MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_013223	CTG	2	6	1364146	1364151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405283
21002	NC_013223	TGCC	2	8	1364171	1364178	0 %	25 %	25 %	50 %	258405283
21003	NC_013223	ACC	2	6	1364188	1364193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405283
21004	NC_013223	GCC	2	6	1364234	1364239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405283
21005	NC_013223	TTG	2	6	1364251	1364256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405283
21006	NC_013223	TGA	3	9	1364303	1364311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405283
21007	NC_013223	GTTG	2	8	1364319	1364326	0 %	50 %	50 %	0 %	258405283
21008	NC_013223	ATA	2	6	1364352	1364357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405283
21009	NC_013223	A	6	6	1364357	1364362	100 %	0 %	0 %	0 %	258405283
21010	NC_013223	A	6	6	1364411	1364416	100 %	0 %	0 %	0 %	258405283
21011	NC_013223	CCG	2	6	1364417	1364422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405283
21012	NC_013223	CAA	2	6	1364510	1364515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405283
21013	NC_013223	A	6	6	1364541	1364546	100 %	0 %	0 %	0 %	258405283
21014	NC_013223	CTG	2	6	1364592	1364597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405283
21015	NC_013223	T	6	6	1364612	1364617	0 %	100 %	0 %	0 %	258405283
21016	NC_013223	TTGGAG	2	12	1364635	1364646	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258405283
21017	NC_013223	A	6	6	1364945	1364950	100 %	0 %	0 %	0 %	258405284
21018	NC_013223	GAT	2	6	1364956	1364961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405284
21019	NC_013223	CAT	2	6	1364962	1364967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405284
21020	NC_013223	ATG	2	6	1364987	1364992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405284
21021	NC_013223	GA	3	6	1365092	1365097	50 %	0 %	50 %	0 %	258405284
21022	NC_013223	GAA	2	6	1365130	1365135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405284
21023	NC_013223	CCA	2	6	1365191	1365196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405284
21024	NC_013223	ATG	2	6	1365209	1365214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405284
21025	NC_013223	ACA	2	6	1365221	1365226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405284
21026	NC_013223	AAG	2	6	1365227	1365232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405284
21027	NC_013223	CAGC	2	8	1365357	1365364	25 %	0 %	25 %	50 %	258405284
21028	NC_013223	GGT	2	6	1365373	1365378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405284
21029	NC_013223	CTT	2	6	1365463	1365468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405284
21030	NC_013223	GGGA	2	8	1365515	1365522	25 %	0 %	75 %	0 %	258405284
21031	NC_013223	GAA	2	6	1365541	1365546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405284
21032	NC_013223	G	6	6	1365579	1365584	0 %	0 %	100 %	0 %	258405284
21033	NC_013223	GCG	2	6	1365664	1365669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405284
21034	NC_013223	CAT	2	6	1365732	1365737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405284
21035	NC_013223	T	6	6	1365769	1365774	0 %	100 %	0 %	0 %	258405284
21036	NC_013223	GAC	2	6	1365847	1365852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405284
21037	NC_013223	CAA	2	6	1365934	1365939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405285
21038	NC_013223	TC	3	6	1365958	1365963	0 %	50 %	0 %	50 %	258405285
21039	NC_013223	GAT	2	6	1366175	1366180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405285
21040	NC_013223	CGT	2	6	1366312	1366317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405285
21041	NC_013223	TCCGG	2	10	1366381	1366390	0 %	20 %	40 %	40 %	258405285
21042	NC_013223	CGG	2	6	1366454	1366459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405285
21043	NC_013223	GAAT	2	8	1366543	1366550	50 %	25 %	25 %	0 %	258405285
21044	NC_013223	GGT	2	6	1366571	1366576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405285
21045	NC_013223	ACA	2	6	1366605	1366610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405285
21046	NC_013223	GGGA	2	8	1366748	1366755	25 %	0 %	75 %	0 %	258405285
21047	NC_013223	TCG	2	6	1366812	1366817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405285
21048	NC_013223	GAG	2	6	1366833	1366838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405285
21049	NC_013223	CGT	2	6	1366870	1366875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405285
21050	NC_013223	AT	3	6	1366922	1366927	50 %	50 %	0 %	0 %	258405285
