MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_013223	GGC	2	6	1168290	1168295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405118
18002	NC_013223	GCC	2	6	1168305	1168310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405118
18003	NC_013223	ATC	2	6	1168350	1168355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405118
18004	NC_013223	AAC	2	6	1168372	1168377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405118
18005	NC_013223	CG	3	6	1168389	1168394	0 %	0 %	50 %	50 %	258405118
18006	NC_013223	GGTT	2	8	1168446	1168453	0 %	50 %	50 %	0 %	258405118
18007	NC_013223	GGGT	2	8	1168464	1168471	0 %	25 %	75 %	0 %	258405118
18008	NC_013223	CGC	2	6	1168485	1168490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405118
18009	NC_013223	GGT	2	6	1168499	1168504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405118
18010	NC_013223	CG	4	8	1168553	1168560	0 %	0 %	50 %	50 %	258405118
18011	NC_013223	GGA	2	6	1168595	1168600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405118
18012	NC_013223	TGGC	2	8	1168633	1168640	0 %	25 %	50 %	25 %	258405118
18013	NC_013223	TTA	2	6	1168705	1168710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405118
18014	NC_013223	CGG	2	6	1168747	1168752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405118
18015	NC_013223	GCG	2	6	1169023	1169028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405119
18016	NC_013223	AGT	2	6	1169083	1169088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405119
18017	NC_013223	CGA	2	6	1169498	1169503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405120
18018	NC_013223	ATG	2	6	1169506	1169511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405120
18019	NC_013223	CAG	2	6	1169520	1169525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405120
18020	NC_013223	ACCGGA	2	12	1169545	1169556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405120
18021	NC_013223	CAA	2	6	1169562	1169567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405120
18022	NC_013223	GCC	2	6	1169614	1169619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405120
18023	NC_013223	ATG	2	6	1169626	1169631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405120
18024	NC_013223	GGT	2	6	1169682	1169687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405120
18025	NC_013223	CGG	2	6	1169691	1169696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405120
18026	NC_013223	CCG	2	6	1169698	1169703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405120
18027	NC_013223	CGAGG	2	10	1169709	1169718	20 %	0 %	60 %	20 %	258405120
18028	NC_013223	ACTGA	2	10	1169788	1169797	40 %	20 %	20 %	20 %	258405120
18029	NC_013223	AAT	2	6	1169847	1169852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405120
18030	NC_013223	CAGGA	2	10	1169919	1169928	40 %	0 %	40 %	20 %	258405120
18031	NC_013223	GAT	2	6	1169973	1169978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405120
18032	NC_013223	AG	3	6	1170022	1170027	50 %	0 %	50 %	0 %	258405120
18033	NC_013223	GGT	2	6	1170036	1170041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405120
18034	NC_013223	GAT	2	6	1170060	1170065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405120
18035	NC_013223	CGC	2	6	1170095	1170100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405120
18036	NC_013223	ACCGG	2	10	1170169	1170178	20 %	0 %	40 %	40 %	258405120
18037	NC_013223	GCA	2	6	1170191	1170196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405120
18038	NC_013223	TGA	2	6	1170227	1170232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405120
18039	NC_013223	CAG	2	6	1170240	1170245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405120
18040	NC_013223	CGG	2	6	1170404	1170409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405120
18041	NC_013223	AAC	2	6	1170478	1170483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405120
18042	NC_013223	CGA	2	6	1170494	1170499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405120
18043	NC_013223	GGC	2	6	1170805	1170810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405121
18044	NC_013223	GCC	2	6	1170880	1170885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405121
18045	NC_013223	CAA	2	6	1170993	1170998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405121
18046	NC_013223	GGCCC	2	10	1171112	1171121	0 %	0 %	40 %	60 %	258405121
18047	NC_013223	TGGTTT	2	12	1171131	1171142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405121
18048	NC_013223	TGT	2	6	1171224	1171229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405121
18049	NC_013223	AAG	2	6	1171412	1171417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405122
18050	NC_013223	AGGC	2	8	1171436	1171443	25 %	0 %	50 %	25 %	258405122
18051	NC_013223	CTG	2	6	1171606	1171611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405122
