MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 chromosome

Total Repeats: 69778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014216	CTGGAG	2	12	134847	134858	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	297568102
3002	NC_014216	GGC	2	6	134875	134880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568102
3003	NC_014216	GTCA	2	8	134889	134896	25 %	25 %	25 %	25 %	297568102
3004	NC_014216	GTGA	2	8	134955	134962	25 %	25 %	50 %	0 %	297568102
3005	NC_014216	CGG	2	6	135002	135007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568102
3006	NC_014216	GGC	3	9	135137	135145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568102
3007	NC_014216	TC	3	6	135167	135172	0 %	50 %	0 %	50 %	297568102
3008	NC_014216	CCG	2	6	135240	135245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568102
3009	NC_014216	CCG	2	6	135262	135267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568102
3010	NC_014216	GGC	2	6	135268	135273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568102
3011	NC_014216	TCG	2	6	135274	135279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568102
3012	NC_014216	ACC	3	9	135285	135293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568102
3013	NC_014216	GAG	2	6	135318	135323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568102
3014	NC_014216	CCG	2	6	135352	135357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568102
3015	NC_014216	GGC	2	6	135434	135439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568102
3016	NC_014216	GTT	2	6	135485	135490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568102
3017	NC_014216	GGT	2	6	135518	135523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568102
3018	NC_014216	TTTC	2	8	135530	135537	0 %	75 %	0 %	25 %	297568102
3019	NC_014216	GCT	2	6	135566	135571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568102
3020	NC_014216	GCA	2	6	135574	135579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568102
3021	NC_014216	TGG	2	6	135639	135644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568102
3022	NC_014216	CAC	2	6	135695	135700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568102
3023	NC_014216	CCG	2	6	135736	135741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568102
3024	NC_014216	GCC	2	6	135783	135788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568102
3025	NC_014216	C	6	6	135794	135799	0 %	0 %	0 %	100 %	297568102
3026	NC_014216	ACCG	2	8	135837	135844	25 %	0 %	25 %	50 %	297568102
3027	NC_014216	GAT	2	6	135878	135883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568102
3028	NC_014216	TGC	2	6	135892	135897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568102
3029	NC_014216	GAG	2	6	135912	135917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568102
3030	NC_014216	TCT	2	6	135919	135924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568102
3031	NC_014216	GGC	2	6	135927	135932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568102
3032	NC_014216	GGA	2	6	136076	136081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568102
3033	NC_014216	GCG	2	6	136091	136096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568102
3034	NC_014216	GAC	2	6	136123	136128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568102
3035	NC_014216	CAG	2	6	136134	136139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568102
3036	NC_014216	C	6	6	136143	136148	0 %	0 %	0 %	100 %	297568102
3037	NC_014216	TGC	2	6	136153	136158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568102
3038	NC_014216	GGC	2	6	136261	136266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568102
3039	NC_014216	CTG	2	6	136356	136361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568102
3040	NC_014216	CCG	2	6	136393	136398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568102
3041	NC_014216	GCA	2	6	136430	136435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568102
3042	NC_014216	CGC	2	6	136515	136520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568102
3043	NC_014216	CGG	2	6	136704	136709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568102
3044	NC_014216	CGC	2	6	136792	136797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568102
3045	NC_014216	T	6	6	136814	136819	0 %	100 %	0 %	0 %	297568102
3046	NC_014216	CAG	2	6	136924	136929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568103
3047	NC_014216	TCA	2	6	136953	136958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568103
3048	NC_014216	CAT	2	6	137015	137020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568103
3049	NC_014216	ATC	2	6	137036	137041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568103
3050	NC_014216	ATC	2	6	137166	137171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568103
3051	NC_014216	CT	3	6	137190	137195	0 %	50 %	0 %	50 %	297568103
3052	NC_014216	GA	3	6	137259	137264	50 %	0 %	50 %	0 %	297568103
3053	NC_014216	AAC	2	6	137310	137315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297568103
3054	NC_014216	ACAA	2	8	137364	137371	75 %	0 %	0 %	25 %	297568103
3055	NC_014216	CAA	2	6	137467	137472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297568103
3056	NC_014216	TCT	2	6	137473	137478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568103
3057	NC_014216	GAA	2	6	137489	137494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568103
3058	NC_014216	GGT	3	9	137509	137517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568103
3059	NC_014216	CCCA	2	8	137555	137562	25 %	0 %	0 %	75 %	297568103
3060	NC_014216	TGG	2	6	137574	137579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568103
3061	NC_014216	TGC	3	9	137595	137603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568103
3062	NC_014216	CCG	2	6	137626	137631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568103
3063	NC_014216	TGCCGA	2	12	137644	137655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297568103
3064	NC_014216	AAT	2	6	137963	137968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297568104
3065	NC_014216	CTT	2	6	137985	137990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568104
3066	NC_014216	TGGC	3	12	138021	138032	0 %	25 %	50 %	25 %	297568104
3067	NC_014216	GAA	2	6	138090	138095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568104
3068	NC_014216	C	6	6	138106	138111	0 %	0 %	0 %	100 %	297568104
3069	NC_014216	GAG	2	6	138120	138125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568104
3070	NC_014216	GCG	2	6	138142	138147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568104
3071	NC_014216	CCGG	2	8	138301	138308	0 %	0 %	50 %	50 %	297568104