21051	NC_013223	CT	3	6	1367033	1367038	0 %	50 %	0 %	50 %	258405285
21052	NC_013223	CTC	2	6	1367066	1367071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405285
21053	NC_013223	CAA	2	6	1367162	1367167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405285
21054	NC_013223	TTG	2	6	1367313	1367318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405285
21055	NC_013223	TTG	2	6	1367322	1367327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405285
21056	NC_013223	A	6	6	1367460	1367465	100 %	0 %	0 %	0 %	258405286
21057	NC_013223	CTTT	2	8	1367476	1367483	0 %	75 %	0 %	25 %	258405286
21058	NC_013223	AG	3	6	1367517	1367522	50 %	0 %	50 %	0 %	258405286
21059	NC_013223	T	6	6	1367555	1367560	0 %	100 %	0 %	0 %	258405286
21060	NC_013223	T	7	7	1367643	1367649	0 %	100 %	0 %	0 %	258405286
21061	NC_013223	ATA	2	6	1367706	1367711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405286
21062	NC_013223	TTG	2	6	1367766	1367771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405286
21063	NC_013223	CAGG	2	8	1367780	1367787	25 %	0 %	50 %	25 %	258405286
21064	NC_013223	CGGA	2	8	1367986	1367993	25 %	0 %	50 %	25 %	258405286
21065	NC_013223	GTTC	2	8	1368142	1368149	0 %	50 %	25 %	25 %	258405286
21066	NC_013223	CAGC	2	8	1368175	1368182	25 %	0 %	25 %	50 %	258405286
21067	NC_013223	TGC	2	6	1368205	1368210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405286
21068	NC_013223	TGACT	2	10	1368223	1368232	20 %	40 %	20 %	20 %	258405286
21069	NC_013223	GCTTG	2	10	1368265	1368274	0 %	40 %	40 %	20 %	258405286
21070	NC_013223	CT	3	6	1368338	1368343	0 %	50 %	0 %	50 %	258405286
21071	NC_013223	ATC	2	6	1368464	1368469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405286
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21073	NC_013223	ACA	2	6	1368723	1368728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405287
21074	NC_013223	TAAATC	2	12	1368752	1368763	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	258405287
21075	NC_013223	T	6	6	1368928	1368933	0 %	100 %	0 %	0 %	258405287
21076	NC_013223	ATC	2	6	1369007	1369012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405287
21077	NC_013223	CCT	3	9	1369071	1369079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405287
21078	NC_013223	ATT	2	6	1369149	1369154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405287
21079	NC_013223	TCT	2	6	1369188	1369193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405287
21080	NC_013223	CTG	2	6	1369243	1369248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405287
21081	NC_013223	CTG	2	6	1369268	1369273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405287
21082	NC_013223	A	7	7	1369292	1369298	100 %	0 %	0 %	0 %	258405287
21083	NC_013223	A	6	6	1369355	1369360	100 %	0 %	0 %	0 %	258405287
21084	NC_013223	TTG	2	6	1369416	1369421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405287
21085	NC_013223	ATT	2	6	1369430	1369435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405287
21086	NC_013223	GCC	2	6	1369440	1369445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405287
21087	NC_013223	GCA	2	6	1369512	1369517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405287
21088	NC_013223	GT	3	6	1369522	1369527	0 %	50 %	50 %	0 %	258405287
21089	NC_013223	T	6	6	1369539	1369544	0 %	100 %	0 %	0 %	258405287
21090	NC_013223	ATG	2	6	1369620	1369625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405287
21091	NC_013223	CATAAC	2	12	1369679	1369690	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	258405287
21092	NC_013223	AAAG	2	8	1369753	1369760	75 %	0 %	25 %	0 %	258405288
21093	NC_013223	TTG	2	6	1369839	1369844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405288
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21097	NC_013223	AGT	2	6	1369916	1369921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405288
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21099	NC_013223	CAT	2	6	1370080	1370085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405288
21100	NC_013223	TAAAAA	2	12	1370090	1370101	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	258405288
21101	NC_013223	TTG	3	9	1370153	1370161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405289
21102	NC_013223	A	7	7	1370199	1370205	100 %	0 %	0 %	0 %	258405289
21103	NC_013223	AAC	2	6	1370241	1370246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405289
21104	NC_013223	ATTTAT	2	12	1370283	1370294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405289
21105	NC_013223	GTCT	2	8	1370339	1370346	0 %	50 %	25 %	25 %	258405289
