MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalogenimonas lykanthroporepellens BL-DC-9 chromosome

Total Repeats: 29786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014314	GAA	2	6	233	238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300087140
2	NC_014314	CAAT	2	8	243	250	50 %	25 %	0 %	25 %	300087140
3	NC_014314	ATG	2	6	252	257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087140
4	NC_014314	CCGG	2	8	258	265	0 %	0 %	50 %	50 %	300087140
5	NC_014314	ACC	2	6	338	343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300087140
6	NC_014314	CGG	2	6	358	363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087140
7	NC_014314	TC	3	6	465	470	0 %	50 %	0 %	50 %	300087140
8	NC_014314	ACCG	2	8	518	525	25 %	0 %	25 %	50 %	300087140
9	NC_014314	TCAT	2	8	584	591	25 %	50 %	0 %	25 %	300087140
10	NC_014314	CGC	3	9	619	627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300087140
11	NC_014314	CGG	2	6	633	638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087140
12	NC_014314	TCA	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300087140
13	NC_014314	TCT	2	6	706	711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300087140
14	NC_014314	GTC	2	6	744	749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300087140
15	NC_014314	TCG	2	6	789	794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300087140
16	NC_014314	GA	3	6	806	811	50 %	0 %	50 %	0 %	300087140
17	NC_014314	GAT	2	6	863	868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087140
18	NC_014314	AG	3	6	901	906	50 %	0 %	50 %	0 %	300087140
19	NC_014314	T	6	6	907	912	0 %	100 %	0 %	0 %	300087140
20	NC_014314	CGG	2	6	960	965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087140
21	NC_014314	CAC	2	6	969	974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300087140
22	NC_014314	GAC	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300087140
23	NC_014314	TGA	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087140
24	NC_014314	A	6	6	1056	1061	100 %	0 %	0 %	0 %	300087140
25	NC_014314	GAA	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300087140
26	NC_014314	TTA	2	6	1205	1210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300087140
27	NC_014314	GC	3	6	1235	1240	0 %	0 %	50 %	50 %	300087140
28	NC_014314	CTG	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300087140
29	NC_014314	CGG	3	9	1355	1363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087140
30	NC_014314	ATGA	2	8	1430	1437	50 %	25 %	25 %	0 %	300087140
31	NC_014314	CGG	2	6	1453	1458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087140
32	NC_014314	GGC	2	6	1654	1659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087141
33	NC_014314	T	6	6	1666	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	300087141
34	NC_014314	TTC	2	6	1685	1690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300087141
35	NC_014314	GAT	2	6	1711	1716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087141
36	NC_014314	CTGG	2	8	1747	1754	0 %	25 %	50 %	25 %	300087141
37	NC_014314	GTC	2	6	1814	1819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300087141
38	NC_014314	GC	3	6	1853	1858	0 %	0 %	50 %	50 %	300087141
39	NC_014314	CAA	2	6	2104	2109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300087142
40	NC_014314	GA	3	6	2180	2185	50 %	0 %	50 %	0 %	300087142
41	NC_014314	AGA	2	6	2233	2238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300087142
42	NC_014314	GTCA	2	8	2637	2644	25 %	25 %	25 %	25 %	300087142
43	NC_014314	ATC	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300087142
44	NC_014314	GAAG	2	8	2813	2820	50 %	0 %	50 %	0 %	300087142
45	NC_014314	CAGC	2	8	2972	2979	25 %	0 %	25 %	50 %	300087142
46	NC_014314	CCG	2	6	2981	2986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300087142
47	NC_014314	GGC	2	6	3088	3093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087142
48	NC_014314	GA	3	6	3117	3122	50 %	0 %	50 %	0 %	300087142
49	NC_014314	CAG	2	6	3216	3221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300087142
50	NC_014314	GAC	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300087142
51	NC_014314	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300087142
52	NC_014314	AGG	2	6	3289	3294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300087142
53	NC_014314	ATT	2	6	3323	3328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300087142
54	NC_014314	ACT	2	6	3471	3476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300087143
55	NC_014314	GCC	2	6	3481	3486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300087143
56	NC_014314	A	6	6	3533	3538	100 %	0 %	0 %	0 %	300087143
57	NC_014314	GTC	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300087143
58	NC_014314	CTT	2	6	3627	3632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300087143
59	NC_014314	ATT	2	6	3839	3844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300087143
60	NC_014314	TTG	2	6	3938	3943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300087143
61	NC_014314	TGG	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300087143
62	NC_014314	ATA	2	6	4021	4026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300087143
63	NC_014314	GTG	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300087143
64	NC_014314	GCC	2	6	4192	4197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300087143
65	NC_014314	TGA	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087143
66	NC_014314	GGT	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300087143
