MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_013223	CTT	2	6	1068382	1068387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405029
16503	NC_013223	TCA	2	6	1068562	1068567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405029
16504	NC_013223	GT	3	6	1068633	1068638	0 %	50 %	50 %	0 %	258405029
16505	NC_013223	A	6	6	1068651	1068656	100 %	0 %	0 %	0 %	258405029
16506	NC_013223	ATC	2	6	1068669	1068674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405029
16507	NC_013223	CCA	2	6	1068712	1068717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405029
16508	NC_013223	CGA	2	6	1068736	1068741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405029
16509	NC_013223	TCG	2	6	1068765	1068770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405029
16510	NC_013223	GAT	2	6	1068797	1068802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405029
16511	NC_013223	GCA	2	6	1069000	1069005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405029
16512	NC_013223	AGG	2	6	1069023	1069028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405029
16513	NC_013223	TCG	2	6	1069077	1069082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405029
16514	NC_013223	CGC	2	6	1069159	1069164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405029
16515	NC_013223	GTT	2	6	1069181	1069186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405029
16516	NC_013223	GCC	2	6	1069224	1069229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405029
16517	NC_013223	C	6	6	1069233	1069238	0 %	0 %	0 %	100 %	258405029
16518	NC_013223	TCG	2	6	1069311	1069316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405029
16519	NC_013223	TTGCGT	2	12	1069353	1069364	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	258405029
16520	NC_013223	GGA	2	6	1069400	1069405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405029
16521	NC_013223	GT	3	6	1069420	1069425	0 %	50 %	50 %	0 %	258405029
16522	NC_013223	GGC	2	6	1069429	1069434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405029
16523	NC_013223	CTGG	2	8	1069807	1069814	0 %	25 %	50 %	25 %	258405030
16524	NC_013223	TCG	2	6	1069826	1069831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405030
16525	NC_013223	CGA	2	6	1069914	1069919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405030
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16527	NC_013223	GATGGC	2	12	1070149	1070160	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258405030
16528	NC_013223	TTGTGG	2	12	1070192	1070203	0 %	50 %	50 %	0 %	258405030
16529	NC_013223	G	6	6	1070283	1070288	0 %	0 %	100 %	0 %	258405030
16530	NC_013223	TGA	2	6	1070445	1070450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405030
16531	NC_013223	TGA	2	6	1071021	1071026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405031
16532	NC_013223	TGT	2	6	1071058	1071063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405031
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16535	NC_013223	TCTG	2	8	1071096	1071103	0 %	50 %	25 %	25 %	258405031
16536	NC_013223	CTG	2	6	1071188	1071193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405031
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16538	NC_013223	GAT	2	6	1071458	1071463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405031
16539	NC_013223	CGG	2	6	1071468	1071473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405031
16540	NC_013223	TGC	2	6	1071474	1071479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405031
16541	NC_013223	CGG	2	6	1071598	1071603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405031
16542	NC_013223	CGC	2	6	1071712	1071717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405031
16543	NC_013223	GCTG	2	8	1071718	1071725	0 %	25 %	50 %	25 %	258405031
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16548	NC_013223	G	6	6	1071907	1071912	0 %	0 %	100 %	0 %	258405031
16549	NC_013223	CTC	2	6	1071917	1071922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405031
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16554	NC_013223	GCT	2	6	1072156	1072161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405031
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16558	NC_013223	GAA	2	6	1072555	1072560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405032
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16560	NC_013223	ATT	2	6	1072673	1072678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405032
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16565	NC_013223	GGATT	2	10	1072956	1072965	20 %	40 %	40 %	0 %	258405032
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16582	NC_013223	CAT	2	6	1074874	1074879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405033
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16587	NC_013223	AAT	2	6	1075199	1075204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405033
16588	NC_013223	CGA	2	6	1075216	1075221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405033
16589	NC_013223	CCT	2	6	1075227	1075232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405033
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16598	NC_013223	GC	3	6	1075443	1075448	0 %	0 %	50 %	50 %	258405033
16599	NC_013223	CGC	3	9	1075505	1075513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405033
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16601	NC_013223	GCCC	2	8	1075744	1075751	0 %	0 %	25 %	75 %	258405033
16602	NC_013223	CGATAC	2	12	1075783	1075794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258405033
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16604	NC_013223	TGC	2	6	1076442	1076447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405034
16605	NC_013223	CTG	2	6	1076477	1076482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405034
16606	NC_013223	GGA	2	6	1076554	1076559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405034
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16610	NC_013223	CGA	2	6	1076683	1076688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405034
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16614	NC_013223	CTGGCC	2	12	1077068	1077079	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258405034
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16734	NC_013223	CAG	2	6	1086009	1086014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405041
16735	NC_013223	AGC	2	6	1086153	1086158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405042
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16850	NC_013223	GGCC	2	8	1093588	1093595	0 %	0 %	50 %	50 %	258405049
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16969	NC_013223	GTC	2	6	1101910	1101915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405057
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16973	NC_013223	A	6	6	1102138	1102143	100 %	0 %	0 %	0 %	258405057
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