MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 22210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013890	TGA	2	6	247047	247052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432216
4002	NC_013890	A	6	6	247077	247082	100 %	0 %	0 %	0 %	289432216
4003	NC_013890	C	6	6	247085	247090	0 %	0 %	0 %	100 %	289432216
4004	NC_013890	TCCT	2	8	247130	247137	0 %	50 %	0 %	50 %	289432216
4005	NC_013890	TAA	2	6	247193	247198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432216
4006	NC_013890	GGT	2	6	247218	247223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432216
4007	NC_013890	ACCTCC	2	12	247318	247329	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	289432216
4008	NC_013890	TGG	2	6	247442	247447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432216
4009	NC_013890	GGC	3	9	247606	247614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432216
4010	NC_013890	TAT	2	6	247623	247628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432216
4011	NC_013890	ACC	2	6	247718	247723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432216
4012	NC_013890	ATT	2	6	247838	247843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432216
4013	NC_013890	CGC	2	6	247873	247878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432216
4014	NC_013890	ACT	2	6	247900	247905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432216
4015	NC_013890	TGA	2	6	247955	247960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432216
4016	NC_013890	GCC	2	6	247966	247971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432216
4017	NC_013890	GAG	2	6	247972	247977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289432216
4018	NC_013890	GCC	2	6	247978	247983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432216
4019	NC_013890	CGG	2	6	248118	248123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432216
4020	NC_013890	AGA	2	6	248175	248180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432216
4021	NC_013890	CGG	2	6	248240	248245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432216
4022	NC_013890	T	6	6	248312	248317	0 %	100 %	0 %	0 %	289432216
4023	NC_013890	CAT	2	6	248330	248335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432216
4024	NC_013890	TTA	2	6	248394	248399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432216
4025	NC_013890	GGC	2	6	248424	248429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432216
4026	NC_013890	CGC	2	6	248506	248511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432216
4027	NC_013890	ATGAA	2	10	248546	248555	60 %	20 %	20 %	0 %	289432216
4028	NC_013890	GAA	2	6	248715	248720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432216
4029	NC_013890	AG	3	6	248847	248852	50 %	0 %	50 %	0 %	289432217
4030	NC_013890	CTA	2	6	248871	248876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432217
4031	NC_013890	CAG	2	6	248919	248924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432217
4032	NC_013890	TGCCGC	2	12	248956	248967	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289432217
4033	NC_013890	ATC	2	6	249020	249025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432217
4034	NC_013890	GCC	2	6	249034	249039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432217
4035	NC_013890	GA	3	6	249260	249265	50 %	0 %	50 %	0 %	289432217
4036	NC_013890	ATC	2	6	249301	249306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432217
4037	NC_013890	CAT	2	6	249340	249345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432217
4038	NC_013890	TCT	3	9	249398	249406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432217
4039	NC_013890	GGC	2	6	249424	249429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432217
4040	NC_013890	GGT	2	6	249463	249468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432217
4041	NC_013890	GGC	2	6	249565	249570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432217
4042	NC_013890	CCT	2	6	249699	249704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289432217
4043	NC_013890	A	6	6	249748	249753	100 %	0 %	0 %	0 %	289432217
4044	NC_013890	GCA	2	6	249774	249779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432217
4045	NC_013890	TGG	3	9	249810	249818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432217
4046	NC_013890	TTG	2	6	249932	249937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289432217
4047	NC_013890	GCTG	2	8	249963	249970	0 %	25 %	50 %	25 %	289432217
4048	NC_013890	TAAA	2	8	250047	250054	75 %	25 %	0 %	0 %	289432217
4049	NC_013890	CAG	2	6	250066	250071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432217
4050	NC_013890	GTTT	2	8	250378	250385	0 %	75 %	25 %	0 %	289432218
4051	NC_013890	A	8	8	250413	250420	100 %	0 %	0 %	0 %	289432218
4052	NC_013890	AAAT	2	8	250429	250436	75 %	25 %	0 %	0 %	289432218
4053	NC_013890	TATC	2	8	250505	250512	25 %	50 %	0 %	25 %	289432218
4054	NC_013890	CGG	2	6	250517	250522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432218
4055	NC_013890	GGC	2	6	250525	250530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432218
4056	NC_013890	AGA	2	6	250579	250584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432218
4057	NC_013890	AG	3	6	250662	250667	50 %	0 %	50 %	0 %	289432218
4058	NC_013890	GGA	2	6	250713	250718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289432218
4059	NC_013890	TTAT	2	8	250741	250748	25 %	75 %	0 %	0 %	289432218
4060	NC_013890	A	6	6	250755	250760	100 %	0 %	0 %	0 %	289432218
4061	NC_013890	GGC	2	6	250838	250843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432218
4062	NC_013890	GTTA	2	8	250864	250871	25 %	50 %	25 %	0 %	289432218
4063	NC_013890	GT	3	6	250909	250914	0 %	50 %	50 %	0 %	289432219
4064	NC_013890	CTG	2	6	250919	250924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432219
4065	NC_013890	TTC	2	6	251081	251086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432219
4066	NC_013890	GCGGG	2	10	251199	251208	0 %	0 %	80 %	20 %	289432219
4067	NC_013890	G	6	6	251206	251211	0 %	0 %	100 %	0 %	289432219
4068	NC_013890	CAT	2	6	251281	251286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432219
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4070	NC_013890	TGG	2	6	251335	251340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432219
4071	NC_013890	TGA	2	6	251371	251376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432219
4072	NC_013890	TGGT	2	8	251442	251449	0 %	50 %	50 %	0 %	289432219
4073	NC_013890	T	6	6	251512	251517	0 %	100 %	0 %	0 %	289432219
4074	NC_013890	T	6	6	251544	251549	0 %	100 %	0 %	0 %	289432219
4075	NC_013890	CAT	2	6	251551	251556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432219
4076	NC_013890	TGT	2	6	251595	251600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289432219
