MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20502	NC_013223	CGG	3	9	1331600	1331608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405259
20503	NC_013223	GAG	2	6	1331629	1331634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405259
20504	NC_013223	GCC	2	6	1331671	1331676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405259
20505	NC_013223	GCC	2	6	1331773	1331778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405259
20506	NC_013223	AC	3	6	1331823	1331828	50 %	0 %	0 %	50 %	258405259
20507	NC_013223	TGA	2	6	1331835	1331840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405259
20508	NC_013223	CCA	2	6	1332046	1332051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405259
20509	NC_013223	CCGT	2	8	1332098	1332105	0 %	25 %	25 %	50 %	258405259
20510	NC_013223	ACG	2	6	1332167	1332172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405259
20511	NC_013223	CAG	2	6	1332253	1332258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405259
20512	NC_013223	GGC	2	6	1332382	1332387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405259
20513	NC_013223	CAG	2	6	1332388	1332393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405259
20514	NC_013223	GCC	2	6	1332403	1332408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405259
20515	NC_013223	ATAG	2	8	1332440	1332447	50 %	25 %	25 %	0 %	258405259
20516	NC_013223	GGC	2	6	1332568	1332573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405260
20517	NC_013223	GATC	2	8	1332625	1332632	25 %	25 %	25 %	25 %	258405260
20518	NC_013223	CCG	2	6	1332638	1332643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405260
20519	NC_013223	CGG	2	6	1332648	1332653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405260
20520	NC_013223	GCA	2	6	1332675	1332680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405260
20521	NC_013223	GCC	2	6	1332713	1332718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405260
20522	NC_013223	ATC	3	9	1332719	1332727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405260
20523	NC_013223	GCC	2	6	1332748	1332753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405260
20524	NC_013223	CG	3	6	1332803	1332808	0 %	0 %	50 %	50 %	258405260
20525	NC_013223	GGC	2	6	1332849	1332854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405260
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20530	NC_013223	CAG	2	6	1333129	1333134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405260
20531	NC_013223	TGC	2	6	1333319	1333324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405260
20532	NC_013223	AGGA	2	8	1333516	1333523	50 %	0 %	50 %	0 %	258405261
20533	NC_013223	CGT	2	6	1333583	1333588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405261
20534	NC_013223	ATG	2	6	1333606	1333611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405261
20535	NC_013223	AT	3	6	1333747	1333752	50 %	50 %	0 %	0 %	258405261
20536	NC_013223	AGCGG	2	10	1333822	1333831	20 %	0 %	60 %	20 %	258405261
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20544	NC_013223	CGT	2	6	1334280	1334285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405261
20545	NC_013223	CGT	2	6	1334288	1334293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405261
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20553	NC_013223	AAT	2	6	1334691	1334696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405262
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20556	NC_013223	CGGC	2	8	1335049	1335056	0 %	0 %	50 %	50 %	258405262
20557	NC_013223	CGA	2	6	1335317	1335322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405263
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20599	NC_013223	T	6	6	1338301	1338306	0 %	100 %	0 %	0 %	258405265
20600	NC_013223	CCG	2	6	1338319	1338324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405265
20601	NC_013223	TGGC	2	8	1338329	1338336	0 %	25 %	50 %	25 %	258405265
20602	NC_013223	CGA	2	6	1338341	1338346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405265
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20733	NC_013223	CCA	2	6	1346757	1346762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405273
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20841	NC_013223	GC	3	6	1353787	1353792	0 %	0 %	50 %	50 %	258405276
20842	NC_013223	ATCGAA	2	12	1353820	1353831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	258405276
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20845	NC_013223	TCA	2	6	1354028	1354033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405276
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20964	NC_013223	CT	4	8	1361933	1361940	0 %	50 %	0 %	50 %	258405281
20965	NC_013223	GGTTAT	2	12	1362101	1362112	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	258405281
20966	NC_013223	TTG	2	6	1362121	1362126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405281
20967	NC_013223	ATA	2	6	1362186	1362191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405281
20968	NC_013223	GTT	2	6	1362204	1362209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405281
20969	NC_013223	TA	3	6	1362213	1362218	50 %	50 %	0 %	0 %	258405281
20970	NC_013223	TTG	2	6	1362349	1362354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405281
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20975	NC_013223	AGC	2	6	1362592	1362597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405281
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20979	NC_013223	GTA	2	6	1362806	1362811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405282
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20990	NC_013223	CTCAG	2	10	1363512	1363521	20 %	20 %	20 %	40 %	258405282
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20992	NC_013223	CCG	2	6	1363653	1363658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405282
20993	NC_013223	CCG	2	6	1363808	1363813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405283
20994	NC_013223	ACA	2	6	1363865	1363870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405283
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