3072	NC_014216	TGG	2	6	138382	138387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568104
3073	NC_014216	ACT	2	6	138454	138459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568104
3074	NC_014216	TGG	2	6	138480	138485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568104
3075	NC_014216	GAT	2	6	138547	138552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568104
3076	NC_014216	TTG	2	6	138682	138687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568105
3077	NC_014216	CTG	2	6	138694	138699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568105
3078	NC_014216	CTG	2	6	138928	138933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568105
3079	NC_014216	GGCT	2	8	138939	138946	0 %	25 %	50 %	25 %	297568105
3080	NC_014216	CCGG	2	8	138971	138978	0 %	0 %	50 %	50 %	297568105
3081	NC_014216	CAAG	2	8	139011	139018	50 %	0 %	25 %	25 %	297568105
3082	NC_014216	TACC	2	8	139041	139048	25 %	25 %	0 %	50 %	297568105
3083	NC_014216	GTG	2	6	139051	139056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568105
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3085	NC_014216	ATC	2	6	139210	139215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568106
3086	NC_014216	GCC	2	6	139238	139243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568106
3087	NC_014216	GCG	2	6	139271	139276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568106
3088	NC_014216	G	6	6	139303	139308	0 %	0 %	100 %	0 %	297568106
3089	NC_014216	CAA	2	6	139401	139406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297568106
3090	NC_014216	GCGG	2	8	139422	139429	0 %	0 %	75 %	25 %	297568106
3091	NC_014216	TGAAC	2	10	139471	139480	40 %	20 %	20 %	20 %	297568106
3092	NC_014216	TAT	2	6	139524	139529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297568106
3093	NC_014216	TATT	2	8	139535	139542	25 %	75 %	0 %	0 %	297568106
3094	NC_014216	TCC	2	6	139565	139570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568106
3095	NC_014216	TCCC	2	8	139663	139670	0 %	25 %	0 %	75 %	297568106
3096	NC_014216	ATA	2	6	139717	139722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297568106
3097	NC_014216	TTC	2	6	139825	139830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568106
3098	NC_014216	GGC	2	6	139836	139841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568106
3099	NC_014216	TCA	2	6	139850	139855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568106
3100	NC_014216	A	6	6	139860	139865	100 %	0 %	0 %	0 %	297568106
3101	NC_014216	GCCCC	2	10	139879	139888	0 %	0 %	20 %	80 %	297568106
3102	NC_014216	AGA	2	6	139935	139940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568106
3103	NC_014216	CAG	2	6	139945	139950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568106
3104	NC_014216	GAT	2	6	139981	139986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568106
3105	NC_014216	CCG	2	6	140006	140011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568106
3106	NC_014216	CCG	2	6	140048	140053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568106
3107	NC_014216	CGG	2	6	140061	140066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568106
3108	NC_014216	CCGC	2	8	140161	140168	0 %	0 %	25 %	75 %	297568106
3109	NC_014216	GGCCAG	2	12	140170	140181	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297568106
3110	NC_014216	GAG	2	6	140588	140593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568107
3111	NC_014216	TGG	2	6	140658	140663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568107
3112	NC_014216	TGA	2	6	140678	140683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568107
3113	NC_014216	ATG	2	6	140709	140714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568108
3114	NC_014216	TGG	2	6	140845	140850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568108
3115	NC_014216	GCCG	2	8	140860	140867	0 %	0 %	50 %	50 %	297568108
3116	NC_014216	CCG	2	6	140959	140964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568108
3117	NC_014216	TGG	2	6	140989	140994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568108
3118	NC_014216	ACT	2	6	141025	141030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568108
3119	NC_014216	GAAG	2	8	141032	141039	50 %	0 %	50 %	0 %	297568108
3120	NC_014216	CATC	2	8	141102	141109	25 %	25 %	0 %	50 %	297568109
3121	NC_014216	GCT	3	9	141141	141149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568109
3122	NC_014216	TTC	2	6	141217	141222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568109
3123	NC_014216	TTC	2	6	141240	141245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568110
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3362	NC_014216	CTTTGT	2	12	152038	152049	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	297568116
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3481	NC_014216	GGC	2	6	156235	156240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568118
3482	NC_014216	GGAA	2	8	156262	156269	50 %	0 %	50 %	0 %	297568118
3483	NC_014216	GGC	2	6	156359	156364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568118
3484	NC_014216	TTC	2	6	156573	156578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568119
3485	NC_014216	CTT	2	6	156608	156613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297568119
3486	NC_014216	T	8	8	156612	156619	0 %	100 %	0 %	0 %	297568119
3487	NC_014216	TCG	2	6	156700	156705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568119
3488	NC_014216	C	6	6	156713	156718	0 %	0 %	0 %	100 %	297568119
3489	NC_014216	TGC	2	6	156833	156838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568119
3490	NC_014216	CCG	2	6	156850	156855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568119
3491	NC_014216	TCA	2	6	156884	156889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568119
3492	NC_014216	GCG	2	6	156904	156909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568119
3493	NC_014216	CCA	2	6	156956	156961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568119
3494	NC_014216	CCACCG	2	12	156986	156997	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	297568119
3495	NC_014216	TCC	2	6	157006	157011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568119
3496	NC_014216	GCA	2	6	157019	157024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568119
3497	NC_014216	T	6	6	157050	157055	0 %	100 %	0 %	0 %	297568119
3498	NC_014216	CCT	2	6	157079	157084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568119
3499	NC_014216	C	6	6	157088	157093	0 %	0 %	0 %	100 %	297568119
3500	NC_014216	AGC	2	6	157100	157105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568119

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