MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 chromosome

Total Repeats: 69778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014216	GCA	2	6	534	539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567993
2	NC_014216	T	7	7	634	640	0 %	100 %	0 %	0 %	297567993
3	NC_014216	TGC	2	6	666	671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567993
4	NC_014216	AGG	2	6	677	682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567993
5	NC_014216	CGA	2	6	747	752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567993
6	NC_014216	GGC	2	6	821	826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567993
7	NC_014216	CGA	2	6	861	866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567993
8	NC_014216	TGG	2	6	872	877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567993
9	NC_014216	GCC	2	6	919	924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567993
10	NC_014216	GCCGAG	2	12	931	942	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297567993
11	NC_014216	TCA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567993
12	NC_014216	CAT	2	6	1006	1011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567993
13	NC_014216	TA	3	6	1013	1018	50 %	50 %	0 %	0 %	297567993
14	NC_014216	TGC	2	6	1042	1047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567993
15	NC_014216	ACC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567993
16	NC_014216	CTG	2	6	1144	1149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567993
17	NC_014216	GGA	2	6	1152	1157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567993
18	NC_014216	CCG	2	6	1336	1341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567993
19	NC_014216	GCC	2	6	1378	1383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567993
20	NC_014216	GAG	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567993
21	NC_014216	TGG	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567993
22	NC_014216	CCG	2	6	1449	1454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567993
23	NC_014216	TTG	2	6	1469	1474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297567993
24	NC_014216	AAGGCC	2	12	1480	1491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567993
25	NC_014216	AGCC	2	8	1504	1511	25 %	0 %	25 %	50 %	297567993
26	NC_014216	CCATGG	2	12	1514	1525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297567993
27	NC_014216	AGG	2	6	1529	1534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567993
28	NC_014216	TGG	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567993
29	NC_014216	GGT	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567993
30	NC_014216	GGC	3	9	1561	1569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567993
31	NC_014216	CCG	2	6	1574	1579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567993
32	NC_014216	CGC	2	6	1599	1604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567993
33	NC_014216	CGA	2	6	1704	1709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567993
34	NC_014216	GTG	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567993
35	NC_014216	CATTC	2	10	1762	1771	20 %	40 %	0 %	40 %	297567993
36	NC_014216	GGC	2	6	1892	1897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567994
37	NC_014216	TGA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567994
38	NC_014216	CGG	2	6	1913	1918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567994
39	NC_014216	TCA	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567994
40	NC_014216	TGG	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567994
41	NC_014216	GCCAG	2	10	2015	2024	20 %	0 %	40 %	40 %	297567994
42	NC_014216	GAT	2	6	2033	2038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567994
43	NC_014216	GCC	2	6	2058	2063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567994
44	NC_014216	GCA	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567994
45	NC_014216	CGG	2	6	2091	2096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567994
46	NC_014216	GCA	2	6	2108	2113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567994
47	NC_014216	ATC	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567994
48	NC_014216	TCCAGT	2	12	2158	2169	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297567994
49	NC_014216	GCCG	2	8	2183	2190	0 %	0 %	50 %	50 %	297567994
50	NC_014216	CCA	2	6	2192	2197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567994
51	NC_014216	CAG	2	6	2205	2210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567994
52	NC_014216	CGG	2	6	2219	2224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567994
53	NC_014216	TG	3	6	2243	2248	0 %	50 %	50 %	0 %	297567994
54	NC_014216	GCCG	2	8	2307	2314	0 %	0 %	50 %	50 %	297567994
55	NC_014216	CAG	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567994
56	NC_014216	GCC	2	6	2487	2492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567994
57	NC_014216	T	6	6	2510	2515	0 %	100 %	0 %	0 %	297567994
58	NC_014216	CGG	2	6	2609	2614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567994
59	NC_014216	GGT	2	6	2631	2636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567994
60	NC_014216	CGG	2	6	2640	2645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567994
61	NC_014216	TGC	2	6	2648	2653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567994
62	NC_014216	GCC	2	6	2660	2665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567994
63	NC_014216	TTCT	2	8	2700	2707	0 %	75 %	0 %	25 %	297567994
64	NC_014216	GCC	2	6	2711	2716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567994
65	NC_014216	CCG	2	6	2780	2785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567994
66	NC_014216	CCA	2	6	2789	2794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567994
