MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfurococcus mucosus DSM 2162 chromosome

Total Repeats: 23223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_014961	TTG	2	6	1188877	1188882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101425
21003	NC_014961	ATT	2	6	1188889	1188894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320101425
21004	NC_014961	GTC	2	6	1188903	1188908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101425
21005	NC_014961	TAT	2	6	1188933	1188938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320101425
21006	NC_014961	TTG	2	6	1188971	1188976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101425
21007	NC_014961	TGG	2	6	1189006	1189011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101425
21008	NC_014961	TAA	2	6	1189037	1189042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320101425
21009	NC_014961	CA	3	6	1189061	1189066	50 %	0 %	0 %	50 %	320101425
21010	NC_014961	TTAT	2	8	1189218	1189225	25 %	75 %	0 %	0 %	320101426
21011	NC_014961	CCT	2	6	1189250	1189255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101426
21012	NC_014961	AGC	2	6	1189278	1189283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101426
21013	NC_014961	CCCTT	2	10	1189292	1189301	0 %	40 %	0 %	60 %	320101426
21014	NC_014961	TG	3	6	1189315	1189320	0 %	50 %	50 %	0 %	320101426
21015	NC_014961	TAGG	2	8	1189478	1189485	25 %	25 %	50 %	0 %	320101426
21016	NC_014961	TCG	2	6	1189572	1189577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101426
21017	NC_014961	TC	3	6	1189583	1189588	0 %	50 %	0 %	50 %	320101426
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21019	NC_014961	TCT	2	6	1189738	1189743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101426
21020	NC_014961	GAG	2	6	1189790	1189795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101426
21021	NC_014961	TGT	2	6	1189805	1189810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101426
21022	NC_014961	TGA	2	6	1189892	1189897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101426
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21024	NC_014961	ACC	3	9	1190157	1190165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101426
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21027	NC_014961	TCG	2	6	1190328	1190333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101426
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21029	NC_014961	GAG	2	6	1190345	1190350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101426
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21032	NC_014961	GCC	2	6	1190448	1190453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101426
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21051	NC_014961	CTT	2	6	1191370	1191375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101427
21052	NC_014961	ACT	2	6	1191419	1191424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101427
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21054	NC_014961	T	6	6	1191778	1191783	0 %	100 %	0 %	0 %	320101428
21055	NC_014961	TGG	2	6	1191857	1191862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101428
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21066	NC_014961	TCT	2	6	1192335	1192340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101429
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21085	NC_014961	CGA	2	6	1193371	1193376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101430
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21101	NC_014961	GATA	2	8	1194755	1194762	50 %	25 %	25 %	0 %	320101433
21102	NC_014961	AGA	2	6	1194763	1194768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101433
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21106	NC_014961	GA	3	6	1194901	1194906	50 %	0 %	50 %	0 %	320101433
21107	NC_014961	GGA	2	6	1194929	1194934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101433
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21115	NC_014961	CAC	2	6	1195594	1195599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101434
21116	NC_014961	TCC	2	6	1195671	1195676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101434
21117	NC_014961	TCC	2	6	1195843	1195848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101434
21118	NC_014961	TCG	2	6	1195855	1195860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101434
21119	NC_014961	GCGG	2	8	1195863	1195870	0 %	0 %	75 %	25 %	320101434
21120	NC_014961	CAGC	2	8	1195885	1195892	25 %	0 %	25 %	50 %	320101434
21121	NC_014961	CGA	2	6	1195910	1195915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101434
21122	NC_014961	GA	3	6	1195914	1195919	50 %	0 %	50 %	0 %	320101434
21123	NC_014961	CTT	2	6	1196010	1196015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101434
21124	NC_014961	CTG	2	6	1196043	1196048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101434
21125	NC_014961	GAG	2	6	1196084	1196089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101434
21126	NC_014961	AGGC	2	8	1196094	1196101	25 %	0 %	50 %	25 %	320101434
21127	NC_014961	GTC	2	6	1196261	1196266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101434
21128	NC_014961	TGG	2	6	1196344	1196349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101434
21129	NC_014961	AGG	2	6	1196383	1196388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101434
21130	NC_014961	TCC	2	6	1196443	1196448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101434
21131	NC_014961	GTG	2	6	1196463	1196468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101434
21132	NC_014961	CCG	2	6	1196469	1196474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101434