67	NC_014314	GA	3	6	4270	4275	50 %	0 %	50 %	0 %	300087144
68	NC_014314	GCG	2	6	4327	4332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087144
69	NC_014314	GGT	2	6	4343	4348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300087144
70	NC_014314	TAC	2	6	4382	4387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300087144
71	NC_014314	A	7	7	4426	4432	100 %	0 %	0 %	0 %	300087144
72	NC_014314	TCG	2	6	4444	4449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300087144
73	NC_014314	GGGGA	2	10	4453	4462	20 %	0 %	80 %	0 %	300087144
74	NC_014314	TTC	2	6	4478	4483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300087144
75	NC_014314	CAC	2	6	4537	4542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300087145
76	NC_014314	CGG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087145
77	NC_014314	CGA	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300087145
78	NC_014314	CGC	2	6	4648	4653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300087145
79	NC_014314	ATC	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300087145
80	NC_014314	CGG	2	6	4705	4710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087145
81	NC_014314	GTG	2	6	4766	4771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300087145
82	NC_014314	GAA	2	6	4844	4849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300087145
83	NC_014314	A	6	6	4978	4983	100 %	0 %	0 %	0 %	300087145
84	NC_014314	ATA	2	6	5055	5060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300087145
85	NC_014314	CGGATT	2	12	5074	5085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300087145
86	NC_014314	TTG	2	6	5159	5164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300087145
87	NC_014314	CCG	2	6	5210	5215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300087145
88	NC_014314	GGC	2	6	5239	5244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087145
89	NC_014314	TCG	2	6	5259	5264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300087145
90	NC_014314	CAT	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300087145
91	NC_014314	CAT	2	6	5332	5337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300087145
92	NC_014314	TTTA	2	8	5395	5402	25 %	75 %	0 %	0 %	300087146
93	NC_014314	GGC	2	6	5464	5469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087146
94	NC_014314	C	8	8	5575	5582	0 %	0 %	0 %	100 %	300087146
95	NC_014314	TCC	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300087146
96	NC_014314	TG	3	6	5761	5766	0 %	50 %	50 %	0 %	300087146
97	NC_014314	ATT	2	6	5852	5857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300087146
98	NC_014314	TCTG	2	8	5893	5900	0 %	50 %	25 %	25 %	300087147
99	NC_014314	GCC	2	6	5906	5911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300087147
100	NC_014314	GGC	2	6	6007	6012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087147
101	NC_014314	CAC	2	6	6081	6086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300087147
102	NC_014314	A	6	6	6188	6193	100 %	0 %	0 %	0 %	300087147
103	NC_014314	TG	3	6	6203	6208	0 %	50 %	50 %	0 %	300087147
104	NC_014314	GGT	2	6	6256	6261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300087147
105	NC_014314	TGG	2	6	6330	6335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300087147
106	NC_014314	AAG	2	6	6442	6447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300087147
107	NC_014314	GCC	2	6	6469	6474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300087147
108	NC_014314	GGCA	2	8	6626	6633	25 %	0 %	50 %	25 %	300087147
109	NC_014314	TTC	2	6	6793	6798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300087148
110	NC_014314	A	7	7	6799	6805	100 %	0 %	0 %	0 %	300087148
111	NC_014314	CGGA	2	8	6810	6817	25 %	0 %	50 %	25 %	300087148
112	NC_014314	ACTTC	2	10	6920	6929	20 %	40 %	0 %	40 %	300087148
113	NC_014314	CCG	2	6	7028	7033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300087148
114	NC_014314	GTT	2	6	7109	7114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300087148
115	NC_014314	TAC	2	6	7137	7142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300087148
116	NC_014314	CGT	3	9	7143	7151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300087148
117	NC_014314	TAA	2	6	7167	7172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300087148
118	NC_014314	GGAA	2	8	7212	7219	50 %	0 %	50 %	0 %	300087148
119	NC_014314	ACG	2	6	7236	7241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300087148
120	NC_014314	GTGG	2	8	7244	7251	0 %	25 %	75 %	0 %	300087148
121	NC_014314	AGT	2	6	7258	7263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087148
122	NC_014314	CAC	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300087148
123	NC_014314	CCG	2	6	7305	7310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300087148
124	NC_014314	TAA	2	6	7327	7332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300087148
125	NC_014314	AAG	2	6	7353	7358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300087148
126	NC_014314	GTC	2	6	7688	7693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300087149
127	NC_014314	GA	3	6	7760	7765	50 %	0 %	50 %	0 %	300087149
128	NC_014314	GCC	2	6	7768	7773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300087149
129	NC_014314	TGA	2	6	7803	7808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087149
130	NC_014314	ATT	2	6	7809	7814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300087149
131	NC_014314	TAC	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300087149