67	NC_014216	GCA	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567994
68	NC_014216	T	7	7	2861	2867	0 %	100 %	0 %	0 %	297567994
69	NC_014216	AG	3	6	2904	2909	50 %	0 %	50 %	0 %	297567994
70	NC_014216	CAG	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567994
71	NC_014216	CCA	2	6	2951	2956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567994
72	NC_014216	GCC	2	6	2957	2962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567994
73	NC_014216	GCG	2	6	2996	3001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567994
74	NC_014216	CCT	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567994
75	NC_014216	GCA	2	6	3035	3040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567994
76	NC_014216	CGTC	2	8	3136	3143	0 %	25 %	25 %	50 %	297567994
77	NC_014216	CGG	2	6	3170	3175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567994
78	NC_014216	GGCC	2	8	3209	3216	0 %	0 %	50 %	50 %	297567994
79	NC_014216	CGA	2	6	3218	3223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567994
80	NC_014216	CGG	2	6	3606	3611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567995
81	NC_014216	CGA	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567995
82	NC_014216	GGT	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567995
83	NC_014216	TGA	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567995
84	NC_014216	T	6	6	3732	3737	0 %	100 %	0 %	0 %	297567995
85	NC_014216	GAC	2	6	3777	3782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567995
86	NC_014216	TGG	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567995
87	NC_014216	ACCT	2	8	3809	3816	25 %	25 %	0 %	50 %	297567995
88	NC_014216	CTG	2	6	3849	3854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567995
89	NC_014216	GC	3	6	3920	3925	0 %	0 %	50 %	50 %	297567995
90	NC_014216	CTC	2	6	4064	4069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567995
91	NC_014216	GCA	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567995
92	NC_014216	CGA	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567995
93	NC_014216	GGC	2	6	4141	4146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567995
94	NC_014216	GTGGG	2	10	4168	4177	0 %	20 %	80 %	0 %	297567995
95	NC_014216	CAG	2	6	4359	4364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567996
96	NC_014216	GCCG	2	8	4375	4382	0 %	0 %	50 %	50 %	297567996
97	NC_014216	CTG	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567996
98	NC_014216	GCA	2	6	4397	4402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567996
99	NC_014216	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567996
100	NC_014216	CCA	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567996
101	NC_014216	GGT	2	6	4593	4598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567996
102	NC_014216	CGC	2	6	4628	4633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567996
103	NC_014216	GCG	2	6	4708	4713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567996
104	NC_014216	GAT	2	6	4743	4748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567996
105	NC_014216	GGT	2	6	4758	4763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567996
106	NC_014216	GGT	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567997
107	NC_014216	GGC	2	6	4798	4803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567997
108	NC_014216	TGC	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567997
109	NC_014216	TAA	2	6	4827	4832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297567997
110	NC_014216	GGC	2	6	4847	4852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567997
111	NC_014216	GGC	2	6	4856	4861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567997
112	NC_014216	GGC	3	9	4865	4873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567997
113	NC_014216	CCA	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567997
114	NC_014216	G	6	6	4939	4944	0 %	0 %	100 %	0 %	297567997
115	NC_014216	CGG	2	6	5008	5013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567997
116	NC_014216	AGC	3	9	5016	5024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567997
117	NC_014216	GGC	2	6	5093	5098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567997
118	NC_014216	TGC	2	6	5136	5141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567997
119	NC_014216	CGG	2	6	5166	5171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567997
120	NC_014216	TGA	3	9	5182	5190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567997
121	NC_014216	GC	3	6	5207	5212	0 %	0 %	50 %	50 %	297567997
122	NC_014216	TTC	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567997
123	NC_014216	AGC	2	6	5253	5258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567997
124	NC_014216	AGC	4	12	5265	5276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567997
125	NC_014216	GGCCC	2	10	5291	5300	0 %	0 %	40 %	60 %	297567997
126	NC_014216	GGT	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567997
127	NC_014216	ATC	2	6	5336	5341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567997
128	NC_014216	GGC	2	6	5345	5350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567997
129	NC_014216	GTG	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567997
130	NC_014216	GCG	2	6	5454	5459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567997
131	NC_014216	A	6	6	5514	5519	100 %	0 %	0 %	0 %	297567997
132	NC_014216	CAG	2	6	5555	5560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567997
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499	NC_014216	CCCTGG	2	12	21148	21159	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297568010
500	NC_014216	CTG	2	6	21195	21200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568010

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