MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_013223	CTG	2	6	1137413	1137418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405087
17503	NC_013223	CGC	2	6	1137463	1137468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405087
17504	NC_013223	CCGT	2	8	1137512	1137519	0 %	25 %	25 %	50 %	258405087
17505	NC_013223	CTC	2	6	1137527	1137532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405087
17506	NC_013223	CGT	2	6	1137571	1137576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405087
17507	NC_013223	TTG	2	6	1137609	1137614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405087
17508	NC_013223	ACC	2	6	1137657	1137662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405087
17509	NC_013223	CTG	2	6	1137677	1137682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405087
17510	NC_013223	CAC	2	6	1137724	1137729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405087
17511	NC_013223	CTA	2	6	1137874	1137879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405088
17512	NC_013223	GCCC	2	8	1137898	1137905	0 %	0 %	25 %	75 %	258405088
17513	NC_013223	CACC	2	8	1137968	1137975	25 %	0 %	0 %	75 %	258405088
17514	NC_013223	CGC	2	6	1137990	1137995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405088
17515	NC_013223	T	6	6	1138542	1138547	0 %	100 %	0 %	0 %	258405089
17516	NC_013223	GCCC	2	8	1138573	1138580	0 %	0 %	25 %	75 %	258405089
17517	NC_013223	CGC	2	6	1138759	1138764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405089
17518	NC_013223	GAC	2	6	1138871	1138876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405089
17519	NC_013223	GAG	2	6	1138922	1138927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405089
17520	NC_013223	CTC	2	6	1138937	1138942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405089
17521	NC_013223	TTG	2	6	1138983	1138988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405089
17522	NC_013223	CGGAA	2	10	1139041	1139050	40 %	0 %	40 %	20 %	258405089
17523	NC_013223	GGC	2	6	1139063	1139068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405089
17524	NC_013223	CG	3	6	1139074	1139079	0 %	0 %	50 %	50 %	258405089
17525	NC_013223	TCG	2	6	1139091	1139096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405089
17526	NC_013223	GTA	2	6	1139150	1139155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405089
17527	NC_013223	CGG	2	6	1139240	1139245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405089
17528	NC_013223	GGT	2	6	1139270	1139275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405089
17529	NC_013223	GGC	2	6	1139363	1139368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405089
17530	NC_013223	GGAA	2	8	1139421	1139428	50 %	0 %	50 %	0 %	258405089
17531	NC_013223	GC	3	6	1139443	1139448	0 %	0 %	50 %	50 %	258405089
17532	NC_013223	CCT	2	6	1139554	1139559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405089
17533	NC_013223	GCT	2	6	1139592	1139597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405089
17534	NC_013223	GCG	2	6	1139675	1139680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405089
17535	NC_013223	GTG	2	6	1140152	1140157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405090
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17539	NC_013223	AGAGC	2	10	1140379	1140388	40 %	0 %	40 %	20 %	258405090
17540	NC_013223	CTGT	2	8	1140473	1140480	0 %	50 %	25 %	25 %	258405090
17541	NC_013223	TGG	2	6	1140568	1140573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405090
17542	NC_013223	TCT	2	6	1140613	1140618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405090
17543	NC_013223	GCG	2	6	1140654	1140659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405090
17544	NC_013223	GCG	2	6	1140693	1140698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405090
17545	NC_013223	CAT	2	6	1140719	1140724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405090
17546	NC_013223	CGG	2	6	1140740	1140745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405090
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17548	NC_013223	AC	3	6	1140850	1140855	50 %	0 %	0 %	50 %	258405090
17549	NC_013223	GGA	2	6	1140872	1140877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405090
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17551	NC_013223	CGG	2	6	1140970	1140975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405090
17552	NC_013223	CGG	2	6	1141006	1141011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405090
17553	NC_013223	GGC	2	6	1141082	1141087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405090
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17556	NC_013223	CGA	2	6	1141138	1141143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405090
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17582	NC_013223	A	6	6	1142867	1142872	100 %	0 %	0 %	0 %	258405093
17583	NC_013223	GA	3	6	1142907	1142912	50 %	0 %	50 %	0 %	258405093
17584	NC_013223	TCCAG	2	10	1142938	1142947	20 %	20 %	20 %	40 %	258405093
17585	NC_013223	GGC	2	6	1143001	1143006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405093
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17588	NC_013223	AAC	2	6	1143335	1143340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405093
