MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_013223	CTT	2	6	1265048	1265053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405197
19502	NC_013223	GCT	2	6	1265084	1265089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405197
19503	NC_013223	AGC	2	6	1265185	1265190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405197
19504	NC_013223	GCC	2	6	1265198	1265203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405197
19505	NC_013223	CGA	2	6	1265246	1265251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405197
19506	NC_013223	ATC	2	6	1265272	1265277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405197
19507	NC_013223	TCC	2	6	1265519	1265524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405198
19508	NC_013223	GCG	3	9	1265552	1265560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405198
19509	NC_013223	GGC	2	6	1265707	1265712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405198
19510	NC_013223	G	6	6	1265730	1265735	0 %	0 %	100 %	0 %	258405198
19511	NC_013223	GGC	2	6	1265752	1265757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405198
19512	NC_013223	GGC	2	6	1265791	1265796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405198
19513	NC_013223	GAACT	2	10	1265897	1265906	40 %	20 %	20 %	20 %	258405198
19514	NC_013223	GCT	2	6	1265910	1265915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405198
19515	NC_013223	GCC	2	6	1265974	1265979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405198
19516	NC_013223	GCAGG	2	10	1266009	1266018	20 %	0 %	60 %	20 %	258405198
19517	NC_013223	TTCTC	2	10	1266026	1266035	0 %	60 %	0 %	40 %	258405198
19518	NC_013223	AGG	2	6	1266039	1266044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405198
19519	NC_013223	GGCC	2	8	1266072	1266079	0 %	0 %	50 %	50 %	258405198
19520	NC_013223	CAG	2	6	1266118	1266123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405198
19521	NC_013223	CCGG	2	8	1266128	1266135	0 %	0 %	50 %	50 %	258405198
19522	NC_013223	TGA	2	6	1266216	1266221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405198
19523	NC_013223	GC	3	6	1266305	1266310	0 %	0 %	50 %	50 %	258405198
19524	NC_013223	GC	3	6	1266466	1266471	0 %	0 %	50 %	50 %	258405199
19525	NC_013223	ATC	2	6	1266506	1266511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405199
19526	NC_013223	A	6	6	1266584	1266589	100 %	0 %	0 %	0 %	258405199
19527	NC_013223	CCA	2	6	1266702	1266707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405199
19528	NC_013223	TGC	3	9	1266746	1266754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405199
19529	NC_013223	CATCC	2	10	1266775	1266784	20 %	20 %	0 %	60 %	258405199
19530	NC_013223	GAC	2	6	1266827	1266832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405199
19531	NC_013223	TGT	2	6	1266850	1266855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405199
19532	NC_013223	TTG	2	6	1267405	1267410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405200
19533	NC_013223	CCGGG	2	10	1267571	1267580	0 %	0 %	60 %	40 %	258405200
19534	NC_013223	GT	4	8	1267588	1267595	0 %	50 %	50 %	0 %	258405200
19535	NC_013223	GGC	2	6	1267614	1267619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405200
19536	NC_013223	T	6	6	1267620	1267625	0 %	100 %	0 %	0 %	258405200
19537	NC_013223	AGGTCG	2	12	1267733	1267744	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258405200
19538	NC_013223	GACC	2	8	1267780	1267787	25 %	0 %	25 %	50 %	258405200
19539	NC_013223	T	7	7	1267802	1267808	0 %	100 %	0 %	0 %	258405200
19540	NC_013223	GCC	2	6	1267843	1267848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405200
19541	NC_013223	GAC	2	6	1267939	1267944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405200
19542	NC_013223	GTG	2	6	1268149	1268154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405200
19543	NC_013223	GGA	2	6	1268190	1268195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405200
19544	NC_013223	ACG	2	6	1268282	1268287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405200
19545	NC_013223	CTG	2	6	1268417	1268422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405200
19546	NC_013223	GCC	2	6	1268458	1268463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405200
19547	NC_013223	TAC	2	6	1268464	1268469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405200
19548	NC_013223	T	7	7	1268720	1268726	0 %	100 %	0 %	0 %	258405201
19549	NC_013223	GTT	2	6	1268829	1268834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405201
