MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR04

Total Repeats: 1465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015163	GAT	3	9	68929	68937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284517
1002	NC_015163	GTTC	2	8	68946	68953	0 %	50 %	25 %	25 %	325284517
1003	NC_015163	CTG	2	6	68959	68964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284517
1004	NC_015163	TGA	2	6	69012	69017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284517
1005	NC_015163	CGT	2	6	69054	69059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284517
1006	NC_015163	GCCA	2	8	69060	69067	25 %	0 %	25 %	50 %	325284517
1007	NC_015163	CGG	2	6	69096	69101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284517
1008	NC_015163	GGTC	2	8	69120	69127	0 %	25 %	50 %	25 %	325284517
1009	NC_015163	CTT	2	6	69236	69241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284518
1010	NC_015163	TCC	2	6	69278	69283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284518
1011	NC_015163	GCC	2	6	69393	69398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284518
1012	NC_015163	CAA	2	6	69440	69445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284518
1013	NC_015163	GAA	2	6	69493	69498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284519
1014	NC_015163	CTG	2	6	69504	69509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284519
1015	NC_015163	CCG	2	6	69513	69518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284519
1016	NC_015163	GCC	2	6	69579	69584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284519
1017	NC_015163	CG	3	6	69654	69659	0 %	0 %	50 %	50 %	325284519
1018	NC_015163	GGA	2	6	69676	69681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284519
1019	NC_015163	GGA	2	6	69715	69720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284519
1020	NC_015163	TGG	2	6	69807	69812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284519
1021	NC_015163	CGC	2	6	69845	69850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284519
1022	NC_015163	CAG	2	6	69863	69868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284519
1023	NC_015163	CAG	2	6	70151	70156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284520
1024	NC_015163	GCC	2	6	70171	70176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284520
1025	NC_015163	CGG	2	6	70192	70197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284520
1026	NC_015163	GCT	2	6	70234	70239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284520
1027	NC_015163	AGC	2	6	70314	70319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284520
1028	NC_015163	CGG	2	6	70389	70394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284520
1029	NC_015163	GCA	2	6	70432	70437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284520
1030	NC_015163	TGG	3	9	70494	70502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284520
1031	NC_015163	GCG	2	6	70524	70529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284520
1032	NC_015163	CGG	2	6	70585	70590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284520
1033	NC_015163	GCT	2	6	70668	70673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284521
1034	NC_015163	GCCG	2	8	70696	70703	0 %	0 %	50 %	50 %	325284521
1035	NC_015163	GGC	2	6	70778	70783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284521
1036	NC_015163	CCG	2	6	70791	70796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284521
1037	NC_015163	CTC	2	6	70801	70806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284521
1038	NC_015163	ACAG	2	8	70875	70882	50 %	0 %	25 %	25 %	325284521
1039	NC_015163	CAG	3	9	70885	70893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284521
1040	NC_015163	CAG	2	6	70944	70949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284522
1041	NC_015163	GC	3	6	71021	71026	0 %	0 %	50 %	50 %	325284522
1042	NC_015163	AGT	2	6	71044	71049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284522
1043	NC_015163	TCAT	2	8	71134	71141	25 %	50 %	0 %	25 %	325284522
1044	NC_015163	GACC	2	8	71207	71214	25 %	0 %	25 %	50 %	325284522
1045	NC_015163	AGT	2	6	71237	71242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284522
1046	NC_015163	AGA	2	6	71252	71257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284522
1047	NC_015163	CCT	2	6	71312	71317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284522
1048	NC_015163	AGG	2	6	71382	71387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284523
1049	NC_015163	GCC	2	6	71422	71427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284523
1050	NC_015163	CAC	2	6	71443	71448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284523
1051	NC_015163	GCA	2	6	71466	71471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284523
1052	NC_015163	GCCT	2	8	71515	71522	0 %	25 %	25 %	50 %	325284523
1053	NC_015163	GCG	2	6	71528	71533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284523
1054	NC_015163	GGC	2	6	71611	71616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284523
1055	NC_015163	GCG	2	6	71624	71629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284523
1056	NC_015163	GC	3	6	71739	71744	0 %	0 %	50 %	50 %	325284523
1057	NC_015163	CGG	2	6	71766	71771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284523
1058	NC_015163	CCGC	2	8	71772	71779	0 %	0 %	25 %	75 %	325284523
1059	NC_015163	CTT	2	6	71817	71822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284523
1060	NC_015163	CGT	2	6	71856	71861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284523
1061	NC_015163	TGCT	2	8	71930	71937	0 %	50 %	25 %	25 %	325284523
1062	NC_015163	GCT	2	6	72042	72047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1063	NC_015163	TGC	3	9	72081	72089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1064	NC_015163	GAT	2	6	72091	72096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284524
1065	NC_015163	CGG	2	6	72237	72242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284524
1066	NC_015163	G	6	6	72252	72257	0 %	0 %	100 %	0 %	325284524
1067	NC_015163	GCT	2	6	72260	72265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1068	NC_015163	GAC	2	6	72313	72318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1069	NC_015163	GCT	2	6	72324	72329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1070	NC_015163	GCA	2	6	72342	72347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1071	NC_015163	GCA	2	6	72351	72356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1072	NC_015163	GTG	2	6	72362	72367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284524
1073	NC_015163	TGG	2	6	72393	72398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284524
1074	NC_015163	GCTG	2	8	72414	72421	0 %	25 %	50 %	25 %	325284524
1075	NC_015163	GCT	2	6	72456	72461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1076	NC_015163	CGA	2	6	72504	72509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284524
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1078	NC_015163	AGCC	2	8	72556	72563	25 %	0 %	25 %	50 %	325284524
1079	NC_015163	CGG	2	6	72600	72605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284524
1080	NC_015163	GCC	2	6	72626	72631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284524
