MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_013223	TCT	2	6	1103863	1103868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405059
17003	NC_013223	TA	3	6	1103943	1103948	50 %	50 %	0 %	0 %	258405059
17004	NC_013223	ATT	2	6	1103989	1103994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405059
17005	NC_013223	A	7	7	1104039	1104045	100 %	0 %	0 %	0 %	258405059
17006	NC_013223	ATC	2	6	1104237	1104242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405060
17007	NC_013223	TTG	2	6	1104300	1104305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405060
17008	NC_013223	TGG	2	6	1104353	1104358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405060
17009	NC_013223	AGC	2	6	1104360	1104365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405060
17010	NC_013223	TGCT	2	8	1104373	1104380	0 %	50 %	25 %	25 %	258405060
17011	NC_013223	CAC	2	6	1104410	1104415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405060
17012	NC_013223	TTC	2	6	1104468	1104473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405060
17013	NC_013223	GCA	2	6	1104496	1104501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405060
17014	NC_013223	TTC	2	6	1104510	1104515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405060
17015	NC_013223	GCT	2	6	1104604	1104609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405060
17016	NC_013223	CGA	2	6	1104620	1104625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405060
17017	NC_013223	T	6	6	1104635	1104640	0 %	100 %	0 %	0 %	258405060
17018	NC_013223	CAA	2	6	1104791	1104796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405060
17019	NC_013223	GCC	2	6	1104829	1104834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405060
17020	NC_013223	GCA	2	6	1104841	1104846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405060
17021	NC_013223	TCA	2	6	1104880	1104885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405060
17022	NC_013223	CGG	2	6	1104911	1104916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405060
17023	NC_013223	CTG	2	6	1104942	1104947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405060
17024	NC_013223	CCA	2	6	1104977	1104982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405060
17025	NC_013223	TTG	2	6	1105014	1105019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405060
17026	NC_013223	TTTG	2	8	1105034	1105041	0 %	75 %	25 %	0 %	258405060
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17029	NC_013223	TGAC	2	8	1105119	1105126	25 %	25 %	25 %	25 %	258405060
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17031	NC_013223	AATA	2	8	1105236	1105243	75 %	25 %	0 %	0 %	258405060
17032	NC_013223	CCA	2	6	1105271	1105276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405060
17033	NC_013223	TGC	2	6	1105327	1105332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405060
17034	NC_013223	GTC	2	6	1105432	1105437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405060
17035	NC_013223	CTG	2	6	1105476	1105481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405060
17036	NC_013223	TTCA	2	8	1105545	1105552	25 %	50 %	0 %	25 %	258405060
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17038	NC_013223	CTGG	2	8	1105833	1105840	0 %	25 %	50 %	25 %	258405060
17039	NC_013223	TGGAC	2	10	1105898	1105907	20 %	20 %	40 %	20 %	258405060
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17042	NC_013223	GGT	2	6	1106175	1106180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405060
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17050	NC_013223	GCG	2	6	1107279	1107284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405061
17051	NC_013223	GGGA	2	8	1107309	1107316	25 %	0 %	75 %	0 %	258405061
17052	NC_013223	TGA	2	6	1107344	1107349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405061
17053	NC_013223	GCGA	2	8	1107397	1107404	25 %	0 %	50 %	25 %	258405061
17054	NC_013223	TTG	2	6	1107465	1107470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405061
17055	NC_013223	TCC	2	6	1107515	1107520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405061
17056	NC_013223	CGA	2	6	1107531	1107536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405061
17057	NC_013223	TC	3	6	1107571	1107576	0 %	50 %	0 %	50 %	258405061
17058	NC_013223	GCG	2	6	1107582	1107587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405061
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17067	NC_013223	GCG	2	6	1107917	1107922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405061
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17102	NC_013223	TAG	2	6	1110091	1110096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405062
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17112	NC_013223	GGAG	2	8	1110670	1110677	25 %	0 %	75 %	0 %	258405063
17113	NC_013223	AT	3	6	1110747	1110752	50 %	50 %	0 %	0 %	258405063
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17116	NC_013223	TGA	2	6	1110889	1110894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405063
17117	NC_013223	GCT	2	6	1110977	1110982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405063
17118	NC_013223	GAG	2	6	1110992	1110997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405063
17119	NC_013223	CAAG	2	8	1111025	1111032	50 %	0 %	25 %	25 %	258405063
17120	NC_013223	TCA	2	6	1111041	1111046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405063
17121	NC_013223	TTG	2	6	1111083	1111088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405063
