MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_013223	CTG	2	6	1299369	1299374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405230
20003	NC_013223	C	6	6	1299699	1299704	0 %	0 %	0 %	100 %	258405231
20004	NC_013223	ACC	2	6	1299738	1299743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405231
20005	NC_013223	CCAT	2	8	1299909	1299916	25 %	25 %	0 %	50 %	258405231
20006	NC_013223	CGG	2	6	1300018	1300023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405231
20007	NC_013223	CAGCC	2	10	1300052	1300061	20 %	0 %	20 %	60 %	258405231
20008	NC_013223	CGA	2	6	1300249	1300254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405231
20009	NC_013223	CGGC	2	8	1300495	1300502	0 %	0 %	50 %	50 %	258405231
20010	NC_013223	GCC	2	6	1300533	1300538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405231
20011	NC_013223	GTT	2	6	1300549	1300554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405231
20012	NC_013223	AGTG	2	8	1300621	1300628	25 %	25 %	50 %	0 %	258405232
20013	NC_013223	GGCA	2	8	1300743	1300750	25 %	0 %	50 %	25 %	258405232
20014	NC_013223	CTGC	2	8	1300803	1300810	0 %	25 %	25 %	50 %	258405232
20015	NC_013223	GAA	2	6	1300824	1300829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405232
20016	NC_013223	ACG	2	6	1300850	1300855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405232
20017	NC_013223	TGC	2	6	1300880	1300885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405232
20018	NC_013223	TCCGG	2	10	1300938	1300947	0 %	20 %	40 %	40 %	258405232
20019	NC_013223	CGG	2	6	1300959	1300964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405232
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20031	NC_013223	TG	3	6	1301572	1301577	0 %	50 %	50 %	0 %	258405232
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20116	NC_013223	ATA	2	6	1307346	1307351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405240
20117	NC_013223	CAGGG	2	10	1307508	1307517	20 %	0 %	60 %	20 %	258405240
20118	NC_013223	ACA	2	6	1307534	1307539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405240
20119	NC_013223	GCC	2	6	1307560	1307565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405240
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20215	NC_013223	ACA	2	6	1314065	1314070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405244
20216	NC_013223	CCTGGC	2	12	1314192	1314203	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258405244
20217	NC_013223	GCT	2	6	1314252	1314257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405244
20218	NC_013223	CGC	2	6	1314324	1314329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405244
20219	NC_013223	AT	3	6	1314479	1314484	50 %	50 %	0 %	0 %	258405245
20220	NC_013223	CCA	2	6	1314567	1314572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405245
20221	NC_013223	GGA	2	6	1314597	1314602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405245
20222	NC_013223	A	7	7	1314620	1314626	100 %	0 %	0 %	0 %	258405245
20223	NC_013223	CCG	2	6	1314795	1314800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405245
20224	NC_013223	AAG	2	6	1314808	1314813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405245
20225	NC_013223	CAG	2	6	1314820	1314825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405245
20226	NC_013223	GGTCAT	2	12	1314828	1314839	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258405245
20227	NC_013223	CCAT	2	8	1314950	1314957	25 %	25 %	0 %	50 %	258405245
20228	NC_013223	CAG	2	6	1315012	1315017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405245
20229	NC_013223	TC	3	6	1315062	1315067	0 %	50 %	0 %	50 %	258405245
20230	NC_013223	GGC	2	6	1315081	1315086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405245
20231	NC_013223	CCG	2	6	1315119	1315124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405245
20232	NC_013223	CTA	2	6	1315143	1315148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405245
20233	NC_013223	TC	3	6	1315157	1315162	0 %	50 %	0 %	50 %	258405245
20234	NC_013223	GGAG	2	8	1315164	1315171	25 %	0 %	75 %	0 %	258405245
20235	NC_013223	CGG	2	6	1315172	1315177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405245
20236	NC_013223	ATA	2	6	1315265	1315270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405245
20237	NC_013223	A	7	7	1315270	1315276	100 %	0 %	0 %	0 %	258405245
20238	NC_013223	GAT	2	6	1315288	1315293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405245
20239	NC_013223	ATC	2	6	1315294	1315299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405245
20240	NC_013223	CCT	2	6	1315306	1315311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405245
