MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013223	GCT	2	6	234843	234848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404322
3502	NC_013223	ATGAA	2	10	234859	234868	60 %	20 %	20 %	0 %	258404322
3503	NC_013223	CCCG	2	8	234923	234930	0 %	0 %	25 %	75 %	258404322
3504	NC_013223	T	6	6	234998	235003	0 %	100 %	0 %	0 %	258404322
3505	NC_013223	CG	3	6	235010	235015	0 %	0 %	50 %	50 %	258404322
3506	NC_013223	CGT	2	6	235055	235060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404322
3507	NC_013223	G	6	6	235120	235125	0 %	0 %	100 %	0 %	258404322
3508	NC_013223	GTG	2	6	235139	235144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404322
3509	NC_013223	GCCA	2	8	235209	235216	25 %	0 %	25 %	50 %	258404322
3510	NC_013223	AGC	2	6	235240	235245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404322
3511	NC_013223	TGA	2	6	235250	235255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404322
3512	NC_013223	CGT	2	6	235274	235279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404322
3513	NC_013223	ACC	2	6	235338	235343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404322
3514	NC_013223	CGGC	2	8	235426	235433	0 %	0 %	50 %	50 %	258404322
3515	NC_013223	GAT	2	6	235489	235494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404322
3516	NC_013223	TCG	2	6	235521	235526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404323
3517	NC_013223	GAA	2	6	235606	235611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404323
3518	NC_013223	GAA	2	6	235640	235645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404323
3519	NC_013223	TC	3	6	235930	235935	0 %	50 %	0 %	50 %	258404323
3520	NC_013223	CCG	2	6	235979	235984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404323
3521	NC_013223	GGA	2	6	235993	235998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404323
3522	NC_013223	CGT	2	6	236112	236117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404323
3523	NC_013223	TGC	2	6	236118	236123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404323
3524	NC_013223	GCT	2	6	236129	236134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404323
3525	NC_013223	CTG	2	6	236138	236143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404323
3526	NC_013223	CCGA	2	8	236306	236313	25 %	0 %	25 %	50 %	258404323
3527	NC_013223	TAT	2	6	236341	236346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404323
3528	NC_013223	CG	3	6	236349	236354	0 %	0 %	50 %	50 %	258404323
3529	NC_013223	GGC	2	6	236422	236427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404323
3530	NC_013223	A	6	6	236469	236474	100 %	0 %	0 %	0 %	258404323
3531	NC_013223	G	6	6	236483	236488	0 %	0 %	100 %	0 %	258404323
3532	NC_013223	CTG	2	6	236489	236494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404323
3533	NC_013223	CTG	2	6	236510	236515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404323
3534	NC_013223	CG	3	6	236549	236554	0 %	0 %	50 %	50 %	258404323
3535	NC_013223	CA	3	6	236568	236573	50 %	0 %	0 %	50 %	258404323
3536	NC_013223	C	6	6	236618	236623	0 %	0 %	0 %	100 %	258404323
3537	NC_013223	CTC	2	6	236716	236721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404324
3538	NC_013223	ACG	2	6	236803	236808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404324
3539	NC_013223	GGC	2	6	236919	236924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404324
3540	NC_013223	ACC	2	6	236942	236947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404324
3541	NC_013223	GCA	2	6	236964	236969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404324
3542	NC_013223	GCA	2	6	236978	236983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404324
3543	NC_013223	CGGG	2	8	237021	237028	0 %	0 %	75 %	25 %	258404324
3544	NC_013223	GAC	2	6	237106	237111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404324
3545	NC_013223	CCT	2	6	237142	237147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404324
3546	NC_013223	GTG	2	6	237183	237188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404324
3547	NC_013223	CT	3	6	237236	237241	0 %	50 %	0 %	50 %	258404324
3548	NC_013223	TCTGG	2	10	237417	237426	0 %	40 %	40 %	20 %	258404324
3549	NC_013223	CGGA	2	8	237434	237441	25 %	0 %	50 %	25 %	258404324
3550	NC_013223	GGT	2	6	237444	237449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404324
3551	NC_013223	CGAGGC	2	12	237525	237536	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258404324
3552	NC_013223	TGG	2	6	237551	237556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404324
3553	NC_013223	GGC	2	6	237600	237605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404324
3554	NC_013223	GCGGA	2	10	237799	237808	20 %	0 %	60 %	20 %	258404324
3555	NC_013223	GGC	2	6	237870	237875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404324
3556	NC_013223	CCAAAG	2	12	237959	237970	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258404324
3557	NC_013223	AAG	3	9	237968	237976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404324
3558	NC_013223	CTTG	2	8	238050	238057	0 %	50 %	25 %	25 %	258404324
3559	NC_013223	A	6	6	238076	238081	100 %	0 %	0 %	0 %	258404324
3560	NC_013223	CTG	2	6	238141	238146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404324
3561	NC_013223	GGC	2	6	238190	238195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404324
3562	NC_013223	AG	3	6	238207	238212	50 %	0 %	50 %	0 %	258404324
