MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 chromosome

Total Repeats: 69778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014216	CGG	2	6	224384	224389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568181
5002	NC_014216	TGG	2	6	224400	224405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568181
5003	NC_014216	T	6	6	224438	224443	0 %	100 %	0 %	0 %	297568181
5004	NC_014216	GGC	2	6	224482	224487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568181
5005	NC_014216	TGG	2	6	224499	224504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568181
5006	NC_014216	CGG	2	6	224521	224526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568181
5007	NC_014216	TGC	2	6	224562	224567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568181
5008	NC_014216	T	6	6	224598	224603	0 %	100 %	0 %	0 %	297568181
5009	NC_014216	CGA	2	6	224626	224631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568181
5010	NC_014216	CCG	2	6	224648	224653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568181
5011	NC_014216	GCC	2	6	225015	225020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568182
5012	NC_014216	GCC	2	6	225025	225030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568182
5013	NC_014216	TGC	2	6	225035	225040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568182
5014	NC_014216	TGC	2	6	225074	225079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568182
5015	NC_014216	ACCG	2	8	225082	225089	25 %	0 %	25 %	50 %	297568182
5016	NC_014216	GAT	2	6	225172	225177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568182
5017	NC_014216	GAC	2	6	225178	225183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568182
5018	NC_014216	TGG	2	6	225191	225196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568182
5019	NC_014216	GCC	2	6	225234	225239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568182
5020	NC_014216	GAA	2	6	225250	225255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568182
5021	NC_014216	CAC	2	6	225319	225324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568182
5022	NC_014216	CGG	2	6	225333	225338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568182
5023	NC_014216	GGT	2	6	225345	225350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568182
5024	NC_014216	GCCG	2	8	225362	225369	0 %	0 %	50 %	50 %	297568182
5025	NC_014216	CCT	2	6	225410	225415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568182
5026	NC_014216	GCC	2	6	225418	225423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568182
5027	NC_014216	G	6	6	225458	225463	0 %	0 %	100 %	0 %	297568182
5028	NC_014216	CCG	2	6	225529	225534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568182
5029	NC_014216	AACC	2	8	225540	225547	50 %	0 %	0 %	50 %	297568182
5030	NC_014216	GGC	2	6	225554	225559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568182
5031	NC_014216	TGC	2	6	225590	225595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568182
5032	NC_014216	GGC	2	6	225635	225640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568182
5033	NC_014216	CTG	2	6	225661	225666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568182
5034	NC_014216	CGA	2	6	225723	225728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568182
5035	NC_014216	GGC	2	6	225813	225818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568182
5036	NC_014216	GGC	2	6	225846	225851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568182
5037	NC_014216	GAG	2	6	225922	225927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568182
5038	NC_014216	GCC	2	6	225940	225945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568182
5039	NC_014216	GTG	2	6	226006	226011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568182
5040	NC_014216	CGC	2	6	226053	226058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568182
5041	NC_014216	CTG	2	6	226078	226083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568182
5042	NC_014216	GGA	2	6	226098	226103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568182
5043	NC_014216	TGG	2	6	226211	226216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568182
5044	NC_014216	CCG	2	6	226241	226246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568182
5045	NC_014216	GCC	2	6	226277	226282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568182
5046	NC_014216	ATG	2	6	226300	226305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568182
5047	NC_014216	CGGC	2	8	226312	226319	0 %	0 %	50 %	50 %	297568182
5048	NC_014216	CAT	2	6	226332	226337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568182
5049	NC_014216	CCA	2	6	226340	226345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568182
5050	NC_014216	CGG	2	6	226409	226414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568182
5051	NC_014216	CACC	2	8	226440	226447	25 %	0 %	0 %	75 %	297568182
5052	NC_014216	GAA	2	6	226462	226467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568182
5053	NC_014216	ATC	2	6	226483	226488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568182
5054	NC_014216	GCC	2	6	226495	226500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568182
5055	NC_014216	CGG	3	9	226539	226547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568182
5056	NC_014216	CTG	2	6	226582	226587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568182
5057	NC_014216	AAGGTC	2	12	226621	226632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297568182
5058	NC_014216	GCG	2	6	226651	226656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568182
5059	NC_014216	CCG	2	6	226706	226711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568182
5060	NC_014216	GGC	2	6	226773	226778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568182
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5062	NC_014216	TGG	2	6	226847	226852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568182
5063	NC_014216	ATGA	2	8	227129	227136	50 %	25 %	25 %	0 %	297568183
5064	NC_014216	TCG	2	6	227172	227177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568183
5065	NC_014216	GCCGG	2	10	227180	227189	0 %	0 %	60 %	40 %	297568183
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5071	NC_014216	GCT	2	6	227464	227469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568183
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5078	NC_014216	TGG	2	6	227643	227648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568183
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5086	NC_014216	GAT	2	6	228103	228108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568183
