MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_013223	CCA	2	6	1232033	1232038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405166
19002	NC_013223	CCG	2	6	1232141	1232146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405166
19003	NC_013223	TGA	2	6	1232222	1232227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405166
19004	NC_013223	A	6	6	1232229	1232234	100 %	0 %	0 %	0 %	258405166
19005	NC_013223	TGAT	2	8	1232296	1232303	25 %	50 %	25 %	0 %	258405166
19006	NC_013223	T	7	7	1232303	1232309	0 %	100 %	0 %	0 %	258405166
19007	NC_013223	AGG	2	6	1232312	1232317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405166
19008	NC_013223	GCC	2	6	1232404	1232409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405166
19009	NC_013223	AAC	2	6	1232431	1232436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405166
19010	NC_013223	CCCG	2	8	1232439	1232446	0 %	0 %	25 %	75 %	258405166
19011	NC_013223	GGC	2	6	1232481	1232486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405166
19012	NC_013223	C	7	7	1232511	1232517	0 %	0 %	0 %	100 %	258405166
19013	NC_013223	AGC	2	6	1232891	1232896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405167
19014	NC_013223	CGT	2	6	1233144	1233149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405167
19015	NC_013223	C	7	7	1233250	1233256	0 %	0 %	0 %	100 %	258405167
19016	NC_013223	GAA	2	6	1233291	1233296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405167
19017	NC_013223	AAT	2	6	1233318	1233323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405167
19018	NC_013223	G	6	6	1233727	1233732	0 %	0 %	100 %	0 %	258405168
19019	NC_013223	ATT	2	6	1233735	1233740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405168
19020	NC_013223	TTC	2	6	1233846	1233851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405168
19021	NC_013223	TTC	2	6	1233882	1233887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405168
19022	NC_013223	TCG	2	6	1233937	1233942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405168
19023	NC_013223	TGA	2	6	1233950	1233955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405168
19024	NC_013223	TCA	2	6	1233974	1233979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405168
19025	NC_013223	GC	3	6	1233982	1233987	0 %	0 %	50 %	50 %	258405168
19026	NC_013223	CTT	2	6	1234010	1234015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405168
19027	NC_013223	GGA	2	6	1234026	1234031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405168
19028	NC_013223	TCT	2	6	1234150	1234155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405168
19029	NC_013223	TTC	2	6	1234221	1234226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405168
19030	NC_013223	T	7	7	1234247	1234253	0 %	100 %	0 %	0 %	258405168
19031	NC_013223	GTT	2	6	1234284	1234289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405168
19032	NC_013223	GGCC	2	8	1234292	1234299	0 %	0 %	50 %	50 %	258405168
19033	NC_013223	ACC	2	6	1234303	1234308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405168
19034	NC_013223	TCT	2	6	1234405	1234410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405168
19035	NC_013223	GC	3	6	1234441	1234446	0 %	0 %	50 %	50 %	258405168
19036	NC_013223	AAAAG	2	10	1234469	1234478	80 %	0 %	20 %	0 %	258405168
19037	NC_013223	ACC	2	6	1234549	1234554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405168
19038	NC_013223	ATCG	2	8	1234557	1234564	25 %	25 %	25 %	25 %	258405168
19039	NC_013223	CGA	2	6	1234604	1234609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405168
19040	NC_013223	GAC	2	6	1234635	1234640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405168
19041	NC_013223	GGC	2	6	1234764	1234769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405168
19042	NC_013223	GAG	2	6	1234825	1234830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405168
19043	NC_013223	GAT	2	6	1234839	1234844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405168
19044	NC_013223	GCC	2	6	1234881	1234886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405168
19045	NC_013223	A	7	7	1234911	1234917	100 %	0 %	0 %	0 %	258405168
19046	NC_013223	GTC	2	6	1234932	1234937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405168
19047	NC_013223	T	6	6	1235028	1235033	0 %	100 %	0 %	0 %	258405168
19048	NC_013223	GGCA	2	8	1235070	1235077	25 %	0 %	50 %	25 %	258405168
19049	NC_013223	GTG	2	6	1235122	1235127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405168
19050	NC_013223	TCA	2	6	1235171	1235176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405168
19051	NC_013223	CCA	2	6	1235195	1235200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405168
19052	NC_013223	GAT	2	6	1235229	1235234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405168
19053	NC_013223	TCA	2	6	1235339	1235344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405168
19054	NC_013223	A	6	6	1236012	1236017	100 %	0 %	0 %	0 %	258405169
19055	NC_013223	GCCC	2	8	1236057	1236064	0 %	0 %	25 %	75 %	258405169
19056	NC_013223	C	6	6	1236276	1236281	0 %	0 %	0 %	100 %	258405170
19057	NC_013223	GC	3	6	1236331	1236336	0 %	0 %	50 %	50 %	258405170
19058	NC_013223	GTG	2	6	1236369	1236374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405170
19059	NC_013223	TCC	2	6	1236419	1236424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405170
19060	NC_013223	TGG	2	6	1236425	1236430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405170