21106	NC_013223	CT	3	6	1370415	1370420	0 %	50 %	0 %	50 %	258405289
21107	NC_013223	GCT	2	6	1370527	1370532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405289
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21109	NC_013223	CTT	2	6	1370873	1370878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405290
21110	NC_013223	TGT	2	6	1370968	1370973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405290
21111	NC_013223	TTTGC	2	10	1370993	1371002	0 %	60 %	20 %	20 %	258405290
21112	NC_013223	AGC	2	6	1371019	1371024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405290
21113	NC_013223	GA	3	6	1371026	1371031	50 %	0 %	50 %	0 %	258405290
21114	NC_013223	CAG	2	6	1371041	1371046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405290
21115	NC_013223	TAC	2	6	1371229	1371234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405291
21116	NC_013223	TCT	2	6	1371470	1371475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405291
21117	NC_013223	ACC	2	6	1371614	1371619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405291
21118	NC_013223	AAC	2	6	1371622	1371627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405291
21119	NC_013223	TCA	2	6	1371651	1371656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405291
21120	NC_013223	AAGC	2	8	1371669	1371676	50 %	0 %	25 %	25 %	258405291
21121	NC_013223	CCG	2	6	1371746	1371751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405291
21122	NC_013223	AAG	2	6	1371755	1371760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405291
21123	NC_013223	A	6	6	1371923	1371928	100 %	0 %	0 %	0 %	258405291
21124	NC_013223	TGA	2	6	1371954	1371959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405291
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21131	NC_013223	TCG	2	6	1372470	1372475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405291
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21142	NC_013223	GCA	2	6	1373342	1373347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405292
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21148	NC_013223	AGC	2	6	1374061	1374066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405293
21149	NC_013223	T	6	6	1374114	1374119	0 %	100 %	0 %	0 %	258405293
21150	NC_013223	A	6	6	1374133	1374138	100 %	0 %	0 %	0 %	258405293
21151	NC_013223	GTTTT	2	10	1374303	1374312	0 %	80 %	20 %	0 %	258405293
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21187	NC_013223	ATC	2	6	1377130	1377135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405297
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21213	NC_013223	CTGA	2	8	1378995	1379002	25 %	25 %	25 %	25 %	258405298
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21219	NC_013223	TG	3	6	1379384	1379389	0 %	50 %	50 %	0 %	258405298
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21223	NC_013223	GCA	2	6	1380138	1380143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405299
21224	NC_013223	GCTTTT	2	12	1380169	1380180	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	258405299
21225	NC_013223	T	6	6	1380177	1380182	0 %	100 %	0 %	0 %	258405299
21226	NC_013223	CGG	2	6	1380183	1380188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405299
21227	NC_013223	ACA	2	6	1380212	1380217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405299
21228	NC_013223	TC	3	6	1380409	1380414	0 %	50 %	0 %	50 %	258405299
21229	NC_013223	CTC	2	6	1380448	1380453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405299
21230	NC_013223	AGC	2	6	1380461	1380466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405299
21231	NC_013223	CTGC	2	8	1380535	1380542	0 %	25 %	25 %	50 %	258405299
21232	NC_013223	ACT	2	6	1380617	1380622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405299
21233	NC_013223	GC	3	6	1380668	1380673	0 %	0 %	50 %	50 %	258405299
21234	NC_013223	CGC	2	6	1380700	1380705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405299
21235	NC_013223	TGCC	2	8	1380708	1380715	0 %	25 %	25 %	50 %	258405299
21236	NC_013223	AAC	2	6	1380733	1380738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405299
21237	NC_013223	CTC	2	6	1380856	1380861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405299
21238	NC_013223	GCAT	2	8	1380936	1380943	25 %	25 %	25 %	25 %	258405299
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21266	NC_013223	TCG	2	6	1382687	1382692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405301
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21334	NC_013223	AT	3	6	1386478	1386483	50 %	50 %	0 %	0 %	258405303
