MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_013223	TCG	2	6	1036002	1036007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405004
16002	NC_013223	GGT	2	6	1036019	1036024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405004
16003	NC_013223	GGGA	2	8	1036501	1036508	25 %	0 %	75 %	0 %	258405005
16004	NC_013223	CCA	2	6	1036565	1036570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405005
16005	NC_013223	GAT	2	6	1036579	1036584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405005
16006	NC_013223	GACCTG	2	12	1036705	1036716	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258405005
16007	NC_013223	GTC	2	6	1036717	1036722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405005
16008	NC_013223	TGA	2	6	1036806	1036811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405005
16009	NC_013223	CG	3	6	1036933	1036938	0 %	0 %	50 %	50 %	258405005
16010	NC_013223	TGAT	2	8	1037006	1037013	25 %	50 %	25 %	0 %	258405005
16011	NC_013223	TGG	2	6	1037019	1037024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405005
16012	NC_013223	GTTG	2	8	1037145	1037152	0 %	50 %	50 %	0 %	258405005
16013	NC_013223	GCT	3	9	1037214	1037222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405005
16014	NC_013223	TGG	2	6	1037250	1037255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405005
16015	NC_013223	CTG	2	6	1037269	1037274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405005
16016	NC_013223	TTG	2	6	1037335	1037340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405005
16017	NC_013223	TGA	2	6	1037352	1037357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405005
16018	NC_013223	GTC	3	9	1037395	1037403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405005
16019	NC_013223	A	7	7	1037405	1037411	100 %	0 %	0 %	0 %	258405005
16020	NC_013223	TCC	2	6	1037438	1037443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405005
16021	NC_013223	TTG	2	6	1037534	1037539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405005
16022	NC_013223	T	8	8	1037554	1037561	0 %	100 %	0 %	0 %	258405005
16023	NC_013223	GCG	2	6	1037595	1037600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405005
16024	NC_013223	GGT	2	6	1037662	1037667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405005
16025	NC_013223	CCAG	2	8	1037670	1037677	25 %	0 %	25 %	50 %	258405005
16026	NC_013223	CTC	2	6	1037707	1037712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405005
16027	NC_013223	GGC	2	6	1037775	1037780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405005
16028	NC_013223	CTT	2	6	1037919	1037924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405005
16029	NC_013223	CAA	2	6	1037932	1037937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405005
16030	NC_013223	T	6	6	1037958	1037963	0 %	100 %	0 %	0 %	258405005
16031	NC_013223	TGG	2	6	1037970	1037975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405005
16032	NC_013223	TCA	2	6	1038002	1038007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405005
16033	NC_013223	GA	3	6	1038020	1038025	50 %	0 %	50 %	0 %	258405005
16034	NC_013223	G	7	7	1038035	1038041	0 %	0 %	100 %	0 %	258405005
16035	NC_013223	AGG	2	6	1038264	1038269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405005
16036	NC_013223	G	6	6	1038321	1038326	0 %	0 %	100 %	0 %	258405005
16037	NC_013223	GGA	2	6	1038342	1038347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405005
16038	NC_013223	CCG	2	6	1038386	1038391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405005
16039	NC_013223	GAG	2	6	1038404	1038409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405005
16040	NC_013223	CCT	2	6	1038510	1038515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405005
16041	NC_013223	TCC	2	6	1038548	1038553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405005
16042	NC_013223	CAT	2	6	1038565	1038570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405005
16043	NC_013223	GTG	2	6	1038596	1038601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405005
16044	NC_013223	CGC	2	6	1038612	1038617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405005
16045	NC_013223	AGG	2	6	1038692	1038697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405005
16046	NC_013223	CGG	2	6	1038705	1038710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405005
16047	NC_013223	A	6	6	1038743	1038748	100 %	0 %	0 %	0 %	258405005
16048	NC_013223	CAG	2	6	1039056	1039061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405006
16049	NC_013223	AG	3	6	1039149	1039154	50 %	0 %	50 %	0 %	258405006
16050	NC_013223	TGA	2	6	1039165	1039170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405006
16051	NC_013223	G	6	6	1039187	1039192	0 %	0 %	100 %	0 %	258405006
16052	NC_013223	GGC	2	6	1039204	1039209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405006
16053	NC_013223	GCTG	2	8	1039276	1039283	0 %	25 %	50 %	25 %	258405006
16054	NC_013223	G	6	6	1039442	1039447	0 %	0 %	100 %	0 %	258405006