3563	NC_013223	AGG	2	6	238238	238243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404324
3564	NC_013223	CGC	2	6	238263	238268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404324
3565	NC_013223	TGCGGC	2	12	238340	238351	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258404324
3566	NC_013223	CCG	2	6	238424	238429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404324
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3568	NC_013223	TCC	2	6	238525	238530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404324
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3570	NC_013223	G	7	7	238596	238602	0 %	0 %	100 %	0 %	258404324
3571	NC_013223	GTC	2	6	238619	238624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404324
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3573	NC_013223	CTG	2	6	238676	238681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404324
3574	NC_013223	GCCA	2	8	238683	238690	25 %	0 %	25 %	50 %	258404324
3575	NC_013223	CGT	2	6	238692	238697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404324
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3579	NC_013223	TGG	2	6	238973	238978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404324
3580	NC_013223	GGC	2	6	239420	239425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404325
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3582	NC_013223	CG	3	6	239455	239460	0 %	0 %	50 %	50 %	258404325
3583	NC_013223	TCC	2	6	239478	239483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404325
3584	NC_013223	GCC	2	6	239552	239557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404325
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3586	NC_013223	GGC	2	6	239687	239692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404325
3587	NC_013223	CTG	2	6	239721	239726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404325
3588	NC_013223	G	7	7	239759	239765	0 %	0 %	100 %	0 %	258404325
3589	NC_013223	AC	4	8	239777	239784	50 %	0 %	0 %	50 %	258404325
3590	NC_013223	GGA	2	6	239891	239896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404325
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3592	NC_013223	CCT	2	6	239934	239939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404325
3593	NC_013223	GGT	2	6	239962	239967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404325
3594	NC_013223	GTC	2	6	239973	239978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404325
3595	NC_013223	GCC	2	6	240014	240019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404325
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3598	NC_013223	CGA	2	6	240220	240225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404325
3599	NC_013223	A	6	6	240271	240276	100 %	0 %	0 %	0 %	258404325
3600	NC_013223	GCG	2	6	240388	240393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404325
3601	NC_013223	CCG	2	6	240468	240473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404325
3602	NC_013223	AAG	2	6	240489	240494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404325
3603	NC_013223	CGG	2	6	240574	240579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404325
3604	NC_013223	AGC	2	6	240625	240630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404325
3605	NC_013223	TTGAG	2	10	240874	240883	20 %	40 %	40 %	0 %	258404326
3606	NC_013223	TAA	2	6	240907	240912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404326
3607	NC_013223	CCCA	2	8	241105	241112	25 %	0 %	0 %	75 %	258404327
3608	NC_013223	GCA	2	6	241157	241162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404327
3609	NC_013223	TGGT	2	8	241180	241187	0 %	50 %	50 %	0 %	258404327
3610	NC_013223	CTG	2	6	241284	241289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404327
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3612	NC_013223	CCTT	2	8	241315	241322	0 %	50 %	0 %	50 %	258404327
3613	NC_013223	ATG	2	6	241348	241353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404327
3614	NC_013223	CGG	2	6	241402	241407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404327
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3617	NC_013223	CCAG	2	8	241535	241542	25 %	0 %	25 %	50 %	258404327
3618	NC_013223	GGA	2	6	241640	241645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404327
3619	NC_013223	AT	3	6	241979	241984	50 %	50 %	0 %	0 %	258404328
3620	NC_013223	A	7	7	242005	242011	100 %	0 %	0 %	0 %	258404328
3621	NC_013223	CTG	2	6	242099	242104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404328
3622	NC_013223	AGC	2	6	242115	242120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404328
3623	NC_013223	TGG	2	6	242131	242136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404328
3624	NC_013223	TA	3	6	242143	242148	50 %	50 %	0 %	0 %	258404328
3625	NC_013223	GCG	2	6	242149	242154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404328
3626	NC_013223	ATG	2	6	242214	242219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404328
3627	NC_013223	T	6	6	242283	242288	0 %	100 %	0 %	0 %	258404328
3628	NC_013223	GCA	2	6	242369	242374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404328
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3630	NC_013223	ATT	2	6	242520	242525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404328