21335	NC_013223	AGTA	2	8	1386531	1386538	50 %	25 %	25 %	0 %	258405303
21336	NC_013223	CAA	2	6	1386597	1386602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405303
21337	NC_013223	AGT	2	6	1386604	1386609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405303
21338	NC_013223	TAA	2	6	1386640	1386645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405303
21339	NC_013223	A	6	6	1386661	1386666	100 %	0 %	0 %	0 %	258405303
21340	NC_013223	A	8	8	1386674	1386681	100 %	0 %	0 %	0 %	258405303
21341	NC_013223	TCA	2	6	1387005	1387010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405304
21342	NC_013223	GAG	2	6	1387088	1387093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405304
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21344	NC_013223	TCA	2	6	1387170	1387175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405304
21345	NC_013223	GCTC	2	8	1387195	1387202	0 %	25 %	25 %	50 %	258405304
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21347	NC_013223	CAAT	2	8	1387273	1387280	50 %	25 %	0 %	25 %	258405304
21348	NC_013223	CGC	2	6	1387282	1387287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405304
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21350	NC_013223	A	6	6	1387388	1387393	100 %	0 %	0 %	0 %	258405304
21351	NC_013223	GCA	2	6	1387410	1387415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405304
21352	NC_013223	GGC	2	6	1387486	1387491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405304
21353	NC_013223	TATACC	2	12	1387517	1387528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405304
21354	NC_013223	ATT	2	6	1387538	1387543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405304
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21470	NC_013223	ATC	2	6	1393563	1393568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405308
21471	NC_013223	CCG	2	6	1393692	1393697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405308
21472	NC_013223	CAT	2	6	1393698	1393703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405308
21473	NC_013223	TCT	2	6	1393711	1393716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405308
21474	NC_013223	GGAG	2	8	1393728	1393735	25 %	0 %	75 %	0 %	258405308
21475	NC_013223	TC	3	6	1393750	1393755	0 %	50 %	0 %	50 %	258405308
21476	NC_013223	TATAG	2	10	1393781	1393790	40 %	40 %	20 %	0 %	258405308
21477	NC_013223	TCC	2	6	1393824	1393829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405309
21478	NC_013223	TTC	2	6	1393884	1393889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405309
21479	NC_013223	AGTCCG	2	12	1393946	1393957	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258405309
21480	NC_013223	TTCGAT	2	12	1394035	1394046	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258405309
21481	NC_013223	TGA	2	6	1394070	1394075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405309
21482	NC_013223	A	6	6	1394252	1394257	100 %	0 %	0 %	0 %	258405309
21483	NC_013223	CTG	2	6	1394334	1394339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405309
21484	NC_013223	GAA	2	6	1394387	1394392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405309
21485	NC_013223	TCA	2	6	1394396	1394401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405309
21486	NC_013223	GTAT	2	8	1394434	1394441	25 %	50 %	25 %	0 %	258405309
21487	NC_013223	TTA	2	6	1394442	1394447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405309
21488	NC_013223	ATC	2	6	1394518	1394523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405309
21489	NC_013223	T	6	6	1394541	1394546	0 %	100 %	0 %	0 %	258405309
21490	NC_013223	GCTAT	2	10	1394549	1394558	20 %	40 %	20 %	20 %	258405309
21491	NC_013223	CAA	2	6	1394559	1394564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405309
21492	NC_013223	AAAG	2	8	1394576	1394583	75 %	0 %	25 %	0 %	258405309
21493	NC_013223	A	6	6	1394646	1394651	100 %	0 %	0 %	0 %	258405309
21494	NC_013223	TGT	2	6	1394709	1394714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405309
21495	NC_013223	T	6	6	1394748	1394753	0 %	100 %	0 %	0 %	258405309
21496	NC_013223	TA	3	6	1394759	1394764	50 %	50 %	0 %	0 %	258405309
21497	NC_013223	T	6	6	1394767	1394772	0 %	100 %	0 %	0 %	258405309
21498	NC_013223	ATC	2	6	1394836	1394841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405309
21499	NC_013223	AAAC	2	8	1394882	1394889	75 %	0 %	0 %	25 %	258405309
21500	NC_013223	TCT	2	6	1394918	1394923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405309

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