MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Delftia sp. Cs1-4 chromosome

Total Repeats: 159327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015563	TCC	2	6	20673	20678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333911685
502	NC_015563	TGGGC	2	10	20692	20701	0 %	20 %	60 %	20 %	333911685
503	NC_015563	GC	3	6	20739	20744	0 %	0 %	50 %	50 %	333911685
504	NC_015563	GGCC	2	8	20856	20863	0 %	0 %	50 %	50 %	333911685
505	NC_015563	GGT	2	6	20870	20875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911685
506	NC_015563	CAGGCG	2	12	20903	20914	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333911685
507	NC_015563	GCA	2	6	20923	20928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911685
508	NC_015563	GCC	2	6	21027	21032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911685
509	NC_015563	GGCC	2	8	21037	21044	0 %	0 %	50 %	50 %	333911685
510	NC_015563	CCA	2	6	21046	21051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911685
511	NC_015563	GCGA	2	8	21057	21064	25 %	0 %	50 %	25 %	333911685
512	NC_015563	CGA	2	6	21067	21072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911685
513	NC_015563	CGG	2	6	21084	21089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911685
514	NC_015563	CAG	2	6	21101	21106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911685
515	NC_015563	GTG	2	6	21131	21136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911685
516	NC_015563	CG	3	6	21137	21142	0 %	0 %	50 %	50 %	333911685
517	NC_015563	CCA	2	6	21163	21168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911685
518	NC_015563	GC	3	6	21193	21198	0 %	0 %	50 %	50 %	333911685
519	NC_015563	CAG	2	6	21239	21244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911685
520	NC_015563	CGGA	2	8	21269	21276	25 %	0 %	50 %	25 %	333911685
521	NC_015563	GGCCAC	2	12	21359	21370	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333911685
522	NC_015563	GAT	3	9	21380	21388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911685
523	NC_015563	GGCG	2	8	21424	21431	0 %	0 %	75 %	25 %	333911685
524	NC_015563	GAT	2	6	21437	21442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911685
525	NC_015563	CAC	2	6	21455	21460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911685
526	NC_015563	CCA	2	6	21469	21474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911685
527	NC_015563	CAG	2	6	21524	21529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911685
528	NC_015563	CCA	2	6	21547	21552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911685
529	NC_015563	CAG	2	6	21647	21652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911685
530	NC_015563	TGC	2	6	21657	21662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911685
531	NC_015563	GCC	2	6	21734	21739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911685
532	NC_015563	CAC	2	6	21779	21784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911685
533	NC_015563	CGC	2	6	21796	21801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911685
534	NC_015563	AGC	2	6	21807	21812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911685
535	NC_015563	CGT	2	6	21829	21834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911685
536	NC_015563	GCG	2	6	21865	21870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911685
537	NC_015563	CAC	2	6	21881	21886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911685
538	NC_015563	GC	3	6	21887	21892	0 %	0 %	50 %	50 %	333911685
539	NC_015563	GC	3	6	21913	21918	0 %	0 %	50 %	50 %	333911685
540	NC_015563	GCG	2	6	21955	21960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911685
541	NC_015563	GCA	2	6	21964	21969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911685
542	NC_015563	GAT	2	6	21983	21988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911685
543	NC_015563	GCC	3	9	22016	22024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911685
544	NC_015563	TTGGAC	2	12	22035	22046	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333911685
545	NC_015563	GCC	2	6	22130	22135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911685
546	NC_015563	GTA	2	6	22244	22249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911685
547	NC_015563	GCG	2	6	22264	22269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911685
548	NC_015563	GC	4	8	22341	22348	0 %	0 %	50 %	50 %	333911685
549	NC_015563	CCT	2	6	22483	22488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333911685
550	NC_015563	GAT	2	6	22595	22600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911685
551	NC_015563	CA	3	6	22609	22614	50 %	0 %	0 %	50 %	333911685
552	NC_015563	CGA	2	6	22618	22623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911685
553	NC_015563	GCC	2	6	22624	22629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911685
554	NC_015563	CAC	2	6	22634	22639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911685
555	NC_015563	GCA	2	6	22657	22662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911685
556	NC_015563	AGC	2	6	22689	22694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911686
557	NC_015563	TGGC	2	8	22695	22702	0 %	25 %	50 %	25 %	333911686
558	NC_015563	AGC	2	6	22713	22718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911686
559	NC_015563	ACG	2	6	22731	22736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911686
560	NC_015563	CG	3	6	22780	22785	0 %	0 %	50 %	50 %	333911686