18052	NC_013223	GGT	2	6	1171659	1171664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405122
18053	NC_013223	TGG	2	6	1171682	1171687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405122
18054	NC_013223	GGC	2	6	1171698	1171703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405122
18055	NC_013223	ATC	2	6	1171967	1171972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405122
18056	NC_013223	CGT	2	6	1172010	1172015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405122
18057	NC_013223	AGG	2	6	1172030	1172035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405122
18058	NC_013223	CAGGCC	2	12	1172185	1172196	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258405122
18059	NC_013223	GT	3	6	1172296	1172301	0 %	50 %	50 %	0 %	258405122
18060	NC_013223	GGC	2	6	1172330	1172335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405122
18061	NC_013223	GTG	2	6	1172429	1172434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405122
18062	NC_013223	TTG	2	6	1172500	1172505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405122
18063	NC_013223	GC	3	6	1172506	1172511	0 %	0 %	50 %	50 %	258405122
18064	NC_013223	CGA	2	6	1172520	1172525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405122
18065	NC_013223	GAC	2	6	1172533	1172538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405122
18066	NC_013223	GCG	2	6	1172540	1172545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405122
18067	NC_013223	A	6	6	1172554	1172559	100 %	0 %	0 %	0 %	258405122
18068	NC_013223	CCGG	2	8	1172583	1172590	0 %	0 %	50 %	50 %	258405122
18069	NC_013223	ATCC	2	8	1172617	1172624	25 %	25 %	0 %	50 %	258405122
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18071	NC_013223	CCG	2	6	1172763	1172768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405122
18072	NC_013223	TCG	2	6	1172772	1172777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405122
18073	NC_013223	ATG	2	6	1172888	1172893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405122
18074	NC_013223	CGG	2	6	1172914	1172919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405122
18075	NC_013223	CGC	2	6	1172950	1172955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405122
18076	NC_013223	CAG	2	6	1173003	1173008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405122
18077	NC_013223	CAT	2	6	1173326	1173331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405123
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18080	NC_013223	GC	3	6	1173420	1173425	0 %	0 %	50 %	50 %	258405123
18081	NC_013223	CCGG	2	8	1173462	1173469	0 %	0 %	50 %	50 %	258405123
18082	NC_013223	T	6	6	1173483	1173488	0 %	100 %	0 %	0 %	258405123
18083	NC_013223	TCT	2	6	1173598	1173603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405123
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18085	NC_013223	T	7	7	1173642	1173648	0 %	100 %	0 %	0 %	258405123
18086	NC_013223	TTATT	2	10	1173770	1173779	20 %	80 %	0 %	0 %	258405123
18087	NC_013223	T	6	6	1173813	1173818	0 %	100 %	0 %	0 %	258405123
18088	NC_013223	T	6	6	1173838	1173843	0 %	100 %	0 %	0 %	258405123
18089	NC_013223	GGC	2	6	1173855	1173860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405123
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18097	NC_013223	GC	3	6	1174523	1174528	0 %	0 %	50 %	50 %	258405124
18098	NC_013223	CGG	2	6	1174579	1174584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405124
18099	NC_013223	GCT	2	6	1174633	1174638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405124
18100	NC_013223	TTTG	2	8	1174639	1174646	0 %	75 %	25 %	0 %	258405124
18101	NC_013223	TCAC	2	8	1174791	1174798	25 %	25 %	0 %	50 %	258405124
18102	NC_013223	ACG	2	6	1174848	1174853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405124
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18104	NC_013223	TGCG	2	8	1174922	1174929	0 %	25 %	50 %	25 %	258405124
18105	NC_013223	GAC	2	6	1174971	1174976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405125
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18107	NC_013223	CTC	2	6	1175153	1175158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405125
18108	NC_013223	ACG	2	6	1175209	1175214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405125
18109	NC_013223	ACT	2	6	1175224	1175229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405125
18110	NC_013223	CGG	2	6	1175291	1175296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405125
18111	NC_013223	CTGT	2	8	1175348	1175355	0 %	50 %	25 %	25 %	258405125
18112	NC_013223	TCG	2	6	1175398	1175403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405125
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18114	NC_013223	AAT	2	6	1175604	1175609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405125