17122	NC_013223	CTT	2	6	1111157	1111162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405063
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17124	NC_013223	ATG	2	6	1111194	1111199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405063
17125	NC_013223	AGC	2	6	1111230	1111235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405063
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17129	NC_013223	CTGG	2	8	1111457	1111464	0 %	25 %	50 %	25 %	258405063
17130	NC_013223	TAA	2	6	1111483	1111488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405063
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17147	NC_013223	CCG	2	6	1112250	1112255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405063
17148	NC_013223	GAA	2	6	1112333	1112338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405063
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17224	NC_013223	T	8	8	1118717	1118724	0 %	100 %	0 %	0 %	258405069
17225	NC_013223	GAA	2	6	1118759	1118764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405069
17226	NC_013223	GCG	2	6	1118803	1118808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405069
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17228	NC_013223	GGA	2	6	1118996	1119001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405069
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17230	NC_013223	TCC	2	6	1119120	1119125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405069
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17234	NC_013223	AGC	2	6	1119382	1119387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405070
17235	NC_013223	CAA	2	6	1119430	1119435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405070
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17237	NC_013223	TCC	2	6	1119483	1119488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405070
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17239	NC_013223	TGA	2	6	1120054	1120059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405070
17240	NC_013223	TCCG	2	8	1120067	1120074	0 %	25 %	25 %	50 %	258405070
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17332	NC_013223	TCT	2	6	1126227	1126232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405076
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17335	NC_013223	ATTT	2	8	1126340	1126347	25 %	75 %	0 %	0 %	258405076
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17339	NC_013223	GCGG	2	8	1126530	1126537	0 %	0 %	75 %	25 %	258405076
17340	NC_013223	GCG	2	6	1126544	1126549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405076
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17348	NC_013223	CCGG	2	8	1127402	1127409	0 %	0 %	50 %	50 %	258405077
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17351	NC_013223	CGA	2	6	1127790	1127795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405077
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17353	NC_013223	CGA	2	6	1127858	1127863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405077
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17467	NC_013223	CGG	2	6	1135656	1135661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405086
17468	NC_013223	CCAA	2	8	1135675	1135682	50 %	0 %	0 %	50 %	258405086
17469	NC_013223	GCG	2	6	1135701	1135706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405086
17470	NC_013223	CG	3	6	1135795	1135800	0 %	0 %	50 %	50 %	258405086
17471	NC_013223	GGA	2	6	1135814	1135819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405086
17472	NC_013223	ACCG	2	8	1135851	1135858	25 %	0 %	25 %	50 %	258405086
17473	NC_013223	TGC	2	6	1135864	1135869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405086
17474	NC_013223	GC	3	6	1135890	1135895	0 %	0 %	50 %	50 %	258405086
17475	NC_013223	GGC	2	6	1136085	1136090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405086
17476	NC_013223	CGG	2	6	1136106	1136111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405086
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17480	NC_013223	CGG	2	6	1136407	1136412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405086
17481	NC_013223	ATGCG	2	10	1136504	1136513	20 %	20 %	40 %	20 %	258405087
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17483	NC_013223	GC	3	6	1136559	1136564	0 %	0 %	50 %	50 %	258405087
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17490	NC_013223	TCC	2	6	1136784	1136789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405087
17491	NC_013223	TTTG	2	8	1136985	1136992	0 %	75 %	25 %	0 %	258405087
17492	NC_013223	GTC	2	6	1137008	1137013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405087
17493	NC_013223	GCG	2	6	1137088	1137093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405087
17494	NC_013223	GCC	2	6	1137101	1137106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405087
17495	NC_013223	GCG	2	6	1137109	1137114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405087
17496	NC_013223	TTTCG	2	10	1137123	1137132	0 %	60 %	20 %	20 %	258405087
17497	NC_013223	C	6	6	1137141	1137146	0 %	0 %	0 %	100 %	258405087
17498	NC_013223	CG	3	6	1137217	1137222	0 %	0 %	50 %	50 %	258405087
17499	NC_013223	CGT	2	6	1137232	1137237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405087
17500	NC_013223	GAA	2	6	1137251	1137256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405087

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