561	NC_015563	CAC	2	6	22799	22804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911686
562	NC_015563	CTG	2	6	22820	22825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911686
563	NC_015563	TGC	2	6	22849	22854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911686
564	NC_015563	TGA	2	6	22867	22872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911686
565	NC_015563	CG	3	6	22927	22932	0 %	0 %	50 %	50 %	333911686
566	NC_015563	GCA	2	6	22948	22953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911686
567	NC_015563	CCA	2	6	23125	23130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911686
568	NC_015563	GGC	2	6	23138	23143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911686
569	NC_015563	CGC	2	6	23167	23172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911686
570	NC_015563	CCA	2	6	23212	23217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911686
571	NC_015563	GC	3	6	23223	23228	0 %	0 %	50 %	50 %	333911686
572	NC_015563	GCA	2	6	23236	23241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911686
573	NC_015563	CGC	3	9	23251	23259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911686
574	NC_015563	CAG	2	6	23267	23272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911686
575	NC_015563	CGCA	2	8	23333	23340	25 %	0 %	25 %	50 %	333911686
576	NC_015563	CCACGC	2	12	23350	23361	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333911686
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578	NC_015563	CTG	2	6	23378	23383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911686
579	NC_015563	GC	3	6	23413	23418	0 %	0 %	50 %	50 %	333911686
580	NC_015563	TCG	2	6	23481	23486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911686
581	NC_015563	CG	4	8	23530	23537	0 %	0 %	50 %	50 %	333911686
582	NC_015563	CG	3	6	23586	23591	0 %	0 %	50 %	50 %	333911686
583	NC_015563	CCA	2	6	23626	23631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911686
584	NC_015563	CAC	2	6	23672	23677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911686
585	NC_015563	GCCG	2	8	23678	23685	0 %	0 %	50 %	50 %	333911686
586	NC_015563	GTTC	2	8	23707	23714	0 %	50 %	25 %	25 %	333911686
587	NC_015563	AGGC	2	8	23751	23758	25 %	0 %	50 %	25 %	333911686
588	NC_015563	ATGCCG	2	12	23776	23787	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333911686
589	NC_015563	A	8	8	24644	24651	100 %	0 %	0 %	0 %	333911687
590	NC_015563	TGA	2	6	24678	24683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911687
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592	NC_015563	GTG	2	6	24820	24825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911687
593	NC_015563	TGGCGC	2	12	24881	24892	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333911687
594	NC_015563	CAG	2	6	24973	24978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911687
595	NC_015563	AGC	2	6	24983	24988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911687
596	NC_015563	CAAGCT	2	12	25032	25043	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333911687
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598	NC_015563	GC	3	6	25156	25161	0 %	0 %	50 %	50 %	333911687
599	NC_015563	CT	3	6	25224	25229	0 %	50 %	0 %	50 %	333911687
600	NC_015563	CGAGGC	2	12	25242	25253	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333911687
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604	NC_015563	TCC	2	6	25390	25395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333911687
605	NC_015563	GCT	2	6	25407	25412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911687
606	NC_015563	CTGC	2	8	25428	25435	0 %	25 %	25 %	50 %	333911687
607	NC_015563	CCA	2	6	25452	25457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911687
608	NC_015563	GCC	2	6	25505	25510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911687
609	NC_015563	GGTCGA	2	12	25560	25571	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333911687
610	NC_015563	GCCA	2	8	25597	25604	25 %	0 %	25 %	50 %	333911687
611	NC_015563	CAG	2	6	25612	25617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911687
612	NC_015563	GC	3	6	25630	25635	0 %	0 %	50 %	50 %	333911687
613	NC_015563	GC	3	6	25701	25706	0 %	0 %	50 %	50 %	333911687
614	NC_015563	TGC	2	6	25718	25723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911687
615	NC_015563	CTG	2	6	25732	25737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911687
616	NC_015563	TGCGC	2	10	25782	25791	0 %	20 %	40 %	40 %	333911687
617	NC_015563	GC	3	6	25809	25814	0 %	0 %	50 %	50 %	333911687
618	NC_015563	GCT	2	6	25917	25922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911687
619	NC_015563	GCA	2	6	25926	25931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911687
620	NC_015563	GAC	2	6	25945	25950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911687
621	NC_015563	CCA	2	6	26055	26060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911687
622	NC_015563	GTG	2	6	26078	26083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911687
623	NC_015563	CTT	2	6	26127	26132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333911687
624	NC_015563	AGGC	2	8	26141	26148	25 %	0 %	50 %	25 %	333911687
625	NC_015563	ACG	2	6	26153	26158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911687
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627	NC_015563	TGG	2	6	26219	26224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911687
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