16055	NC_013223	CT	3	6	1039460	1039465	0 %	50 %	0 %	50 %	258405006
16056	NC_013223	GCC	2	6	1039621	1039626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405007
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16058	NC_013223	TTC	2	6	1039661	1039666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405007
16059	NC_013223	GCG	2	6	1039673	1039678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405007
16060	NC_013223	CTT	2	6	1039690	1039695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405007
16061	NC_013223	TGC	2	6	1039746	1039751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405007
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16063	NC_013223	CGA	2	6	1039800	1039805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405007
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16111	NC_013223	G	6	6	1043017	1043022	0 %	0 %	100 %	0 %	258405010
16112	NC_013223	CGAAA	2	10	1043031	1043040	60 %	0 %	20 %	20 %	258405010
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16116	NC_013223	CGA	2	6	1043149	1043154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405010
16117	NC_013223	GGA	2	6	1043374	1043379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405010
16118	NC_013223	AAG	2	6	1043408	1043413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405010
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16124	NC_013223	GACT	2	8	1043586	1043593	25 %	25 %	25 %	25 %	258405010
16125	NC_013223	GC	3	6	1043599	1043604	0 %	0 %	50 %	50 %	258405010
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16211	NC_013223	AGT	2	6	1049742	1049747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405012
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16215	NC_013223	TA	4	8	1049863	1049870	50 %	50 %	0 %	0 %	258405013
16216	NC_013223	GCGGA	2	10	1049957	1049966	20 %	0 %	60 %	20 %	258405013
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16220	NC_013223	TGG	2	6	1050568	1050573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405014
16221	NC_013223	GCG	2	6	1050711	1050716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405014
16222	NC_013223	CTG	2	6	1050750	1050755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405014
16223	NC_013223	GCG	2	6	1050782	1050787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405014
16224	NC_013223	CCCT	2	8	1050870	1050877	0 %	25 %	0 %	75 %	258405014
16225	NC_013223	G	6	6	1050981	1050986	0 %	0 %	100 %	0 %	258405014
16226	NC_013223	GCC	2	6	1051021	1051026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405014
16227	NC_013223	CAT	2	6	1051139	1051144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405014
16228	NC_013223	GCC	2	6	1051146	1051151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405014
16229	NC_013223	GCA	2	6	1051163	1051168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405014
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16231	NC_013223	GAA	2	6	1051440	1051445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405014
16232	NC_013223	CCGGA	2	10	1051500	1051509	20 %	0 %	40 %	40 %	258405014
16233	NC_013223	TGA	2	6	1051538	1051543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405014
16234	NC_013223	AGG	2	6	1051609	1051614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405014
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16242	NC_013223	GCT	2	6	1052211	1052216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405015
16243	NC_013223	GCG	2	6	1052373	1052378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405015
16244	NC_013223	CA	3	6	1052380	1052385	50 %	0 %	0 %	50 %	258405015
16245	NC_013223	GCG	2	6	1052428	1052433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405015
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16262	NC_013223	CTG	2	6	1053530	1053535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405016
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16334	NC_013223	GCC	2	6	1058016	1058021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405020
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16340	NC_013223	GGCG	2	8	1058270	1058277	0 %	0 %	75 %	25 %	258405020
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16344	NC_013223	CCAG	2	8	1058462	1058469	25 %	0 %	25 %	50 %	258405020
16345	NC_013223	TGGT	2	8	1058491	1058498	0 %	50 %	50 %	0 %	258405020
16346	NC_013223	GCA	3	9	1058531	1058539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405020
16347	NC_013223	CCG	2	6	1058569	1058574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405020
16348	NC_013223	CGT	2	6	1058657	1058662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405020
16349	NC_013223	TCAA	2	8	1058698	1058705	50 %	25 %	0 %	25 %	258405020
16350	NC_013223	CGT	2	6	1058717	1058722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405020
16351	NC_013223	ATG	2	6	1058917	1058922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405020
