MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013223	GTT	2	6	136216	136221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404238
2002	NC_013223	GGC	2	6	136289	136294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404239
2003	NC_013223	GCTG	2	8	136319	136326	0 %	25 %	50 %	25 %	258404239
2004	NC_013223	TCGATG	2	12	136378	136389	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258404239
2005	NC_013223	CGC	2	6	136400	136405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404239
2006	NC_013223	T	7	7	136482	136488	0 %	100 %	0 %	0 %	258404239
2007	NC_013223	GCG	2	6	136495	136500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404239
2008	NC_013223	GCTC	2	8	136523	136530	0 %	25 %	25 %	50 %	258404239
2009	NC_013223	CTG	2	6	136656	136661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404239
2010	NC_013223	GAC	2	6	136716	136721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404239
2011	NC_013223	TCTTT	2	10	136784	136793	0 %	80 %	0 %	20 %	258404239
2012	NC_013223	GCC	2	6	136800	136805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404239
2013	NC_013223	TTG	2	6	136825	136830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404239
2014	NC_013223	TCAGT	2	10	136868	136877	20 %	40 %	20 %	20 %	258404239
2015	NC_013223	ATG	2	6	136939	136944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404239
2016	NC_013223	CGT	3	9	136946	136954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404239
2017	NC_013223	CGC	2	6	136982	136987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404239
2018	NC_013223	CT	3	6	137238	137243	0 %	50 %	0 %	50 %	258404240
2019	NC_013223	GAC	2	6	137259	137264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404240
2020	NC_013223	GCC	2	6	137265	137270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404240
2021	NC_013223	GAT	2	6	137289	137294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404240
2022	NC_013223	CAG	2	6	137298	137303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404240
2023	NC_013223	CCA	2	6	137319	137324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404240
2024	NC_013223	ACC	2	6	137347	137352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404240
2025	NC_013223	GCGG	2	8	137379	137386	0 %	0 %	75 %	25 %	258404240
2026	NC_013223	AGGT	2	8	137428	137435	25 %	25 %	50 %	0 %	258404240
2027	NC_013223	GCCA	2	8	137461	137468	25 %	0 %	25 %	50 %	258404240
2028	NC_013223	AGAA	2	8	137509	137516	75 %	0 %	25 %	0 %	258404240
2029	NC_013223	GGGCA	2	10	137526	137535	20 %	0 %	60 %	20 %	258404240
2030	NC_013223	AGA	2	6	137537	137542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404240
2031	NC_013223	TCCAG	2	10	137639	137648	20 %	20 %	20 %	40 %	258404240
2032	NC_013223	GCC	2	6	137686	137691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404240
2033	NC_013223	CAG	2	6	137751	137756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404240
2034	NC_013223	AGC	2	6	137764	137769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404240
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2036	NC_013223	CGG	2	6	137810	137815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404240
2037	NC_013223	A	7	7	137851	137857	100 %	0 %	0 %	0 %	258404240
2038	NC_013223	CTGA	2	8	137860	137867	25 %	25 %	25 %	25 %	258404240
2039	NC_013223	A	8	8	137867	137874	100 %	0 %	0 %	0 %	258404240
2040	NC_013223	GTGG	2	8	137937	137944	0 %	25 %	75 %	0 %	258404240
2041	NC_013223	GCC	2	6	137965	137970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404240
2042	NC_013223	GCG	3	9	138049	138057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404240
2043	NC_013223	CAG	2	6	138248	138253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404241
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2047	NC_013223	GCT	2	6	138392	138397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404241
2048	NC_013223	GCGTTG	2	12	138984	138995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258404242
2049	NC_013223	TCG	2	6	139038	139043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404242
2050	NC_013223	ATG	2	6	139068	139073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404242
2051	NC_013223	TCA	2	6	139146	139151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404242
2052	NC_013223	CAC	2	6	139224	139229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404242
2053	NC_013223	GAA	2	6	139305	139310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404242
2054	NC_013223	TCG	2	6	139353	139358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404242
2055	NC_013223	CCAC	2	8	139383	139390	25 %	0 %	0 %	75 %	258404242
2056	NC_013223	TC	3	6	139456	139461	0 %	50 %	0 %	50 %	258404242
2057	NC_013223	ACC	2	6	139487	139492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404242