19550	NC_013223	TGG	2	6	1268841	1268846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405201
19551	NC_013223	CT	3	6	1268856	1268861	0 %	50 %	0 %	50 %	258405201
19552	NC_013223	CACGG	2	10	1268869	1268878	20 %	0 %	40 %	40 %	258405201
19553	NC_013223	GAT	2	6	1268928	1268933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405201
19554	NC_013223	GTC	2	6	1269037	1269042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405201
19555	NC_013223	GCCC	2	8	1269127	1269134	0 %	0 %	25 %	75 %	258405201
19556	NC_013223	CTG	2	6	1269148	1269153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405201
19557	NC_013223	TGC	2	6	1269254	1269259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405201
19558	NC_013223	CG	3	6	1269308	1269313	0 %	0 %	50 %	50 %	258405201
19559	NC_013223	TCCAA	2	10	1269347	1269356	40 %	20 %	0 %	40 %	258405201
19560	NC_013223	ACG	2	6	1269521	1269526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405201
19561	NC_013223	GCC	2	6	1269530	1269535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405201
19562	NC_013223	GGT	2	6	1269579	1269584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405201
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19565	NC_013223	AT	3	6	1269801	1269806	50 %	50 %	0 %	0 %	258405202
19566	NC_013223	GCAG	2	8	1269858	1269865	25 %	0 %	50 %	25 %	258405202
19567	NC_013223	TGA	2	6	1269916	1269921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405202
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19569	NC_013223	CGA	3	9	1269961	1269969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405202
19570	NC_013223	TCGCA	2	10	1270024	1270033	20 %	20 %	20 %	40 %	258405202
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19573	NC_013223	GAT	2	6	1270237	1270242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405202
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19576	NC_013223	CAG	2	6	1270295	1270300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405202
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19578	NC_013223	TGA	2	6	1270396	1270401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405202
19579	NC_013223	GATTCG	2	12	1270434	1270445	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258405202
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19582	NC_013223	GTC	2	6	1270880	1270885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405203
19583	NC_013223	CGC	2	6	1271054	1271059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405203
19584	NC_013223	TCC	2	6	1271121	1271126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405203
19585	NC_013223	GGC	2	6	1271262	1271267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405203
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19587	NC_013223	GCG	2	6	1271320	1271325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405203
19588	NC_013223	ACC	2	6	1271452	1271457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405203
19589	NC_013223	CGG	2	6	1271468	1271473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405203
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19593	NC_013223	GCCA	2	8	1271614	1271621	25 %	0 %	25 %	50 %	258405203
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19596	NC_013223	CAG	2	6	1271947	1271952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405204
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19599	NC_013223	GTC	2	6	1272055	1272060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405204
19600	NC_013223	GGTG	2	8	1272081	1272088	0 %	25 %	75 %	0 %	258405204
19601	NC_013223	GCG	2	6	1272124	1272129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405204
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19603	NC_013223	T	6	6	1272472	1272477	0 %	100 %	0 %	0 %	258405204
19604	NC_013223	A	6	6	1272801	1272806	100 %	0 %	0 %	0 %	258405205
19605	NC_013223	CGG	2	6	1272842	1272847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405205
19606	NC_013223	GA	3	6	1272918	1272923	50 %	0 %	50 %	0 %	258405205
19607	NC_013223	TAT	2	6	1272999	1273004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405206
19608	NC_013223	GAG	2	6	1273038	1273043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405206
19609	NC_013223	ACG	2	6	1273195	1273200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405206
19610	NC_013223	CAACGG	2	12	1273205	1273216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405206
19611	NC_013223	ACG	2	6	1273369	1273374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405206
