 %	0 %	334338616
58	NC_015589	AGT	2	6	2981	2986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334338616
59	NC_015589	AGG	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334338617
60	NC_015589	CATC	2	8	3067	3074	25 %	25 %	0 %	50 %	334338617
61	NC_015589	ATT	2	6	3082	3087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338617
62	NC_015589	TATT	2	8	3129	3136	25 %	75 %	0 %	0 %	334338617
63	NC_015589	CTG	2	6	3206	3211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334338617
64	NC_015589	T	6	6	3244	3249	0 %	100 %	0 %	0 %	334338617
65	NC_015589	AAG	2	6	3277	3282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338617
66	NC_015589	GTT	2	6	3334	3339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334338617
67	NC_015589	AGA	2	6	3388	3393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338617
68	NC_015589	T	6	6	3417	3422	0 %	100 %	0 %	0 %	334338617
69	NC_015589	ATC	2	6	3568	3573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334338617
70	NC_015589	AATT	2	8	3599	3606	50 %	50 %	0 %	0 %	334338617
71	NC_015589	AAG	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338617
72	NC_015589	AGA	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338617
73	NC_015589	TTC	2	6	3732	3737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334338617
74	NC_015589	A	6	6	3739	3744	100 %	0 %	0 %	0 %	334338617
75	NC_015589	GAA	2	6	3754	3759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338617
76	NC_015589	ATT	2	6	3777	3782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338617
77	NC_015589	CAA	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334338617
78	NC_015589	TTTG	2	8	3948	3955	0 %	75 %	25 %	0 %	334338617
79	NC_015589	GCA	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338617
80	NC_015589	ATG	2	6	3976	3981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334338617
81	NC_015589	CAC	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334338617
82	NC_015589	GGT	2	6	4036	4041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334338617
83	NC_015589	AGG	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334338617
84	NC_015589	TTG	2	6	4144	4149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334338618
85	NC_015589	A	6	6	4155	4160	100 %	0 %	0 %	0 %	334338618
86	NC_015589	TTA	2	6	4285	4290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338618
87	NC_015589	CAC	2	6	4325	4330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334338618
88	NC_015589	GAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338618
89	NC_015589	CAG	2	6	4554	4559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338619
90	NC_015589	CAA	2	6	4560	4565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334338619
91	NC_015589	GCCG	2	8	4627	4634	0 %	0 %	50 %	50 %	334338619
92	NC_015589	GTAT	2	8	4636	4643	25 %	50 %	25 %	0 %	334338619
93	NC_015589	GCA	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338619
94	NC_015589	GTG	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334338619
95	NC_015589	ATA	2	6	4696	4701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334338619
96	NC_015589	CTGG	2	8	4716	4723	0 %	25 %	50 %	25 %	334338619
97	NC_015589	GAT	2	6	4779	4784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334338619
98	NC_015589	GGTA	2	8	4799	4806	25 %	25 %	50 %	0 %	334338619
99	NC_015589	AAAGT	2	10	4810	4819	60 %	20 %	20 %	0 %	334338619
100	NC_015589	CGG	2	6	4828	4833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334338619
101	NC_015589	CGG	2	6	4862	4867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334338619
102	NC_015589	GGC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334338619
103	NC_015589	GGT	2	6	4881	4886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334338619
104	NC_015589	GGT	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334338619
105	NC_015589	GGT	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334338619
106	NC_015589	TAC	2	6	4983	4988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334338619
107	NC_015589	GTAAAA	2	12	5035	5046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	334338619
108	NC_015589	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338619
109	NC_015589	GA	3	6	5132	5137	50 %	0 %	50 %	0 %	334338619
110	NC_015589	TAAA	2	8	5149	5156	75 %	25 %	0 %	0 %	334338619
111	NC_015589	ATC	2	6	5166	5171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334338619
112	NC_015589	AAT	2	6	5376	5381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334338619
113	NC_015589	ATC	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334338619
114	NC_015589	GGA	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334338619
115	NC_015589	CCA	2	6	5521	5526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334338619
116	NC_015589	TTA	2	6	5530	5535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338619
117	NC_015589	T	6	6	5620	5625	0 %	100 %	0 %	0 %	334338619
118	NC_015589	GAA	2	6	5649	5654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338619
119	NC_015589	A	6	6	5669	5674	100 %	0 %	0 %	0 %	334338619
120	NC_015589	ATT	2	6	5676	5681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338619
121	NC_015589	AGC	2	6	5714	5719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338619
122	NC_015589	TGG	2	6	5830	5835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334338619
123	NC_015589	CGG	2	6	5845	5850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334338619
124	NC_015589	GAA	2	6	5958	5963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338619
125	NC_015589	CCGATG	2	12	6052	6063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334338619
126	NC_015589	TGGA	2	8	6064	6071	25 %	25 %	50 %	0 %	334338619
127	NC_015589	CTG	2	6	6087	6092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334338619
128	NC_015589	GA	3	6	6116	6121	50 %	0 %	50 %	0 %	334338619
129	NC_015589	ATTG	2	8	6122	6129	25 %	50 %	25 %	0 %	334338619
130	NC_015589	GC	3	6	6171	6176	0 %	0 %	50 %	50 %	334338619
131	NC_015589	TTAT	2	8	6194	6201	25 %	75 %	0 %	0 %	334338619
132	NC_015589	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338619
133	NC_015589	AAC	2	6	6220	6225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334338619
134	NC_015589	ACC	2	6	6309	6314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334338619
135	NC_015589	AT	3	6	6460	6465	50 %	50 %	0 %	0 %	334338619
136	NC_015589	TAT	2	6	6561	6566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338620
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266	NC_015589	TGG	3	9	19321	19329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334338626
267	NC_015589	GA	3	6	19360	19365	50 %	0 %	50 %	0 %	334338626
268	NC_015589	TGG	2	6	19407	19412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334338626
269	NC_015589	GAA	2	6	19454	19459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338626
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272	NC_015589	TTTG	2	8	19643	19650	0 %	75 %	25 %	0 %	334338626
273	NC_015589	GA	3	6	19690	19695	50 %	0 %	50 %	0 %	334338626
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281	NC_015589	TTA	2	6	20235	20240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338628
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