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4081	NC_013890	T	6	6	251976	251981	0 %	100 %	0 %	0 %	289432219
4082	NC_013890	CTGG	2	8	251996	252003	0 %	25 %	50 %	25 %	289432219
4083	NC_013890	CTG	2	6	252062	252067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432219
4084	NC_013890	GCG	2	6	252068	252073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432219
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4087	NC_013890	AGTATA	2	12	252303	252314	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289432219
4088	NC_013890	CAGC	2	8	252356	252363	25 %	0 %	25 %	50 %	289432219
4089	NC_013890	CGG	2	6	252397	252402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432219
4090	NC_013890	GCC	2	6	252455	252460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432219
4091	NC_013890	GTTC	2	8	252493	252500	0 %	50 %	25 %	25 %	289432219
4092	NC_013890	TCT	2	6	252531	252536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432219
4093	NC_013890	GCA	2	6	252550	252555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432219
4094	NC_013890	GTT	2	6	252619	252624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289432219
4095	NC_013890	CGG	2	6	252672	252677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432219
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4099	NC_013890	TTA	2	6	253127	253132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432220
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4101	NC_013890	CAGT	2	8	253160	253167	25 %	25 %	25 %	25 %	289432220
4102	NC_013890	CAG	2	6	253187	253192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432220
4103	NC_013890	GGTT	2	8	253193	253200	0 %	50 %	50 %	0 %	289432220
4104	NC_013890	GTTC	2	8	253229	253236	0 %	50 %	25 %	25 %	289432220
4105	NC_013890	GTCAG	2	10	253255	253264	20 %	20 %	40 %	20 %	289432220
4106	NC_013890	CAG	2	6	253282	253287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432220
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4108	NC_013890	ATCA	2	8	253476	253483	50 %	25 %	0 %	25 %	289432220
4109	NC_013890	TTTCCA	2	12	253490	253501	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	289432220
4110	NC_013890	ATG	2	6	253525	253530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432220
4111	NC_013890	TGC	2	6	253556	253561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432220
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4117	NC_013890	CCG	2	6	254124	254129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432221
4118	NC_013890	TCC	2	6	254280	254285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289432221
4119	NC_013890	AAT	2	6	254522	254527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432221
4120	NC_013890	AG	3	6	254551	254556	50 %	0 %	50 %	0 %	289432221
4121	NC_013890	ACC	2	6	254565	254570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432221
4122	NC_013890	TGA	2	6	254596	254601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432221
4123	NC_013890	GAA	2	6	254616	254621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432221
4124	NC_013890	TCCG	2	8	254639	254646	0 %	25 %	25 %	50 %	289432221
4125	NC_013890	AAG	2	6	254653	254658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432221
4126	NC_013890	T	6	6	254746	254751	0 %	100 %	0 %	0 %	289432221
4127	NC_013890	TTGG	2	8	254837	254844	0 %	50 %	50 %	0 %	289432221
4128	NC_013890	AAAG	2	8	254897	254904	75 %	0 %	25 %	0 %	289432221
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4131	NC_013890	CGG	2	6	255081	255086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432221
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4136	NC_013890	CTG	2	6	255407	255412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432222
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4140	NC_013890	A	6	6	255644	255649	100 %	0 %	0 %	0 %	289432222
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4241	NC_013890	CTGGT	2	10	262135	262144	0 %	40 %	40 %	20 %	289432230
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4245	NC_013890	ATC	2	6	262360	262365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432230
4246	NC_013890	GCTT	2	8	262383	262390	0 %	50 %	25 %	25 %	289432230
4247	NC_013890	AT	4	8	262444	262451	50 %	50 %	0 %	0 %	289432231
4248	NC_013890	GGGT	2	8	262564	262571	0 %	25 %	75 %	0 %	289432231
4249	NC_013890	TA	3	6	262605	262610	50 %	50 %	0 %	0 %	289432231
4250	NC_013890	GGC	2	6	262641	262646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432231
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4253	NC_013890	TGCCT	2	10	262790	262799	0 %	40 %	20 %	40 %	289432231
4254	NC_013890	GGT	2	6	262886	262891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432231
4255	NC_013890	ATGGCA	2	12	262909	262920	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289432231
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4258	NC_013890	TCA	2	6	262976	262981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432231
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4270	NC_013890	TGA	3	9	263789	263797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432232
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4392	NC_013890	GCG	2	6	271191	271196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432237
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4487	NC_013890	CGGTAC	2	12	276008	276019	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289432243
4488	NC_013890	GAA	2	6	276042	276047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432243
4489	NC_013890	GCG	2	6	276058	276063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432243
4490	NC_013890	AAG	2	6	276130	276135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432243
4491	NC_013890	CTG	2	6	276147	276152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432243
4492	NC_013890	ATC	2	6	276174	276179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432243
4493	NC_013890	CTG	2	6	276192	276197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432243
4494	NC_013890	TG	3	6	276202	276207	0 %	50 %	50 %	0 %	289432243
4495	NC_013890	CCGGC	2	10	276349	276358	0 %	0 %	40 %	60 %	289432243
4496	NC_013890	TGC	2	6	276404	276409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432243
4497	NC_013890	CTG	2	6	276432	276437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432243
4498	NC_013890	GGC	2	6	276483	276488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432243
4499	NC_013890	CCTGA	2	10	276489	276498	20 %	20 %	20 %	40 %	289432243
4500	NC_013890	AGC	2	6	276518	276523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432243

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