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18116	NC_013223	TTG	2	6	1175809	1175814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405125
18117	NC_013223	TCG	2	6	1175827	1175832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405125
18118	NC_013223	GGTC	2	8	1175920	1175927	0 %	25 %	50 %	25 %	258405125
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18121	NC_013223	GAT	2	6	1176089	1176094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405125
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18123	NC_013223	GTCG	2	8	1176495	1176502	0 %	25 %	50 %	25 %	258405126
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18131	NC_013223	CTGA	2	8	1177275	1177282	25 %	25 %	25 %	25 %	258405126
18132	NC_013223	TGG	2	6	1177422	1177427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405126
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18144	NC_013223	GCT	2	6	1178266	1178271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405127
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18147	NC_013223	AC	3	6	1178456	1178461	50 %	0 %	0 %	50 %	258405127
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18227	NC_013223	TCGA	2	8	1182838	1182845	25 %	25 %	25 %	25 %	258405132
18228	NC_013223	TGG	2	6	1182907	1182912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405132
18229	NC_013223	G	6	6	1182945	1182950	0 %	0 %	100 %	0 %	258405132
18230	NC_013223	TGT	2	6	1182981	1182986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405132
18231	NC_013223	GCTGA	2	10	1182994	1183003	20 %	20 %	40 %	20 %	258405132
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18233	NC_013223	TGG	2	6	1184128	1184133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405133
18234	NC_013223	T	6	6	1184158	1184163	0 %	100 %	0 %	0 %	258405133
18235	NC_013223	CT	3	6	1184165	1184170	0 %	50 %	0 %	50 %	258405133
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18241	NC_013223	A	6	6	1184421	1184426	100 %	0 %	0 %	0 %	258405133
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18317	NC_013223	ATC	2	6	1189432	1189437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405135
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18332	NC_013223	GCT	3	9	1190109	1190117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405135
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18334	NC_013223	CGGC	2	8	1190134	1190141	0 %	0 %	50 %	50 %	258405135
18335	NC_013223	ACGA	2	8	1190167	1190174	50 %	0 %	25 %	25 %	258405135
18336	NC_013223	TGG	2	6	1190213	1190218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405135
18337	NC_013223	GTCA	2	8	1190242	1190249	25 %	25 %	25 %	25 %	258405135
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18339	NC_013223	GAGCCG	2	12	1190368	1190379	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258405135
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18341	NC_013223	AAGG	2	8	1190494	1190501	50 %	0 %	50 %	0 %	258405135
18342	NC_013223	GCC	2	6	1190530	1190535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405135
18343	NC_013223	GC	3	6	1190560	1190565	0 %	0 %	50 %	50 %	258405135
18344	NC_013223	GAA	2	6	1190632	1190637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405135
18345	NC_013223	GTG	2	6	1190830	1190835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405136
18346	NC_013223	GGA	2	6	1190874	1190879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405136
18347	NC_013223	TA	3	6	1190948	1190953	50 %	50 %	0 %	0 %	258405136
18348	NC_013223	GAG	2	6	1191004	1191009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405136
18349	NC_013223	GGT	2	6	1191069	1191074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405136
18350	NC_013223	GCA	2	6	1191132	1191137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405136
18351	NC_013223	CCG	2	6	1191150	1191155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405136
18352	NC_013223	TTTG	2	8	1191282	1191289	0 %	75 %	25 %	0 %	258405136
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18468	NC_013223	AT	3	6	1198552	1198557	50 %	50 %	0 %	0 %	258405142
18469	NC_013223	A	6	6	1198588	1198593	100 %	0 %	0 %	0 %	258405142
18470	NC_013223	A	6	6	1198650	1198655	100 %	0 %	0 %	0 %	258405142
18471	NC_013223	ATG	2	6	1198690	1198695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405142
18472	NC_013223	CTG	2	6	1198747	1198752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405142
18473	NC_013223	CAA	2	6	1198779	1198784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405142
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18491	NC_013223	T	6	6	1199382	1199387	0 %	100 %	0 %	0 %	258405142
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18499	NC_013223	T	7	7	1199560	1199566	0 %	100 %	0 %	0 %	258405142
18500	NC_013223	GAT	2	6	1199643	1199648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405142

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