3631	NC_013223	GAG	2	6	242592	242597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404328
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3633	NC_013223	TGC	2	6	242740	242745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404328
3634	NC_013223	AGCG	2	8	242764	242771	25 %	0 %	50 %	25 %	258404328
3635	NC_013223	GAC	2	6	242792	242797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404328
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3639	NC_013223	A	6	6	243185	243190	100 %	0 %	0 %	0 %	258404329
3640	NC_013223	GGCCTC	2	12	243230	243241	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258404329
3641	NC_013223	TG	3	6	243292	243297	0 %	50 %	50 %	0 %	258404329
3642	NC_013223	GCA	2	6	243376	243381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404329
3643	NC_013223	TCTCC	2	10	243409	243418	0 %	40 %	0 %	60 %	258404329
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3652	NC_013223	GTC	2	6	243983	243988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404330
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3654	NC_013223	CTG	2	6	244076	244081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404330
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3662	NC_013223	GC	3	6	244429	244434	0 %	0 %	50 %	50 %	258404331
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3679	NC_013223	GCG	2	6	245506	245511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404332
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3732	NC_013223	GGC	2	6	248509	248514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404334
3733	NC_013223	CCA	3	9	248640	248648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404334
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3740	NC_013223	TTG	2	6	249087	249092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404335
3741	NC_013223	CCATGG	2	12	249145	249156	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404335
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3743	NC_013223	AGG	2	6	249229	249234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404335
3744	NC_013223	GCA	2	6	249239	249244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404335
3745	NC_013223	GTC	2	6	249323	249328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404335
3746	NC_013223	ATG	2	6	249357	249362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404335
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3748	NC_013223	GCGG	2	8	249542	249549	0 %	0 %	75 %	25 %	258404335
3749	NC_013223	GCA	2	6	249686	249691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404335
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3766	NC_013223	GCC	2	6	251201	251206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404337
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3773	NC_013223	GATA	2	8	251517	251524	50 %	25 %	25 %	0 %	258404337
3774	NC_013223	GTT	2	6	251542	251547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404337
3775	NC_013223	TCG	2	6	251570	251575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404337
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3840	NC_013223	GGATT	2	10	255670	255679	20 %	40 %	40 %	0 %	258404340
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3852	NC_013223	GC	3	6	256681	256686	0 %	0 %	50 %	50 %	258404342
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3859	NC_013223	CTGGTG	2	12	256900	256911	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258404342
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3862	NC_013223	CCG	2	6	256996	257001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404342
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3980	NC_013223	G	7	7	263454	263460	0 %	0 %	100 %	0 %	258404345
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3984	NC_013223	AGG	2	6	263539	263544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404345
3985	NC_013223	A	7	7	263654	263660	100 %	0 %	0 %	0 %	258404345
3986	NC_013223	GAG	2	6	264019	264024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404346
3987	NC_013223	ACC	2	6	264041	264046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404346
3988	NC_013223	GCA	2	6	264147	264152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404346
3989	NC_013223	CA	3	6	264156	264161	50 %	0 %	0 %	50 %	258404346
3990	NC_013223	TGT	2	6	264171	264176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404346
3991	NC_013223	GTCCAG	2	12	264205	264216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404346
3992	NC_013223	GAG	2	6	264284	264289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404346
3993	NC_013223	ACA	2	6	264290	264295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404346
3994	NC_013223	CTG	2	6	264304	264309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404346
3995	NC_013223	CGG	2	6	264342	264347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404346
3996	NC_013223	TCG	2	6	264470	264475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404346
3997	NC_013223	CCAG	2	8	264509	264516	25 %	0 %	25 %	50 %	258404346
3998	NC_013223	TTC	2	6	264520	264525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404346
3999	NC_013223	GAGG	2	8	264532	264539	25 %	0 %	75 %	0 %	258404346
4000	NC_013223	AGC	2	6	264611	264616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404346

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