MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Delftia sp. Cs1-4 chromosome

Total Repeats: 159327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015563	GGC	2	6	229253	229258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911868
6002	NC_015563	ACGG	2	8	229293	229300	25 %	0 %	50 %	25 %	333911868
6003	NC_015563	CCT	2	6	229348	229353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333911868
6004	NC_015563	GCC	2	6	229354	229359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911868
6005	NC_015563	GCC	2	6	229371	229376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911868
6006	NC_015563	GCT	2	6	229382	229387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911868
6007	NC_015563	CCG	2	6	229417	229422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911868
6008	NC_015563	GCTGGC	2	12	229529	229540	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333911868
6009	NC_015563	CG	3	6	229541	229546	0 %	0 %	50 %	50 %	333911868
6010	NC_015563	GCC	2	6	229590	229595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911868
6011	NC_015563	ACC	2	6	229596	229601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911868
6012	NC_015563	GCC	2	6	229650	229655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911868
6013	NC_015563	CAC	2	6	229691	229696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911868
6014	NC_015563	CG	3	6	229759	229764	0 %	0 %	50 %	50 %	333911868
6015	NC_015563	GAC	2	6	229818	229823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911868
6016	NC_015563	CG	3	6	229870	229875	0 %	0 %	50 %	50 %	333911868
6017	NC_015563	CAC	2	6	230007	230012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911869
6018	NC_015563	CCG	3	9	230019	230027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911869
6019	NC_015563	GCC	3	9	230044	230052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911869
6020	NC_015563	GCC	2	6	230062	230067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911869
6021	NC_015563	GAC	2	6	230073	230078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911869
6022	NC_015563	CGT	2	6	230115	230120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911869
6023	NC_015563	TCG	2	6	230123	230128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911869
6024	NC_015563	GGC	2	6	230143	230148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911869
6025	NC_015563	TGG	2	6	230159	230164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911869
6026	NC_015563	CTG	2	6	230170	230175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911869
6027	NC_015563	GCGG	2	8	230233	230240	0 %	0 %	75 %	25 %	333911869
6028	NC_015563	GGCCAA	2	12	230262	230273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911869
6029	NC_015563	CCA	2	6	230298	230303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911869
6030	NC_015563	AAG	2	6	230335	230340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333911869
6031	NC_015563	CTG	2	6	230404	230409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911869
6032	NC_015563	CAA	2	6	230430	230435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333911869
6033	NC_015563	GCT	2	6	230445	230450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911869
6034	NC_015563	GAA	3	9	230460	230468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333911869
6035	NC_015563	GGCG	2	8	230544	230551	0 %	0 %	75 %	25 %	333911869
6036	NC_015563	CAC	2	6	230559	230564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911869
6037	NC_015563	GGC	2	6	230608	230613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911869
6038	NC_015563	CTG	2	6	230623	230628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911869
6039	NC_015563	GACCA	2	10	230632	230641	40 %	0 %	20 %	40 %	333911869
6040	NC_015563	GC	3	6	230673	230678	0 %	0 %	50 %	50 %	333911869
6041	NC_015563	CAA	2	6	230829	230834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333911869
6042	NC_015563	CACC	2	8	230937	230944	25 %	0 %	0 %	75 %	333911869
6043	NC_015563	GC	3	6	230959	230964	0 %	0 %	50 %	50 %	333911869
6044	NC_015563	TCA	2	6	230975	230980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333911869
6045	NC_015563	GCG	2	6	231112	231117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911870
6046	NC_015563	GGA	2	6	231140	231145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333911870
6047	NC_015563	GGCCC	2	10	231213	231222	0 %	0 %	40 %	60 %	333911870
6048	NC_015563	CTG	2	6	231231	231236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911870
6049	NC_015563	GC	4	8	231281	231288	0 %	0 %	50 %	50 %	333911870
6050	NC_015563	TGG	2	6	231298	231303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911870
6051	NC_015563	TGC	2	6	231394	231399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911870
6052	NC_015563	GGCC	2	8	231416	231423	0 %	0 %	50 %	50 %	333911870
6053	NC_015563	GGT	2	6	231458	231463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911870
6054	NC_015563	GCT	2	6	231533	231538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911870
6055	NC_015563	CGCGC	2	10	231568	231577	0 %	0 %	40 %	60 %	333911870
6056	NC_015563	CG	4	8	231651	231658	0 %	0 %	50 %	50 %	333911870
6057	NC_015563	GGC	2	6	231672	231677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911870