2058	NC_013223	ATCCA	2	10	139599	139608	40 %	20 %	0 %	40 %	258404242
2059	NC_013223	TGTAA	2	10	139615	139624	40 %	40 %	20 %	0 %	258404242
2060	NC_013223	GTT	2	6	139686	139691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404242
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2062	NC_013223	GCT	2	6	139741	139746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404242
2063	NC_013223	AG	3	6	139782	139787	50 %	0 %	50 %	0 %	258404242
2064	NC_013223	GTC	2	6	139874	139879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404242
2065	NC_013223	GCCGAG	2	12	139916	139927	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258404242
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2084	NC_013223	GGGC	2	8	141889	141896	0 %	0 %	75 %	25 %	258404244
2085	NC_013223	GATT	2	8	141963	141970	25 %	50 %	25 %	0 %	258404244
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2106	NC_013223	GAC	2	6	143661	143666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404246
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2108	NC_013223	CGA	2	6	143868	143873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404246
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2115	NC_013223	G	6	6	144157	144162	0 %	0 %	100 %	0 %	258404246
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2119	NC_013223	GA	3	6	144233	144238	50 %	0 %	50 %	0 %	258404246
2120	NC_013223	G	6	6	144262	144267	0 %	0 %	100 %	0 %	258404246
2121	NC_013223	GGT	2	6	144270	144275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404246
2122	NC_013223	GAC	2	6	144280	144285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404246
2123	NC_013223	GAC	2	6	144376	144381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404246
2124	NC_013223	TC	3	6	144477	144482	0 %	50 %	0 %	50 %	258404246
2125	NC_013223	GTT	2	6	144541	144546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404246
2126	NC_013223	TGC	2	6	144554	144559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404246
2127	NC_013223	TTG	2	6	144686	144691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404246
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2131	NC_013223	GGC	2	6	144774	144779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404246
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2157	NC_013223	A	7	7	147011	147017	100 %	0 %	0 %	0 %	258404247
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2235	NC_013223	GGTC	2	8	153403	153410	0 %	25 %	50 %	25 %	258404252
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2241	NC_013223	GGT	2	6	153707	153712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404252
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2243	NC_013223	CTG	2	6	153900	153905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404252
2244	NC_013223	GCG	2	6	153910	153915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404252
2245	NC_013223	ATG	2	6	153967	153972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404253
2246	NC_013223	TGTA	2	8	153977	153984	25 %	50 %	25 %	0 %	258404253
2247	NC_013223	GGT	2	6	154008	154013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404253
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2365	NC_013223	TTG	2	6	160378	160383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404258
2366	NC_013223	CGC	3	9	160612	160620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404259
2367	NC_013223	AGC	2	6	160709	160714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404259
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2369	NC_013223	TGT	2	6	160765	160770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404259
2370	NC_013223	TCTT	2	8	160893	160900	0 %	75 %	0 %	25 %	258404259
2371	NC_013223	GCT	2	6	160990	160995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404259
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2374	NC_013223	GC	3	6	161089	161094	0 %	0 %	50 %	50 %	258404259
2375	NC_013223	GGT	2	6	161098	161103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404259
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2391	NC_013223	ATC	2	6	161973	161978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404260
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2478	NC_013223	TGGAT	2	10	168448	168457	20 %	40 %	40 %	0 %	258404266
2479	NC_013223	CGT	2	6	168469	168474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404266
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2484	NC_013223	TGG	2	6	168796	168801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404266
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2491	NC_013223	AAG	2	6	169488	169493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404267
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