132	NC_014314	A	6	6	7956	7961	100 %	0 %	0 %	0 %	300087149
133	NC_014314	AGTC	2	8	7971	7978	25 %	25 %	25 %	25 %	300087149
134	NC_014314	AAGC	2	8	8107	8114	50 %	0 %	25 %	25 %	300087149
135	NC_014314	GTT	2	6	8149	8154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300087149
136	NC_014314	CACG	2	8	8163	8170	25 %	0 %	25 %	50 %	300087149
137	NC_014314	TTA	2	6	8351	8356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300087149
138	NC_014314	TGA	2	6	8361	8366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087149
139	NC_014314	GACC	2	8	8531	8538	25 %	0 %	25 %	50 %	300087150
140	NC_014314	GA	3	6	8711	8716	50 %	0 %	50 %	0 %	300087150
141	NC_014314	TAA	2	6	8864	8869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300087150
142	NC_014314	CGAA	2	8	8921	8928	50 %	0 %	25 %	25 %	300087150
143	NC_014314	CTG	2	6	8968	8973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300087150
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145	NC_014314	ATC	2	6	9186	9191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300087150
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147	NC_014314	TTA	2	6	9228	9233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300087150
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150	NC_014314	GTA	2	6	9310	9315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087151
151	NC_014314	TCGC	2	8	9334	9341	0 %	25 %	25 %	50 %	300087151
152	NC_014314	TTC	2	6	9389	9394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300087151
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158	NC_014314	GTC	2	6	9808	9813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300087151
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161	NC_014314	GGC	2	6	11000	11005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087152
162	NC_014314	ATT	2	6	11012	11017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300087152
163	NC_014314	CGG	2	6	11139	11144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087152
164	NC_014314	A	6	6	11268	11273	100 %	0 %	0 %	0 %	300087153
165	NC_014314	ATTG	2	8	11276	11283	25 %	50 %	25 %	0 %	300087153
166	NC_014314	CTT	2	6	11307	11312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300087153
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169	NC_014314	ATGG	2	8	11433	11440	25 %	25 %	50 %	0 %	300087153
170	NC_014314	CAAC	2	8	11476	11483	50 %	0 %	0 %	50 %	300087153
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172	NC_014314	GGGA	2	8	11964	11971	25 %	0 %	75 %	0 %	300087154
173	NC_014314	GTA	2	6	11980	11985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087154
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176	NC_014314	TTG	2	6	12056	12061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300087154
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196	NC_014314	CTT	2	6	13398	13403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300087155
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265	NC_014314	TC	3	6	18749	18754	0 %	50 %	0 %	50 %	300087158
266	NC_014314	TGA	2	6	19191	19196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087159
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287	NC_014314	CAGG	2	8	20470	20477	25 %	0 %	50 %	25 %	300087160
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392	NC_014314	TCC	2	6	28814	28819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300087166
393	NC_014314	CTAT	2	8	28830	28837	25 %	50 %	0 %	25 %	300087166
394	NC_014314	CAG	2	6	28886	28891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300087166
395	NC_014314	CCAG	2	8	29001	29008	25 %	0 %	25 %	50 %	300087166
396	NC_014314	CCA	2	6	29025	29030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300087166
397	NC_014314	GTA	2	6	29057	29062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300087166
398	NC_014314	GTT	2	6	29074	29079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300087166
399	NC_014314	GGCCAG	2	12	29093	29104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300087166
400	NC_014314	GGGC	2	8	29138	29145	0 %	0 %	75 %	25 %	300087166
401	NC_014314	CTT	2	6	29245	29250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300087166
402	NC_014314	CTT	2	6	29323	29328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300087166
403	NC_014314	CCGT	2	8	29339	29346	0 %	25 %	25 %	50 %	300087166
404	NC_014314	CAGG	2	8	29388	29395	25 %	0 %	50 %	25 %	300087166
405	NC_014314	TGG	2	6	29518	29523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300087166
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407	NC_014314	ATC	2	6	29751	29756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300087167
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409	NC_014314	TGG	2	6	29847	29852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300087167
410	NC_014314	T	6	6	29962	29967	0 %	100 %	0 %	0 %	300087167
411	NC_014314	TTC	2	6	29978	29983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300087167
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423	NC_014314	GGT	2	6	30611	30616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300087167
424	NC_014314	TGG	2	6	30648	30653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300087167
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499	NC_014314	GGC	3	9	35212	35220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300087171
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