17589	NC_013223	TAT	2	6	1143416	1143421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405093
17590	NC_013223	CAG	2	6	1143647	1143652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405093
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17597	NC_013223	GC	3	6	1144060	1144065	0 %	0 %	50 %	50 %	258405093
17598	NC_013223	CTGGC	2	10	1144098	1144107	0 %	20 %	40 %	40 %	258405093
17599	NC_013223	CAA	2	6	1144117	1144122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405093
17600	NC_013223	TGC	2	6	1144155	1144160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405093
17601	NC_013223	CT	3	6	1144187	1144192	0 %	50 %	0 %	50 %	258405093
17602	NC_013223	CCG	2	6	1144341	1144346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405093
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17605	NC_013223	GAC	2	6	1144559	1144564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405093
17606	NC_013223	ACG	2	6	1144592	1144597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405093
17607	NC_013223	GGT	2	6	1144633	1144638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405093
17608	NC_013223	TCGAA	2	10	1144677	1144686	40 %	20 %	20 %	20 %	258405093
17609	NC_013223	CGA	2	6	1145014	1145019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405094
17610	NC_013223	ATGG	2	8	1145171	1145178	25 %	25 %	50 %	0 %	258405094
17611	NC_013223	TGC	2	6	1145229	1145234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405094
17612	NC_013223	GCA	2	6	1145247	1145252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405094
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17614	NC_013223	ACC	2	6	1145460	1145465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405094
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17616	NC_013223	CAG	2	6	1145694	1145699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405094
17617	NC_013223	TTG	2	6	1145711	1145716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405094
17618	NC_013223	CAGGAG	2	12	1145774	1145785	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258405094
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17732	NC_013223	GAC	2	6	1153203	1153208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405101
17733	NC_013223	GA	3	6	1153251	1153256	50 %	0 %	50 %	0 %	258405102
17734	NC_013223	TGT	2	6	1153284	1153289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405102
17735	NC_013223	TCG	2	6	1153383	1153388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405102
17736	NC_013223	TGA	2	6	1153456	1153461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405102
17737	NC_013223	CTG	2	6	1153541	1153546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405102
17738	NC_013223	CAGG	2	8	1153550	1153557	25 %	0 %	50 %	25 %	258405102
17739	NC_013223	CTA	2	6	1153660	1153665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405102
17740	NC_013223	GCG	2	6	1153672	1153677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405102
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17744	NC_013223	TCT	2	6	1153905	1153910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405102
17745	NC_013223	CTG	2	6	1153916	1153921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405102
17746	NC_013223	ACC	2	6	1154043	1154048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405102
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17748	NC_013223	T	6	6	1154183	1154188	0 %	100 %	0 %	0 %	258405102
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17750	NC_013223	CTT	2	6	1154210	1154215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405102
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17753	NC_013223	GGT	2	6	1154333	1154338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405102
17754	NC_013223	CCGG	2	8	1154590	1154597	0 %	0 %	50 %	50 %	258405103
17755	NC_013223	GGGC	2	8	1154634	1154641	0 %	0 %	75 %	25 %	258405103
17756	NC_013223	GAC	2	6	1154663	1154668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405103
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17763	NC_013223	TTGG	2	8	1154961	1154968	0 %	50 %	50 %	0 %	258405103
17764	NC_013223	AAC	2	6	1154977	1154982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405103
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17803	NC_013223	T	6	6	1157568	1157573	0 %	100 %	0 %	0 %	258405106
17804	NC_013223	GACCG	2	10	1157585	1157594	20 %	0 %	40 %	40 %	258405106
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17818	NC_013223	ATG	2	6	1158252	1158257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405106
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17820	NC_013223	TCG	2	6	1158472	1158477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405106
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17823	NC_013223	CCA	2	6	1158661	1158666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405106
17824	NC_013223	CAA	2	6	1158849	1158854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405106
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17832	NC_013223	G	7	7	1159040	1159046	0 %	0 %	100 %	0 %	258405106
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17835	NC_013223	TATC	2	8	1159285	1159292	25 %	50 %	0 %	25 %	258405107