19061	NC_013223	ACA	2	6	1236447	1236452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405170
19062	NC_013223	CATGT	2	10	1236500	1236509	20 %	40 %	20 %	20 %	258405170
19063	NC_013223	CGG	2	6	1236511	1236516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405170
19064	NC_013223	CGG	2	6	1236531	1236536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405170
19065	NC_013223	CGC	2	6	1236721	1236726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405170
19066	NC_013223	CGATC	2	10	1236739	1236748	20 %	20 %	20 %	40 %	258405170
19067	NC_013223	GCAT	2	8	1236753	1236760	25 %	25 %	25 %	25 %	258405170
19068	NC_013223	ACG	2	6	1236809	1236814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405170
19069	NC_013223	GAT	2	6	1236833	1236838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405170
19070	NC_013223	GCC	2	6	1236848	1236853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405170
19071	NC_013223	GAA	2	6	1236857	1236862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405170
19072	NC_013223	ATC	2	6	1236942	1236947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405170
19073	NC_013223	CGG	2	6	1237105	1237110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405170
19074	NC_013223	CGA	2	6	1237128	1237133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405170
19075	NC_013223	GCC	2	6	1237151	1237156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405170
19076	NC_013223	AGTCTG	2	12	1237241	1237252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258405170
19077	NC_013223	CCT	2	6	1237475	1237480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405170
19078	NC_013223	C	6	6	1237793	1237798	0 %	0 %	0 %	100 %	258405171
19079	NC_013223	GCA	2	6	1237807	1237812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405171
19080	NC_013223	GGA	2	6	1237820	1237825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405171
19081	NC_013223	GGCCC	2	10	1237974	1237983	0 %	0 %	40 %	60 %	258405171
19082	NC_013223	TGC	2	6	1238024	1238029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405171
19083	NC_013223	CCGGAG	2	12	1238074	1238085	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258405171
19084	NC_013223	CGGC	2	8	1238109	1238116	0 %	0 %	50 %	50 %	258405171
19085	NC_013223	GGA	2	6	1238145	1238150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405171
19086	NC_013223	AATGGG	2	12	1238278	1238289	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	258405172
19087	NC_013223	GCT	2	6	1238345	1238350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405172
19088	NC_013223	CGG	2	6	1238408	1238413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405172
19089	NC_013223	GAA	2	6	1238493	1238498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405172
19090	NC_013223	CTG	2	6	1238548	1238553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405172
19091	NC_013223	GGC	2	6	1238597	1238602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405172
19092	NC_013223	ACC	2	6	1238707	1238712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405172
19093	NC_013223	ACG	2	6	1238767	1238772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405172
19094	NC_013223	GGC	2	6	1238801	1238806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405172
19095	NC_013223	GCG	2	6	1238824	1238829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405172
19096	NC_013223	GCGTC	2	10	1238949	1238958	0 %	20 %	40 %	40 %	258405172
19097	NC_013223	CGCTG	2	10	1238971	1238980	0 %	20 %	40 %	40 %	258405172
19098	NC_013223	ATC	2	6	1238988	1238993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405172
19099	NC_013223	CAT	2	6	1239101	1239106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405172
19100	NC_013223	CTG	2	6	1239159	1239164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405172
19101	NC_013223	TCC	2	6	1239240	1239245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405173
19102	NC_013223	ATA	2	6	1239315	1239320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405173
19103	NC_013223	T	7	7	1239389	1239395	0 %	100 %	0 %	0 %	258405173
19104	NC_013223	GGC	2	6	1239552	1239557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405173
19105	NC_013223	GAG	2	6	1239684	1239689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405173
19106	NC_013223	GGCA	2	8	1239753	1239760	25 %	0 %	50 %	25 %	258405173
19107	NC_013223	AGC	2	6	1239838	1239843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405173
19108	NC_013223	C	6	6	1239843	1239848	0 %	0 %	0 %	100 %	258405173
19109	NC_013223	AGC	2	6	1239971	1239976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405173
19110	NC_013223	TGT	2	6	1239985	1239990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405173
19111	NC_013223	GCG	2	6	1240045	1240050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405174
19112	NC_013223	GC	3	6	1240058	1240063	0 %	0 %	50 %	50 %	258405174
19113	NC_013223	GC	3	6	1240070	1240075	0 %	0 %	50 %	50 %	258405174
19114	NC_013223	CGG	2	6	1240096	1240101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405174
19115	NC_013223	TTG	2	6	1240114	1240119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405174
19116	NC_013223	CAGA	2	8	1240129	1240136	50 %	0 %	25 %	25 %	258405174
19117	NC_013223	GCA	2	6	1240244	1240249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405174
19118	NC_013223	AGC	2	6	1240291	1240296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405174