1081	NC_015163	GCC	2	6	72634	72639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284524
1082	NC_015163	CGC	2	6	72640	72645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284524
1083	NC_015163	CAG	2	6	72660	72665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1084	NC_015163	CTG	2	6	72679	72684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1085	NC_015163	TGAGA	2	10	72749	72758	40 %	20 %	40 %	0 %	325284524
1086	NC_015163	CAG	2	6	72802	72807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284524
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1088	NC_015163	CTT	4	12	72882	72893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284524
1089	NC_015163	TAG	2	6	72921	72926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284524
1090	NC_015163	TGG	2	6	72927	72932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284524
1091	NC_015163	CTC	3	9	72988	72996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284524
1092	NC_015163	CCTT	2	8	73046	73053	0 %	50 %	0 %	50 %	325284524
1093	NC_015163	ACG	2	6	73124	73129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1094	NC_015163	GTC	2	6	73159	73164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1095	NC_015163	GGT	2	6	73199	73204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284524
1096	NC_015163	GAT	2	6	73236	73241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284524
1097	NC_015163	GCG	2	6	73259	73264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284524
1098	NC_015163	TGA	2	6	73296	73301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284524
1099	NC_015163	CAT	2	6	73339	73344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284524
1100	NC_015163	CAG	2	6	73351	73356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284524
1101	NC_015163	GTT	2	6	73399	73404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325284524
1102	NC_015163	TG	3	6	73409	73414	0 %	50 %	50 %	0 %	325284524
1103	NC_015163	T	7	7	73425	73431	0 %	100 %	0 %	0 %	325284524
1104	NC_015163	GCG	3	9	73432	73440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284524
1105	NC_015163	ATC	2	6	73442	73447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284524
1106	NC_015163	GGCA	2	8	73476	73483	25 %	0 %	50 %	25 %	325284525
1107	NC_015163	GCG	2	6	73530	73535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284525
1108	NC_015163	CTT	2	6	73572	73577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284525
1109	NC_015163	GAG	2	6	73630	73635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284525
1110	NC_015163	CAG	2	6	73677	73682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284525
1111	NC_015163	GCG	2	6	73684	73689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284525
1112	NC_015163	CT	3	6	73744	73749	0 %	50 %	0 %	50 %	325284525
1113	NC_015163	GGC	2	6	74068	74073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284526
1114	NC_015163	CAG	2	6	74089	74094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284526
1115	NC_015163	CCCAG	2	10	74135	74144	20 %	0 %	20 %	60 %	325284526
1116	NC_015163	GCA	3	9	74150	74158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284526
1117	NC_015163	GGC	2	6	74213	74218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284526
1118	NC_015163	GGT	2	6	74246	74251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284526
1119	NC_015163	GCT	3	9	74276	74284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284526
1120	NC_015163	CAG	2	6	74295	74300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284526
1121	NC_015163	CAC	2	6	74307	74312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284526
1122	NC_015163	GGCGG	2	10	74319	74328	0 %	0 %	80 %	20 %	325284526
1123	NC_015163	TCC	2	6	74357	74362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284527
1124	NC_015163	AGC	2	6	74363	74368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284527
1125	NC_015163	GAA	2	6	74389	74394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284527
1126	NC_015163	GCG	3	9	74395	74403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284527
1127	NC_015163	CCG	2	6	74418	74423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284527
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1129	NC_015163	TCA	2	6	74553	74558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284527
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1131	NC_015163	AGC	2	6	74609	74614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284527
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1133	NC_015163	CTG	2	6	74710	74715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284527
1134	NC_015163	GCG	2	6	74747	74752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284527
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1142	NC_015163	CGA	2	6	77364	77369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284528
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1154	NC_015163	GAT	2	6	78237	78242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284530
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1229	NC_015163	CAA	2	6	83432	83437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284535
1230	NC_015163	AAT	2	6	83445	83450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325284535
1231	NC_015163	CAGC	2	8	83466	83473	25 %	0 %	25 %	50 %	325284535
1232	NC_015163	TCA	2	6	83491	83496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284535
1233	NC_015163	ACCA	2	8	83497	83504	50 %	0 %	0 %	50 %	325284535
1234	NC_015163	CGCTC	2	10	83578	83587	0 %	20 %	20 %	60 %	325284535
1235	NC_015163	C	6	6	83587	83592	0 %	0 %	0 %	100 %	325284535
1236	NC_015163	A	7	7	83665	83671	100 %	0 %	0 %	0 %	325284535
1237	NC_015163	TGC	2	6	83694	83699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284535
1238	NC_015163	GTCA	2	8	83726	83733	25 %	25 %	25 %	25 %	325284535
1239	NC_015163	C	7	7	83772	83778	0 %	0 %	0 %	100 %	325284535
1240	NC_015163	AAC	2	6	84024	84029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284536
1241	NC_015163	CGC	2	6	84058	84063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284536
1242	NC_015163	GAC	2	6	84095	84100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284536
1243	NC_015163	ACCGA	2	10	84101	84110	40 %	0 %	20 %	40 %	325284536
1244	NC_015163	CAG	2	6	84170	84175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284536
1245	NC_015163	TCCG	2	8	84215	84222	0 %	25 %	25 %	50 %	325284536
1246	NC_015163	GAA	2	6	84242	84247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284536
1247	NC_015163	AGC	2	6	84270	84275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284536
1248	NC_015163	AAC	2	6	84288	84293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284536
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1250	NC_015163	ATC	2	6	84356	84361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284536
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1375	NC_015163	CAG	2	6	93029	93034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284546
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1404	NC_015163	GA	3	6	94030	94035	50 %	0 %	50 %	0 %	325284547
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