21133	NC_014961	GTT	2	6	1196598	1196603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101434
21134	NC_014961	TCC	2	6	1196649	1196654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101434
21135	NC_014961	CT	3	6	1196702	1196707	0 %	50 %	0 %	50 %	320101434
21136	NC_014961	TC	5	10	1196733	1196742	0 %	50 %	0 %	50 %	320101435
21137	NC_014961	TAT	2	6	1196758	1196763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320101435
21138	NC_014961	CCT	2	6	1196769	1196774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101435
21139	NC_014961	TATC	2	8	1196790	1196797	25 %	50 %	0 %	25 %	320101435
21140	NC_014961	TA	3	6	1196859	1196864	50 %	50 %	0 %	0 %	320101435
21141	NC_014961	GAG	2	6	1196959	1196964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101435
21142	NC_014961	CTTCTC	2	12	1197013	1197024	0 %	50 %	0 %	50 %	320101435
21143	NC_014961	TCC	2	6	1197026	1197031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101435
21144	NC_014961	CTT	2	6	1197066	1197071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101435
21145	NC_014961	TC	3	6	1197121	1197126	0 %	50 %	0 %	50 %	320101435
21146	NC_014961	GGA	2	6	1197150	1197155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101435
21147	NC_014961	TGC	2	6	1197168	1197173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101435
21148	NC_014961	CTG	2	6	1197224	1197229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101435
21149	NC_014961	CCA	2	6	1197321	1197326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101435
21150	NC_014961	TGC	2	6	1197384	1197389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101435
21151	NC_014961	TGA	2	6	1197396	1197401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101435
21152	NC_014961	CTC	3	9	1197417	1197425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101436
21153	NC_014961	CT	3	6	1197432	1197437	0 %	50 %	0 %	50 %	320101436
21154	NC_014961	C	6	6	1197515	1197520	0 %	0 %	0 %	100 %	320101436
21155	NC_014961	G	6	6	1197521	1197526	0 %	0 %	100 %	0 %	320101436
21156	NC_014961	AGA	2	6	1197587	1197592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101436
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21163	NC_014961	CCA	2	6	1198012	1198017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101437
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21189	NC_014961	TCC	2	6	1199375	1199380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101438
21190	NC_014961	CGT	2	6	1199412	1199417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101438
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21192	NC_014961	TCC	2	6	1199555	1199560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101438
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21199	NC_014961	CT	3	6	1199831	1199836	0 %	50 %	0 %	50 %	320101438
21200	NC_014961	GCC	2	6	1199839	1199844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101438
21201	NC_014961	TCT	2	6	1199903	1199908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101438
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21212	NC_014961	AGT	2	6	1200344	1200349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101438
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21214	NC_014961	CTT	2	6	1200361	1200366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101438
21215	NC_014961	TAT	2	6	1200367	1200372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320101438
21216	NC_014961	ACC	2	6	1200419	1200424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101438
21217	NC_014961	GAA	2	6	1200454	1200459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101438
21218	NC_014961	CAT	2	6	1200468	1200473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101438
21219	NC_014961	CTTG	2	8	1200481	1200488	0 %	50 %	25 %	25 %	320101438
21220	NC_014961	CTC	2	6	1200520	1200525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101438
21221	NC_014961	GTT	2	6	1200526	1200531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101438
21222	NC_014961	TCC	2	6	1200575	1200580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101438
21223	NC_014961	CTC	2	6	1200637	1200642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101438
21224	NC_014961	TGC	2	6	1200739	1200744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101438
21225	NC_014961	CAT	2	6	1200783	1200788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101438
21226	NC_014961	ATC	2	6	1200860	1200865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101438
21227	NC_014961	TGTT	2	8	1200891	1200898	0 %	75 %	25 %	0 %	320101438
21228	NC_014961	GTT	2	6	1200917	1200922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101438
21229	NC_014961	CCT	2	6	1200933	1200938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101438
21230	NC_014961	CGA	2	6	1201138	1201143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101439
21231	NC_014961	AAC	2	6	1201157	1201162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101439
21232	NC_014961	CCT	2	6	1201195	1201200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101439
21233	NC_014961	TGAA	2	8	1201520	1201527	50 %	25 %	25 %	0 %	320101440
21234	NC_014961	GGA	2	6	1201549	1201554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101440
21235	NC_014961	GAG	2	6	1201565	1201570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101440
21236	NC_014961	GGA	2	6	1201594	1201599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101440
21237	NC_014961	GCG	2	6	1201608	1201613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101440
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21239	NC_014961	AGA	2	6	1201731	1201736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101440