16352	NC_013223	CG	3	6	1059012	1059017	0 %	0 %	50 %	50 %	258405020
16353	NC_013223	GTTCG	2	10	1059063	1059072	0 %	40 %	40 %	20 %	258405020
16354	NC_013223	TGC	2	6	1059641	1059646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405021
16355	NC_013223	CGGCG	2	10	1059650	1059659	0 %	0 %	60 %	40 %	258405021
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16362	NC_013223	GCC	2	6	1060036	1060041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405021
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16374	NC_013223	GAG	2	6	1060757	1060762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405022
16375	NC_013223	CGG	2	6	1060873	1060878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405022
16376	NC_013223	TCA	2	6	1060881	1060886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405022
16377	NC_013223	TCG	2	6	1060920	1060925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405022
16378	NC_013223	GGT	2	6	1060943	1060948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405022
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16457	NC_013223	AG	3	6	1065238	1065243	50 %	0 %	50 %	0 %	258405026
16458	NC_013223	CGC	2	6	1065296	1065301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405026
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16460	NC_013223	CGG	2	6	1065398	1065403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405026
16461	NC_013223	TTG	2	6	1065429	1065434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405026
16462	NC_013223	GCG	2	6	1065449	1065454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405026
16463	NC_013223	ATC	2	6	1065706	1065711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405027
16464	NC_013223	TGG	2	6	1065734	1065739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405027
16465	NC_013223	TGC	2	6	1065813	1065818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405027
16466	NC_013223	CGGGG	2	10	1065820	1065829	0 %	0 %	80 %	20 %	258405027
16467	NC_013223	T	6	6	1065909	1065914	0 %	100 %	0 %	0 %	258405027
16468	NC_013223	CGC	2	6	1065917	1065922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405027
16469	NC_013223	CGG	2	6	1065994	1065999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405027
16470	NC_013223	CGC	2	6	1066067	1066072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405027
16471	NC_013223	CGACGG	2	12	1066158	1066169	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258405027
16472	NC_013223	GGA	2	6	1066236	1066241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405027
16473	NC_013223	GCG	2	6	1066247	1066252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405027
16474	NC_013223	TC	3	6	1066257	1066262	0 %	50 %	0 %	50 %	258405027
16475	NC_013223	GAA	2	6	1066264	1066269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405027
16476	NC_013223	GCG	2	6	1066270	1066275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405027
16477	NC_013223	GGC	2	6	1066307	1066312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405027
16478	NC_013223	GCTG	2	8	1066313	1066320	0 %	25 %	50 %	25 %	258405027
16479	NC_013223	TTC	2	6	1066517	1066522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405027
16480	NC_013223	CAC	2	6	1066591	1066596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405027
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16482	NC_013223	CCCG	2	8	1066685	1066692	0 %	0 %	25 %	75 %	258405027
16483	NC_013223	CGTT	2	8	1066816	1066823	0 %	50 %	25 %	25 %	258405027
16484	NC_013223	GCA	3	9	1066887	1066895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405027
16485	NC_013223	ATCG	2	8	1066930	1066937	25 %	25 %	25 %	25 %	258405027
16486	NC_013223	GAA	2	6	1067041	1067046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405027
16487	NC_013223	GAA	2	6	1067179	1067184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405027
16488	NC_013223	G	6	6	1067185	1067190	0 %	0 %	100 %	0 %	258405027
16489	NC_013223	TGG	2	6	1067192	1067197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405027
16490	NC_013223	CGGA	2	8	1067237	1067244	25 %	0 %	50 %	25 %	258405027
16491	NC_013223	TGGA	2	8	1067246	1067253	25 %	25 %	50 %	0 %	258405027
16492	NC_013223	GAG	2	6	1067254	1067259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405027
16493	NC_013223	GAA	2	6	1067398	1067403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405027
16494	NC_013223	TCA	2	6	1067462	1067467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405027
16495	NC_013223	GGC	2	6	1067971	1067976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405028
16496	NC_013223	A	6	6	1068010	1068015	100 %	0 %	0 %	0 %	258405028
16497	NC_013223	AGGC	2	8	1068017	1068024	25 %	0 %	50 %	25 %	258405028
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16499	NC_013223	GC	3	6	1068213	1068218	0 %	0 %	50 %	50 %	258405029
16500	NC_013223	CAG	2	6	1068308	1068313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405029

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