19119	NC_013223	GGC	2	6	1240303	1240308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405174
19120	NC_013223	TGC	2	6	1240316	1240321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405174
19121	NC_013223	CGG	2	6	1240339	1240344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405174
19122	NC_013223	TG	3	6	1240386	1240391	0 %	50 %	50 %	0 %	258405174
19123	NC_013223	GTG	3	9	1240409	1240417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405174
19124	NC_013223	CCG	2	6	1240466	1240471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405174
19125	NC_013223	TGAG	2	8	1240473	1240480	25 %	25 %	50 %	0 %	258405174
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19129	NC_013223	AG	3	6	1240704	1240709	50 %	0 %	50 %	0 %	258405175
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19221	NC_013223	GCGG	2	8	1245536	1245543	0 %	0 %	75 %	25 %	258405177
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19229	NC_013223	AGG	2	6	1245995	1246000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405178
19230	NC_013223	TGC	2	6	1246070	1246075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405178
19231	NC_013223	T	6	6	1246172	1246177	0 %	100 %	0 %	0 %	258405178
19232	NC_013223	A	6	6	1246181	1246186	100 %	0 %	0 %	0 %	258405178
19233	NC_013223	AAC	2	6	1246379	1246384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405179
19234	NC_013223	ACG	2	6	1246395	1246400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405179
19235	NC_013223	CGG	3	9	1246463	1246471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405179
19236	NC_013223	ATC	2	6	1246479	1246484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405179
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19238	NC_013223	CGG	2	6	1246652	1246657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405179
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19243	NC_013223	CTT	2	6	1246892	1246897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405179
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19245	NC_013223	CGT	2	6	1247150	1247155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405179
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19263	NC_013223	TG	3	6	1248002	1248007	0 %	50 %	50 %	0 %	258405180
19264	NC_013223	GGCTT	2	10	1248239	1248248	0 %	40 %	40 %	20 %	258405180
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19331	NC_013223	GCGG	2	8	1254061	1254068	0 %	0 %	75 %	25 %	258405187
19332	NC_013223	CTG	2	6	1254076	1254081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405187
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19337	NC_013223	G	6	6	1254723	1254728	0 %	0 %	100 %	0 %	258405188
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19342	NC_013223	CGA	2	6	1254806	1254811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405188
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19345	NC_013223	TC	3	6	1255116	1255121	0 %	50 %	0 %	50 %	258405189
19346	NC_013223	TGG	2	6	1255165	1255170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405189
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19350	NC_013223	GGC	2	6	1255336	1255341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405189
19351	NC_013223	TGC	2	6	1255351	1255356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405189
19352	NC_013223	CTGG	2	8	1255376	1255383	0 %	25 %	50 %	25 %	258405189
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19451	NC_013223	GAG	2	6	1262378	1262383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405195
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19455	NC_013223	CAGGGC	2	12	1262467	1262478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258405195
19456	NC_013223	CAGA	2	8	1262494	1262501	50 %	0 %	25 %	25 %	258405195
19457	NC_013223	TGT	2	6	1262688	1262693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405195
19458	NC_013223	GGAG	2	8	1262745	1262752	25 %	0 %	75 %	0 %	258405195
19459	NC_013223	CGG	2	6	1262865	1262870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405195
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19463	NC_013223	GCA	2	6	1263031	1263036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405195
19464	NC_013223	TCC	2	6	1263083	1263088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405195
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19466	NC_013223	GGTC	2	8	1263153	1263160	0 %	25 %	50 %	25 %	258405195
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19468	NC_013223	GTC	2	6	1263322	1263327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405196
19469	NC_013223	CTGT	2	8	1263357	1263364	0 %	50 %	25 %	25 %	258405196
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19493	NC_013223	GCA	2	6	1264553	1264558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405197
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19495	NC_013223	GCG	2	6	1264740	1264745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405197
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19497	NC_013223	CGG	2	6	1264876	1264881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405197
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19499	NC_013223	AGC	2	6	1264921	1264926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405197
19500	NC_013223	AGT	2	6	1264966	1264971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405197

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