17836	NC_013223	GGCC	2	8	1159414	1159421	0 %	0 %	50 %	50 %	258405107
17837	NC_013223	TGC	2	6	1159464	1159469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405107
17838	NC_013223	GCT	2	6	1159483	1159488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405107
17839	NC_013223	CCT	2	6	1159521	1159526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405107
17840	NC_013223	TCT	2	6	1159581	1159586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405107
17841	NC_013223	GGT	2	6	1159630	1159635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405107
17842	NC_013223	AGC	2	6	1159659	1159664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405107
17843	NC_013223	CGTC	2	8	1159739	1159746	0 %	25 %	25 %	50 %	258405108
17844	NC_013223	AGC	2	6	1159778	1159783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405108
17845	NC_013223	TGC	2	6	1159795	1159800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405108
17846	NC_013223	GGC	2	6	1159859	1159864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405108
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17848	NC_013223	TTG	2	6	1159956	1159961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405108
17849	NC_013223	CGG	3	9	1160003	1160011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405108
17850	NC_013223	T	7	7	1160059	1160065	0 %	100 %	0 %	0 %	258405108
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17961	NC_013223	TTCT	2	8	1166513	1166520	0 %	75 %	0 %	25 %	258405115
17962	NC_013223	TTG	2	6	1166524	1166529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405115
17963	NC_013223	GGCC	2	8	1166562	1166569	0 %	0 %	50 %	50 %	258405115
17964	NC_013223	AGA	2	6	1166637	1166642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405115
17965	NC_013223	TGA	2	6	1166682	1166687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405115
17966	NC_013223	GCC	2	6	1166752	1166757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405115
17967	NC_013223	GAC	2	6	1166779	1166784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405115
17968	NC_013223	AGG	2	6	1166813	1166818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405115
17969	NC_013223	GAC	2	6	1166833	1166838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405115
17970	NC_013223	TGGA	2	8	1166886	1166893	25 %	25 %	50 %	0 %	258405116
17971	NC_013223	GATCTG	2	12	1166972	1166983	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258405116
17972	NC_013223	CAC	2	6	1167014	1167019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405116
17973	NC_013223	GGA	2	6	1167025	1167030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405116
17974	NC_013223	GTC	2	6	1167140	1167145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405116
17975	NC_013223	GAC	2	6	1167179	1167184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405116
17976	NC_013223	GAT	2	6	1167196	1167201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405116
17977	NC_013223	CGG	2	6	1167202	1167207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405116
17978	NC_013223	TTC	2	6	1167233	1167238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405116
17979	NC_013223	CTG	2	6	1167308	1167313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405116
17980	NC_013223	CCAGGG	2	12	1167364	1167375	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258405116
17981	NC_013223	AGG	2	6	1167406	1167411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405116
17982	NC_013223	GC	3	6	1167420	1167425	0 %	0 %	50 %	50 %	258405117
17983	NC_013223	TCTTGC	2	12	1167431	1167442	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	258405117
17984	NC_013223	TGA	2	6	1167455	1167460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405117
17985	NC_013223	GC	3	6	1167474	1167479	0 %	0 %	50 %	50 %	258405117
17986	NC_013223	TCC	2	6	1167505	1167510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405117
17987	NC_013223	TGGCCG	2	12	1167515	1167526	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258405117
17988	NC_013223	GAG	2	6	1167580	1167585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405117
17989	NC_013223	CCT	2	6	1167623	1167628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405117
17990	NC_013223	CCGGG	2	10	1167655	1167664	0 %	0 %	60 %	40 %	258405117
17991	NC_013223	CGGAC	2	10	1167716	1167725	20 %	0 %	40 %	40 %	258405117
17992	NC_013223	TGCC	2	8	1167766	1167773	0 %	25 %	25 %	50 %	258405117
17993	NC_013223	T	6	6	1167800	1167805	0 %	100 %	0 %	0 %	258405117
17994	NC_013223	TGG	2	6	1167822	1167827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405117
17995	NC_013223	GCCA	2	8	1167846	1167853	25 %	0 %	25 %	50 %	258405117
17996	NC_013223	GGT	2	6	1167855	1167860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405117
17997	NC_013223	AAC	3	9	1167923	1167931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405117
17998	NC_013223	GAG	2	6	1168000	1168005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405117
17999	NC_013223	CTG	2	6	1168063	1168068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405118
18000	NC_013223	CCT	2	6	1168180	1168185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405118

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