6058	NC_015563	GGC	2	6	231789	231794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911870
6059	NC_015563	TGC	3	9	231853	231861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911870
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6061	NC_015563	GGC	2	6	232200	232205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911871
6062	NC_015563	CGG	2	6	232214	232219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911871
6063	NC_015563	TCG	2	6	232274	232279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911871
6064	NC_015563	GCG	2	6	232288	232293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911871
6065	NC_015563	GGC	2	6	232294	232299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911871
6066	NC_015563	GC	3	6	232315	232320	0 %	0 %	50 %	50 %	333911871
6067	NC_015563	CAG	2	6	232342	232347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911871
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6069	NC_015563	ACA	2	6	232370	232375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333911871
6070	NC_015563	GGC	2	6	232383	232388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911871
6071	NC_015563	CGG	2	6	232398	232403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911871
6072	NC_015563	TGG	2	6	232409	232414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911871
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6074	NC_015563	CTG	3	9	232441	232449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911871
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6080	NC_015563	CG	3	6	232532	232537	0 %	0 %	50 %	50 %	333911871
6081	NC_015563	TGG	2	6	232559	232564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911871
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6086	NC_015563	CGC	2	6	232855	232860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911871
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6088	NC_015563	GGCT	2	8	232930	232937	0 %	25 %	50 %	25 %	333911871
6089	NC_015563	GCCG	2	8	232962	232969	0 %	0 %	50 %	50 %	333911871
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6095	NC_015563	CGG	2	6	233135	233140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911871
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6100	NC_015563	CAG	2	6	233466	233471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911872
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6103	NC_015563	CTT	2	6	233616	233621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333911872
6104	NC_015563	TGG	2	6	233630	233635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911872
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6106	NC_015563	GCG	2	6	233714	233719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911872
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6108	NC_015563	GAC	2	6	233840	233845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911872
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6112	NC_015563	GC	3	6	233987	233992	0 %	0 %	50 %	50 %	333911873
6113	NC_015563	GCCGC	2	10	234008	234017	0 %	0 %	40 %	60 %	333911873
6114	NC_015563	CGC	2	6	234043	234048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911873
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6116	NC_015563	TGG	2	6	234082	234087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333911873
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6119	NC_015563	CGC	2	6	234175	234180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911873
6120	NC_015563	CATGGG	2	12	234269	234280	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333911873
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6122	NC_015563	GCC	2	6	234652	234657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911874
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6485	NC_015563	CG	3	6	248042	248047	0 %	0 %	50 %	50 %	333911885
6486	NC_015563	GCG	2	6	248071	248076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911885
6487	NC_015563	GCA	2	6	248077	248082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911885
6488	NC_015563	CG	4	8	248114	248121	0 %	0 %	50 %	50 %	333911885
6489	NC_015563	AGC	2	6	248161	248166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911885
6490	NC_015563	GC	3	6	248182	248187	0 %	0 %	50 %	50 %	333911885
6491	NC_015563	GCGCA	2	10	248241	248250	20 %	0 %	40 %	40 %	333911885
6492	NC_015563	GTA	2	6	248294	248299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911885
6493	NC_015563	GCCC	2	8	248302	248309	0 %	0 %	25 %	75 %	333911885
6494	NC_015563	GCCAG	2	10	248314	248323	20 %	0 %	40 %	40 %	333911885
6495	NC_015563	GCG	2	6	248326	248331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333911885
6496	NC_015563	CAG	2	6	248333	248338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911885
6497	NC_015563	CAGCGC	2	12	248345	248356	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333911885
6498	NC_015563	GCC	2	6	248376	248381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333911885
6499	NC_015563	CAG	2	6	248390	248395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911885
6500	NC_015563	GCA	2	6	248408	248413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333911885

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