19612	NC_013223	GCG	2	6	1273483	1273488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405206
19613	NC_013223	AGGTC	2	10	1273559	1273568	20 %	20 %	40 %	20 %	258405206
19614	NC_013223	CCG	2	6	1273642	1273647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405206
19615	NC_013223	GCG	2	6	1273678	1273683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405206
19616	NC_013223	GCC	2	6	1273812	1273817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405206
19617	NC_013223	GCG	2	6	1273888	1273893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405206
19618	NC_013223	GAA	2	6	1274004	1274009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405206
19619	NC_013223	GAA	2	6	1274034	1274039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405206
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19621	NC_013223	GTC	2	6	1274185	1274190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405207
19622	NC_013223	TGC	2	6	1274373	1274378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405207
19623	NC_013223	ATCGAG	2	12	1274389	1274400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258405207
19624	NC_013223	ACC	2	6	1274413	1274418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405207
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19628	NC_013223	CAAA	2	8	1274955	1274962	75 %	0 %	0 %	25 %	258405208
19629	NC_013223	CAC	2	6	1274998	1275003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405208
19630	NC_013223	ATC	2	6	1275219	1275224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405208
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19648	NC_013223	TTTA	2	8	1276545	1276552	25 %	75 %	0 %	0 %	258405210
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19654	NC_013223	TGGCT	2	10	1276897	1276906	0 %	40 %	40 %	20 %	258405210
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19720	NC_013223	C	7	7	1281036	1281042	0 %	0 %	0 %	100 %	258405212
19721	NC_013223	GGC	2	6	1281245	1281250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405212
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19724	NC_013223	GCCA	2	8	1281472	1281479	25 %	0 %	25 %	50 %	258405213
19725	NC_013223	GAA	2	6	1281522	1281527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405213
19726	NC_013223	GAC	2	6	1281540	1281545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405213
19727	NC_013223	GAT	2	6	1281570	1281575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405213
19728	NC_013223	CAA	2	6	1281587	1281592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405213
19729	NC_013223	A	6	6	1281591	1281596	100 %	0 %	0 %	0 %	258405213
19730	NC_013223	GAT	3	9	1281597	1281605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405213
19731	NC_013223	GAT	2	6	1281615	1281620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405213
19732	NC_013223	GCG	2	6	1281668	1281673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405213
19733	NC_013223	GGC	2	6	1281963	1281968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405214
19734	NC_013223	AG	3	6	1282152	1282157	50 %	0 %	50 %	0 %	258405214
19735	NC_013223	AGGCG	2	10	1282269	1282278	20 %	0 %	60 %	20 %	258405214
19736	NC_013223	GGC	2	6	1282287	1282292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405214
19737	NC_013223	CGAAG	2	10	1282372	1282381	40 %	0 %	40 %	20 %	258405214
19738	NC_013223	TGC	2	6	1282393	1282398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405214
19739	NC_013223	AAG	2	6	1282425	1282430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405214
19740	NC_013223	A	7	7	1282498	1282504	100 %	0 %	0 %	0 %	258405214
19741	NC_013223	GCT	2	6	1282593	1282598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405214
19742	NC_013223	AGGC	2	8	1282600	1282607	25 %	0 %	50 %	25 %	258405214
19743	NC_013223	CAA	2	6	1282656	1282661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405214
19744	NC_013223	GAC	2	6	1282810	1282815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405215
19745	NC_013223	GAA	2	6	1282858	1282863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405215
19746	NC_013223	CGA	2	6	1282884	1282889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405215
19747	NC_013223	CTT	2	6	1282926	1282931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405215
19748	NC_013223	ACC	2	6	1282958	1282963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405215
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19750	NC_013223	CCT	2	6	1283111	1283116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405215