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20252	NC_013223	ATTC	2	8	1316235	1316242	25 %	50 %	0 %	25 %	258405245
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20263	NC_013223	GA	3	6	1316759	1316764	50 %	0 %	50 %	0 %	258405246
20264	NC_013223	GTGA	2	8	1316911	1316918	25 %	25 %	50 %	0 %	258405246
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20344	NC_013223	CCG	2	6	1321002	1321007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405250
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20349	NC_013223	ACT	2	6	1321263	1321268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405251
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20379	NC_013223	TGG	2	6	1323331	1323336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405253
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20454	NC_013223	GA	3	6	1327794	1327799	50 %	0 %	50 %	0 %	258405255
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20463	NC_013223	CAG	2	6	1328932	1328937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405256
20464	NC_013223	CGT	2	6	1328985	1328990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405256
20465	NC_013223	AGCCGC	2	12	1329030	1329041	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258405256
20466	NC_013223	GCA	2	6	1329084	1329089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405256
20467	NC_013223	AGG	2	6	1329347	1329352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405256
20468	NC_013223	GCA	2	6	1329402	1329407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405256
20469	NC_013223	CCA	2	6	1329432	1329437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405256
20470	NC_013223	AGG	2	6	1329441	1329446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405256
20471	NC_013223	CCGTGG	2	12	1329489	1329500	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258405256
20472	NC_013223	CGT	2	6	1329588	1329593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405256
20473	NC_013223	CAAGGC	2	12	1329600	1329611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405256
20474	NC_013223	CAC	2	6	1329673	1329678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405256
20475	NC_013223	GCCG	2	8	1329690	1329697	0 %	0 %	50 %	50 %	258405256
20476	NC_013223	GTG	3	9	1329698	1329706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405256
20477	NC_013223	GAC	2	6	1329715	1329720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405256
20478	NC_013223	AAGCTG	2	12	1329910	1329921	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258405256
20479	NC_013223	TCA	2	6	1329929	1329934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405256
20480	NC_013223	GCG	2	6	1329956	1329961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405256
20481	NC_013223	GTC	2	6	1329999	1330004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405257
20482	NC_013223	CG	3	6	1330042	1330047	0 %	0 %	50 %	50 %	258405257
20483	NC_013223	CGA	2	6	1330094	1330099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405257
20484	NC_013223	CAC	2	6	1330155	1330160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405257
20485	NC_013223	TCA	2	6	1330174	1330179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405257
20486	NC_013223	TCA	2	6	1330243	1330248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405257
20487	NC_013223	TCG	2	6	1330381	1330386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405257
20488	NC_013223	ATG	2	6	1330522	1330527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405257
20489	NC_013223	CCG	2	6	1330591	1330596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405257
20490	NC_013223	GCA	2	6	1330601	1330606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405257
20491	NC_013223	CGT	2	6	1330632	1330637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405257
20492	NC_013223	GC	3	6	1330806	1330811	0 %	0 %	50 %	50 %	258405258
20493	NC_013223	CTT	2	6	1330816	1330821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405258
20494	NC_013223	CCCGT	2	10	1330861	1330870	0 %	20 %	20 %	60 %	258405258
20495	NC_013223	CAG	2	6	1331030	1331035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405258
20496	NC_013223	CTG	2	6	1331075	1331080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405258
20497	NC_013223	T	7	7	1331211	1331217	0 %	100 %	0 %	0 %	258405258
20498	NC_013223	AAT	2	6	1331292	1331297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405258
20499	NC_013223	ATGG	2	8	1331429	1331436	25 %	25 %	50 %	0 %	258405258
20500	NC_013223	GGC	2	6	1331438	1331443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405258

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