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21241	NC_014961	GAG	2	6	1201822	1201827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101440
21242	NC_014961	TGA	2	6	1201836	1201841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101440
21243	NC_014961	GCAAG	2	10	1201848	1201857	40 %	0 %	40 %	20 %	320101440
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21245	NC_014961	TCG	2	6	1201989	1201994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101440
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21251	NC_014961	AG	3	6	1202594	1202599	50 %	0 %	50 %	0 %	320101441
21252	NC_014961	ACCT	2	8	1202669	1202676	25 %	25 %	0 %	50 %	320101441
21253	NC_014961	GGA	2	6	1202726	1202731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101441
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21256	NC_014961	AGGCT	2	10	1202906	1202915	20 %	20 %	40 %	20 %	320101441
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21261	NC_014961	TA	3	6	1203057	1203062	50 %	50 %	0 %	0 %	320101442
21262	NC_014961	TGT	2	6	1203140	1203145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101442
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21331	NC_014961	CAG	2	6	1207676	1207681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101446
21332	NC_014961	AGG	2	6	1207766	1207771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101446
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21340	NC_014961	AGG	2	6	1208205	1208210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101447
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21343	NC_014961	AG	3	6	1208375	1208380	50 %	0 %	50 %	0 %	320101447
21344	NC_014961	GAG	2	6	1208384	1208389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101447
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21347	NC_014961	CAG	2	6	1208557	1208562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101447
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21464	NC_014961	AGT	2	6	1215535	1215540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101451
21465	NC_014961	GTA	2	6	1215578	1215583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101451
21466	NC_014961	CAG	2	6	1215691	1215696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101451
21467	NC_014961	TCA	2	6	1215700	1215705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101451
21468	NC_014961	AGG	2	6	1215774	1215779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101451
21469	NC_014961	GCC	2	6	1215821	1215826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101451
21470	NC_014961	TTA	2	6	1215946	1215951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320101451
21471	NC_014961	TATGT	2	10	1215960	1215969	20 %	60 %	20 %	0 %	320101451
21472	NC_014961	GTA	3	9	1215986	1215994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101451
21473	NC_014961	CCA	2	6	1215998	1216003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101451
21474	NC_014961	CCT	2	6	1216068	1216073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101451
21475	NC_014961	CTGC	2	8	1216087	1216094	0 %	25 %	25 %	50 %	320101451
21476	NC_014961	GCT	2	6	1216202	1216207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101451
21477	NC_014961	GTA	2	6	1216253	1216258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101451
21478	NC_014961	GGA	2	6	1216486	1216491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101451
21479	NC_014961	ACC	2	6	1216507	1216512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101451
21480	NC_014961	GAA	3	9	1216523	1216531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101451
21481	NC_014961	GCC	2	6	1216532	1216537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101451
21482	NC_014961	CTA	2	6	1216590	1216595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101451
21483	NC_014961	CAG	2	6	1216697	1216702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101451
21484	NC_014961	CTG	2	6	1216806	1216811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101451
21485	NC_014961	GGTCAG	2	12	1216814	1216825	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320101451
21486	NC_014961	ATGG	2	8	1216833	1216840	25 %	25 %	50 %	0 %	320101451
21487	NC_014961	GCT	2	6	1216886	1216891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101451
21488	NC_014961	TCA	2	6	1216929	1216934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101451
21489	NC_014961	CGA	2	6	1217053	1217058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101451
21490	NC_014961	TCA	2	6	1217203	1217208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101451
21491	NC_014961	TGT	2	6	1217395	1217400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101451
21492	NC_014961	TATC	2	8	1217434	1217441	25 %	50 %	0 %	25 %	320101451
21493	NC_014961	ACT	2	6	1217448	1217453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101451
21494	NC_014961	CGC	2	6	1217528	1217533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101451
21495	NC_014961	AAG	2	6	1217880	1217885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101452
21496	NC_014961	AGG	2	6	1217918	1217923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101452
21497	NC_014961	GGC	2	6	1217983	1217988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101452
21498	NC_014961	TGA	2	6	1217999	1218004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101452
21499	NC_014961	GTC	2	6	1218012	1218017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101452
21500	NC_014961	GAC	2	6	1218052	1218057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101452

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