19751	NC_013223	C	6	6	1283196	1283201	0 %	0 %	0 %	100 %	258405215
19752	NC_013223	TTG	2	6	1283275	1283280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405215
19753	NC_013223	CCCG	2	8	1283358	1283365	0 %	0 %	25 %	75 %	258405215
19754	NC_013223	GCAGC	2	10	1283392	1283401	20 %	0 %	40 %	40 %	258405215
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19756	NC_013223	GAT	2	6	1283679	1283684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405216
19757	NC_013223	ACC	2	6	1283815	1283820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405216
19758	NC_013223	TGA	2	6	1283843	1283848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405216
19759	NC_013223	ATC	2	6	1283872	1283877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405216
19760	NC_013223	CGGC	2	8	1283941	1283948	0 %	0 %	50 %	50 %	258405216
19761	NC_013223	GCCG	2	8	1284036	1284043	0 %	0 %	50 %	50 %	258405216
19762	NC_013223	G	6	6	1284049	1284054	0 %	0 %	100 %	0 %	258405216
19763	NC_013223	G	6	6	1284113	1284118	0 %	0 %	100 %	0 %	258405216
19764	NC_013223	T	6	6	1284153	1284158	0 %	100 %	0 %	0 %	258405216
19765	NC_013223	GAA	2	6	1284216	1284221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405216
19766	NC_013223	TGA	2	6	1284236	1284241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405216
19767	NC_013223	GAACC	2	10	1284430	1284439	40 %	0 %	20 %	40 %	258405217
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19769	NC_013223	AATGC	2	10	1284529	1284538	40 %	20 %	20 %	20 %	258405217
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19772	NC_013223	TGG	2	6	1284737	1284742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405217
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19783	NC_013223	CAA	2	6	1285374	1285379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405218
19784	NC_013223	TGT	2	6	1285394	1285399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405218
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19787	NC_013223	GAA	2	6	1285486	1285491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405218
19788	NC_013223	GAC	2	6	1285492	1285497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405218
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19790	NC_013223	ACGG	2	8	1285615	1285622	25 %	0 %	50 %	25 %	258405218
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19802	NC_013223	CCG	2	6	1286509	1286514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405221
19803	NC_013223	C	7	7	1286519	1286525	0 %	0 %	0 %	100 %	258405221
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19824	NC_013223	GC	3	6	1287394	1287399	0 %	0 %	50 %	50 %	258405221
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19826	NC_013223	GATG	2	8	1287544	1287551	25 %	25 %	50 %	0 %	258405221
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19831	NC_013223	G	6	6	1288228	1288233	0 %	0 %	100 %	0 %	258405222
19832	NC_013223	CGG	2	6	1288244	1288249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405222
19833	NC_013223	G	6	6	1288267	1288272	0 %	0 %	100 %	0 %	258405222
19834	NC_013223	T	6	6	1288334	1288339	0 %	100 %	0 %	0 %	258405222
19835	NC_013223	ATC	2	6	1288383	1288388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405222
19836	NC_013223	GGC	2	6	1288418	1288423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405222
19837	NC_013223	GTTGGG	2	12	1288466	1288477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405222
19838	NC_013223	ATGTCG	2	12	1288785	1288796	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258405223
19839	NC_013223	CTGC	2	8	1288838	1288845	0 %	25 %	25 %	50 %	258405223
19840	NC_013223	GC	3	6	1288854	1288859	0 %	0 %	50 %	50 %	258405223
19841	NC_013223	GCG	2	6	1288897	1288902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405223
19842	NC_013223	GCT	2	6	1288986	1288991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405223
19843	NC_013223	CGG	2	6	1289122	1289127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405223
19844	NC_013223	AC	3	6	1289132	1289137	50 %	0 %	0 %	50 %	258405223
19845	NC_013223	GCC	2	6	1289292	1289297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405223
19846	NC_013223	CGC	2	6	1289303	1289308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405223
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19848	NC_013223	CTG	2	6	1289478	1289483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405223
19849	NC_013223	CCTACG	2	12	1289521	1289532	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258405223
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