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5088	NC_014216	GCC	2	6	228191	228196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568183
5089	NC_014216	GCC	3	9	228254	228262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568183
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5091	NC_014216	GGC	3	9	228298	228306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568183
5092	NC_014216	GCGG	2	8	228325	228332	0 %	0 %	75 %	25 %	297568183
5093	NC_014216	GTG	2	6	228335	228340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568183
5094	NC_014216	GGC	3	9	228349	228357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568183
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5101	NC_014216	TGA	2	6	228580	228585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568183
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5103	NC_014216	A	6	6	228660	228665	100 %	0 %	0 %	0 %	297568183
5104	NC_014216	CGGC	2	8	228680	228687	0 %	0 %	50 %	50 %	297568183
5105	NC_014216	CTGC	2	8	228700	228707	0 %	25 %	25 %	50 %	297568183
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5108	NC_014216	GGC	2	6	228852	228857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568184
5109	NC_014216	GGCC	2	8	228862	228869	0 %	0 %	50 %	50 %	297568184
5110	NC_014216	GGA	2	6	228901	228906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568184
5111	NC_014216	ATCC	2	8	228907	228914	25 %	25 %	0 %	50 %	297568184
5112	NC_014216	CTG	2	6	228917	228922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568184
5113	NC_014216	GCCG	2	8	228923	228930	0 %	0 %	50 %	50 %	297568184
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5116	NC_014216	TGA	2	6	229092	229097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568184
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5118	NC_014216	CAC	2	6	229114	229119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568184
5119	NC_014216	ACC	2	6	229124	229129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568184
5120	NC_014216	AAGATC	2	12	229154	229165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	297568184
5121	NC_014216	GAT	2	6	229183	229188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568184
5122	NC_014216	CGG	2	6	229195	229200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568184
5123	NC_014216	GCT	2	6	229252	229257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568184
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5134	NC_014216	AGGC	2	8	229553	229560	25 %	0 %	50 %	25 %	297568184
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5232	NC_014216	CAGGGC	2	12	233638	233649	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297568188
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5237	NC_014216	GGGCC	2	10	233838	233847	0 %	0 %	60 %	40 %	297568188
5238	NC_014216	TAT	2	6	233865	233870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297568188
5239	NC_014216	C	6	6	233872	233877	0 %	0 %	0 %	100 %	297568188
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5241	NC_014216	T	6	6	234037	234042	0 %	100 %	0 %	0 %	297568189
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5363	NC_014216	CCGGCC	2	12	240000	240011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568197
5364	NC_014216	GGC	2	6	240029	240034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568197
5365	NC_014216	TGG	2	6	240136	240141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568197
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5371	NC_014216	G	6	6	240328	240333	0 %	0 %	100 %	0 %	297568197
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5390	NC_014216	CTG	2	6	241170	241175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568197
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5427	NC_014216	A	6	6	242691	242696	100 %	0 %	0 %	0 %	297568199
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5463	NC_014216	GTG	3	9	244198	244206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568201
5464	NC_014216	CT	3	6	244224	244229	0 %	50 %	0 %	50 %	297568201
5465	NC_014216	CGG	3	9	244235	244243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568201
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5467	NC_014216	TGG	2	6	244331	244336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568201
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5472	NC_014216	TGC	2	6	244412	244417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568201
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5480	NC_014216	TGG	2	6	244664	244669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568201
5481	NC_014216	CTG	2	6	244723	244728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568201
5482	NC_014216	AGG	2	6	244769	244774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568201
5483	NC_014216	GGC	2	6	244779	244784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568201
5484	NC_014216	GTG	2	6	244795	244800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568201
5485	NC_014216	GCG	2	6	244808	244813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568201
5486	NC_014216	GCT	2	6	244818	244823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568201
5487	NC_014216	CGG	2	6	244824	244829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568201
5488	NC_014216	GCC	2	6	244853	244858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568201
5489	NC_014216	TGC	2	6	244943	244948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568201
5490	NC_014216	GAG	2	6	244963	244968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568201
5491	NC_014216	AGC	2	6	245021	245026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568201
5492	NC_014216	GCC	2	6	245027	245032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568201
5493	NC_014216	CGC	2	6	245070	245075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568201
5494	NC_014216	CTG	2	6	245076	245081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568201
5495	NC_014216	GAACTG	2	12	245083	245094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297568201
5496	NC_014216	CGG	3	9	245115	245123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568201
5497	NC_014216	GCGG	2	8	245208	245215	0 %	0 %	75 %	25 %	297568201
5498	NC_014216	GCCGGT	2	12	245217	245228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297568201
5499	NC_014216	GAT	2	6	245245	245250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568201
5500	NC_014216	CTG	2	6	245254	245259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568201

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